实验二 阳性重组质粒的抽提及双酶切鉴定

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实验二阳性重组质粒的抽提及双酶切鉴定

实验目的:练习质粒的抽提及双酶切的实验过程,熟悉相关操作。

实验材料及设备

pMD-T重组质粒;内切酶Xba I 及Pst I;10×M Buffe r;琼脂糖;电泳仪及电泳所需试剂。

实验步骤

A 大肠杆菌的扩繁及质粒DNA碱裂解法抽提

挑取筛选平板上的白色菌落,

接种到5ml LB液体培养基(含100μg/ml Amp)中,

37℃振荡培养约12小时至对数生长后期

取培养液倒入2 ml eppendorf管中,4℃下12000 rpm离心2分钟,去上清

沉淀中加入150 μl溶液I(50 mmol/L 葡萄糖,25 mmol/L Tris.Cl (pH8.0),10mmol/L EDTA (pH8.0)),

剧烈振荡使菌体悬浮,室温下放置5分钟

加入250 μl新配制的溶液II (0.2 mol/L NaOH, 1%SDS, 临用前配制)

盖紧管口,快速温和颠倒eppendorf管数次,

以混匀内容物(千万不要振荡),室温下放置5分钟

加入180 μl预冷的溶液III

(5 mol/L KAc 60ml, 冰醋酸11.5ml, H2O 28.5ml, 定容至100ml , 并高压灭菌)

盖紧管口,并倒置离心管,温和振荡10秒,使沉淀混匀

冰浴10分钟,4℃下12000rpm离心10分钟

上清液移入干净eppendorf管中,计算体积

加入各1/2体积的Tris-饱和酚以及氯仿/异戊醇(24:1),混匀

20℃下12000 rpm离心10分钟,取上清, 计算体积

加等体积的氯仿/异戊醇(24:1),12000 rpm离心10分钟

将上清移入干净eppendorf管中,计算体积

加入2倍体积的无水乙醇

混匀后置于-20℃冰箱中30分钟

然后4℃下12000 rpm离心10分钟

弃上清,将管口敞开倒置于纸巾上使所有液体流出,

用70%乙醇、无水乙醇各洗沉淀一次

将管倒置于纸巾上使液体流尽,室温干燥

将沉淀溶于100 μl TE缓冲液(pH8.0,(含20μg /ml RNaseA )中,储于-20℃冰箱中备用

B 双酶切反应

1、在PCR管中配制下列酶切体系(1×M Buffer):

重组质粒10 ul(未稀释的原液)

ddH2O 6 ul

10×M Buffer 2ul

Xba I 1ul (15 U )

Pst I 1ul (15 U )

总体积20ul

2、反应管置37℃下,酶切反应3~4小时。.

3、酶切反应产物的检测:反应管中加入6×溴酚兰载样缓冲液4 µl,混匀后于1.0%琼脂糖凝胶中电泳,同时取8 µl DNA分子量标准DL2000于样品相邻孔中电泳,紫外光观察仪观察或凝胶成像仪照相。根据分子量标准判断扩增产物大小和大致浓度。本实验中预计酶切产物为844 bp。

C DNA琼脂糖凝胶电泳观察(同实验一)

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