核酸凝胶染色剂-GelRed
DNA琼脂糖凝胶电泳-染料分析

核酸凝胶电泳染料的选择1.EB溴化乙锭(EB)由于其价格便宜、使用方便已成为最常用的核酸染料,被广泛应用于观察、检测琼脂糖凝胶与聚丙烯酰胺凝胶中的DNA或RNA。
然而EB是一种强诱变剂,具有中等毒性,对皮肤、眼睛、口腔和上呼吸道系统有刺激性作用,对人体有潜在危害性。
且废弃的EB染液易污染环境。
EB本身在紫外下不发光,与单链、双链或三链DNA结合后发出明亮的荧光,EB-DNA结合物会导致染料的光漂白和DNA单链断裂,且具有潜在的诱变作用。
EB的使用方法简单,可在制胶时将其加入进行前染,也可在电泳结束后进行后染。
前染有利于节约时间,但是易出现条带变形拖尾等问题,后染较费时,但效果较好。
2.GeneFinderGeneFinder TM是新型的核酸染料,可以代替EB作为各种核酸电泳的染色剂。
与强致癌性的EB不同,GeneFinder TM属于花青类染料,毒性较低,GeneFinder TM与dsDNA结合发出荧光,其检测核酸的灵敏度比EB染色法高。
GeneFinder TM染料最大吸收峰为470nm,与该染料结合的核酸在紫外线下呈现绿色荧光,另外,该染料同样能引起有机体突变,在使用时候一样要采取适当的保护措施。
3.GoldViewGoldView TM也是一种可代替溴化乙锭(EB)的新型核酸染料,采用琼脂糖电泳检测DNA时,GoldView TM与核酸结合后能产生很强的荧光信号,其灵敏度与EB相当,使用方法与之完全相同。
GoldView对于大片段DNA的染色效果较好,但对于500 bp以下的片段效果并不理想,而且它的荧光基团在紫外灯下非常容易淬灭,一般约5-10min条带就会消失。
所以应尽快拍照、观察。
另外,GoldView 灵敏度差,本底色严重,不适用于切胶回收。
且其毒性较大,尤其在紫外灯下,其诱导突变能力极高。
4.SybrGreenISybrGreenI也是一种常用的核酸染料,它与双链DNA(dsDNA)结合后,荧光大大增强,检测的灵敏度也高于EB。
GelRed基本问答
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A:GelRed/GelGreen是超敏感的染料。有些用户反馈可以检测含量<0.1ng的DNA。然而,染色的灵敏度取决于仪器的性能和曝光设置等。
Q:GelRed / GelGreen的结合机制是什么?
A:GelRed/GelGreen作用原理通过静电及电荷相互作用的结合。
针对预制胶电泳拖带、不清上样量。
2.建议把GelREed再稀释一倍后使用,但过低会影响结果的灵敏性。
3.用1XTBE缓冲液代替TAE,因为含硼酸盐的试剂导电性能更好。
GelRed&GelGreen常见问题:
Q:污染或微笑的DNA条带或错误的DNA迁移条带?
Q:可以提前制作GelRed / GelGreen凝胶,储存供以后使用吗?
A:可以,GelRed和GelGreen染料是稳定的。在保证琼脂糖凝胶的完整性不会被破坏的前提下,你可以将预制的GelRed / GelGreen凝胶储存供以后使用。我们建议在4℃避光贮存凝胶。
Q:GelRed / GelGreen在熔化的琼脂糖中稳定么?可以将GelRed / GelGreen储存在熔化的琼脂糖胶中,到用的时候在制备凝胶吗?
Q:为什么有GelRed和GelGreen两种溶剂(二甲基亚砜DMSO和水)?在DMSO和水中的染料是否存在差异?
A:水溶解的产品相对于储存在DMSO中,是一个全新的改良。由于DMSO会被皮肤吸收,我们建议染料溶于水,以避免处理二甲基亚砜存在的潜在危害。鉴于有些用户不希望改变实验方案,我们将继续提供储存在DMSO的染料。经过内部测试,两种溶剂方案的效果相似。
Q:GelRed / GelGreen的使用量?
