一株肠道病毒71型广西分离株全基因序列分析
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ｓｆ ａｅ ｅｅｕ ｅ ｎｌｚ ｅｎ ｃｅｔ ｅ， ｍ ｎ ｃｄｓｑ ｅｃ ｎ ｈ ｌ ｅ ｅ ｃｔ ｅｉｃｕ ｉｇＣｕｔ （．） Ｎ Ｓａ， ｏｔ ｒｓ ｒ ｓｄｔ ａａｙｅｔ ｕｌｏ ｄ ａ ｉｏａｉ ｅｕ ｎｅａｄｐ ｙ ｇｎ ｔ ｅ ｌｄｎ ｌｓ ｌ １ ， Ａ ｔｒ ｗ ｗ ｏ ｈ ｉ ｏ ｉ ｒ ｎ ａＸ ８Ｄ
２ ７２ 文 章 编 号 ： １７ ６ ３—７ ５ ２ １）５— ２ ２ ５ ８Ｘ（０ ｏ ０７ —０ １
Ａ ｐｉ ｒｖＭｅ ｐ ｌｄ Ｐｅ ｄ ｅ
，
Ｏｃｏ ｅ ０１ ，Ｖｏ ７ Ｎｏ ５ ｔｂ ｒ ２ １ ｌ１ ．
中 图 分 类 号 ：Ｒ３ ３ ７ ． ２
文 献 标 识 码 ：Ａ
［ ｓｒｃ】Ｏｂｅｔ ｅ Ｔ ｎ ｅｓ ｎ ｈ ｈｒｃｅｉｉｓｏ ｈ ｏ ｌｔ ｎ ｃｅｔ ｅ ａ ｄ ａ ｎ ｃｄ ｓｑ ｅｃｓ ｏ Ａｂｔａ ｔ ｊｃｉ ｏ ｕ ｄ ｒ ａｄ ｔｅ ｃａａｔｒ ｔ ｆｔｅ ｃｍｐｅ ｕｌｏ ｄ ｎ ｍｉｏ ａｉ ｅｕ ｎｅ ｆ ｖ ｔ ｓｃ ｅ ｉ Ｅ ｔ ｏ ｉ ｓ７ Ｅ ７ ） ｏ ｔｄｉ Ｇ ａ ｇｉ ｒｖ ｃ． ｔｏ ｓＴ ｅ１ ａ ｓｏ ｒ ｅ ｏｅｉｇｖ ａ ｇｎｍ ｅｅｕｅ ｏ ｎｅ ｖｒ １（ Ｖ １ｓｌ ｅ ｎ ｕｎｘ ｏｉ ｅ Ｍｅｈ ｄ ｈ ５ｐ ｉ ｆｐｉ ｒｃｖｒ ｉ ｌ ｅｏ ｅｗ ｒ ｓｄｔ ｒ ｕ ｉ ａ Ｐ ｎ ｒ ｍ ｎ ｒ
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应 用覆盖病 毒全基 因组 的 １ 对 特异性 ５ Ｃ ０ 株病毒全基 因组 核苷酸序 列 Ｚ１
引物对 毒株进行 Ｒ — Ｃ Ｔ Ｐ Ｒ扩增 ，Ｐ Ｒ产物直接测 序 ，拼接后 得到全基 因序列 ，应 用 Ｃｕｔ Ｘ １ １ Ｎ Ｓ Ａ Ｃ ｌｓ ｌ （． 、Ｄ Ａ Ｔ Ｒ、Ｍｅａ ａ ８ ｇ ４１ ． 等生物软件进 行核苷酸序列 及氨基酸序列分 析和病毒 的系统进化分析 。结果 长度 为 ７４ ６ ｐ与 中国大陆北京 毒株 Ｂ０ 一 Ｏ ４ ０ ｂ ， Ｊ８ Ｚ １－ 和安徽 阜 阳毒株 Ｆ ｙｎ ．