基于体数据分类的直接体绘制传输函数研究
NPR技术在体绘制中的应用研究

电 子
测
量
技
术
第 3 卷 第 7期 O
20 0 7年 7月
ELE r R0NI C M| EAS UREM ENT TECH N0L GY D
NP R技 术在 体 绘 制 中 的应 用 研 究
周 宁 孙济 洲 张加 万
天津 30 7) 0 0 2 ( 天津大 学计算机 学院
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
作 为一项 重要 的可视 化 技 术 , 接 体绘 制 能 够 显示 出 直
体数据内部精细的结构分布 , 在传统体绘制 中, 一般利用 传递 函数 将感 兴趣 部分 的 数据 显 示 为 图像 。但 是 , 递 函 传
数 调整是 一个 比较 繁琐 的工 作 , 得到 一 幅结 构 清 晰 的 图像 往 往不太 容 易 ; 而且 , 传递 函数 机 制缺 乏 灵活 性 , 般不 能 一 自由控制 绘制 图像 的特 征 和效 果 。 目前 , 效 的传 递 函数 有 设 计仍然 是一个 热 门的研 究领 域[ 。 1 ] 近几 年 , P N R技术 的研究 工作 取得 了很 大 进展 。这 种 技 术可 以使 用 传 统 图形 学 中 的几 何 面 片来 实 现 。Mat rn i
术 与原 始 的 D R(i c vl n ei V dr t ou r dr g直 接体 绘 制 ) e me e n 方 法 。H l g等人介 绍 了一种 两级 体绘 制方 法[ , e wi 7 即体数 据 ] 中不 同的部 分 , 根据 其特性 , 分别 使用 D R、 P 面 绘制 、 V MI 、
中图 分 类 号 :T 3 1 P 9 文 献 标 识 码 :A
Applc to fNPR e hn qu si o u er n rng ia i n o tc i e n v l m e de i
传递函数建模

传递函数建模
传递函数建模是一种将系统的输入与输出之间的关系表示为传递函数的方法。
传递函数(Transfer Function)描述了输入信号与输出信号之间的数学关系,在控制系统中常用于分析系统的动态行为和进行系统设计。
传递函数建模的步骤如下:
1. 系统分析:首先对待建模的系统进行分析,了解系统的输入输出关系。
可以通过实验、观察或数学建模等方法来获取系统的输入输出数据。
2. 建立数学模型:根据系统的输入输出关系,建立系统的数学模型。
传递函数通常是用拉普拉斯变换表示的,可以将系统的输入输出关系表示为一个分子多项式除以一个分母多项式的形式。
3. 参数估计:确定传递函数的参数。
有时候,系统的参数可以通过实验测量得到,或者通过理论分析进行估计。
4. 评估模型:对建立的传递函数模型进行评估,比较模型的输出与实际系统的输出之间的差异,调整模型的参数以提高模型的拟合度。
5. 使用模型:使用建立的传递函数模型进行系统分析和设计。
传递函数可以用于分析系统的稳定性、频率响应、阶跃响应等性能指标,同时也可以用于设计控制器或者滤波器。
总之,传递函数建模是一种对系统进行数学建模的方法,通过建立数学模型来描述输入输出关系,从而分析系统的动态行为和进行系统设计。
基于K-Means++聚类的体绘制高维传递函数设计方法

基于K-Means++聚类的体绘制高维传递函数设计方法岑梓源;李彬;田联房【摘要】如何将体数据中重要的信息高质量地绘制出来是医学可视化急需解决的问题.基于高维直方图的高维传递函数交互设计法是目前流行的方法,但是该方法设计复杂且效果不理想.针对高维特征的传递函数设计问题,提出一个基于改进的K均值(K-Means++)聚类的高维传递函数自动设计与交互式的体绘制方法:首先,对三维数据场进行特征提取;然后,采用基于K-Means++聚类的传递函数自动生成方法;最后,提供便捷的交互式界面给用户进行调整.还利用基于图形处理器(GPU)的体绘制方法,充分利用图形卡的强大并行计算能力,达到实时绘制的效果.实验结果表明,该方法能消除高维传递函数设计的复杂性,并且能有效地融合多种人体组织结构特征,提高渲染效果.%The problem how to render the important information of the volume data qualitatively in medical visualization needs to be resolved urgently. The method of designing high dimensional transfer function interactively according to the high dimension histogram was used widely, but this method is complex and is of low quality. To solve the design problems of the characteristic high dimensional transfer function, a volume rendering method of automatic and interactive design of high dimensional transfer function based on X-Means ++ clustering algorithm was presented in this paper. Firstly, feature extraction was done on the volume data, then to cluster the feature space, X-Means ++ clustering algorithm was used, and the group of label transfer function was generated automatically. Finally, a convenient interactive user interface was provided to users to adjust. The GPU (Graphic Processing Unit) based volumerendering was used to perform the strong parallel computing ability for real-time rendering. The experimental results show that this method can eliminate the complexity of the design of high dimensional transfer function, and many kinds of human body organization structure characteristics can be shown in the rendering results.