A:10,000×储备液用于1X预制凝胶使用量1:10000(例如,5 uL用于50ml凝胶),或1:3333比例用于电泳后染色(15uL用于50 mL溶液)。
EB替代品及其优缺点
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1.GeneFinder核酸染料GeneFinder是新型核酸染料,具有安全、灵敏等突出优点,可以代替溴化乙锭(EB)作为各种核酸电泳的染色剂。
与强致癌性的EB不同,GeneFinder毒性很低,使用安全,可有效保护实验操作者和环境。
GeneFinder与dsDNA结合荧光信号可增强800—1000倍,其检测核酸的灵敏度比EB染色法平均高10倍左右,与SYBRGreenI染料的灵敏度相当。
另外,该染料同样能引起有机体突变,在使用时候一样要采取适当的保护措施。
1.1.GeneFinder的特点:1. 安全性:GeneFinder核酸染料致突变性远低于EB数倍甚至数十倍2. 灵敏度:检测核酸的灵敏度平均高于EB染色法10倍左右3. 操作简单:本染料有多种使用方法,操作简单4. 适用范围:适用于多种核酸电泳分析,可以对DNA、RNA、及寡核苷酸等进行染色5. 兼容性:对常用酶(如Taq酶、逆转录酶、内切酶、连接酶等)没有抑制作用2.Goldview核酸染料GoldenView是一种可代替溴化乙锭(EB)的新型核酸染料,采用琼脂糖电泳检测DNA时,GoldenView与核酸结合后能产生很强的荧光信号,其灵敏度与EB相当,使用方法与之完全相同。
在100ml琼脂糖胶溶液中加入5-10µlGoldenView即可。
在紫外透射光下双链DNA呈现绿色荧光,也可用于染RNA。
无致突变性;而溴化乙锭EB是一种强致癌剂,选用GoldenView代替EB比较明智和安全。
目前尚未发现Geneview有致癌性,但是在使用中发现它有一定的刺激性,在使用过程中应戴上手套。
Goldview对于大片段DNA的染色效果还行,但是对于500bp以下的片段效果不是很好,还有一个很致命的弱点是它的荧光基团在紫外灯下非常容易淬灭,一般5-10min条带就会消失。
所以应该抓紧时间拍照后再观察。
另外Goldview不适用于胶回收。
灵敏度差,本底色严重,不利于回收,不稳定。
核酸染料文档
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核酸染料简介核酸染料是一种用于染色核酸(DNA和RNA)的化合物,常用于分子生物学实验中的核酸检测、分离和可视化。
核酸染料通常具有高亲和力,能够与核酸分子特异性地结合,并在染色后发出荧光信号,以便观察和测量核酸的存在和定量。
核酸染料在分子生物学领域中具有广泛的应用。
它们可以在凝胶电泳实验中用于可视化和分离DNA,也可用于定量PCR、蛋白质-核酸相互作用研究、细胞核酸染色和细胞核型分析等实验中。
常见的核酸染料1. 基于暗电荷色团的核酸染料基于暗电荷色团的核酸染料是最常见的核酸染料之一。
它们的分子结构中含有芳香环和氮碱基,能够与DNA或RNA 的磷酸二酯链发生静电吸引力作用。
常见的基于暗电荷色团的核酸染料有乙溴铵溴化物(EB)、溴化乙啶(EtBr)等。
这类染料通常呈现橙色到红色的荧光,可以与DNA或RNA 的碱基配对形成稳定的络合物。
它们在紫外-可见光谱中显示出特定的吸收峰,并能够发出强烈的荧光信号,使核酸在凝胶电泳实验中可视化。
然而,这些染料具有一定的毒性,对人体和环境有潜在危害。
2. 基于亮电荷色团的核酸染料基于亮电荷色团的核酸染料是近年来发展起来的一类新型核酸染料。
它们的分子结构中含有多个亮电荷基团,能够与DNA或RNA的排斥性电荷相互作用,实现与核酸的高亲和力结合。
常见的基于亮电荷色团的核酸染料有SYBR Green、SYBR Safe等。
这类染料通常呈现绿色的荧光,能够与DNA或RNA形成稳定的复合物,并显示出荧光增强效应。
相比基于暗电荷色团的染料,这些染料毒性较低,对人体和环境的危害较小。
它们在核酸检测、定量PCR等实验中得到了广泛应用。
3. 其他类型的核酸染料除了基于暗电荷色团和亮电荷色团的核酸染料,还存在其他类型的核酸染料。
例如,环形染料是一类由多环芳香烃环组成的染料,可用于核酸检测和荧光原位杂交实验。
还有一些特殊的核酸染料,如GelRed、GelGreen等,它们能够与DNA 或RNA的双链结合,在凝胶中呈现高亮度的荧光。
GelRed Nucleic Acid Gel Stain,10000X in water
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品名:GelRed Nucleic Acid Gel Stain,10000X in water商品型号:410031. 使用预制GelRed 胶为DNA染色1.1 按照自己的标准规范准备琼脂糖凝胶溶液1.2 加入GelRed TM10,000X储备试剂至琼脂糖溶液,比例1:10,000(如5微升的GelRed TM10,000X储备试剂加入到50ml的胶溶液中)。
由于GelRed TM通常是热稳定的,10,000X储备试剂可以在胶溶液依旧是热的的时候加入(不需要等到胶溶液冷却下来再加)。
通过旋转、搅拌或者倒转确保染料和胶溶液充分混匀。
(注意:仔细检查10,000X 药水瓶。
如果染料发生沉淀,加热或者声波处理药水瓶。
)或者,可以提前混合GelRed TM 储备剂、琼脂糖粉末和你常用的buffer,微波或其他常用于制备琼脂糖胶的方式加热。
GelRed TM和一般的电泳缓冲液都是兼容的。
1.3 铸胶并允许它固化。
任何残余的胶溶液可以储存并稍后重新加热,以用于其他的铸胶。
因为GelRed TM具有水解稳定性,GelRed TM预制的胶可以大量准备和存放,以备稍候使用。
为了避免发霉,我们建议预制胶储备在冰箱中。
1.4 按你的标准规范加样并跑胶。
1.5 用标准透射法(302或312nm)观察染色胶,并用偏光薄膜667胶卷和EB过滤器照胶。
因为荧光在红色波长区域,SYBR○R或者GelStar过滤器也可以用于照胶,同样可以获得好结果。
(如果你始终看到条带的拖尾和/或条带分离度不佳,按照下述方法跑后染色胶,以确认问题是由于染料引起还是和染料无关的因素引起。
