T载体与目的基因连接
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
一. 重组质粒的构建 T质粒载体
重组的DNA分子是在DNA连接酶的作用下,有Mg2 、ATP存在的连接缓冲系统中,将分别经酶切的载体分子与外源DNA分子进行连接。
DNA连接酶有两种:T4噬菌体DNA连接酶和大肠杆菌DNA连接酶。
两种DNA连接酶都有将两个带有相同粘性末端的DNA分子连在一起的功能,而且T4噬菌体DNA连接酶还有一种大肠杆菌DNA连接酶没有的特性,即能使两个平末端的双链DNA分子连接起来。
但这种连接的效率比粘性末端的连接率低,一般可通过提高T4噬菌体DNA 连接酶浓度或增加DNA浓度来提高平末端的连接效率。
T4噬菌体DNA 连接酶催化DNA 连接反应分为3 步:首先,T4 DNA 连接酶与辅因子ATP形成酶-ATP复合物;然后,酶-ATP复合物再结合到具有5’磷酸基和3’羟基切口的DNA上,使DNA腺苷化;最后产生一个新的磷酸二酯键,把切口封起来。
连接反应通常将两个不同大小的片断相连。
很多DNA聚合酶在进行PCR扩增时会在PCR产物双链DNA每条链的3’端加上一个突出的碱基A。
pUCm-T载体是一种已经线性化的载体,载体每条链的3’端带有一个突出的T。
这样,pUCm-T载体的两端就可以和PCR产物的两端进行正确的AT配对,在连接酶的催化下,就可以把PCR产物连接到pUCm-T载体中,形成含有目的片断的重组载体。
连接反应的温度在37℃时有利于连接酶的活性。
但是在这个温度下粘末端的氢键结合是不稳定的。
因此采取折中的温度,即12-16℃,连接12-16h(过夜),这样既可最大限度地发挥连接酶的活性,又兼顾到短暂配对结构的稳定。
二. 感受态制备原理
细菌在0°C CaCl
低渗溶液中胀成球形,丢失部分膜蛋白,成为容易
2
吸收外源DNA的感受态。
三. β-半乳糖甘酶显色反应选择法
LacZ基因是大肠杆菌乳糖操纵子中的一个基因,可以编码β—半乳糖核苷酶。
β—半乳糖核苷酶是由4个亚基组成的四聚体,可催化乳糖的水解.用X-Gal为底物进行染色时,呈蓝色。
现在一些特定的质粒(比如pUC/pBS等),常带有β—半乳糖核苷酶的调控序列和β—半乳糖核苷酶N端146个氨基酸(α肽段)的编码序列,在这个编码序列里还插入一个多克隆位点(MCS),它并不影响lacZ的表达。
另外,常用的大肠杆菌带有β—半乳糖核苷酶C端部分序列(β肽段),的编码序列。
在各自独立的情况下,这些质粒与大肠杆菌各自编码的β—半乳糖核苷酶片段都没有酶的活性。
只有当携带α
配制每升培养基,应该在950 ml去离子水中加入:胰化蛋白胨 10g 酵母提取物
5g NaCl 10g 摇动容器直至溶质溶解.用5mol/LNaOH调pH至.用去离子水定容至1L.在15psi高压下蒸汽灭菌20min.( 100mlLB培养基加入琼脂粉为固体培养基)LCaCl2:取氯化钙固体定容至10ml
Amp(100mg/ml):溶解氨苄青霉素钠盐于足量的水中,最后定容至1ml,用μm滤膜过滤除菌.
(一).目的基因片段与载体连接
器材
旋涡混合器,微量移液取样器,移液器吸头,微量离心管,双面离心管架,台式离心机,干式恒温气浴。
试剂
T 载体,T4 DNA 连接酶,连接酶缓冲液,无菌dd Water 。
操作步骤
PCR产物与T载体直接连接:
(1)事先将干式恒温仪(或冰盒里的水)温度设定在14~16°C。
(2)取4个灭菌的200ul微量离心管,加入:(需要调整) 4ml 目的基因;1ml T载体; T4 DNA连接酶(TAKARA, 350U/ul);1ml 连接酶缓冲液10 x buffer ;ml dd Water ,总量10ml 体系。
(3)述混合液轻轻震荡后再短暂离心,然后置于14°C干式恒温仪(或14°C 水中)中保温过夜(12-16h)。
(4)连接后的产物可以立即用来转化感受态细胞或置4°C冰箱备用。
(二). 大肠杆菌感受态细胞的制备细菌转化
仪器:旋涡混合器,微量移液取样器,移液器吸头,50ml 微量离心管,微量离心管,台式冷冻离心机,制冰机,恒温摇床,分光光度计,超净工作台,恒温培养箱,摇菌试管,三角烧瓶,接种环,恒温摇床,培养皿(已铺好固体LB-Amp),酒精灯,玻璃涂棒,恒温培养箱,滤膜和过滤器试剂: E. coli菌种,LB培养基, mol/L CaCl2溶液,无菌dd Water ,LB培养基(不加抗菌素),LB培养基(加抗菌素),无菌dd water,IPTG,X-gal。
步骤(1)在超净工作台中,将1ml大肠杆菌菌液加入100ml LB液态培养基(不含抗菌素),37℃摇床培养过夜。
