实验二 阳性重组质粒的抽提及双酶切鉴定
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实验二阳性重组质粒的抽提及双酶切鉴定
实验目的:练习质粒的抽提及双酶切的实验过程,熟悉相关操作。
实验材料及设备
pMD-T重组质粒;内切酶Xba I 及Pst I;10×M Buffe r;琼脂糖;电泳仪及电泳所需试剂。
实验步骤
A 大肠杆菌的扩繁及质粒DNA碱裂解法抽提
挑取筛选平板上的白色菌落,
接种到5ml LB液体培养基(含100μg/ml Amp)中,
37℃振荡培养约12小时至对数生长后期
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取培养液倒入2 ml eppendorf管中,4℃下12000 rpm离心2分钟,去上清
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沉淀中加入150 μl溶液I(50 mmol/L 葡萄糖,25 mmol/L Tris.Cl (pH8.0),10mmol/L EDTA (pH8.0)),
剧烈振荡使菌体悬浮,室温下放置5分钟
↓
加入250 μl新配制的溶液II (0.2 mol/L NaOH, 1%SDS, 临用前配制)
盖紧管口,快速温和颠倒eppendorf管数次,
以混匀内容物(千万不要振荡),室温下放置5分钟
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加入180 μl预冷的溶液III
(5 mol/L KAc 60ml, 冰醋酸11.5ml, H2O 28.5ml, 定容至100ml , 并高压灭菌)
盖紧管口,并倒置离心管,温和振荡10秒,使沉淀混匀
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冰浴10分钟,4℃下12000rpm离心10分钟
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上清液移入干净eppendorf管中,计算体积
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加入各1/2体积的Tris-饱和酚以及氯仿/异戊醇(24:1),混匀
20℃下12000 rpm离心10分钟,取上清, 计算体积
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加等体积的氯仿/异戊醇(24:1),12000 rpm离心10分钟
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将上清移入干净eppendorf管中,计算体积
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加入2倍体积的无水乙醇
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混匀后置于-20℃冰箱中30分钟
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然后4℃下12000 rpm离心10分钟
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弃上清,将管口敞开倒置于纸巾上使所有液体流出,
用70%乙醇、无水乙醇各洗沉淀一次
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将管倒置于纸巾上使液体流尽,室温干燥
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将沉淀溶于100 μl TE缓冲液(pH8.0,(含20μg /ml RNaseA )中,储于-20℃冰箱中备用
B 双酶切反应
1、在PCR管中配制下列酶切体系(1×M Buffer):
重组质粒10 ul(未稀释的原液)
ddH2O 6 ul
10×M Buffer 2ul
Xba I 1ul (15 U )
Pst I 1ul (15 U )
总体积20ul
2、反应管置37℃下,酶切反应3~4小时。.
3、酶切反应产物的检测:反应管中加入6×溴酚兰载样缓冲液4 µl,混匀后于1.0%琼脂糖凝胶中电泳,同时取8 µl DNA分子量标准DL2000于样品相邻孔中电泳,紫外光观察仪观察或凝胶成像仪照相。根据分子量标准判断扩增产物大小和大致浓度。本实验中预计酶切产物为844 bp。
C DNA琼脂糖凝胶电泳观察(同实验一)