如果后染色胶正常,问题不是由染料引起的,尝试一下方法:降低核酸量、降低跑胶电压、降低胶中琼脂糖的量、增大胶的长度、增加胶的厚度、增强胶的固化时间以确保成形良好、提高加样技术或者按照你的方法选择后染色胶。
)*预制GelRed 胶不适用于丙烯酰胺胶。
可将后染色胶法用于丙烯酰胺胶。
Ts-GelRed核酸凝胶染料cdr
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目录号:
TSJ0 0 2
产品说明:
T S -GelRed 核酸凝胶染料(以下简称TS-GelRed )是一种集高灵敏、低毒性和超稳定于一身的核酸凝胶电泳荧光染 色试剂。艾姆斯氏试验结果也表明 TS-GelRed 在凝胶染色浓度下完全无诱变性,它不易挥发升华,人体不会吸入, 它可替代溴化乙锭(EB )成为一种安全无毒的核酸染料。由于 TS-GelRed 和EB有相同的光谱特性,无需改变滤光片 及观察装置(普通紫外凝胶透射仪)。
常见问题与解决方案:
1 .如果总是看到条带弥散或分离不理想,建议使用泡染法染色以确认问题是否与染料有关。 2.如 果 染 色 后 问 题 依 旧 存 在 , 则 说 明 问 题 与 染 料 无 关 , 请 尝 试 : 降 低 琼 脂 糖 浓 度 、 选 用 更 长 的 凝 胶 、 延 长 凝 胶 时 间 以保证边缘清晰、改进上样技巧或选择泡染法染色。
使用方法:
1.胶染法(用法同EB)
(1)制胶时加入TS-GelRed(例如:每100mL琼脂糖溶液中加入10 μl TS-GelRed 10,000×水溶液)。 (相对较少,500 μl染 料大约可以做100块50 mL的胶。 由于TS-GelRed具有良好的稳定性,室温下在酸或碱缓冲液中 极 其稳定,耐光性强,可室温保存。摇晃,振荡 或者翻转以保证染料充分混匀。TS-GelRed兼容所有常用的电泳缓冲溶液。 含有染料的预制凝胶溶液可以大量制备,并长期保存直到使用。 此方法不适合预制聚丙烯酰胺凝胶,对于聚丙烯酰胺凝胶请使用泡染法。
注意事项:
用泡染法染色时,染料用量较多,单次使用的染色液可重复使用3次左右。 3 × TS- Ge lR e d染色液可以大量制备,在室温下避光保存直至用完。
核酸染料比较
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系统或 蓝色可 紫外透射仪 见光激发
250, 500/530 290, 380, nm 中 1200-600元 /0.5ml 10 µL 24-12元
中 550元/0.5ml 10 µL 11元
低 120元/1ml 5-10µl
低
核酸染料比较
EcoDye 灵敏度 稳定性 ++++ +++++ 安全无毒;没 有诱变性 室温/-4℃, 避 光 dsDNA 、 适用性 ssDNA 或 RNA 标准的紫外透 检测 射仪、可见光 312 nm UV 凝胶成 透射仪或激光 像系统 扫描仪 激发/发射波 295, 490/530 长 价格 nm 中 1000-600元 /0.5ml 用量/100mL Agarose Gel 价格/100mL Agarose Gel 5 µL 10-6元 270, 510/600 nm 中 1200-600元/0.5ml 10 µL 24-12元 Gelred ++++ +++++ 在 18.5 μg /mL S9 代谢活化时有微弱 的诱变性 室温 dsDNA 、ssDNA 或 RNA Gelgreen ++++ +++++ 安全无毒;没 有诱变性 SYBR Green ++++ ++++ 剂量达到1μg /plate 时,致突 诱变性比EB低 变 -20℃,避光保 -20℃,避光保 存6-12个月 dsDNA 、 存6-12个月 dsDNA 、 SYBR Gold ++++ ++++ SYBR Safe +++ +++++ 诱变性比EB要低得 多 GeneGreen ++++ ++++ Gold view ++ ++++ EB +++ ++++
常见核酸染料选择浅析
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常见核酸染料选择浅析(李路军河南农业职业学院植物科学系河南郑州450000)摘要:由于只需简单温和的物理方法(光照)激发和检测,荧光染料是研究生物学微观世界特别是核酸时最常用的示踪工具之一。
DNA电泳后检测凝胶的EB大概是最为人熟知的荧光核酸染料。
除了染胶,荧光核酸染料还可用于荧光原位杂交中作为常见的复染剂。
下面比较一下在分子生物学实验和细胞学实验中常用的荧光染料。
关键词:核酸染料、EB、GeneFinder、Goldview、SYBER greenI、GelRed、GelGreen引言:作为生物体内的重要的大分子,核酸是研究生命现象与本质的物质基础,通过对它们的理化性质、复制与转录、表达与调控等的研究,可以了解生命有关的本质规律。
因此,对核酸的研究具有及其重要的意义。
但核酸肉眼不可见,对其的研究主要是借助一定的仪器来观察它的形态、大小、表达量,其中最常见的也是最简单的是琼脂糖凝胶电泳。
EB(溴化乙锭)是实验室最常用的核酸染料,有着简单、快速、灵敏度高的特点,但是由于其有着强烈的致突变能力和中度致癌性,对实验者和周围环境都有着较大的危害。
溴化乙锭(EB)是分子生物学实验室常用的一种核酸荧光染料。
但是,由于EB是一种强烈的致癌物,因此,如何消除EB对实验室的污染,是分子生物学实验室安全所必须面对的一个难题。