【期刊名称】《计算机应用》【年(卷),期】2012(032)012【总页数】4页(P3404-3407)【关键词】体绘制;K-Means++;传递函数;人机交互【作者】岑梓源;李彬;田联房【作者单位】华南理工大学自动化科学与工程学院,广州510640;华南理工大学自动化科学与工程学院,广州510640;华南理工大学自动化科学与工程学院,广州510640【正文语种】中文【中图分类】TP391.410 引言医学图像可视化是科学计算可视化技术在医学领域的一个重要应用,它将计算机X 射线断层扫描技术(Computed Tomography,CT)、磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)等影像信息在计算机上重建并直观地显示出三维效果图,从而提供传统医学手段不能获得的人体信息。
基于K均值聚类的体绘制传递函数设计方法研究
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{
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o n= n<NΒιβλιοθήκη +) fr( 0; n+ / 中间变量 , / 保存样 本所属 的类别 / 求得最小距离并最终判别该样本属于 a / 类
+d h Pie e a x l+d l Gr d e t e t a i n a +d l S c r d e t et e ga in ; a
范翠萍 张尤赛
( 江苏科技 大学电子信息学院 江苏 镇 江 22 0 ) 10 3
摘
要
提 出一种基于 K均值聚类算法 的体绘制 多维传 递 函数设 计方法 。在 利用灰 度一 梯度 直方 图分 析体 数据 内部结构 信 息
的基础上 , 应用 K均值聚类算法对整个体数据进 行聚类分类 , 属于不 同聚类 中的体 素俾= 对 进行伪 彩色映射 , 实现体 数据 与彩 色编码 的转换 关系。实验表 明, 用该 方法所设计 的体绘制传递 函数能够揭示体数据 的内部 结构 关系 , 利 重建 的三维图像逼 真 、 质量高 。
第2 8卷 第 9期 21 0 1年 9月
计算 机应 用与软件
Co u e p i ainsa d S f r mp t rAp lc to n o t e wa
V0 . . 128 No 9 S p.2 1 e 01
基 于 K 均 值 聚 类 的体 绘 制 传 递 函数 设 计 方 法 研 究
/ 各个类别中的样本数 /
/ MiDs ne为样本与聚类中心的最小距离 , iac / n iac t Ds ne为样本与聚类 中 t
回
() a 灰度 图像 ( )灰度一梯度直方图 b
图 1 物质边界和直方图曲线
/ 心的距离,et dlY,et ,e ai ldlG ai tdh Se ai t / dl X,ea dl Z dl Px ,et rde ,eaeg de a t a t e a n r n / 分别为样本与聚类中心各特征值差值 的平方 /
直接体绘制中传输函数设计综述

息来区分感兴趣的区域。2 传 输 函数的巨大灵活性。 ) 这个特点能以多种方式可视 化体数据 , 但难 以确定最 合适的可视化方式 。3用户接 口的设计 。传输函数的 )
设计一般需要用户交互地修改。这是因为用户常常需 要观察体数据 内部 的不 同物体 、 同的表面或物体的 不 某一子结构。如在 医疗诊断 中 , 医生需准确地掌握病 灶的大小 、 形状 、 位置及与周 围组织的关 系 , 这就需要 交互地修改传输函数来获取人体 的内部结构信息。另 外, 传输 函数中参数的变化与体绘制结果是非线性的,
值, O是不透 明度值 、 颜色等光学 特征值 。传输 函数
的核心是对体数据进行分类并通过分配不同的光学特 征来去除不感兴趣的对象 , 目的是生成有 意义的图像
以反映体数据中感兴趣 的对 象及 与周 围对象 的关 系。 F一般是分段线性函数 、 多项式 函数和样条函数 , 实际
应用中考虑到计算复杂性 和交互性 , 多采用分段线性
1 传输 函数
从数学角度来说 , 传输 函数是一个标量集 S的笛
卡尔积到光学特征集 O的笛卡尔积 , : 即
F: 1 8 × … × a O1 O2 … × O o S× 2 n × ×
其 中, s可以是体素值 、 体素梯 度幅度 、 梯度 方向 的二阶导 数和等值面 的值等从体 数据 中提取 的特征
函数 , n和 m的值都较小。根据 n值 的大小 , 且 可将 传输函数分为一维传输 函数( =1和多 维传输 函数 ) ( ≥2。根据光学特征集 , n ) 可将传输函数分 为不透 明 度传输函数 ( 只映射到不 透明度值) 和颜 色传输 函数
收稿 日期 :06一 r一o 20 c 7 4
维普资讯
基于均值聚类的体绘制中传递函数的自动产生
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菁口 l
() 3 用下式将 A=Ⅱ更新为A“ ) : ) ( :0
第2 6卷第 6期
20 09年 1 2月
学
学
报
V0 . 6 。 6 1 2 No. De , 0 9 c. 2 0
J u a o at hn ioogUnvri or l fE s iaJatn iest n C y
文 章 编 号 :05— 5 320 )6 05— 4 10 02 (09 0 —06 0
体绘制是 1 种重要的三维数据场可视化算法 , 它是 1 种通过计算彩色半透明体 的二维 映射来呈现三 维空间样条函数的技术。体绘制算法的关键是传递函数的设计 , 它将三维数据场的数据值转换为光学成 像 参数 , 决定 了投 影 图像 的质 量 。 目前 传 递 函数 设计方 法 主要有 手 动调节 法 、 图像 中心 法 、 据 中心 法和对 象 中心 法这 4种方 法 。其 它 数 的有采用 I D T S A A聚类算法对数据场进行聚类 , O 还有利用神经网络和支持向量机等机器学习算法对数据
作者简介 : 马得安 (97 , , 18 一)男 山东 日照人 , 士研 究生 , 硕 研究方 向为图像处理与信息技术 。
华
东
交
通
大
学
学
报
20 09正
1 1 K. a s . men 算法 Km a s . en 算法 的思 想就是 使得被 划分 到 同一 簇 的对象之 问相 似度最 大 , 而不 同簇 之 间的相 似度最 小 。 K均值 算法 【 的一般步 骤如 下 . J ( )假设给出 n个数据点 U={ lu , , , 1 u , 2… ‰}其中 u ( , , 『) . … m ∈ 取定分类数 c2 ≤凡 , ( ≤c )并 初始化 A o∈ , 中 【 其 J
