根癌农杆菌Ti质粒简介

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生 物 学ห้องสมุดไป่ตู้ 学 2018年(第43卷)第6期
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根 癌 农 杆 菌 Ti质 粒 简 介
王裕鹏 (海南省洋浦经济开发区洋浦中学 578000)
摘 要 本 文 以高 中知 识 为 背 景 ,对 根 癌 农 杆 菌 中 Ti质 粒 的 分 类 、结 构 、转 化 机 理 和 基 因工 程 中 的适 用 范 围进 行 归 纳 总 结 。 关键词 根癌农杆菌 Ti质粒 T—DNA区 双元载体系统
在过去的几十年 间 ,关 于根 癌农杆 菌转 化植 物 细 胞的分子机制得 到 了广泛研 究 。 目前 ,人们 普遍 认 同 Ti质粒转 化过程可分 为 8个 相互 关联 的 阶段 ,分 别
为 :① 当植物受到创 伤后 ,会 分泌酚类 化合物 ,吸引农 杆菌移 向植物细胞 ,然后与植物细胞相关受体蛋 白特异 性结合 ;@VirA蛋白是位于细菌细胞膜上 能识别植物酚 类化合物的受体 蛋 白,两者结 合后 引发 VirG蛋 白的磷 酸化 ;③ 由于 Vi 蛋 白磷 酸化 ,使其从非 活性状 态转变 至活性状态 ,并作 为激 活因子结合 至其他 Vir基 因的启 动子上 ,开启 Vir基 因表达 ;④VirD1和 VirD2蛋 白作 用 于 T—DNA的底链上 ,将其切割形成单链 T—DNA分子 (即 T—strand);同 时 VirD2蛋 白以共 价 方式 连 接在 T— strand的 5 端 ,形成一个不成熟 T链 复合物 ;⑤ VirD4和 VirB类蛋 白结合形成具有转运功能的通道 ,协助不成熟 T链复合物和一些 Vir蛋 白进入植物 细胞 中;⑥在转运 途 中,VirE2蛋 白包被在不成熟 T链 复合物上 ,构成成熟 T链复合物 ;⑦成 熟 T链 复 合物 和一 些植物 细胞 蛋 白 (Ran、VIP1等)进一步识 别结合 ,协 助 T链复合物经核 孔到达细胞核 ;⑧在 VirD2、VirE2和植物 细胞相 关蛋 白 的协助下 ,T—strand与植物细胞基 因组完成整合 。 3 Ti质 粒 在 实 际应 用 中 的 改 造
高 中生物学教材提 到用 于基因工程 的载体 分子量 并不 大 :如 TA 克 隆 用 到 的 pMD19质 粒 长 度 仅 有 2692 bp,原核表达 蛋白质 常用质 粒 pET一28a长度也只 有5369 bp。而 Ti质粒 长度 约 200 Kb左右 ,片段 过大 , 不易操作 。所 以野 生 型 Ti质粒 需改 造才 能应 用 于植 物 基 因工 程 。
人教 版高 中生 物学教 材选修 3中提 到 ,将 目的基 因导入植 物 细胞 的方 法 中采 用 最多 的是 农 杆 菌 转化 法 ,其 中根癌农杆 菌细胞中的 Ti质 粒在 整个转 化过程 中起 到了关键 作用 。本 文 就 Ti质粒 相关 知识 进 行梳 理 和 总结 。 1 Ti质粒 的分类 和结构 1.1 Ti质粒 的分 类 农杆 菌是一 类 能侵染 植物 受损 伤部 位 ,进 而引起植 物细胞 产生冠 瘿碱 和毛状根 的革 兰 氏阴性 土壤杆 菌。它包括根 癌农 杆菌和发 根农杆菌 两类 。而致 瘤 质粒 (tumor—inducing plasmid,简 称 为 Ti 质粒 )是根癌农杆 菌细胞 拟核 区外 分离 到 的一种 能 自 主复制的双链环状 DNA分 子 ,长度约为 200~250 Kb。 Ti质粒可 以诱导植物 细胞 产生不 同种类 的冠瘿碱 ,根 据产生冠瘿碱 的类型 ,Tj质 粒 可以分 为 4类 :章鱼 碱 型 、胭脂碱型 、农杆碱型和琥珀碱 型…。 1.2 Ti质 粒 的结 构 从 结 构上 看 ,Ti质粒 包 括 T— DNA 区、毒性 区、接合转移 区和复制起始 区 4部分 。其 中 ,T—DNA 区和毒 性 区参与 了外源基 因的转移 整合 , 其结构特 点如下 :①T—DNA 区。该 区是根 癌农杆 菌 侵染植物细胞时 ,Ti质粒 在相 关蛋 白的作 用下 被切 割 下来 整合至植物 基 因组 的一段 DNA分 子。该 区段 分 布一些 与激素合 成相关 的基 因 ,其表 达产物 能引起 植 物细胞激素紊乱 ,进而导致肿 瘤 的形 成 。由于 Ti质 粒 类 型不同 ,T—DNA长度也 有所不 同 ,总体 介于12—24 Kb之间 。其最重要 的 区域是 分别 位 于左 右两端 边 界 处 25 bp的重 复序 列 ,两者在 T—DNA转移外 源基 因整 合 至植物 基 因组 中发挥 功能 ,其 中右边 界序列 的作 用 更 为重要 。② 毒性 区(Vir区 )。该 区是 位 于 T—DNA 以外 的一段 DNA分子 ,长度 介于 30~40 Kb之 间。不 同类 型的 Ti质粒 Vir区结构也 有所 不 同 ,以胭脂 碱 型 rri质粒为例 ,其 Vir区有 7个操 纵子 ,共 22个 基 因,分 别 为 , J—VirB11,VirC1,VirC2,VirD1一D4, VirE1,VirE2,VirG,Virtzs。这 些 基 因 编 码 的 蛋 白 质 在 T—DNA转移整 合 中起辅 助作 用 ,其本 身 不会 与植 物 基 因组 整合 。 2 Ti质粒 的转化 机理
关 于 Ti质 粒 的 改 造 方 法 中 最 常 见 的 是 双 元 载 体 系统 …。前 面提 到 Vir区对 T—DNA的转移至关重要 , 但它并没有和 T—DNA区 连在一 起 。基 于此 ,可 以把 这两个 区段分别 改造 到两个 质粒 上 。通 常是将 含 T— DNA 的质粒称之为微 型 Ti质 粒 ,它缺 失 Vir基 因,但含 有复制起点 、标 记 基 因和 多克 隆位 点 ,能 整 合外 源 基 因 。由于该质粒在大肠杆菌和农杆菌 中均可 以复制 保 存 ,也称之为大肠杆菌一农杆菌穿梭质 粒 。将含一 整套 Vir区基 因但缺失 T—DNA区的质粒称 之为辅 助 Tj质 粒 。两种质粒构建 完成 后 ,采 用一 定 的方 法将 它们 转 入 同一 株 农 杆 菌 中 ,构 成 双 元 载 体 系 统 ,就 能 使 T—DNA整合至植物基 因组 中。此外 ,人们还建立 了共 整合载体 、超级 双元 载体等系统 。 4 Ti质 粒 在 基 因工 程 中 的 适 用 范 围
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