A bstract:Because only needs the simple temperate physical method(illumination)to stimulate and the examination,the fluorescent dye studies the biology microcosm is when specially the nucleic acid one of most commonly used tracing tools.After DNA electrophoresis,examines the gelatin EB is the fluorescence nucleic acid dye which probably the most person knew very well. Except dyes the rubber,the fluorescence nucleic acid dye may also use in the fluorescence home position hybrid taking the common counterstain.Following compares in the molecular biology experiment and the cytology experiment the commonly used fluorescent dye.Key word:Nucleic acid dye,EB,GeneFinder,Goldview,SYBER greenI,GelRed,GelGreenIntroduction:In the achievement organism's important macro-molecule,the nucleic acid is studies the biological phenomena and the essential material base,through to their physics and chemistry nature,the duplication and the duplication,the expression and the regulation and so on research,may understand the life related essence rule.Therefore,has and the vital significance to the nucleic acid research.But the nucleic acid naked eye is not obvious,is mainly draws support from certain instrument to its research to observe its shape,the size,the expression quantity,what most common is also the simple is the agarose gel electrophoresis.EB(bromination second grade spindle)is the laboratory most commonly used nucleic acid dye,has simply,fast,the sensitivity high characteristic,but because it has intense sends the sudden change ability and the moderatecarcinogenicity,has the big harm to the laboratory technician and the environment.Bromination second grade spindle(EB)is the molecular biology laboratory commonly used one kind of nucleic acid fluorescent dye.But,because EB is one kind of intense careinogen,therefore,how to eliminate EB to the laboratory pollution,is a difficult problem which the molecular biology laboratory security must face.1.EB核酸染料溴化乙锭(EB)是一种常规核酸染料,被广泛应用于观察、检测琼脂糖凝胶与聚丙烯酰胺凝胶中的DNA或RNA。
EB替代品及其优缺点

1.GeneFinder核酸染料GeneFinder是新型核酸染料,具有安全、灵敏等突出优点,可以代替溴化乙锭(EB)作为各种核酸电泳的染色剂。
与强致癌性的EB不同,GeneFinder毒性很低,使用安全,可有效保护实验操作者和环境。
GeneFinder与dsDNA结合荧光信号可增强800—1000倍,其检测核酸的灵敏度比EB染色法平均高10倍左右,与SYBRGreenI染料的灵敏度相当。
另外,该染料同样能引起有机体突变,在使用时候一样要采取适当的保护措施。
1.1.GeneFinder的特点:1. 安全性:GeneFinder核酸染料致突变性远低于EB数倍甚至数十倍2. 灵敏度:检测核酸的灵敏度平均高于EB染色法10倍左右3. 操作简单:本染料有多种使用方法,操作简单4. 适用范围:适用于多种核酸电泳分析,可以对DNA、RNA、及寡核苷酸等进行染色5. 兼容性:对常用酶(如Taq酶、逆转录酶、内切酶、连接酶等)没有抑制作用2.Goldview核酸染料GoldenView是一种可代替溴化乙锭(EB)的新型核酸染料,采用琼脂糖电泳检测DNA时,GoldenView与核酸结合后能产生很强的荧光信号,其灵敏度与EB相当,使用方法与之完全相同。
在100ml琼脂糖胶溶液中加入5-10µlGoldenView即可。
在紫外透射光下双链DNA呈现绿色荧光,也可用于染RNA。
无致突变性;而溴化乙锭EB是一种强致癌剂,选用GoldenView代替EB比较明智和安全。
目前尚未发现Geneview有致癌性,但是在使用中发现它有一定的刺激性,在使用过程中应戴上手套。
Goldview对于大片段DNA的染色效果还行,但是对于500bp以下的片段效果不是很好,还有一个很致命的弱点是它的荧光基团在紫外灯下非常容易淬灭,一般5-10min条带就会消失。
所以应该抓紧时间拍照后再观察。
另外Goldview不适用于胶回收。
灵敏度差,本底色严重,不利于回收,不稳定。
GelRed 安全无毒核酸染料,真正的EB替代者
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图 4.GelGreen(绿色)GelRed(红色)在 PBS 缓冲溶液中结合 dsDNA 后的 激发和发射光谱
GelRed 和 GelGreen 是设计以取代剧毒的溴化乙锭
