泛素化蛋白修饰教学资料
合集下载
相关主题
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
在Goldberg发明的蛋白酶体抑制剂MG132的基础上研发而成的。 2004年,Ciechanover,Hershko和Rose因发现泛素介导的蛋白质降解共
同获得诺贝尔化学奖。 2008年,Darwin等在细菌中发现类泛素化修饰。
7
Figure 8-34 Ubiquitin (泛素)
泛素由76个氨基酸残基组成,其中包括7个赖氨酸残基(K), 其C末端可与 底物的赖氨酸残基形成异肽键,从而引起底物泛素化。泛素的K11、K29 、K48和K63均能参与形成泛素与泛素间的异肽键 (Isopeptide bond)。
Multiple monoubiquitylation 12
E3的种类
a. RING finger domain(SCF复合体,APC, MDM2, Parkin, 和c-Cb1)
b. U-box domain(CHIP) c. HECT domain(能与底物形成硫酯键) d. N-End Rule
阿龙.西查诺瓦
阿夫拉姆.赫希科
Irwin Rose
欧文.罗斯
3
近年与泛素-蛋白酶体相关的PubMed论 文数在持续增长
篇数
年份 4
本专题内容
1. 泛素-蛋白酶体通路的组成及重要性 2. 泛素化与泛素化酶 3. 去泛素化酶 4. 泛素化异常与人类重大疾病的发生 5. 蛋白酶体构成 6. 蛋白酶体抑制剂与药物 7. 调节蛋白酶体活性的新机制 8. 类泛素蛋白(SUMO, NEDD8, ISG15,
泛素化(ubiquitination)即蛋白质被泛素 (ubiquitin,由76个氨基酸组成的多肽)共价 修饰的过程,在几乎所有的真核细胞活动中起 着关键作用。泛素 –蛋白酶体(proteasome)通 路则是真核细胞内最主要的蛋白质降解途径。 泛素化调控的细胞活动至少包括:
细胞周期(Cell cycle progression) 细胞凋亡(Apoptosis) 转录调控(Transcriptional regulation) DNA修复(DNA repair) 免疫应答(Immune response) 蛋白质降解及质量控制(Protein
13
E3泛素连接酶以单体和复合体两种形式存在
14
去泛素化作用 (Deubiquitination)
Amerik and Hochstrasser, 2004
15
去泛素化酶 (Deubiquitinating enzyme)
去泛素化酶可分为两类:
泛素-C-末端水解酶 ,通常参与蛋白降解后泛素分子的再 利用及对多聚泛素链的修饰,也参与由泛素前体产生泛素 单体的过程(如UCH37、UCH-L1)。 泛素特异性蛋白酶 ,参与去除蛋白质上的多聚泛素链,也 可从短泛素链的末端去掉单个泛素(如USP8)。
Bond)结合。 1977年,Goldberg证明人类细胞中存在一可溶的,直接依赖于能量的非溶
酶体类蛋白酶 。 1978年,Ciechanover 和 Hershko发现了APF-1是Goldberg系统中蛋白酶
系的必要成分,结果发表在BBRC。 1980年,Ciechanover,Hershko和Rose等人证明了APF-1与当时已被发
degradation and quality control ) 2
The Nobel Prize in Chemistry 2004 for the discovery of ubiquitin-mediated proteolysis
Aaron Ciechanover Avram Hershko
泛素化蛋白修饰
泛素-蛋白酶体通路
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
Ub
E1
Ub-E2
底物
ATP AMP+PPi
-E1 Ub
E3 E2
蛋白酶体
