最新-2014分子生物学复习资料汇总

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2013-2014分子生物学复习资料

2013-2014分子生物学复习资料

一、中心法则

DNA RNA 蛋白质

二、DNA复制

(一) DNA复制的特点

1、半保留复制

DNA复制时分别以两条亲代链作为模板链通过酶催化各形成一条子代链,亲代链分开处即子代链合成处成为复制叉。

2、半不连续复制

DNA亲代链5’到3’方向的复制时,是以小片段的形式从5’到3’不连续的复制形成冈崎片段,再经DNA连接酶连接形成一条链。

3、RNA的引导

RNA的引导保证DNA复制的高忠实性。

(二) DNA复制所需要的酶

1、原核中:

(1)DNA解旋酶:利用ATP水解的能量解开双链DNA

(2)DNA旋转酶(Ⅱ型拓扑异构酶):引入负超螺旋从而释放正超螺旋。(3)DNA聚合酶Ⅲ:延伸前导链和后随链中的引物。

(4)DNA聚合酶Ⅰ:切除引物。

(5)DNA连接酶:连接冈崎片段形成DNA子代链。

2、真核中:

(1)DNA聚合酶α:前导链和后随链的每个片段都是利用其引发酶活性从RNA 引物开始。

(2)DNA聚合酶δ:在前导链上替代前一种酶继续延伸。

(3)DNA聚合酶ε:在后随链上完成DNA的复制。

(三) DNA聚合酶

1、真核中:真核细胞有5种DNA聚合酶,分别为DNA聚合酶α(定位于胞核,参与复制引发具5-3外切酶活性),β(定位于核内,参与修复,具5-3外

切酶活性),γ(定位于线粒体,参与线粒体复制具5-3和3-5外切活性),δ(定位核,参与复制,具有3-5和5-3外切活性),ε(定位于核,参与损伤修复,具有3-5和5-3外切活性)。

2、原核中:原核细胞有3种DNA聚合酶,都与DNA链的延长有关。DNA聚合酶I是单链多肽,可催化单链或双链DNA 的延长;DNA聚合酶II则与低分子脱氧核苷酸链的延长有关;DNA聚合酶III在细胞中存在的数目不多,是促进DNA 链延长的主要酶。

(四)DNA的损伤与修复

1、诱变

(1)突变

1)点突变:一个单一碱基的改变

转换:嘌呤与嘌呤之间或是嘧啶与嘧啶之间

颠换:嘌呤与嘧啶之间或是嘧啶与嘌呤之间

2)沉默突变:突变发生在DNA的非编码区、非调节区或密码子的第

三个碱基位置,不影响掺进蛋白质中的氨基酸

3)错义突变:突变改变了基因产物的一个氨基酸

4)移码突变:插入或缺失涉及一个或多个碱基的增加或丢失

(2)物理诱变:高能离子化辐射,如X射线、γ射线、紫外线(嘧啶二聚体是常见的一种产物)

(3)化学诱变:碱基类似物(直接诱变)、亚硝酸、烷化剂等

2、损伤

(1)氧化性损伤

(2)烷基化(如MMS、ENU)

(3)聚化加合物

3、修复

(1)光复活:在可见光下,DNA光解酶可将环丁烷嘧啶二聚体再分解为单体

(2)烷基转移酶

(3)切除修复:核苷酸切除修复和碱基切除修复

(4)错配修复

(5)遗传性修复

(五)DNA的克隆

1、DNA的制备

(1)质粒DNA的制备

碱裂解法:从染色体DNA及大部分其他细胞成分中纯化

酚抽提法:采用酚或酚-氯仿混合物进行抽提

乙醇沉淀:

氯化铯梯度法:

(2)噬菌体DNA的制备

2、载体

(1)质粒载体

1)插入失活原理:pBR322及其衍生物包含两个抗生素抗性基因,amp r

和tet r,当目的基因插入其中一个时,会导致该基因失活。

2)蓝白斑筛选:在质粒中含有LacZ基因(编码β-半乳糖苷酶,受

Lac启动子的调控)的α-肽的序列,当无外源DNA片段插入时,质

粒表达α-肽,它与宿主菌的Lac ZM15基因的产物互补,产生有活

性的β-半乳糖苷酶,在含有指示剂X-gal和诱导剂IPTG存在的情

况下,菌落呈蓝色(质粒自身环化);外源基因插入后,肽基因阅

读框架被破坏,细菌内无半乳糖苷酶活性存在,菌落呈白色(阳性克隆)。

(2)噬菌体载体

噬菌体颗粒将其线性DNA 注入细胞,进而DNA 连成环状,其后该DNA 被复制组装成噬菌体颗粒,经裂解细胞释放到胞外,造成细胞死亡,或通过特异位点将其DNA 整合到宿主基因组,而获得长期插入。 (3)其他载体

黏粒载体:利用λ噬菌体cos 位点 YAC :酵母人工染色体 BAC :细菌人工染色体 (六)基因文库

1、基因组文库(DNA 来自基因组DNA )

文库的大小)1(1)

p 1(ln N f n --=

,p 代表给定概率,f 是插入片段大小占总基因大小的

比例。

2、cDNA 文库(DNA 来自群体mRNA 的拷贝) cDNA 第二条链的合成:

a) 自身引物合成法:cDNA/mRNA 杂合体用碱处理后获得单链cDNA ,随即在3’

端形成一个短小的发夹结构,次发夹结构可以作为引物合成第二条链。最后用SI 核酸酶处理除去末端发夹结构,但5’端部分序列会因此而失去。 b) 置换合成法:RNaseH 在mRNA 上产生缺口(内切作用)残存的RNA可以作

为合成第二条链的引物,最后用T4DNA连接酶连接修复缺口。通过这种方法可以获得近乎全长的dscDNA 。

c) 引导合成法:NaoH 降解杂交链中的mRNA ,然后用末端转移酶在cDNA 3'端

加聚C尾巴,以Oligo (dG )为引物合成第二条链,这种方法可获得全长的dscDNA 。 (七)DNA 测序

1、双脱氧链终止法测序的原理

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