(EtBr)的新一代的核酸凝胶荧光染料。 Biotium 科 学 家 研 发 的 GelRed 和 GelGreen 集 低 毒 性、 高 灵敏性和出色的稳定性等优点于一体,效果优于 EtBr 及其他 EtBr 替代品。 几 十 年 来,EtBr 因 其 低 廉 的 价 格, 一 般 的 灵 敏 度,一直被用作核酸凝胶染色的主要染料。然而, EtBr 是一个高度诱变的物质。该染料的使用安全 隐患、净化及废物处置的相关费用等,最终导致其 代价高昂。正因如此,近年来市场上出现一些替代 品,如 SYBR® 染料等。尽管这些替代染料减少了 致突变性,但却丧失了染料其他方面的性能。例 如,SYBR® Safe 的灵敏性很低,SYBR® Green 及 SYBR® Gold 的稳定性远远低于 EtBr。 SYBR® 染料 能够快速进入细胞,结合线粒体及核 DNA,使得染 料在一定浓度更下是有毒的。事实上,在紫外线或 其他诱变剂诱导下,SYBR®Green I 强烈的突变性 已被广泛认知(Ohta, et al. Mutat. Res. 492, 91(2001))。 为了保证 GelRed 和 GelGreen 的安全性,Biotium 的科学家采用一种新型非常简单的概念:阻止染料 进入活细胞减少遗传毒性。我们相信,不给 DNA 结 合染料渗透活细胞中结合基因组 DNA 的机会,便可 以保证染料没有或大幅度减少其诱变性作用。 因此, 我们设计的 GelRed 和 GelGreen 染料的化学结构保 证其无法渗透细胞膜。 Ames 试验证实即使浓度远 远高于实验者操作凝胶染色的工作浓度,GelRed 和 GelGreen 也无诱变性。此外,环境的安全性试 验表明,GelRed 和 GelGreen 是完全无害的,对水 生生物无毒。因此,废弃的 GelRed 和 GelGreen 可 以直接倒下水道,或按照普通垃圾处理。有关其 详 细 信 息, 请 登 陆 Biotium 网 站 上 下 载 GelRed/ GelGreen 的安全报告。 无论是作为预制凝胶染色或电泳后染色,GelRed 和 GelGreen 染料都是高度敏感的。312/302 nm 的 紫外光透射下,GelRed 灵敏度远远超过 EtBr, 与 SYBR® Gold 灵敏度相当,后凝胶染色法 GelRed 效 果更明亮。与 SYBR® Gold 不同的是,GelRed 也可 以被作高度敏感的预制凝胶染色。 GelGreen 是 用于 488 nm 激光凝胶扫描仪或者可见蓝光激发的 Dark Reader 的研究人员的使用要求。 GelGreen 光谱类似于 SYBR® Safe,但比后者更为敏感。 GelRed 和 GelGreen 另一个主要优势是其显着的稳 定性。你可以用操作 EtBr 同样的方式操作两种染 料。这意味着,染料在水中是非常稳定的,可以在 室温下长期储存,也可以在微波中加热进行预制凝 胶。这两种染料也非常耐光,暴露在室内灯光下也 比较稳定。
GelRed产品说明书
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产品使用说明书产品名称: GelRed TM核酸凝胶染色剂,10,000X in DMF产品编号: 41000包装规格: 0.5 mL贮存和处置方法:GelRed™10,000X in DMF可在室温条件下储存一年以上。
尽管并非必须,GelRed™依旧可以在低温、避光环境下长时间贮存。
但在正常的室内光照实验条件下,该染色剂可以安全操作。
应用: GelRed™是一种具有凝胶染色特性,并被设计为替换高毒性染色剂-溴化乙锭(EB)的红色荧光核酸染色剂。
因为GelRed™与EB有着相同的光谱特性(如图1),所以您可以在不改变任何成像系统的情况下用GelRed™替换EB。
如果您目前使用的是SYBR(如SYBR Green 1/SYBR Gold)染色剂,并使用紫外投射器(UV transilluminator)来观察凝胶,那么您可以使用GelRed™替换SYBR染色剂,不需要更换现有的SYBR虑光片。
然而,在488 nm 激光或类似可见光下GelRed™不能被充分地激发,如果需要,我们建议您使用我们的GelGreen™(Cat# 41004)染色剂,其灵敏度与SYBRGreen 1 一样,但其稳定性和可靠性远胜于后者。
GelRed™既可用于前染(precast gel staining),也可用于后染(post gel staining)。
通常后染比前染能够获得更灵敏的特性,并能排除染色剂在电泳过程中对核酸条带分离造成任何影响的可能性。
然而,前染较后染更为简单、经济,因为前染不需要额外的着色过程,并且燃料用量更少。
因此,假如灵敏度和条带清晰度不成问题,前染则是首选。
我们强烈建议您尝试两种染色方法,以便根据您的需要选择最佳的染色方法。
概括而言,GelRed™在性能和可操作性方面均超过SYBR或EB。
通常,GelRed™最显著的特性是其在多种条件下的高灵敏性和稳定性。
另外,与GelGreen™、EvaGreen™一样,相对EB或SYBR,GelRed™诱导突变的能力极低。
M56×GelredLoadingBuffer6×含gelredDNA上样缓冲液使用说明书

M5 6×Gelred Loading Buffer6×含gelred DNA上样缓冲液使用说明书产品名称单位货号M5 6×Gelred Loading Buffer 0.5ml MF830-01M5 6×Gelred Loading Buffer 5x0.5ml MF830-05【储存条件】2-8℃。
【产品简介】本产品在常规6×Loading Buffer中添加了Gelred染料,该染料是一种生物大分子,不能穿透细胞膜进入细胞内。
相对于EB的强诱变性,是一种安全无毒的核酸染料。
使用6×Gelred Loading Buffer替代原始Loading Buffer时,在制胶过程中无需加入EB等核酸染料,只需要将DNA与6×Gelred Loading Buffer混匀即可进行凝胶电泳。
由于Gelred 与EB具有相同的光谱特性,无需改变滤光片及观察装置,在正常紫外光激发检测即可,使用非常方便和灵活。
【注意事项】1.由于该染料只需在电泳前与DNA混匀,无需加入凝胶中,可使制备的凝胶保存时间更长。
2.由于Loading Buffer中染料的量远高于将染料加入凝胶中的量,对DNA的灵敏度更高。