Ub: 泛素 (Ubiquitin),一高度保守的,由76个氨基酸组成的多肽。 E1: 泛素激活酶 (Ubiquitin-activating enzyme),人类仅有2种E1。 E2: 泛素载体蛋白 (Ubiquitin-carrier protein), 人类约有 30 种E2s。 E3: 泛素-蛋白连接酶 (Ubiquitin-protein ligase), 人类有500多种E3s 。 9
11
泛素化模式(Ubiquitination Modes)
K48 polyubiquitylation
靶蛋白必须经多聚泛素(多于4个泛 素分子)修饰才能被蛋白酶体识别 与降解。
K63 polyubiquitylation 调节蛋白质的活性和定位
Monoubiquitylation
调节蛋白质内吞,修饰和转录
现的泛素是同一物质 。 1984年,Finley和Varshavsky等发现泛素在细胞周期中的重要性。 1987年,Goldberg和Rechsteiner两个小组几乎同时分离出分子量很大的
依赖于ATP并降解泛素化底物的蛋白水解酶。 1988年,Goldberg将这种蛋白水解酶命名为Proteasome(蛋白酶体)。 1997年,Yeh 等小组发现类泛素蛋白SUMO和NEDD8的功能。 2003年,美国FDA批准了用Velcade来治疗多发性骨髓瘤; Velcade 是
APG8, APG12, PUP等)
5
参考书
《泛素介导的蛋白质降解》
Ubiquitin-Mediated Proteolysis 主编:邱小波 王琛 王琳芳
陈竺和诺贝尔奖得主 Aaron Ciechanover 作序
中国协和医科大学出版社, 2008年
蛋白质泛素化研究简史
1975年,Goldstein误将泛素(Ubiquitin)当作胸腺激素而发现。 1977年,Goldknopf和Busch认定组蛋白2A与泛素以异肽键(Isopeptide
E1与ATP结合后,催化泛素羧基末端 腺嘌呤化,同时释放无机焦磷酸( PPi)。E1活化位点的半胱氨酸硫醇 激活泛素腺嘌呤核苷酸中间产物上的 羧基,形成一个泛素硫酯键。
E2激活的重要条件是位于UBC结构 域的一个保守半胱氨酸催化位点与泛 素羧基端形成一个硫酯键。
E3催化被E2活化的泛素C-端甘氨酸 与底物或下一个泛素的赖氨酸间形成 泛素异肽键 (Isopeptide bond)。
同获得诺贝尔化学奖。 2008年,Darwin等在细菌中发现类泛素化修饰。
7
Figure 8-34 Ubiquitin (泛素)
泛素由76个氨基酸残基组成,其中包括7个赖氨酸残基(K), 其C末端可与 底物的赖氨酸残基形成异肽键,从而引起底物泛素化。泛素的K11、K29 、K48和K63均能参与形成泛素与泛素间的异肽键 (Isopeptide bond)。
Multiple monoubiquitylation 12
E3的种类
a. RING finger domain(SCF复合体,APC, MDM2, Parkin, 和c-Cb1)
b. U-box domain(CHIP) c. HECT domain(能与底物形成硫酯键) d. N-End Rule
阿龙.西查诺瓦
阿夫拉姆.赫希科
Irwin Rose
欧文.罗斯
3
近年与泛素-蛋白酶体相关的PubMed论 文数在持续增长
篇数
年份 4
本专题内容
1. 泛素-蛋白酶体通路的组成及重要性 2. 泛素化与泛素化酶 3. 去泛素化酶 4. 泛素化异常与人类重大疾病的发生 5. 蛋白酶体构成 6. 蛋白酶体抑制剂与药物 7. 调节蛋白酶体活性的新机制 8. 类泛素蛋白(SUMO, NEDD8, ISG15,
泛素化(ubiquitination)即蛋白质被泛素 (ubiquitin,由76个氨基酸组成的多肽)共价 修饰的过程,在几乎所有的真核细胞活动中起 着关键作用。泛素 –蛋白酶体(proteasome)通 路则是真核细胞内最主要的蛋白质降解途径。 泛素化调控的细胞活动至少包括:
细胞周期(Cell cycle progression) 细胞凋亡(Apoptosis) 转录调控(Transcriptional regulation) DNA修复(DNA repair) 免疫应答(Immune response) 蛋白质降解及质量控制(Protein
