生物化学-核酸PPT课件

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5′pACGTGCGT 3′ ( pACGTGCGT)
U
OH OH OH OH
OH
5’
3’
RNA
5′pApCpGpUOH ′
5′pACGUAUGU 3′
d
pACGUAUGU
二、DNA的二级结构
1.提出DNA双螺旋结构模型的根据 (1)x-光衍射分析
.
27
(2)DNA碱基组成的定量分析
20世纪40年代chargaff规则
β-D-核糖
HOH 2C O H
H OH
OH H
H H
β-D-2-脱氧核糖
HOH 2C O OH
H
H
H OH
H OCH 3
β-D-2-O-甲基核糖
.
16
二、核苷、核苷酸
(一)核苷(nucleoside)
1.核苷的结构
HOH 2C
O
base
H
H
H
H
OH
OH
核苷:含N苷,β-苷
.
17
核苷中戊糖与碱基的连接方式:
(一)类别
nucleic acid
ribonucleic acid, RNA deoxyribonucleic acid, DNA
.
9
(二)分布
DNA ( deoxyribonucleic acid):大部分在核中 RNA ( ribonucleic acid ):核,质均有分布 三种 RNA :tRNA , mRNA, rRNA
Z 细长 左手 1.84nm
0.38nm
12
螺距 碱基倾角
大沟
2.8nm 20°
3.32nm 1°
4.56nm 9°
很窄很深 很宽较深
平坦
小沟
很宽、浅 窄、深
较窄很深
Z-DNA的生物功能:
与基因表达、基因调控有关。
.
38
三、超螺旋结构
噬菌体T2DNA长约50μm E-coli DNA 长约1mm 人生殖细胞DNA长约1m
碱基 戊糖
蛋白质
.
12
一、组成
1.碱基(base):又称含氮碱
(1)嘧啶碱(pyrimidine, Py)
.
13
.
14
(2)嘌呤碱(purine, Pu)
其它嘌呤(核酸的代谢产物): 黄嘌呤、次黄嘌呤、尿酸等
.
15
2.戊糖(pentose)
(1)结构
HOH 2C O H
H OH
OH H
H OH
.
19
2’,3’,5’一核糖核苷酸
(2´-AMP)
(3´-AMP) .
(5´-AMP) 20
.
21
(2)脱氧(核糖)核苷酸
3’,5’一脱氧核糖核苷酸
Deoxyadenosine 3’- monphosphate (3’- dAMP)
Deoxyadenosine 5’- monphosphate (5’- dAMP)
第四章 核酸
主要内容:
主要介绍碱基、 核苷、核苷酸和核 酸的结构、性质和 功能,核酸的分离、 提纯、鉴定等。
.
1
核酸的概述
一、核酸的概念
核酸英文名nucleic acid(NA) 1868年瑞士F. Miescher(米歇尔)发现了核酸。
.
2
作业
.
3
.
4
.
5
.
6
.
7
.
8
二、核酸的类别、分布和组成
NH 2
N
N
9
N
N
HOH 2 C
O
1'
H
H
H
H
OH
OH
腺嘌呤核苷 (adenosine)
NH 2
N
HOH 2 C
1ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
O
N
O
1'
H
H
H
H
OH
H
胞嘧啶脱氧核苷 (deoxycytidne)
.
18
(二)核苷酸(nucleotide, Nt)
1.核苷酸的结构 (1)(核糖)核苷酸(ribonucleotide):
.
39
动态中DNA超螺旋结构
.
40
DNA分子的琼脂糖凝胶电泳图谱
核苷酸夹角为36℃,每一圈10个核苷酸,螺距为
3.4nm。
.
31
脱氧核糖核酸的双螺旋结构稳定因素
1. 氢键 2. 碱基堆集力(base-
stacking forces) 3. 磷酸基上负电荷被胞内组
蛋白或正离子中和 4. 碱基处于疏水环境中
DNA 双螺旋结构的意义
该模型揭示了脱氧核糖核酸作为遗传物质的稳 定性特征,最有价值的是确认了碱基配对原则,这 是脱氧核糖核酸复制、转录和反转录的分子基础, 亦是遗传信息传递和表达的分子基础。该模型的提 出是20世纪生命科学的重大突破之一,它奠定了生 物化学和分子生物学乃至整个生命科学飞速发展的 基石。
1979年美国A·Rich等人发现了左旋DNA(左手 DNA双螺旋结构)
d(CpGpCpGpCpGp) 晶体X-光衍射分析
.
35
.
36
三种 DNA 双螺旋构象比较
外型 螺旋方向 螺旋直径
碱基直升
每圈碱基数
A 粗短 右手 2.55nm
0.23nm
11
B 适中 右手 2.37nm
0.34nm
10.4
.
22
.
23
三、核酸的结构
(一)核酸一级结构
1.核酸分子中核苷酸的连接方式 3 ′, 5 ′—磷酸二酯键
.
24
RNA
.
25
5′-磷酸端(常用5′-P表示);3′-羟基端(常用3′-OH表示) 方向性:注明它的方向是5′→3′或是3′→5′。
多聚核苷酸的表示方式 T
OH
5’
3’
DNA
5′pdApdCpdGpdTOH 3′
( 15% ( 5% )( 80% )
.
10
98 %核中(染色体中)
真核
线粒体( mDNA )
核外
叶绿体( ctDNA )
DNA
拟核
原核
核外:质粒(质体)
病毒: DNA 病毒
.
11
第一节 DNA的结构
核酸是由几十个甚至几千万个核苷酸聚合 而成的具有一定空间结构的大分子化合物。
核蛋白
核酸→核苷酸
磷酸 核苷
① DNA碱基组成有种的特异性,但没有组织、器官特异性。
② A=T;G=C;A+G=T+C
.
28
2.DNA双螺旋结构模型
1953年Watson和Crick提出了DNA双螺旋结构。
.
29

磷酸 核糖 碱基
DNA 双螺旋结构的形成
5


´



3
´
DNA 双螺旋模型主要特征( P167 )
.
33
3.DNA双螺旋的种类
Watson Crick DNA双螺旋结构(B型DNA)
当DNA钠盐纤维相对湿度和盐的种类改变时, DNA的构象发生改变。
不同DNA纤维的空间结构
类型 A B C
结晶状态 Na盐,相对湿度75%时结晶 Na盐,相对湿度92%时结晶 锂盐,相对湿度66%时结晶
.
34
Z-DNA
1. 两条反向平行的多聚核苷酸链沿同一中心轴右旋
相互盘绕而形成。
2. 磷酸和脱氧核糖单位作为不变的骨架组成位于外
侧,糖环平面与中轴平行,作为可变成分的碱基
位于内侧,碱基平面与中轴垂直,链间碱基按A—
T,G—C配对(碱基配对原则,Chargaff定律)

3. 螺旋直径2nm,相邻碱基平面垂直距离0.34nm,两
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