【自备试剂】琼脂糖(聚合美MF103)TAE(聚合美MF143)/TBE(聚合美MF146)电泳缓冲液【操作步骤】1.配置合适浓度的琼脂糖凝胶。
2.吸取5 μl DNA样品与1 μl 6×Gelred Loading Buffer混匀后,直接电泳于上样孔内,进行常规电泳和图像采集。
向DNA Marker中添加1μl 本产品,在不加染料的TAE缓冲液配置的琼脂糖凝胶中的电泳图,从左到右主带上样量为(150 ng,75 ng)。
【备注】本产品仅供科研使用。
在确认产品质量出现问题时,本公司承诺为客户免费更换等量的质量合格产品。
新型核酸染料-gelred、EB替代品

核酸染料!EB?Gelred?你还有其他选择!EB替代品!你还只知道Gelred的吗?那么你已经out了!新型核酸染料强势来袭!本人郑重推荐两款全进口核酸染料有两个分类,全都是安全无毒的花青类的染料。
第一类:RS-138Safe DNA Stain(核酸安全染色剂)1经Ames-test测试,不透过细胞膜,安全无毒,美国认证;2与EB使用方法一致,灵敏度高,在紫外光及蓝光下均可观察实验结果,发出绿色荧光,效果好;3耐热,可加在缓冲液里,100℃溶解凝胶,防止染色剂没充分混匀;4电泳时染色均匀,靠近负极凝胶和靠近正极端的亮度一样;5稳定性好,不像EB、Goldview放久(一天)了会淬灭,电泳时间过长(>30min)会变暗;6含有Safe DNA Stain的琼脂糖凝胶在4℃可存放7天;7无毒性,不进入细胞内,是花菁染料成分;8EB替代品,与之使用方法一样,可前染,可后染第二类:Red/Green Safe DNA Loading Dye特色:1安全无毒(Ames-test污染物致突变性检测),可替代EB;2电泳时有3条指示带:蓝(4000bp),紫(300bp),黄(50bp),一般的只含有两种3无需添加额外的上样液,只需将本品与DNA按1:5的比例混合直接上样即可;4在紫色或蓝色荧光灯下均可视,条带清晰、明亮;5Red Safe DNA Loading Dye显示红色荧光,Green Safe DNA Loading Dye显示绿色荧光。
优势价格某公司gelred促销信息Table A.促销信息Cat#Product Name Unit Size Unit Price促销价品牌41001GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain''3X in water 4.0L¥2411¥1326Biotium 41002GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain''10''000X in DMSO0.5mL¥1176¥647Biotium 41003GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain''10''000X in water0.5mL¥1235¥679Biotium 41003-1GelRedTM10''000X solution in water''bulk pack10mL¥19757¥10866Biotium 41004GelGreenTM Nucleic Acid Gel Stain''10''000X in DMSO0.5mL¥1058¥582Biotium 41005GelGreenTM Nucleic Acid Gel Stain''10''000X in water0.5mL¥1176¥647Biotium Table B.以下标签可以极好地配合以上产品使用:Cat#Product Name Unit Size Unit Price促销价品牌310211KB DNA Ladder(100ng/uL)30ug/300ul¥647¥517Biotium 31022Ready-to-Use1KB DNA Ladder150applications(1.5ml)¥764¥612Biotium创英生物产品价格:Catlog No.Product Name Size Official Price RS-138Safe DNA Stain Reagent0.5ml520RSG Green Safe DNA Loading Dye1ml780RSG-100Green Safe100bp DNA Loading Dye1ml Marker+1ml Dye860RSG-1KB Green Safe1KB DNA Loading Dye1ml Marker+1ml Dye860 RSR Red Safe DNA Loading Dye1ml780RSR-100Red Safe100bp DNA Loading Dye1ml Marker+1ml Dye860RSR-1KB Red Safe1KB DNA Loading Dye1ml Marker+1ml Dye860可以明显的比较出来,gelred的价格促销后的价格仍然比较贵,而此的两款产品价格比较亲民!欢迎大家选购!。
核酸染色剂对dna在琼脂糖凝胶电泳中迁移速度的影响

To analyze the ePect on monilito of DNA fraamepts in agarose with ethidium bromide(EB) ang GelRee, we uscP pre-
ang post-staining with the two Syes, aS the aaarose gel electrophoresis wae uscP at the Setection methon. Thee the gel imaaing system took
moro sePsitive , gontoxia ang epviroumeptalty safe than EB. In conclusion , prestaining with EB ang poststaining can measure the DNA fraamePts
accurately. Ang we can use GelReS to replace EB wheP the concePtration oS the samples is Rw ang an ePvironmePt-safe Sye is geeSeP.