13
E3泛素连接酶以单体和复合体两种形式存在
14
去泛素化作用 (Deubiquitination)
Amerik and Hochstrasser, 2004
15
去泛素化酶 (Deubiquitinating enzyme)
去泛素化酶可分为两类:
泛素-C-末端水解酶 ,通常参与蛋白降解后泛素分子的再 利用及对多聚泛素链的修饰,也参与由泛素前体产生泛素 单体的过程(如UCH37、UCH-L1)。 泛素特异性蛋白酶 ,参与去除蛋白质上的多聚泛素链,也 可从短泛素链的末端去掉单个泛素(如USP8)。
Bond)结合。 1977年,Goldberg证明人类细胞中存在一可溶的,直接依赖于能量的非溶
酶体类蛋白酶 。 1978年,Ciechanover 和 Hershko发现了APF-1是Goldberg系统中蛋白酶
系的必要成分,结果发表在BBRC。 1980年,Ciechanover,Hershko和Rose等人证明了APF-1与当时已被发
degradation and quality control ) 2
The Nobel Prize in Chemistry 2004 for the discovery of ubiquitin-mediated proteolysis
Aaron Ciechanover Avram Hershko
泛素化蛋白修饰
泛素-蛋白酶体通路
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
Ub
E1
Ub-E2
底物
ATP AMP+PPi
-E1 Ub
E3 E2
蛋白酶体
Ub: 泛素 (Ubiquitin),一高度保守的,由76个氨基酸组成的多肽。 E1: 泛素激活酶 (Ubiquitin-activating enzyme),人类仅有2种E1。 E2: 泛素载体蛋白 (Ubiquitin-carrier protein), 人类约有 30 种E2s。 E3: 泛素-蛋白连接酶 (Ubiquitin-protein ligase), 人类有500多种E3s 。 9
11
泛素化模式(Ubiquitination Modes)
K48 polyubiquitylation
靶蛋白必须经多聚泛素(多于4个泛 素分子)修饰才能被蛋白酶体识别 与降解。
K63 polyubiquitylation 调节蛋白质的活性和定位
Monoubiquitylation
调节蛋白质内吞,修饰和转录
现的泛素是同一物质 。 1984年,Finley和Varshavsky等发现泛素在细胞周期中的重要性。 1987年,Goldberg和Rechsteiner两个小组几乎同时分离出分子量很大的
依赖于ATP并降解泛素化底物的蛋白水解酶。 1988年,Goldberg将这种蛋白水解酶命名为Proteasome(蛋白酶体)。 1997年,Yeh 等小组发现类泛素蛋白SUMO和NEDD8的功能。 2003年,美国FDA批准了用Velcade来治疗多发性骨髓瘤; Velcade 是
APG8, APG12, PUP等)
5
参考书
《泛素介导的蛋白质降解》
Ubiquitin-Mediated Proteolysis 主编:邱小波 王琛 王琳芳
陈竺和诺贝尔奖得主 Aaron Ciechanover 作序
中国协和医科大学出版社, 2008年
蛋白质泛素化研究简史
1975年,Goldstein误将泛素(Ubiquitin)当作胸腺激素而发现。 1977年,Goldknopf和Busch认定组蛋白2A与泛素以异肽键(Isopeptide
E1与ATP结合后,催化泛素羧基末端 腺嘌呤化,同时释放无机焦磷酸( PPi)。E1活化位点的半胱氨酸硫醇 激活泛素腺嘌呤核苷酸中间产物上的 羧基,形成一个泛素硫酯键。
E2激活的重要条件是位于UBC结构 域的一个保守半胱氨酸催化位点与泛 素羧基端形成一个硫酯键。
E3催化被E2活化的泛素C-端甘氨酸 与底物或下一个泛素的赖氨酸间形成 泛素异肽键 (Isopeptide bond)。