医学体数据三维可视化方法的分类与评价

医学体数据三维可视化方法的分类与评价全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:医学体数据三维可视化方法的分类与评价随着医疗技术的不断发展,医学体数据的采集和分析变得越来越重要。
医学体数据包括CT、MRI等影像数据、生理信号数据、基因组数据等多种形式,这些数据可以帮助医生做出更精准的诊断和治疗方案。
而医学体数据的可视化则是将这些复杂的数据转化为直观、可视化的图像,帮助医生更好地理解和分析这些数据。
医学体数据的三维可视化方法主要分为几种类型,包括体积渲染、曲面重建、虚拟现实等。
每种方法都有其独特的特点和应用场景,下面将逐一介绍这些方法并对其进行评价。
一、体积渲染体积渲染是将医学体数据中的像素值转换为颜色和光照信息,从而呈现出立体感的图像。
体积渲染可以用于显示患者的器官结构、病变部位等信息。
这种方法的优点是能够直观地展示出数据的三维结构,有利于医生观察病灶的位置、形状和大小。
体积渲染的缺点是无法准确刻画组织的细微结构,可能会造成误诊。
二、曲面重建曲面重建是通过对医学体数据进行数学建模,将其转换为曲面模型。
曲面重建可以用于显示人体器官的表面结构,帮助医生更直观地观察器官的形态和位置。
曲面重建的优点是可以准确地展示出组织的表面结构,有利于医生进行手术规划和模拟。
曲面重建的缺点是无法展示出组织的内部结构,可能会忽略一些重要的信息。
三、虚拟现实虚拟现实是将医学体数据呈现为虚拟的三维环境,医生可以通过头戴式显示器等设备进行互动式观察和操作。
虚拟现实可以用于模拟手术过程、进行医学培训等应用。
虚拟现实的优点是可以提供更加生动和直观的体验,有利于医生进行实时交互和训练。
虚拟现实的缺点是设备成本高昂,不太适合普及应用。
综合评价而言,以上三种医学体数据三维可视化方法都有其优点和缺点,应根据具体的应用需求选择合适的方法。
体积渲染适合展示器官的整体结构和位置,曲面重建适合展示组织的表面结构和形态,虚拟现实适合进行模拟手术和医学培训。
体绘制(Volume Rendering)概述

体绘制(Volume Rendering)概述之1:什么是体绘制?2010-11-18 21:39 118人阅读评论(0) 收藏举报/liu_lin_xm/archive/2009/11/22/4850575.aspx摘抄“GPU Programming And Cg Language Primer 1rd Edition” 中文名“GPU编程与CG语言之阳春白雪下里巴人”1982 年2 月,美国国家科学基金会在华盛顿召开了科学可视化技术的首次会议,会议认为“科学家不仅需要分析由计算机得出的计算数据,而且需要了解在计算过程中的数据变换,而这些都需要借助于计算机图形学以及图像处理技术”。
---- 《三维数据场可视化》1.1 节科学计算可视化概述自 20 世纪 80 年代科学计算可视化( Visualization in Scientific Computing )被提出后,三维体数据的可视化逐渐称为发展的重点,并最终形成了体绘制技术领域。
一些文章,甚至是优秀硕博士论文库上的文章,解释体绘制概念时,通常都说“体绘制技术是直接根据三维体数据场信息产生屏幕上的二维图像”,这种说法太过含糊,如果根据三维体数据场信息随便产生一张图像,难道也是体绘制吗?我查找相关文献后,发现这种说法是国外一些文献的误译,例如, M.Levoy 在文章“Display of surfaces from volume data”(文献【 14 】 ) 中提到“volume rendering describes a wide range of techniques for generating images fromthree-dimensional scalar data”,翻译过来就是“体绘制描述了一系列的“根据三维标量数据产生二维图片”的技术”。
注意,人家文章中用的是“描述”,而不是对体绘制下定义。
老实说,老外的这种说法虽然挑不出毛病,但是我依然感觉没有落实到重点。
2021年医学影像成像原理复习题汇编

2021年医学影像成像原理复习题汇编㈠名词解释⒈CT值:CT影像中每个像素所对应的物质对X线线性平均衰减量大小的表示。
CT值定义为将人体被测组织的吸收系数与水的吸收系数的相对值⒉TR(重复时间):从90°脉冲开始至下一次90°脉冲开始的时间间隔。
⒊SNR(信噪比):图像中的信号能量与噪声能量之比。
⒋PACS(图像存档与传输系统):是适应医学影像领域数字化、网络化、信息化发展势的要求,一数字成像、计算机技术和网络技术为基础,以全面解决医学影像获取、显示、处理、储存、传输和管理为目的的综合性规划方案及系统。
⒌螺距:(pitch,P)有关螺旋CT的一个概念。
对单层螺旋CT,各厂家对此定义是统一的,即螺距=球管旋转360度的进床距离/准直宽度。
也即扫描时床进速度与扫描层厚之比。
⒍阳极效应:又称足跟效应,是指在通过X线管长轴且垂直于有效焦点平面内,近阳极端X线强度弱,近阴极端强,最大值约在10°处,其分布是非对称性的,这种现象称为阳极效应。
阳极倾角越小,阳极效应越明显。
⒎自旋-晶格弛豫:(spin��Lattice relaxation)�灿殖谱菹虺谠�(longitudinal relaxation)或T1弛豫。
指平行于外磁场Bo方向的磁化矢量的指数性恢复的过程。
⒏灵敏度:(Sensitivity)也称敏感度,在MR范畴内,是反映磁性核的MR信号可检测程度的指标。
㈡简答与分析论述题⒈分析CR成像基本原理答:X射线入射基于光激励荧光粉(PSP)的成像板(IP)产生一帧潜影(latent image),潜影存储于成像板中。
用激光激励成像板,成像板会发射出和潜影能量分布一致的光,这些光被捕捉后被转换成电信号,从而潜影被转换成可以传输和存储的数字图像。
⒉分析MRI空间分辨力优化的方法与作用答:⑴调整扫描矩阵、FOV 扫描矩阵的大小决定序列中相位编码梯度的步数及频率编码步数,即数据的采样点数。
基于小波变换的传输函数研究
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关键 词 中图分类号 Nhomakorabea体绘制 传 输 函数 小波 变换
T P 3 文献标识码
边 缘检测 多分辨 率分 析
D O I : 1 0 . 3 9 6 9 / j . i s s n . 1 0 0 0 - 3 8 6 x . 2 0 1 3 . 1 1 . 0 8 1
0 引 言
近 年来 , 体 绘制 技术 作 为计 算机 图形 学 的分 支 以 及重 要
