植物蛋白质组学

生命科学与技术学院研究生课程简介

课程名称：植物蛋白质组学课程代码：170.515

课程类型：□博士专修课程■硕士专修课程

考核方式：全英文考试教学方式：全英文讲授

适用专业：植物学、生化与分子生物学、

适用层次：■硕士□博士

作物遗传育种等专业

开课学期：秋季总学时：32 学分：2

先修课程要求：生物化学、分子生物学

课程组教师姓名职称专业年龄学术方向

49 植物生化与分子生物学

杨广笑教授生化与分

子生物学

涂知明副教授生化与分

47 植物生化与分子生物学

子生物学

课程负责教师留学经历及学术专长简介：

留学经历：

1996.10—1999.03 在日本筑波大学做博士后研究

1999.04—2005.03 在日本国立农业生物资源研究所任特别研究员

学术专长：

主要从事植物生物化学与分子生物学研究, 内容涉及植物功能基因组学、蛋白质组学、植物储藏蛋白结构与功能、植物激素信号传导的分子机制及其调控的基因表达、植物对逆境反应的分子机理等。

课程教学目标：

蛋白质组学是二十世纪九十年代中期诞生的一门新兴学科，是新世纪生命科学研究的前沿，是应用大规模蛋白质分离和识别技术研究蛋白质组及蛋白质间相互作用的一门学科。本课程着重讲授植物蛋白质组学的基本原理和研究方法，同时介绍植物蛋白质组学研究领域的最新进展。通过本课程的学习，使学生了解并初步掌握植物蛋白质大规模分离、鉴定以及蛋白质间相互的研究手段和实验方法。

课程大纲：（章节目录）

第一章绪论

§1.1 蛋白质组学概念的提出

§1.2 蛋白质组学与基因组学的联系与区别

§1.3 植物蛋白质组学的研究意义和内容

§1.4 植物蛋白质组学的研究现状和发展趋势

第二章蛋白质组学的研究方法

§2.1 概述

§2.2 大规模蛋白质分离技术

§2.3 高通量蛋白质鉴定技术

第三章植物蛋白质提取方法

§3.1 概述

§3.2 TCA-丙酮法提取植物全蛋白质技术

§3.3 顽拗植物蛋白质提取技术

§3.4 木本植物蛋白质提取技术

§3.5 植物种子蛋白质提取技术

§3.6 植物细胞器蛋白质提取技术

第四章蛋白质的分离技术

§4.1 一维等电聚焦电泳

§4.2 Blue-Native凝胶技术分析植物蛋白质复合物

§4.3 二维SDS—聚丙烯酰胺凝胶电泳

§4.4 胶上蛋白的检测

§4.5 存在问题

第五章蛋白质组研究中的图像分析与蛋白谱数据库的建立

§5.1 蛋白电泳图像分析系统

§5.2 实用软件简介

§5.3 二维电泳蛋白谱数据库

第六章蛋白质测序仪与蛋白质的鉴定

§6.1 原理

§6.2 蛋白质序列分析仪和质谱仪优缺点比较

§6.3 样品制备

§6.4 分析与数据检索

第七章基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱

§7.1 MALDI离子源

§7.2 线性飞行时间质量检测器

§7.3 反射飞行时间质量检测器

§7.4 样品制备方法

第八章液相色谱—电喷雾—串联质谱

§8.1 电喷雾电离源

§8.2 串联质谱

第九章肽质量指纹谱鉴定蛋白质技术

§9.1 肽质量指纹谱鉴定蛋白质原理

§9.2 凝胶电泳分离蛋白质PMF鉴定方法

§9.3 凝胶电泳分离蛋白质PMF鉴定方法实例

第十一章肽序列标签与蛋白质从头测序技术

§10.1 串联质谱测定多肽序列原理

§10.2 串联质谱分析肽段序列原理

§10.3 肽序列标签鉴定技术

§10.4 PDS质谱数据库检索鉴定技术

§10.5 从头测序技术

第十一章植物磷酸化蛋白质的鉴定

§11.1 磷酸化蛋白质分析概述

§11.2 磷酸化蛋白质的检测

§11.3 蛋白质磷酸化位点的分析

§11.4 蛋白质磷酸化的定量分析

第十二章植物糖基化蛋白质的鉴定

§12.1 糖蛋白的结构特征

§12.2 生物质谱技术鉴定糖蛋白

§12.3 糖蛋白与蛋白质组学

第十三章利用荧光染料进行定量的植物蛋白质组分析技术§13.1 二维电泳凝胶的荧光染色

§13.2 蛋白质样品的荧光标记与分离

§13.3 图像分析与数据定量

第十四章利用荧光染料进行定量的植物蛋白质组分析技术

§14.1 运用质谱进行定量的植物蛋白质组分析技术

§14.2 稳定同位素代谢标记技术

§14.3 同位素亲和标签技术

第十五章植物蛋白质组研究中的生物信息学

§15.1 生物信息学简介

§15.2 数据库的构建

§15.3 植物蛋白质组研究中常用的网站及数据库

全英文教材：

Plant Proteomics, Methods and Protocols. in：METHODS IN MOLECULAR BIOLOGY, 355, Edited by HervéThiellement; Michel Zivy; Catherine Damerval; Valérie Méchin. Human Press,2007.

主要参考书：

1. Proteomics: From protein sequence to function. Eds S. Pennington & M. Dunn.

2001. BIOS Scientific Publishers

2．蛋白质组学：理论与方法，钱小红、贺福初主编，2003年6月，科学出版社出版。

3. 国内外相关期刊杂志。