氨基酸的合成代谢

第三节氨基酸的合成代谢一、N的来源

二、氨基酸的合成

三、谷氨酸族氨基酸的合成

四、天冬氨酸族丙氨酸族氨基酸的合成

五丝氨酸族氨基酸的合成

六芳香族氨基酸的合成

第四节蛋白质的生物合成

一遗传密码

遗传密码（genetic code): 是指mRNA中对应于氨基酸的核苷酸序列。

密码子（codon）：mRNA上3个相邻的核苷酸序列作为一个密码单位，称密码子。密码子的阅读方向5ˊ→3ˊ

遗传密码的基本特点：

1. 密码无标点符号

是连续阅读的，若插入或删除一个碱基，会使以后的读码发生错误，称为移码。

2. 一般情况下遗传密码是不重叠的

只有少数基因的遗传密码是重叠的。

3. 密码的简并性

几种密码子编码一种氨基酸的现象称为密码子的简并性。如GGN（GGA、GGU、GGG、GGC）都编码Gly，那么这4种密码子就称为Gly的简并密码。只有Met 和Trp没有简并密码。一般情况下密码子的简并性只涉及第三位碱基。

问题：简并性的生物学意义？

A、可以降低由于遗传密码突变造成的灾难性后果

试想，如果每种氨基酸只有一个密码子，那么剩下的44个密码子都了终止子，如果一旦哪个氨基酸的密码子发生了单碱基的点突变，那么极有可能造成肽链合成的过早终止。如GUU编码Ala，由于简并性的存在，不论第三位的U变成什么，都仍然编码Ala

B、可以使DNA上的碱基组成有较达的变化余地，而仍然保持多肽上氨基酸序列不变（意思基本同上）。

4. 密码的摆动性

密码子中第三位碱基与反密码子第一位碱基的配对有时不一定完全遵循A-U、G-C的原则，也就是说密码子的碱基配对只有第一、二位是严谨的，第三位严谨

度低，Crick把这种情况称为摇摆性，有人也称摆动配对或不稳定配对。显然，密码子的第三位和反密码子的第一位是摇摆位点。

1966年F.Crick提出的摆动假说

具体说来，反密码子第一位的G可以与密码子第三位的C、U配对，U可以与A、G配对，另外反密码子中还经常出现罕见的I，可以和密码子的U、C、A配对，这使得该类反密码子的阅读能力更强。

问题：细胞内有几种tRNA？

当遗传密码破译后，由于有61个密码子编码氨基酸，于是人们预测细胞内有61种，但事实上绝大多数细胞内只有50种左右，Crick也正是在这种情况下提出了摇摆假说并合理解释了这种情况。

根据摇摆性和61个密码子，经过仔细计算，要翻译61个密码子至少需要31种tRNA，外加1个起始tRNA，共需32种。但是，在叶绿体和线粒体内，由于基因组很小用到的密码子少，那么，叶绿体内就有30种左右tRNAs，线粒体只有24种。

5.密码的通用性和变异性

在各种生物中几乎完全通用，但发现线粒体有所不同，如人线粒体中UGA编码色氨酸。

6.起始密码子、终止密码子、氨基酸密码子

方向：从mRNA的5’到3’

起始密码子：AUG-蛋氨酸

终子密码子：UAA、UAG、UGA-不编氨基酸

编码一个肽链的所有密码子是一个接着一个地线形排列，密码子之间既不重叠也不间隔，从起始密码子到终止密码子构成一个完整的读码框架（不包括终止子），又称开放阅读框架（ORF）。那么如果在阅读框中插入或删除一个碱基就会使其后的读码发生移位性错误（称为移码）。

需要指出的是，两个基因之间或两个ORF之间可能会互相部分重叠（共用部分序列）。

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