罗非鱼无乳链球菌环介导等温扩增(LAMP)检测技术的建立及应用
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在增加了公共卫生安全的风险,这就需要研发采取一种快速、 1.1.1 细菌菌株 罗非鱼 GBS菌株、大肠杆菌(Escherichia
灵敏和可靠的污染链球菌检测方法,通过采取适当的防控措 coli)、沙 门 氏 菌 (Salmonella)、嗜 水 气 单 胞 菌 (Aeromonas
施,保护易感染群体免受这种人畜共患病原体的侵袭。
optimization of citric acid wastewater treatment and biomass
2017,19:312-321.
productionbyphotosyntheticbacteria[J].Desalination& Water
[17]LiLX,YangXM,LiA,etal.Researchprogressofphotosynthetic
科学基金(编号:2015GXNSFAA139068)。 作者简介:余艳玲(1976—),女,陕西咸阳人,硕士,工程师,主要从事
水产动物分子生物学研究。E-mail:yaeling@126.com。
(Vibriovulnificus)与海豚 链 球 菌 (S.iniae),均 由 广 西 水 产 遗 传育种与健康养殖重点实验室鉴定和保存。 1.1.2 主要试剂 细菌全基因组 DNA提取试剂盒购自北京 康为世纪生物科技有限公司;LoopampDNA扩增试剂盒购自 日本荣研生物科技公司;PCRMasterMix、DNAMarker、钙黄绿
包括野生鱼类[6-7]和养殖鱼类[8-9]严重的疾病,也可导致新生 评价。
儿严重的脑膜炎[10]和成人败血症[11-12]。人类或牲畜的 GBS 对罗非鱼具有潜在的感染性[13],而来自罗非鱼的 GBS也可能 导致人类感染[14]。因此,罗非鱼和 /或水环境中 GBS菌株的存
1 材料与方法 1.1 试验材料
余艳玲1,彭 昊2,冯世文2,张永德1,罗洪林1,李 军2
(1.广西水产科学研究院 /广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西南宁 530021; 2.广西兽医研究所 /广西兽医生物技术重点实验室,广西南宁 530001)
摘要:针对罗非鱼无乳链球菌 Sip基因建立了 LAMP检测方法,并对野外样本进行了无乳链球菌的调查研究。结ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ 表明,目标 Sip基因可在 63℃ 40min内被 LAMP检测到,比 PCR快约 2h,其 DNA检测最低浓度为 3.55×10-5 ng/μL, 灵敏度比 PCR高 100倍,且对参考细菌无扩增。野外样品检测结果表明,运用 LAMP检测技术对 GBS的检出率为 813%,比 PCR高约 20.0%。应用 LAMP和 PCR分别检测健康罗非鱼 GBS检出率 4.4%和 2.2%,检测池塘水样品 GBS检出率分别为 10.0%和 6.7%。 关键词:罗非鱼;无乳链球菌(GBS);环介导等温扩增(LAMP) 中图分类号:S917 文献标志码:A 文章编号:1002-1302(2019)13-0200-04
— 200—
江苏农业科学 2019年第 47卷第 13期
余艳玲,彭 昊,冯世文,等.罗非鱼无乳链球菌环介导等温扩增(LAMP)检测技术的建立及应用[J].江苏农业科学,2019,47(13):200-203. doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2019.13.049
罗非鱼无乳链球菌环介导等温扩增(LAMP) 检测技术的建立及应用
本的检测方法,在等温条件下扩增靶基因核苷酸,通常在 1h 内完成 [15-16],扩增产物 可 通 过 浊 度 或 荧 光 染 料 监 测。 此 外, LAMP检测可 在 野 外 进 行,因 此 可 用 于 现 场 测 定[16]。基 于
族链球菌或 GBS)。过去 5年,由链球菌导致的罗非鱼死亡率 LAMP的优点,本研究开发了一种针对 GBSSip基因可用于野 达 15% ~95% 。 [2] GBS不仅会引起水生或半水生生物 , [4-5] 外现场检测 的 单 步 LAMP法,并 对 其 特 异 性 和 灵 敏 性 进 行
链球菌病已成为全球罗非鱼最严重的疾病之一[1],每年
环介导等温扩 增 技 术 (LAMP)是 一 种 敏 感、快 速 和 低 成
造成的经济损失达 4000多万美元[2-3]。过去数十年,我国 罗非鱼 链 球 病 逐 年 增 长,其 优 势 种 类 已 经 从 海 豚 链 球 菌 (Streptococcusiniae)转变为无乳链球菌(S.agalactiae,也称 B
forremovalofheavy metals,macro- pollutantsand dye from [20]ZhouQ,ZhangG M,LuY F,etal.Feasibilitystudyandprocess
wastewater:areview[J].JournalofWaterProcessEngineering,
hydrophila)、维氏 气 单胞 菌 (Aeromonasveronii)、爱德 华 氏 菌
(Edwardsiellaictaluri)、哈 氏 弧 菌 (Briohatveyi)、创 伤 弧 菌
收稿日期:2018-04-08 基金项目:国家自然科学 基 金 面 上 项 目 (编 号:31372553);广 西 自 然
重庆:西南大学,2015.
[19]宋协法,潘玉兰,马 真,等.单 菌 种 和 混 合 菌 处 理 养 殖 污 水 的
[16]TalaiekhozaniA,RezaniaS.Applicationofphotosyntheticbacteria
效果[J].环境工程学报,2015,9(7):3281-3287.
通信作者:李 军,副研究员,主要从事动物疫病防控与病原分子生 素等,购自天根生化科技(北京)有限公司。
物学研究工作。E-mail:jlee9981@163.com。
1.1.3 待检样品 2014年 7—9月,从野外共收集样品 490
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