1 相关技术
1 . 1 传 输 函数
在体绘制 中, 传输 函数 定义 了体体数 据从体 数据属性 到光 学属性( 不透 明度 、 颜色等 ) 的映射规 则 , 它决定 了体 绘制 的效 果, 是体绘制研究 的关键 。从数 学角度来 说 , 传输 函数的映射关
系如下 :
F: S 1×S 2×… ×S Ⅳ Q 1×Q 2×… ×Q ( 1 )
的可 视化 技 术得 到 了迅 速发 展 , 广 泛 地 应 用 于 医学 、 流 体 力 学、 气 象 等领 域 。与 常规 的 面绘 制 技 术 不 同 , 体 绘 制 技 术 直 接对 所 有得 到 的体 数据 进行 明暗处 理 , 然 后合 成 具 有 三维 效 果 的 图像 。体绘 制 的优 点 是无 需进 行 分 割 即 可直 接 进 行 绘 制, 图像 质 量 高 , 细节描述更加 准确 , 增 强 了整 体 的 绘 制 效 果 。在 体绘 制 中 , 传 输 函 数 定 义 了 体 数 据 属 性 到 光 学 属 性 ( 不透 明度 、 颜色等 ) 的映 射 规 则 , 它 决 定 了 体 绘 制 的效 果 ,
第3 0卷 第 1 1 期
2 0 1 3年 1 1月
VTK中的体绘制方法

基于VolumePro硬件辅助的体绘制方法,成像质量虽然不及光线投射法,但是要比二维纹理映射好。利用VolumePro硬件支持的体绘制速度是最快的,一般每秒至少20帧画面,但目前只支持平行投影且价格昂贵。
每种技术各有其优点和缺点,开发人员应该根据实际需要进行选择。就目前看来,VTK中的光线投射法是应用最多的。这是因为不仅它的成像质量是最好的,而且随着计算机技术的发展和算法的不断改进,其绘制能力也在不断提高。二维纹理映射受限于其成像质量和图形硬件,VolumePro更是由于其价格原因使用较少。
VTK中的光线投射法
(1)不透明度传递函数。该函数确定各体素或单位长度值的不透明度;
(2)颜色传递函数。该函数确定体素的颜色值或者灰度值;
(3)梯度传递函数。该函数确定不同梯度值的不透明度,从而突出不同组织之间的结构和相互之间的层次关系。
在VTK中,使用vtkPiecewiseFunction类来实现传递函数的设计,使用该类中的AddPoint和AddSegment函数来实现数值点的添加。一个简单的传递函数的设计如以下代码所示:
在上述代码中,只需要对最大密度投影函数vtkVolumeRayCastMIPFunction和等值面绘制函数vtkVolumeRayCastIsosurfaceFunction分别初始化,在vtkVolumeRayCastMapper类中的SetVolumeRayCastFunction函数里将体绘制的方法分别进行替换即可实现最大密度投射体绘制和等值面体绘制。
基于梯度特征的医学体绘制传输函数曲线拟合方法

传输 函数 的功 能是 把 体数 据 的信 息 映射 成颜
色、 不透 明度等 光学属 性L , 赋予 每个 体素 。 】并 ] 传输 函数设计 的好坏 , 对体 绘制 的结果 将会产 生 十分 重 要的影 响 。设计 合适 的传输 函数 , 以将 原始数 据 可
a r g a ol m e rc da a Th x rm e a e u t ho t a t me h i a plc b e n t e ul r v u t i t . e e pe i nt l r s l s ws h t he t od s p ia l i
m e ia iu lz to d c 1v s a ia i n.
第 2卷 第 6 3 期
20 0 8年 1 1月 Βιβλιοθήκη 数 据 采
集
与
处
理
Vo1 23 No.6 .
NO V. 2 8 00
J u n l fDaaAc ust n & Prc s ig o r a t q iio o i o e sn
文章 编 号 : 0 4 9 3 ( D 8 O 一 7 6O 10 —0 7 2 0 )6O 5 一5
Ab t a t n me ia o ume r n rng,t e p e i i n he r a —i e twih t e pr cson s r c :I d c lv l e de i h r cson a d t e ltme r s t h e i i a c nd omp a i n r de e mi d y e e s o t e ut to a e t r ne b xp n e f h ge e a i n r c s f r r ns e f c i n r to p o e s o t a f r un ton c v .The t pia r ns e u c i a o p e i i n a d i i — o umi g,t s i s g n ur e y c lt a f r f n ton h s a l w r cs o n stme c ns n hu ti e — e a e g a pp n t t e e me t lne r f c i n. Thi p p r p o s s n w t od r t d by r y ma i g o h s g n i a un to s a e r po e a e me h b s d o h r d e tc r c e itc fv l me d t .The d t a u nd isfr ta d s c nd di a e n t e g a i n ha a t rs iso o u a a a a v l e a t is n e o —
面向台风数据体绘制的传输函数研究

u me r e n d e i r n g t e c h n o l o g y i n m e t e o r o l o ic g a l a r e a , i t i s n e c e s s a r y t o s t u d y a n d d e s i g n t h e t r a n s f e r f u n c t i o n f o r me t e o r o l o i g c a l d a t a v o l u me t e n -
向俊利 范 茵 许 屏 李宝强
( 解放军理工大学气象海洋学院 ( 防化研究院 江苏 南京 2 1 1 1 0 1 ) 北京 1 0 2 2 0 5 )
摘 要
在 直接体绘制 中, 传 输 函数定义 了从数据属性 到光 学属 性的映射关 系, 直接决定 了绘制 的效果 , 是体 绘制研 究的关键技 术之 一。为 了 使体 绘制技术在气象领域真正发挥作用 , 必须结合 气象规 律研究和设 计面 向气象数据体绘 制的传输 函数。研 究 台风 数据 的特点 以及针对 台风数据体绘制 的传输 函数的设计流程 , 在数 据值一 梯度直方 图基础上结合光照参数设计 了台风标量场数据 的