(2)取上述菌液转接到含有50mL LB培养基的三角烧瓶中,37℃下250r/min 摇床培养2~3h,测定OD590为~左右(<~,细胞数<108/mL,此为关键参数!)。
(注意:此步摇菌的时候,要有一管不加菌的LB培养液同时摇菌)
(3)将1ml菌液加入到4支预冷无菌的聚丙烯离心管中,于冰上放置10min,然后于4℃,5000rpm离心5min。
(4)将离心管倒置以倒尽上清液,加入1ml 冰冷的 mol/L CaCl2溶液,立即在涡旋混合器上混匀,插入冰中放置30min。
(5) 4℃,5000rpm离心5min,弃上清液后,用100μL 冰冷的 mol/L CaCl2溶液垂悬,插入冰中放置2h,可以直接用作转化实验,或立即放入-4摄氏度冰柜中保藏。
(6)事先将恒温水浴的温度调到42℃。
(7)从-70℃超低温冰柜中取出一管(100μL)感受态菌,立即用手指加温融化后插入冰上,冰浴5~10min。
(8)加入5μL连接好的质粒混合液(DNA含量不超过100ng),轻轻震荡后放置冰上20min。
(9)轻轻摇匀后插入42℃水浴中90s进行热休克,然后迅速放回冰中,静置
3min。
(10)在超净工作台中向上述各管中分别加入300μL LB培养基(不含抗菌素)轻轻混匀,然后固定到摇床的弹簧架上37℃震荡1h。
(11)在超净工作台中取上述转化混合液200μL,分别滴到含合适抗菌素(Amp 100ug/L)的固体LB平板培养皿中,再在平板上滴加40μL 20mg/ml X-gal,7μL 200mg/ml IPTG,用酒精灯烧过的玻璃涂布棒涂布均匀(注意:一个不含抗生素作为对照组,玻璃涂布棒上的酒精熄灭后稍等片刻,待其冷却后再涂,菌液涂皿操作时,应避免反复来回涂布,因为感受态细菌的细胞壁有了变化,过多的机械挤压涂布会使细胞破裂,影响转化率。
)。
(12)在涂好的培养皿上做上标记,先放置在37℃恒温培养箱中30min直到表面的液体都渗透到培养基里后,再倒置过来放入37℃恒温培养箱过夜。
(13)在被细菌污染的桌面上喷洒70%乙醇,擦干桌面。
(14)观察平板上长出的菌落克隆,以菌落之间能互相分开为好。
注意白色菌斑。
(三). 转化克隆的筛选和鉴定
器材旋涡混合器,小镊子,微量移液取样器,移液器吸头,微量离心管,双面离心管架,干式恒温气浴(或恒温水浴锅),制冰机,恒温摇床,超净工作台,酒精灯,无菌牙签,摇菌管。
试剂LB培养基(加抗菌素),PCR用试剂,引物,质粒提取用试剂,酶切需要的限制性内且酶及其缓冲液,65%甘油(65%甘油,L MgSO4,L Tris Cl )。
操作步骤方法一:快速PCR筛选法
(1)在转化的平板培养基上随机选取4个边缘清晰的白色菌落,并用记号笔在其所在的培养皿底部玻璃背面画圈做标记编号。
(2)在 PCR 微量离心管中配制25μl反应体系。
dd water 16μl
10×PCR buffer(不含MgCl2)μl
25mM MgCl2 μl
L dNTP 2μl(每种dNTP终浓度)
10μmol/L Primer1 1μl(—25pmoles)
10μmol/L primer2 1μl(—25pmoles)
模板质粒用小tip头轻轻粘一下选中的白色菌落,再伸入PCR混合液中洗一洗Taq酶μl()
总体积 25μl
(2)根据厂商的操作手册设置PCR仪的循环程序(本实验室已经设置为WZ):①94℃5min ②94℃1min ③60℃1min ④72℃1min50s⑤goto②29 times ⑥72℃10min (2) PCR结束后,取10μl产物进行琼脂糖凝胶电泳(与原始插入片断同时比对)。
观察胶上是否有预计的主要产物带。
(3)按照编号找到培养皿中的原菌斑。
根据需要进行放大培养提取其质粒
(4)提取到的质粒与原先的空载体(或已知分子量的质粒)再对比电泳,以进一步确认。
方法二:提质粒再PCR或酶切鉴定
(1)在超净工作台中取3支无菌摇菌管,各加入3mL LB(含50mg/mL氨苄青霉素),用记号笔写好编号。
(2)在超净工作台中将70%乙醇浸泡的小镊子头用酒精灯烤过,镊取一支无菌牙签。
用牙签的尖部接触转化的平板培养基上的一个白色菌落,然后将牙签放入盛有3mL LB(含50mg/mL氨苄青霉素)的摇菌管中。
用此法随机取3个白色菌落,分别装入3个摇菌管中。
(3)37℃摇菌过夜后,用碱裂解法分别提取质粒。
摇菌管中的剩余菌液保留在4℃冰箱中。
(4)提取到的3管质粒样品可用PCR法扩增,或用酶切电泳法来鉴定其上是否含有外源插入片断(方法见有关实验)。
(5)将经过鉴定判断为正确的质粒保存。
按照编号找到冰箱中原菌液。
根据需要进行放大培养提取其质粒或进行诱导表达,或取500mL菌液与500mL 65%甘油混合后-80℃保存。
(6)在被细菌污染的桌面上喷洒70%乙醇,擦干桌面。