收稿日期22190928的移动情况ogston模型认为较小分子量的dna片段可以凝胶它们的迁移速度与凝胶的数量以及dna分子量有关系4oreptation理论认为dna分子会反复的凝胶孔径这些凝胶际就像了一根管子因此可以看成dna在一根管子中移动真功地小于40kb的dna分子在琼脂糖凝胶中的移动情况其迁移率和碱基对的倒数成正比46ogelrep是一种核酸染色剂使用方法简便染色优越稳定性好
BO Xin-met (National Basic Meeical ExpeOmental Teaching Demonstration Ceeteo, Basic Meeical College, XuzUou Meeical University,
EMSA凝胶阻滞实验操作方法

Electrophoresis mobility-shift assay (EMSAs).--By David. He Section 1 : Purpose and PrinciplePurpose:EMSAs,gel shift(凝胶阻滞实验),是体外检测蛋白质与DNA相互作用的基本实验。
Principle:蛋白质与DNA相互作用后,增大了DNA的分子量,在电泳场中的电泳速度会比没有结合蛋白质的DNA慢,于是出现shift 现象,于是我们通过shift 的能力判断DNA与蛋白质是否存在相互作用以及作用的强弱。
Section 2 : Procedure and materialsProcedure:(Reaction – Electrophoresis – Dyeing - Imaging)(1)首先准备纯度达到要求的蛋白质,以及想要去研究的DNA 片段;(2)EMSA的反应体系为20μL, DNA 的用量在20nM,蛋白质的用量则根据自己的蛋白质而定;(3)反应的缓冲液如:DTT、Mg2+、ATP、甘油等等根据自己的蛋白加入;(4)蛋白质与DNA的最适反应温度与该蛋白所在的菌体的最适温度一致;(5)将蛋白质、DNA与缓冲液分别加入PCR管,最适温度反应,时间一般为30min;(6)反应完后,加入 6 X DNA Loading dye,点样,6 % 非变性胶,0.5xTBE 电泳缓冲液电泳120-180V均可;(7)Gel-Red染色,染色10-20min,然后清水中漂洗10-20min,image lab 成像。
(8)成像步骤:(1)打开Bio-Rad成像仪,点击image lab 进入操作界面;(2)点击新建–核酸凝胶– GelRed ;(3)点击运行实验协议,务必使用UV tray;(4)出现上述界面后,即开始成像,请勿打开成像仪的门,(5)成像完成后,点击左侧的图像工具,对图像进行编辑,点击对曝光度进行编辑;(6)点击文件,保存,保存一份.scn 格式的原始文件,可以在软件上对图像进行更改,然后点击导出,导出以便发布;(7)导出一份JPG or TIF格式的图像。
GelRed 核酸电泳用染料

GelRed核酸染料(10,000 >水溶液)GelRed核酸染料特点•无毒性:GelRed独特的油性和大分子量特点使其不能穿透细胞膜进入细胞内,艾姆斯氏试验结果也表明,该染料的诱变性远远小于EB。
•灵敏度高:适用于各种大小片段的电泳染色,对核酸迁移的影响小于SYBR Green I。
•稳定性高:适用于使用微波或其它加热方法制备琼脂糖凝胶;室温下在酸或碱缓冲液中极其稳定,耐光性强。
•信噪比高:样品荧光信号强,背景信号低。
•操作简单:与EB 一样,在预制胶和电泳过程中染料不降解;而电泳后染色过程也只需30分钟且无需脱色或冲洗,即可直接用紫外凝胶透射仪观察。
•适用范围广:可选择电泳前染色(胶染法)或电泳后染色(泡染法);适用于琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶电泳;可用于dsDNA或ssDNA或RNA染色。
•无需改变滤光片及观察装置:标准的EB滤光片或SYBR滤光片都适用,使用与观察EB相同的普通紫外凝胶透射仪观察即可,在300nm紫外光附近可得到最佳激发。
GelRed使用方法简介1 •胶染法(用法同EB)(推荐方法)(1)制胶时加入GelRed核酸染料。
每50mL胶中加入5卩LGelRed核酸染料。
(2)按照常规方法进行电泳即可。
注:此方法染色染料用量相对较少。
500 染料大约可以做100块50mL的胶。
当染料稀释在TBE或者类似的电泳缓冲溶液中时可以使用微波炉加热,从而与通常制备预制凝胶的方法相同。
含有染料的预制凝胶可以成批制备,并可以长期保存直到使用。
2.泡染法(1)按照常规方法进行电泳。
(2)用0.1M的NaCl水溶液按照3300 : 1的比例稀释GelRed浓缩液,混匀,制成3x GelRed染色溶液。
(例如:在45mL水溶液中加入5mL 1M的NaCl溶液及15卩L10,000 X GelRed水溶液。
)(3)将染色溶液倒入合适的聚丙烯容器中,放入凝胶,用铝箔等盖住容器使染料避光。
室温振荡染色30分钟左右,染色时间因凝胶浓度和厚度而定。
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环境安全、极其灵敏的核酸凝胶染色试剂GelRed&GelGreen-真正的EB替代者