( R e s e a r c h I n s t i t u t e o f C h e mi c a l O e f e n c e , B e j i i n g 1 0 2 2 0 5, C h i n a)
Ab s t r a c t I n d i r e c t v du me r e n d e r i n g, t r a n s f e r f u n c t i o n d e f i n e s t h e ma p p i n g r e l a t i o n f r o m v  ̄u me d a t a p r o p e r t y t o o p t i c a l p r o p e r t y ,t h i s d i -
VTK体绘制讨论_颜色传输函数

VTK体绘制讨论_颜⾊传输函数1.颜⾊传输函数颜⾊传输函数与不透明度传输函数的使⽤类似,⼆者的不同之处在于颜⾊传输函数是将⼀个标量值映射为颜⾊值。
这个颜⾊值可以是RGB值,也可以是HSV值。
VTK颜⾊传输函数采⽤VTKColorTransferFunction类实现,其函数为:1int AddRGBPoint(double x,double r,double g, double b);2int AddHSVPoint(double x,double h,double s,double v);这样就可以实现⼀个RGB断点或者HSV断点的添加,其中x表⽰像素灰度值,r,g,b为映射的RGB分量,h,s,v为映射的HSV颜⾊分量。
当然,颜⾊传输函数也⽀持添加线段的⽅法。
1void AddRGBSegment(double x1, double r1,double g1,double b1, double x2,double r2,double g2,double b2);2void AddHSVSegment(double x1, double h1,double s1,double v1, double x2,double h2,double s2,double v2);颜⾊传输函数标准代码⽚如下:1 vtkSmartPointer<vtkColorTransferFunction> color =2 vtkSmartPointer<vtkColorTransferFunction>::New();3 color->AddRGBPoint(0, 0, 0, 0);4 color->AddRGBPoint(64, 1.0, 0.52, 0.3);5 color->AddRGBPoint(190.0, 1.00, 1.00, 1.00);6 color->AddRGBPoint(220.0, 0.20, 0.20, 0.20);由于VTKVolumeProperty接受两种形式的颜⾊传输函数(灰度或者RGB),⼀次在获取相应的颜⾊传输函数时,需要⾸先判断VTKVolumeProperty已经设置的颜⾊传输类型,其函数为:int GetColorChannels();如果返回为1,则说明设置的是灰度传输函数;如果返回为3,则说明设置的是彩⾊RGB传输函数。
VTK中的体绘制方法[修订]
![VTK中的体绘制方法[修订]](https://img.taocdn.com/s3/m/b5c935d2ba4cf7ec4afe04a1b0717fd5370cb240.png)
VTK中的体绘制方法VTK中的体绘制方法VTK最初是针对医疗领域的应用而设计的,所以对于医疗的可视化方面,如处理CT的扫描数据等,具有强大的功能。
它将在可视化过程中经常遇到的细节屏蔽起来,并封装了一些常用的可视化算法,如将面绘制中常用的MC(Marching Cubes)算法和体绘制中常用的光线投射(Ray-Casting)算法封装成类的形式提供给使用者。
这样在进行医学体数据的可视化时就可以直接使用VTK中已提供的相关类。
VTK主要提供了三种体绘制技术,除了光线投射法外,还有二维纹理映射和基于VolumePro硬件辅助的体绘制。
光线投射法是一种基于图像空间扫描的,生成高质量图像的典型的体绘制算法,基本思想是从图像平面的每个像素都沿着视线方向发出一条射线,此射线穿过体数据集,按一定步长进行采样,由内插计算每个采样点的颜色值和不透明度,然后由前向后或由后向前逐点计算累计的颜色值和不透明度值,直至光线完全被吸收或穿过物体。
该方法能很好地反映物质边界的变化,使用Phong模型,引入镜面反射、漫反射和环境反射能得到很好的光照效果,在医学上可将各组织器官的性质属性、形状特征及相互之间的层次关系表现出来,从而丰富了图像的信息。
二维纹理映射与光线投射法不同,它是基于物体空间扫描的,也就是对物体空间的数据点加以处理,计算每个数据点对屏幕像素的贡献并加以合成,形成最终的图像。
它的绘制速度比光线投射法快上5~10倍,但是成像质量远不及采用三线性插值的光线投射法精确,当视角改变时还会产生伪迹。
基于VolumePro硬件辅助的体绘制方法,成像质量虽然不及光线投射法,但是要比二维纹理映射好。
利用VolumePro硬件支持的体绘制速度是最快的,一般每秒至少20帧画面,但目前只支持平行投影且价格昂贵。
每种技术各有其优点和缺点,开发人员应该根据实际需要进行选择。
就目前看来,VTK中的光线投射法是应用最多的。
这是因为不仅它的成像质量是最好的,而且随着计算机技术的发展和算法的不断改进,其绘制能力也在不断提高。
基于视觉感知增强的最大密度投影算法

知. 我们提 出 了一种 形状感 知增强 的最大密 度投影 算法( S E MI P ) [ , 该方 法利用 经典 的光 照模型 对最大 密度值进
行 光照 明处理, 有效 地增强 了感兴趣 特征 的形状 感知 . 但 是有效梯 度位 置的选 取过分 依赖于 用户手 动调 节的全 局 阂值, 不具有 自适应 性, 而且 基于颜 色 的深度 提示容 易给人 眼视觉 带来歧义, 一定 程度上 影响 了用 户对感 兴趣
特 征密度 值和特 征三 维空 间距离 为标准进 行 区域增长 , 并 最终获 得突 出感兴趣特 征 的绘制 结果. 采用 本文算 法
可 以有效 地增 强感兴 趣特征 的视觉 感知, 有利 于用户 进一 步认知和 分析初 始体 数据, 而且 方便 的交互策 略使 得 本文 算法具 有更强 的实用 性. 本文第 1节 介绍本文 算法 的相关工作 . 第 2节给 出本 文算法 的总体流 程, 并且 详细介 绍本文算 法的各个 步 骤. 第 3节讨论 重要算法 的实现细节 并给 出相关伪码 . 第 4节对 比本 文算法 与传统算法 的实验 结果, 并且通过 用
户 反馈进一 步验证本文算 法的有效 性. 第 5节 总 结 全 文 .