ｎ ｕ／７０／ 整个 基 因组 核苷酸 同源性 为 １ ｕａ ｇ ｈ ｉ ． ２ Ａ １ ８ ９ ．％和 ９ ． ， ８ ８ ８５ 氨基酸 同源性 分别 为９ ． ％ ９７ ％和 ９ ．％；与 Ｅ ７ 国际标 准株 ＭＳ７ ２ ／７ Ｂ Ｃ 基因组核苷 酸同源性仅 ９６ Ｖ１ ／４ ３８ 和 ｒｒ 为 ８ ．％和 ８ ．％ ， １ ７ ０Ｏ 氨基酸 同源性 为 ９ ．％和９ ． ５６ ４９ ％。对外壳蛋 白Ｖ １ Ｐ 编码 区进行种 系发生分析显示 Ｃ ０ 株 为 ｃ 亚 型 Ｚ１ ４
ｅ ａ ． ａ ｇ ｉ ｈ ａ ｇＡｕ ｏ ｏ ｕ ｇ ｏ ｅ ｔｒ ｏ ｔ １Ｇｕ ｎ ￣ Ｚ ｕ ｎ ｔｎ ｍｏ ｓ Ｒｅ ｉｎ Ｃ ｎ ｅ ｆｒＤｉｅ ｓ ｒ ｖ ｎ ｉ ｎ ａ ｄ Ｃ ｎ ｒ ｌ Ｎａ ｎ ｎ ３ ０ ８ Ｃ ｉ ａ ｓ ａ ｅＰ ｅ ｅ ｔ ｎ ｏ ｔ ， ｎ ｉ ｇ５ ０ ２ ， ｈ ｏ ｏ ｎ
Ａｎ ｌｓｓｏ ｅ ｏ ｆａ ｎ ｅ ｏ ｉｕ １ｓｒ ｉ ｓ ｌｔｄｉ ａ ｇ ｉＰ ｏ ｉ ｃ ｕ ｙｎＸＩ Ｚ ｅ － ｕ ，Ｃ ａｙ ｉ ｆｇ ｎ ｍｅｏ ｎｅ ｔｒ ｖｒ ｓ７ ｔａｎ ｉｏａ ｅ ｎ Ｇｕ ｎ ｘ ｒ ｖｎ ｅＢＩＦ — ｉ， Ｅ ｈ ｎ ｇ ｏ ＨＥＮ ｎ ｍｅ Ｍｉ － Ｌ
ห้องสมุดไป่ตู้
的毒株 。结论
Ｅ ７ 型病 毒 Ｃ ０ 株全基 因组 的组成 和结构符合 肠道病毒 特征， Ｖ１ Ｚ１ 与其它 Ｅ ７ 型病 毒具有相 同的基 因 Ｖ１
组结构 ，Ｃ ０ 株是 Ｅ ７ 型的 Ｃ 亚型 的毒株 。 Ｚ１ Ｖ１ ４
［ 关键词】 肠道病毒 ；Ｅ ７ ；全基 因组 ；序列分析 Ｖ１
９ ． ％ ｒ ｓ ｅ ｔ ｅｙ ８５ ｅ ｐ ｃ ｉ ｌ ．ｗｈ ｌ ｈ ｍｉ ｏ ａ ｉ ｏ ｌ ｇｅ ｂ ｔ ｅ ｈ ｍ ｒ ９ ７ ａ ｄ ９ ． ％ ｒ ｓ ｅ ｔ ｅｙＴｈ ｕ ｌｏ ｉ ｅ ｖ ｉ ｔ ｅ ａ ｎ ｃｄ ｈ ｍｏ ｏ ｉｓ ｅｗｅ ｎ ｔ ｅ ｗｅ ｅ ９ ．％ ｎ ９６ ｅ ｅ ｐ ｃ ｉ ｌ ． ｅ ｎ ｃ ｅ ｔｄ ｖ
一
株肠 道病 毒 ７ 型广西分离株全基 因序 列分析 １
宁 ，居 昱 ，莫 兆军 ，谭 毅
广 西 壮 族 自治 区疾 病 预 防 控 制 中心 （ 宁 ５０ ２ ） 南 ３ ０８
闭福 银 ，谢镇 国 ，陈敏 玫 ，周 开娇 ，康
［ 摘要】 目的