水溶性包装产品通过美国环保标准的安全测试,废弃物可直接倒入下水道,而不会造成环境污染。
G elRedTM和GelGreenTM是由美国 BIOTIUM 公司开发的两种集高灵敏度、低毒性和超稳定性于一身的,极佳的核酸凝胶荧光染色试剂。
目前,大多数商业化的核酸凝胶染色试剂总是在安全性、稳定性和灵敏性等方面不能完全令人满意。
例如,EB 作为使用最广泛的核酸凝胶染色试剂,能够在多数应用中提供可以接受的灵敏度,但它是一种高诱变性的化学物质,且染色后背景荧光信号较高(图1)。
SYBR Green I 和 SYBR Gold 也被宣传为最灵敏的凝胶染色试剂。
但 SYBR Green I尤其是 SYBR Gold 在常用的微碱性电泳缓冲溶液或预制凝胶中会快速降解,稳定性差导致染色效果极不可靠。
SYBRsafe 被认为是市场上较为安全的核酸染料,但它的染色效果还远不及 SYBR Green I,且毒性依然较高(图3)。
GelRed和GelGreen无论用于预制凝胶染色还是凝胶电泳后染色,都表现出了极高的灵敏度。
为配合312nm-UV凝胶成像系统而设计的GelRed,在使用了我们新开发的具有专利的试验步骤后(该试验步骤中使用稀释的NaCl溶液替代传统的TBE缓冲溶液),在凝胶电泳后染色中优于或者至少相当于 SYBR Gold。
但与SYBR Gold 不同,GelRed在预制凝胶中使用时仍然有极高的灵敏度。
我们新开发的GelGreen可以满足使用 488 nm 激光凝胶扫描仪或者可见光激发的 Dark Reader 的研究人员的使用要求。
GelGreen 无论是在预制凝
胶还是凝胶电泳后染色中都与 SYBR Green I 灵敏度相当,但不存在后者的稳定性问题。
实际上,GelRed 和 GelGreen ,特别是GelRed非常稳定,可以长期在室温下保存。
当这两种染料稀释在TBE或者类似的电泳缓冲溶液中时甚至可以使用微波炉加热,便于采用常规方法制备预制凝胶。
含有染料的预制凝胶可以成批制备,长期保存。
同样重要的是,GelRed 和 GelGreen 相比 EB 或 SYBR Green 提高了安全性。
独立的测试服务公司(Litron Laboratories, Inc.)进行的标准艾姆斯氏测试结果表明,在18.5μg/mL(该浓度远高于推荐用于电泳后染色的约 4μg/mL 的 3X 染色液)浓度下,GelGreen没有诱变性,而 GelRed 也仅在 S9 代谢活化时有微弱的诱变性。
GelRed 和 GelGreen 的特殊化学结构使其难以穿透细胞膜进入细胞,正是这一特性降低了染料的细胞毒性。
见图3。
相反,SYBR Green I 广泛地用于活细胞线粒体和核 DNA 染色,这正是由于它能快速的被细胞吞入。
由于已知 SYBR Green I 对紫外线导致的突变有强烈的增强作用(Ohta et al. Mutat. Res. 492 , 91(2001)),因此它的高细胞膜透性使它在紫外环境观察时成为凝胶染色的主要有害物质。
图1:GelRed和EtBr预制胶染色(precast gel staining)对比图。
琼脂糖浓度为1%,缓冲液为TBE。
四个泳道的加样量从左至右分别为200 ng, 100 ng, 50 ng and 25 ng。
在300nm紫外灯下成像。
结果显示GelRed 较EtBr有着更高的灵敏度和更低的本底色。
图 2. GelGreen(绿色)GelRed(红色)在 PBS 缓冲溶液中结合dsDNA后的激发和发射光谱。
图3:分别用1X SYBR Green 1、SYBR Safe、GelRed和Gelgreen在 PBS 缓冲液中对Hela细胞染色5分钟和30分钟。
成像结果表明Gelred和GelGreen染色剂几乎没有穿透细胞膜进入细胞内,而SYBR Green 1、SYBR Safe 则完全进入细胞内,并与核酸结合(绿色发光部分)。
这充分证明GelRed和GelGreen具有极好的安全性。
更详细的安全检测报告可以到 官方网站下载。
特性:
1、高灵敏度
GelRedTM和GelGreenTM是目前最灵敏的凝胶核酸染料
2、稳定性极好
可随预制胶直接加热而不会降解;室温下可长期保存
3、更安全
艾姆斯氏试验结果表明,该染料的诱变性远小于溴化乙锭,其水溶性包装产品通过美国环保标准的安全测试
4、广泛的适应性
适用于预制凝胶染色和凝胶电泳后染色
5、染色过程简单
预制胶和电泳过程中不必担心染料降解;电泳后染色也仅需30 分钟,因本底色极低而无需脱色或冲洗
6、对 DNA 和 RNA 的迁移影响极小
对核酸迁移的影响小于 SYBR Green I
7、与标准凝胶成像系统及可见光激发的观察装置完美兼容
使用 312nm 激发的 UV 凝胶成像系统时,GelRedTM可以完美替代 EB;使用 254nm 激发的 UV 凝胶成像系统或可见光激发的凝胶观察装置时,GelGreenTM足以替代任意一SYBR染料
>>假货声明<<
上海开放生物科技有限公司是美国BIOTIUM 官方授权唯一总代理商,向广大用
户提供原装进口的产品。
目前,市场上有部分不法经销商利用EB、GoldView等
致癌染料,勾兑仿制美国GelRed产品,给广大用户的实验结果造成不良影响。
上海开放生物受美国方面委托,在此提醒广大用户,从总代理购买原装产品以保
证产品的质量及安全性。