1 相 关 工 作
文献 [ 4 】 首次提 出 D VR 算法, 利用经 典的光学积 分模 型, 考虑采 样点沿 视线方 向吸收和辐射 的能量, 进 而积
分获得可视 化结果. 绘 制 过 程 为
C i = l + ( 1 — 41 ) × C i × A i 4I + ( 1 — 4 ) × 4
:
… L J
其中 i 和c f 表 示第 i 个采样 点的光 学属性, 即通过 T F 映射 获得 的该 采样 点的不透 明度 值和颜 色值; 4。 和
体绘制传输函数与实现.
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体绘制传输函数与实现最近几年来,直接体绘制技术已经成为三维数据场可视化的一种重要方法。
因为它不需要借助中间几何图元,直接将体数据绘制到二维图像屏幕上,能产生高质量的图像,能够清楚地显示物体内部构造的细节信息,因此被宽泛应用到医学、气象学和地质勘探等领域。
展开这方面的研究,拥有重要理论意义和广阔的应用远景。
直接体绘制技术波及的面很广,研究需要多学科的知识,使这方面的研究变得特别困难。
直接体绘制中影响图像成效的要点是传输函数的设计。
传输函数将三维数据场的数据属性映照为光学成像参数,给每个要显示的体素相应的颜色和不透明度等,来显示我们关怀的地区,隐蔽那些我们不关怀的地区。
对用户来说,传输函数设计难度大,调理的参数多,设置参数难度大且费时。
当前的传输函数主要存在以下的问题:缺少数据场的统计分类指导信息,使传输函数设计存在盲目性。
此外一个问题是缺少直观、简短的传输函数参数调理软件。
本论文针对以上两个问题,进行深入探究与研究。
主要工作以下:(1)提出了一种梯度变化的片段采样绘制方法。
该方法有效地减少了采样后交融的次数和计算量,使光芒投射算法绘制的速度提升,本方法在GPU上实现,绘制速度快。
本文提出的两种传输函数设计,其绘制是采纳梯度变化的片段采样绘制方法。
(2)提出了一种按体数据信息的分类方法,该方法依据体数据进行统计,而后按标量值、梯度进行分类。
采纳该方法绘制的图像清楚,并可获取一些重要的体数据信息,帮助用户更精准地设置颜色及不透明度传输函数曲线。
(3)开发了一种交互式的传输函数调理软件。
采纳VTK、Kwwidgets可视化开发包,在VisualStudio2008上开发了该软件。
主要包含体数据的导入、传输函数参数调理、梯度变化的片段采样绘制、图像显示等模块。
该软件方便调理传输函数标量值颜色映照、梯度和不透明映照曲线,而且能够实现局部参数曲线的微调。
同主题文章[1].胡永祥,蒋鸿. 直接体绘制中传输函数设计综述'[J]. 株洲工学院学报.2006.(06)[2].韩秀苓. 管道有源消声器的传输函数剖析与实现'[J]. 电声技术.1995.(05)[3].吴仲乐,王遵亮,罗立民.鉴于可编程图形硬件的直接体绘制方法'[J].生物医学工程研究.2003.(03)[4].郭作玉.首要任务、全方向推动与分类指导'[J].中国信息界.2008.(02)[5].殷浩,戴光明,洪雄.直接体绘制技术在地质体三维可视化中的应用研究'[J].计算机应用研究.2006.(06)[6].黄展鹏,周苏娟,赵洁.直接体绘制加快算法综述'[J].计算机与数字工程.2008.(03)[7].田振清,博战捷.线性网络传输波形的计算机模拟'[J].内蒙古师大学报(自然科学汉文版).1994.(04)[8].内蒙古呼包鄂:对示范公司要点公司分类指导'[J].信息系统工程.2010.(02)[9].王南雄.衡东县增强分类指导机关档案室上等级活动逐渐深入'档案时空.1989.(05)[10].王应生.通用二阶有源R滤波器的组成与剖析'[J].桂林电子工业学院学报.1990.(01)【要点词有关文档搜寻】:计算机应用技术;直接体绘制;传输函数;片段采样绘制方法;分类【作者有关信息搜寻】:浙江工业大学;计算机应用技术; 梁荣华;谭国珍;。
使用 vtk体绘制中常用的光线投射算法

使用 vtk体绘制中常用的光线投射算法使用vtk体绘制中常用的光线投射算法光线投射算法是一种常用的图形学算法,用于模拟光线在三维场景中的传播和交互。
在vtk体绘制中,光线投射算法被广泛应用于体数据的可视化和分析。
光线投射算法基于光线与物体之间的相互作用,通过追踪光线的路径和计算光线与物体的交点来生成图像。
在vtk中,常用的光线投射算法包括体素光线投射、等值面提取和体绘制。
体素光线投射是一种基于体素的光线投射算法,它通过在体数据中追踪光线的路径来实现体的可视化。
该算法首先将体数据划分为一组体素,然后根据光线与体素的交点来计算光线的颜色和透明度。
通过对每个像素进行光线投射计算,可以得到包含体数据信息的图像。
vtk中提供了多种体素光线投射算法的实现,如多通道体素光线投射、多层次体素光线投射等。
等值面提取是一种基于等值面的光线投射算法,它通过在体数据中提取等值面并对等值面进行光线投射计算来实现体的可视化。
等值面是指与体数据中特定数值相等的曲面,它可以用来表示体数据中的特定结构或属性。
通过对等值面进行光线投射计算,可以得到包含等值面信息的图像。
vtk中提供了多种等值面提取算法的实现,如Marching Cubes等。
体绘制是一种基于体数据的光线投射算法,它通过在体数据中追踪光线的路径来实现体的可视化。
与体素光线投射不同,体绘制算法不需要对体数据进行划分,而是直接对体数据进行光线投射计算。
该算法通过追踪光线的路径并计算光线与体数据的交点来生成体绘制图像。
vtk中提供了多种体绘制算法的实现,如体绘制、直接体绘制等。
在vtk中,使用光线投射算法进行体绘制可以通过以下步骤实现:1. 加载体数据:首先需要加载体数据,可以是常见的体数据格式,如DICOM、VTK等。
2. 创建光线投射器:根据需要选择合适的光线投射算法,并创建对应的光线投射器对象。
