重组质粒的构建与转化

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姓名系年级10级生命基地组别JD-4 同组者

科目分子生物学实验题目重组质粒的构建、转化、筛选和鉴定学号

实验目的

1.学习在实现DNA体外重组过程中,正确选择合适的载体和限制性内切酶并能用限制性核酸内切酶对载

体和目的DNA进行切割,产生利于连接的合适末端。

2.学习设计构建重组DNA分子的基本方法,掌握载体和外源目的DNA酶切的操作。

3.学习利用T4 DNA连接酶把酶切后的载体片段和外源目的DNA片段连接起来,构建体外DNA分子的技

术,了解并掌握几种常用的连接方式。

4.掌握利用Cacl2制备感受态细胞的方法。

5.学习掌握热击法转化E.coli的原理和方法。

6.学习并掌握使用红白菌落法筛选获得重组子以及α互补筛选法的原理及方法。

7.学习并掌握使用Omaga试剂盒抽提质粒的方法及进一步确定重组质粒中含有外源目的DNA片段。

实验原理:

(一)限制性核酸内切酶的酶切反应

体外构建重组DNA分子,首先要了解目的基因的酶切图谱,选用的限制性内切酶不能在目的基因内部有专一的识别位点,否则当用一种或两种限制性内切酶切割外源供体DNA时不能得到完整的目的基因。其次要选择具有相应的单一酶切位点质粒或者噬菌体载体分子。常用的酶切方法有双酶切法和单酶切法两种。本实验采用单酶切法,即只用一种限制性内切酶切割目的DNA 片段,酶切后的片段两端将产生相同的黏性末端或平末端,再选用同样的限制性内切酶处理载体。

在构建重组子时,除了形成正常的重组子外,还可能出现目的DNA片段以相反方向插入载体分子中,或目的DNA串联后再插入载体分子中,甚至出现载体分子自连,重新环化的现象。单酶切法简单易行,但是后期筛选工作比较复杂。各种限制性内切酶都有其最佳反应条件,最主要的因素是反应温度和缓冲液的组成。在双酶切体系中,如果两种酶对盐离子的浓度和温度要求一致,原则上可以将这两种酶同时加入一个反应体系中同步酶切;如果不一致,则酶切反应最好分步进行,常用的酶切顺序是:先低盐后高盐,先低温后高温。

酶切与连接是两个密切相关的步骤,要达到高效率的连接,必须酶切完全,酶切的DNA数量要适当。另外,酶切反应的规模也取决于需要酶切的DNA的量,以及相应的所需酶的量。一般的,酶切0.2~1.0µg的DNA分子时,反应体积约为15~20µg,DNA的量越大,反应体积可按比例适当放大。酶的用量参照标准:一个标准单位酶能在指定的缓冲液系统和温度下,1h完全酶解1µg的pBR322 DNA分子。如果酶活力低,可以适当增加酶的用量,但是最高不能超过反应总体积的10%。因为限制性核酸内切酶一般是保存在50%甘油的缓冲液中,如果酶切反应体系中甘油的含量超过5%,就会抑制酶的活性。

姓名系年级10级生命基地组别JD-4 同组者

科目分子生物学实验题目重组质粒的构建、转化、筛选和鉴定学号

(二)载体与外源DNA的连接反应

连接反应总是紧跟酶切反应,外源DNA片段与载体分子连接的方法即DNA分子体外重组技术主要依赖限制性核酸内切酶和DNA连接酶催化完成的。DNA连接酶催化两双链DNA片段相邻的5’-磷酸和3’-OH间形成磷酸二酯键。在分子克隆中最有用的DNA连接酶是来自T4噬菌体的T4 DNA连接酶,它可以连接黏性末端和平末端。连接反应时,载体DNA和外源DNA的摩尔数之比控制在1:(1~3)之间,可以有效地解决DNA多拷贝插入的现象。实际操作中,反应温度介于酶作用速率和末端结合速率之间,一般是16℃,平末端适当提高连接反应温度。反应时间与温度有关,随温度的提高,反应速度增加,所需时间会相应减少,16℃下最常用的连接时间为12-16h。

(三)感受态细胞的制备及质粒转化

构建好的重组DNA转入感受态细胞中进行表达的现象就是转化。能进行转化的受体细胞必须是感受态细胞,即受体细胞最容易接受外源DNA片段实现转化的生理状态,它决定于受体菌的遗传特性,同时与菌龄、外界环境等因素有关。人工转化是通过人为诱导的方法使细胞具有摄取DNA的能力,或人为地将DNA导入细胞内,该过程与细菌自身的遗传控制无关,常用热击法,电穿孔法等。能否实现质粒DNA的转化还与受体细胞的遗传特性有关,所用的受体细胞一般是限制修饰系统的缺陷变异株,即不含限制性内切酶和甲基化酶的突变株。

目前常用的感受态细胞制备方法有CaCl2法,制备好的感受态细胞可以加入终浓度为15%的无菌甘油,-70℃可保存半年至一年。经过CaCl2处理的细胞细胞膜通透性增加,允许外源DNA 分子进入。在低温下,将携带有外源DNA片段的载体与感受态细胞混合,经过热击或电穿孔技术,使载体分子进入细胞。进入受体细胞的外源DNA分子通过复制、表达,使受体细胞出现新的遗传性状。将这些转化后的细胞在选择性培养基上培养,即可筛选出重组子。本实验以E.coli- DH 5α菌株为受体细胞,用CaCl2处理,使其处于感受态,然后将重组后的pUC19质粒在42℃下热击90s,实现转化。

(四)重组子的鉴定与外源基因的表达

重组DNA进入宿主细胞后,必须使用各种筛选与鉴定手段区分转化子(接纳载体或重组DNA 分子的转化细胞)与非转化子(未接纳载体或重组DNA分子的转化细胞)。而转化子又分为含有重组DNA的转化子(重组子)和仅含有空载体分子的转化子(非重组子)。重组子含有的重组DNA分子中有期望重组子(含有目的基因的重组子)和非期望重组子(不含有目的基因的重组子)。本实验中采用的方法是平板筛选法(α互补筛选原理)、电泳筛选法进行初步鉴定,进一步将采用PCR检测以及酶切验证进行较为准确的鉴定。

利用抗药性筛选原理可筛选出转化子。质粒pUC19携带有氨苄青霉素抗性基因(Amp r),在含有氨苄青霉素平板上筛选转化子,没有导入质粒pUC19的受体细胞,在含有氨苄青霉素的平板上不生长。

利用α互补筛选原理可筛选出转化子中的重组子与非重组子。α互补筛选原理是根据菌落颜色筛选含有重组质粒的转化子。据菌落颜色筛选含有重组质粒的转化子,利用β-半乳糖苷酶筛选

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