了解肠 道病毒 ７ 型 Ｃ ０ 株 的全基 因组分 子特征 。方法 １ Ｚ１
ｃｍ ｌ ｅｇｎｍｅ ｅ ｅｎＣ ０ ｔ ｉ ｎ ｅ ｉｇｓａｎ（Ｊ８ Ｚ １－ ） ｎ ｎｕ ｕ ａｇｓ ａ １．８ ２ ｗ ｒ ８ ％ ａ ｄ ｏ ｐｅ ｅｏ ｓ ｔ ｅ Ｚ １ ｒ ｎａｄＢ ｉｎ ｔ ｉ Ｂ０ － ０ ４ ａｄＡ ｈ ｉ ｙ ｎ ｒｉ ７０ ／） ｅｅ９ ． ｔ ｂｗ ｓａ ｊ ｒ １ Ｆ ｔ ｎ（ ８ ｎ
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２ ７２ 文 章 编 号 ： １７ ６ ３—７ ５ ２ １）５— ２ ２ ５ ８Ｘ（０ ｏ ０７ —０ １
Ａ ｐｉ ｒｖＭｅ ｐ ｌｄ Ｐｅ ｄ ｅ
，
Ｏｃｏ ｅ ０１ ，Ｖｏ ７ Ｎｏ ５ ｔｂ ｒ ２ １ ｌ１ ．
中 图 分 类 号 ：Ｒ３ ３ ７ ． ２
文 献 标 识 码 ：Ａ
［ ｓｒｃ】Ｏｂｅｔ ｅ Ｔ ｎ ｅｓ ｎ ｈ ｈｒｃｅｉｉｓｏ ｈ ｏ ｌｔ ｎ ｃｅｔ ｅ ａ ｄ ａ ｎ ｃｄ ｓｑ ｅｃｓ ｏ Ａｂｔａ ｔ ｊｃｉ ｏ ｕ ｄ ｒ ａｄ ｔｅ ｃａａｔｒ ｔ ｆｔｅ ｃｍｐｅ ｕｌｏ ｄ ｎ ｍｉｏ ａｉ ｅｕ ｎｅ ｆ ｖ ｔ ｓｃ ｅ ｉ Ｅ ｔ ｏ ｉ ｓ７ Ｅ ７ ） ｏ ｔｄｉ Ｇ ａ ｇｉ ｒｖ ｃ． ｔｏ ｓＴ ｅ１ ａ ｓｏ ｒ ｅ ｏｅｉｇｖ ａ ｇｎｍ ｅｅｕｅ ｏ ｎｅ ｖｒ １（ Ｖ １ｓｌ ｅ ｎ ｕｎｘ ｏｉ ｅ Ｍｅｈ ｄ ｈ ５ｐ ｉ ｆｐｉ ｒｃｖｒ ｉ ｌ ｅｏ ｅｗ ｒ ｓｄｔ ｒ ｕ ｉ ａ Ｐ ｎ ｒ ｍ ｎ ｒ
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应 用覆盖病 毒全基 因组 的 １ 对 特异性 ５ Ｃ ０ 株病毒全基 因组 核苷酸序 列 Ｚ１
引物对 毒株进行 Ｒ — Ｃ Ｔ Ｐ Ｒ扩增 ，Ｐ Ｒ产物直接测 序 ，拼接后 得到全基 因序列 ，应 用 Ｃｕｔ Ｘ １ １ Ｎ Ｓ Ａ Ｃ ｌｓ ｌ （． 、Ｄ Ａ Ｔ Ｒ、Ｍｅａ ａ ８ ｇ ４１ ． 等生物软件进 行核苷酸序列 及氨基酸序列分 析和病毒 的系统进化分析 。结果 长度 为 ７４ ６ ｐ与 中国大陆北京 毒株 Ｂ０ 一 Ｏ ４ ０ ｂ ， Ｊ８ Ｚ １－ 和安徽 阜 阳毒株 Ｆ ｙｎ ．