3. 设置光线投射参数:根据需要设置光线投射器的参数,如光线起点、方向、步长等。
投射因子计算
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投射因子计算作为直观显示和分析复杂3D体数据的重要工具,体绘制在医学成像、计算流体动力学、有限元模型、地球物理学、遥感技术等领域起着至关重要的作用。
一般地,这些大型的体数据来由磁共振成像(MRI)、计算机断层扫描(CT)、卫星成像和声纳等设备采样或通过数值模拟获得。
体绘制旨在将三维体数据投影在二维图像平面上,一个体数据集通常组织为由体素(Voxel)组成的3D数组[1]。
一个体素可以表示各种物理特性(如密度、温度、速度和压力)或其它测量(如面积和体积)。
大型体数据可能包含数以亿计的体素,因此需要大量的存储空间。
在图1中,每一个体素都是均匀等间隔分布的。
此外,其它类型的体数据可以分为曲线网格和非结构化网格。
前者可以认为是由规则网格产生的,后者由任意形状的单元组成。
体绘制技术可以分为三种,分别是直接体绘制技术(Direct Volume Rendering,DVR)、间接体绘制技术(Indirect Volume Rendering,IVR)和最大密度投影法(Maximum Intensity Projection,MIR)[2]。
其中,直接体绘制技术又包括光线投射法(Ray Casting,RC)、抛雪球法(Splatting)、错切-变形算法(Shear-warp)等多种技术。
本文旨在介绍光线投射法原理及绘制流水线,回顾其相关研究进展,实现主要的算法。
光线投射算法光线投射法是一种基于图像序列的直接体绘制技术,由Levoy[3]于1988年提出。
光线投射算法原理与光线跟踪算法(Ray Tracing)不同,光线投射算法的计算不会停留在物体的表面,而会沿着射线穿过物体内部进行采样,且不会产生二次射线。
如图2所示,它通过跟踪从视点到物体的射线将3D标量数据场中的体数据通过科学计算绘制成2D图像。
其基本步骤如图3所示,即从屏幕上每一个像素点出发,沿着视线方向发射出一条光线,当这条光线穿过体数据时,沿着光线方向等距离采样,利用插值计算出采样点的光学属性(如颜色值和不透明度);接着按照从前到后(Front-to-back)或从后到前(Back-to-front)的顺序对光线上的采样点进行合成,计算出这条光线对应的屏幕上像素点的颜色值。
张量场的可视化及其科学应用
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张量场的可视化及其科学应用摘要:三维数据场的可视化是科学计算可视化的一个重要研究领域,其最初的应用大大推动了计算流体动力学的研究。
从标量场数据发展到矢量场和张量场数据的可视化,我们对于新的可视化手段的需求与日俱增。
本文从对三维二阶张量的基本数学分析开始,介绍张量场可视化的几类基本手段,图元法,特征法,艺术法,体绘制法,和形变法。
在此基础上,本文介绍张量场可视化在大脑成像和地质勘探两个科学研究中的具体应用,以探讨其可能的发展方向和前景。
关键词:张量数据;可视化;科学应用按照数据参量的复杂程度,数据场可以分为标量场,矢量场和张量场。
标量场的数据结构简单,每一场点对应单一数据,因此其可视化在已经有了成熟的技术,如体积光线投射,等值面等方法;而矢量场和张量场的可视化则在原有的单一变量的基础上,有了更多的数据维度,如方向,形变等,因此要求了更新、更复杂、更综合的可视化方法。
与矢量场相比,张量场的数据点包含着更大的信息量,其可视化涉及了工程和基础科学的各个领域,因此是目前科学计算可视化的热点,也是难点。
基本方法不同维度与阶数的张量为具体的可视化操作带来了巨大的挑战。
在科学数据可视化的常见情况下,三维二阶对称张量数据是我们需要进行可视化操作的对象,比如流体微团的变形率张量,流体面元的应力张量等等。
三维二阶张量包含个分量,这九个分量的可视化必须建立在统一表现的基础上,才得以显示出整个张量在空间点的数据结构,甚至是物理意义,而不像标量场可视化那样,仅仅关注每个空间点的单一数据。
在我们所讨论的张量可视化的方法和实例中,三维二阶对称张量都是我们的主要的,理想的研究对象。
张量数据可视化的方法主要可以分为以下几类:图元类(glyph),特征类(feature-based),艺术类(art-based),体绘制类(volume-rendered)以及形变类(deformation)。
前两者是最常见的方法,在本文中会重点介绍。
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基于体数据分类的直接体绘制传输函数研究摘要:直接体绘制是形成于20世纪80年代后期的一个新研究领域,本论文提出了一种基于体数据的标量值和梯度的分类方法,采用该方法可获得体数据重要的信息,从而帮助研究人员准确地设置传输函数的不透明度和颜色参数,使绘制的图像更加清晰。
关键词:直接体绘制;分类;传输函数direct volume draw transmission function study based on volume data classificationtan guozhen(zhejiang university science park administrative committee,hangzhou310013,china)abstract:visualization is a new field which forward to in the late 80s’ in the 20th century.we present a data classification method according to gradient and scalar value.it can help researcher to more accurately set the opacity and color transfer function,which can be a clear indication of the inner structure and detail information of volume object.keywords:direct volume rendering;classification;transfer function一、前言体视化[1-2]技术在二十多年的发展历程中,从概念、原理、方法到硬件系统等方面得到了全面发展, 已经形成了一套完整的体系。
