基因芯片技术在常见肠道致病菌感染检测中的应用

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流行病学调查研究。

中图分类号：Ｒ５１２．５
文献标志码：Ａ
文章编号：１００２－２６６Ｘ（２０１３）０４－００２４－０４
ＤｅｔｅｃｔｉｏｎｏｆＣｏｍｍｏｎＩｎｔｅｓｔｉｎａｌＰａｔｈｏｇｅｎｓＩｎｆｅｃｔｉｏｎｗｉｔｈＧｅｎｅＣｈｉｐＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ
ｔｈｅｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙａｎｄｓｐｅｃｉｉｆｃｉｔｙｏｆｇｅｎｅｃｈｉｐｔｅｃｈｎｏｌｏｙ．ＲｅｇｓｕｌｔｓＡｍｏｎｇ１００ｆｅｃａｌｓａｍｐｌｅｓ，５０（５０％）ｓａｍｐｌｅｓｗｅｒｅｐｏｓｉ —
山东医药２０１３年第５３卷第４期
基因芯片技术在常见肠道致病菌感染检测中的应用
戈海泽。梁慧敏，卢晋英，刘树业
（１天津市第三中心医院，天津３００１７０；２天津医科大学）
摘要：目的
建立一种运用ＰＣＲ结合基因芯片技术检测和鉴定引起腹泻的常见肠道致病菌方法。方法
Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＯｂｊｅｃｉｆｖｅＴｏｅｓｔａｂｌｉｓｈａＰＣＲ・Ｇｅｎｅｃｈｉｐｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙｆｏｒｄｅｔｅｃｔｉｎｇｃｏｍｍｏｎｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｐ￣ｈｏｇｅｎｓｔｈａｔｃａｕｓｅｓ
１００份腹泻患者粪便标本通过细菌培养结果，比较基因芯片技术的灵敏性和特异性。结果１００份临床粪便标本
中，采用基因芯片技术共检出５０份（５０％）携带肠道致病菌；细菌培养鉴定出４７份（４７％）携带肠道致病菌，其中４２份基因芯片与细菌培养结果一致，准确率为７９．２５％，与基因芯片比较差异无统计学意义（＝５．２８，Ｐ＞０．０５）。结
根据
生物信息学技术以细菌１６ＳｒＤＮＡ和２３ＳｒＤＮＡ序列设计各细菌的特异型探针和引物，在基因芯片制备基础上，通
过对靶基因的扩增、杂交和对杂交结果的分析，对常见肠道致病菌的检测和鉴定效果进行评价，同时对临床采集
ＧＥＨｎｉ — ｚｅＬＬＩＡＮＧＨｕｉ — ｍｉｎ，ＬＵＪ一ｙｉｎｇ，ＬｌＵＳｈｕ — ｙｅ
，
（１死０ｎｊｉｎ
ＣｅｎｔｒａｌＨｏｓｐｉｔａｌ，死０ｉｎ３００１７０，Ｐ．Ｒ．Ｃｈｉｎａ）
ｔｈｅｄｉａｒｒｈｅａａｎｄｐｒｏｖｉｄｅｔｈｅｔｈｅｏｒｙｉｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎｔｏｔｈｅｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｔｒａｃｔｉｎｌｆａｍｍａｔｉｏｎ．ＭｅｔｈｏｄｓＢｉｏｔｉｎ — ｌａｂｅｌｅｄｕｎｉｖｅｒｓａｌｐｉｍｅｒｒｓｆｏｒａｍｐｌｉｉｃｆａｔｉｏｎｏｆｂａｃｔｅｉａｒｌ１６ＳｒＤＮＡａｎｄ２３ＳｒＤＮＡｗｅｒｅｕｓｅｄｔｏａｍｐｌｉｆｙｅｘｔｒａｃｔｅｄｇｅｎｏｍｅＤＮＡ．Ａｐｐｒａｉｓｉｎｇｔｈｅｄｅｔｅｃｔａｎｄａｕｔｈｅｎｔｉｃａｔｅｅｆｅｃｔｔｈｒｏｕｇｈｅｘｐａｎｄｉｎｇｔｈｅｔａｒｇｅｔｇｅｎｅ，ｔｈｅｈｙｂｒｉｄａｎｄｔｈｅｈｙｂｉｄｒｒｅｓｕｌｔａｎａｌｙｓｉｓ，ｍｅａｎｗｈｉｌｅ１００ｆｅｃｌａｓａｍｐｌｅｓｆｒｏｍｐａｔｉｅｎｔｓｗｉｔｈｄｉａｒｒｈｅａｗｅｒｅｄｅｔｅｃｔｅｄａｎｄｉｄｅｎｔｉｉｆｅｄｕｓｉｎｇｔｈｉｓａｓｓａｙａｎｄｂａｃｉｌｌｉｃｕｌｔｕｒｅｒｅｓｕｌｔｓ，ｔｏｉｎｓｐｅｃｔ
论我们所建立的基因芯片系统具有高通量和高准确性，可以作为临床鉴定细菌的一个重要的工具，而且适用于关键词：基因芯片；肠道致病菌；细菌培养；高通量
ｄｏｉ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００２－２６６Ｘ．２０１３．０４．０８