ｎ ｕ／７０／ 整个 基 因组 核苷酸 同源性 为 １ ｕａ ｇ ｈ ｉ ． ２ Ａ １ ８ ９ ．％和 ９ ． ， ８ ８ ８５ 氨基酸 同源性 分别 为９ ． ％ ９７ ％和 ９ ．％；与 Ｅ ７ 国际标 准株 ＭＳ７ ２ ／７ Ｂ Ｃ 基因组核苷 酸同源性仅 ９６ Ｖ１ ／４ ３８ 和 ｒｒ 为 ８ ．％和 ８ ．％ ， １ ７ ０Ｏ 氨基酸 同源性 为 ９ ．％和９ ． ５６ ４９ ％。对外壳蛋 白Ｖ １ Ｐ 编码 区进行种 系发生分析显示 Ｃ ０ 株 为 ｃ 亚 型 Ｚ１ ４
ｅ ａ ． ａ ｇ ｉ ｈ ａ ｇＡｕ ｏ ｏ ｕ ｇ ｏ ｅ ｔｒ ｏ ｔ １Ｇｕ ｎ ￣ Ｚ ｕ ｎ ｔｎ ｍｏ ｓ Ｒｅ ｉｎ Ｃ ｎ ｅ ｆｒＤｉｅ ｓ ｒ ｖ ｎ ｉ ｎ ａ ｄ Ｃ ｎ ｒ ｌ Ｎａ ｎ ｎ ３ ０ ８ Ｃ ｉ ａ ｓ ａ ｅＰ ｅ ｅ ｔ ｎ ｏ ｔ ， ｎ ｉ ｇ５ ０ ２ ， ｈ ｏ ｏ ｎ
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ห้องสมุดไป่ตู้
的毒株 。结论
Ｅ ７ 型病 毒 Ｃ ０ 株全基 因组 的组成 和结构符合 肠道病毒 特征， Ｖ１ Ｚ１ 与其它 Ｅ ７ 型病 毒具有相 同的基 因 Ｖ１
组结构 ，Ｃ ０ 株是 Ｅ ７ 型的 Ｃ 亚型 的毒株 。 Ｚ１ Ｖ１ ４
［ 关键词】 肠道病毒 ；Ｅ ７ ；全基 因组 ；序列分析 Ｖ１
９ ． ％ ｒ ｓ ｅ ｔ ｅｙ ８５ ｅ ｐ ｃ ｉ ｌ ．ｗｈ ｌ ｈ ｍｉ ｏ ａ ｉ ｏ ｌ ｇｅ ｂ ｔ ｅ ｈ ｍ ｒ ９ ７ ａ ｄ ９ ． ％ ｒ ｓ ｅ ｔ ｅｙＴｈ ｕ ｌｏ ｉ ｅ ｖ ｉ ｔ ｅ ａ ｎ ｃｄ ｈ ｍｏ ｏ ｉｓ ｅｗｅ ｎ ｔ ｅ ｗｅ ｅ ９ ．％ ｎ ９６ ｅ ｅ ｐ ｃ ｉ ｌ ． ｅ ｎ ｃ ｅ ｔｄ ｖ
一
株肠 道病 毒 ７ 型广西分离株全基 因序 列分析 １
宁 ，居 昱 ，莫 兆军 ，谭 毅
广 西 壮 族 自治 区疾 病 预 防 控 制 中心 （ 宁 ５０ ２ ） 南 ３ ０８
闭福 银 ，谢镇 国 ，陈敏 玫 ，周 开娇 ，康
［ 摘要】 目的
了解肠 道病毒 ７ 型 Ｃ ０ 株 的全基 因组分 子特征 。方法 １ Ｚ１
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