当前三维数据场可视化的重要方法之一是直接体绘制技术。
它可以在一幅图像中观察整个体数据场,综合了解各种体数据的标量值等信息分布情况。
它被广泛应用到气象预报、地震勘测、地质、石油勘探、医学诊断等领域。
开展体绘制技术的研究,具有重要理论意义和广阔的应用前景。
直接体绘制的一个核心任务就是体数据的标量值转化颜色、不透明度等光学属性。
这一过程是通过传递函数实现,因此,直接体绘制中图像效果的关键是如何设计传输函数及传输函数的调节。
传输函数【3-15】将三维数据场的数据属性映射为光学成像参数,给每个体素分配不透明度和颜色值,决定该体素是否可见及显示的颜色。
体数据中的体素在绘制的图像中是否可见取决于传递函数分配的不透明度值,感兴趣的体素分配较高的不透明度值,相反则分配较低的不透明度值。
体素在结果图像中的颜色也可以由传递函数确定,通过给不同类的体素分配不同的颜色值可以更加清楚地观察到体数据的内部结构。
从而帮助我们显示那些我们想了解的区域,隐藏那些我们不想了解的区域。
对广大用户来说,传输函数设计非常困难,调节的参数非常多,设置参数时难度很大并且调节参数非常耗费时间。
如果设计传输函数时获得体数据的统计分类信息,使传输函数设计和调节变得简单。
本论文针对传输函数设计存在的问题,进行深入研究与思考。
提出了一种基于体数据内部信息的分类方法,采用该方法可获得一些重要的体数据信息,可以精确地设置传输函数的颜色及不透明度曲线,得到的绘制图像比较清晰。
二、面向医学体数据的分类方法(一)传输函数传输函数是直接体绘制的绘制效果关键因素,决定体数据是否可见及显示的颜色等。
为了有效、清晰的显示与当前应用相关的信息非常重要。
从体数据的标量值、梯度幅值、曲率等数据信息到不透明度、颜色、光亮度的映射用来决定什么需要可视化以及如何可视化,这种变换规则就称为传输函数。
传输函数中,不透明度用来选择哪部分可见,颜色用来设置区分不同物体,通常不同的物体设置不同的颜色。
在传输函数据属性中,需要考虑梯度幅值的大小,梯度幅度越大,对应空间域里该物质是边界的可能性就越大。
将梯度变化大的边界点赋予不同的颜色,可以有效区分不同的物质。
本文采用的二维传输函数【3-15】公式如下:(1)其中f表示三维体数据对应体素颜色的红、绿、蓝三个分量的值或该体素的不透明度值; =1表示该体素完全不透明; =0则表示该体素完全透明,图像上不能显示。
s表示三维体数据对应的标量值。
表示三维体数据的梯度幅值;表示传输函数变换规则。
(二)三维体数据标量值曲线的建立采样点的标量值[5]是医学体数据最常用的数据属性,每个采样点标量值的大小具有特定的意义,用来区分不同的物质。
在医学的ct 扫描图像中,对应于骨骼、肌肉和皮肤等不同密度的物质有不同的标量值。
为了更好的建立三维体数据的标量值曲线,本文采用了最小二乘法的隐式曲线算法。
首先,根据三维数据场的体数据标量值信息,采用最小二乘法来建立一个描述一条光线上标量值的隐式曲线方程。
然后,将插入点调整到所拟合的隐式曲线上,使曲线更接近真实体数据值。
最后,求出三维体数据标量值曲线。
本论文采用了三维医学体数据的大腿标量值的信息,用最小二乘法来建立一个拟合曲线来显示三维体数据标量值见图1。
图1大腿体数据标量值分布曲线图1的横坐标为体数据标量值的大小,纵坐标为该标量值的体素的个数,清楚的显示了三维体数据大腿标量值和该标量值有多少体素。
标量值的体素个数最多的几个点从左到右依次是标量值45的体素有27354个,标量值为912的体素有52721个,标量值为1066的体素有16366个。
从上图可以看出人体大腿的体数据标量值分布比较有规律,软组织的标量值比较小和骨头的标量值比较大。
标量值范围在45附近是软组织,标量值的范围在911附近是骨头,从而可以设置传输函数的重要参数。
(三)体数据标量值梯度幅值曲线的建立三维体数据中同一种物质的标量值通常接近,不同的物质标量值变化很大,梯度幅值能有效度量标量值变化的程度,本文采用公式2计算梯度的变化程度。
(2)从坐标点(2,2)发出的一条垂直z轴的光线,在该光线上取256个点其对应的梯度幅值曲线如下图2所示。
图2梯度幅值曲线横坐标为从坐标点(2,2)发出的一条垂直z轴的光线上256个像素点,纵坐标为该光线上体素的梯度幅值的大小。
左到右梯度幅值变化最大的二点的标量值为48、911。
由梯度的属性得出梯度幅值变化最剧烈的地方就是另外一种物质。
因此,从图2可以得出皮肤、肌肉等软组织标量值范围区间是48左右,骨头的标量值范围区间是911左右。
三、实验结果采用基于体数据信息的统计分类方法确定体数据的标量值区间后,在windows xp系统的visual studio 2008平台上,显卡(gpu)为的配置为nvidia6800,利用opengl图形开发包,采用cg语言编写的光线投射算法,并对大腿体数据进行绘制的效果如图3所示。
图3大腿骨的效果图从图3大腿的绘制效果图可以看出,基于体数据信息分类的方法能精确有效分出大腿软组织和骨头。
采用该方法绘制出的大腿骨图像清晰,且绘制的速度较快。
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