XX生物技术公司蛋白质双向电泳知识学习
蛋白质双向电泳
• 通过10000V高压使得蛋白质按照其等电点特性进行 聚焦 • 步骤:胶条水化、低压除盐、高压聚焦、低压维持
• 聚焦时间:聚焦时间太短,会导致水平和垂直条纹 ; 过长,会造成蛋白图谱变性,在胶条碱性端产生水 平条纹以及蛋白丢失。 • 最佳时间的确定需要根据蛋白样品类型、蛋白载样 量、PH范围和胶条长度来确定。
混合肽
肽指纹图 肽序列质谱数据 蛋白质质量 数据搜索 新的或已知蛋白 蛋白转录后修饰的鉴定 N端测序
蛋白质组分析的首要要求
• 将来自于全细胞、组织或生物体中 所包含的多达几千种混合蛋白质进 行分离、检测和分析 。 • 2-DE技术依然是大多数蛋白质组研 究中分离复杂蛋白质混合物的首选 技术 。
二、双向电泳
(+)
高pH
(+)
高pH
等 电 聚 焦 电 泳 进 行 过 程 中
等 电 聚 焦 电 泳 结 束 后
低pH (-) (-)
低pH
2、胶条平衡
• 一维结束后可马上进行二维电泳,也可 保存在两片塑料膜间于-80°保存数月 • 等电聚焦结束后进行SDS-PAGE电泳之前 需进行胶条平衡,以便于被分离的蛋白 质与SDS充分结合,保证SDS-PAGE电泳 的顺利进行 • 步骤:一般采用两步平衡法,用含SDS、 DTT、尿素和甘油等的缓冲液先平衡一 次,再用碘乙酰胺取代DTT后再平衡一 次
(二)双向电泳
第一向:等电点聚焦(IEF) 第二向:SDS聚丙酰胺凝胶电泳(SDSPAGE)
1、等电点聚焦(IEF) • 原理:是根据蛋白质等电点的不同进行
分离,蛋白质是两性分子,根据其周围环 境PH可以带正电荷,负电荷或静电荷为零。 等电点(PI)是蛋白质所带静电荷为零时 的PH,周围PH小于其PI时,蛋白质带正电 荷,大于PI时带负电荷。IEF对蛋白质处于 一个PH梯度中,在电场的作用下,蛋白质 将移向正极,直至到达等电点,如果蛋白 质在其等电点附近扩散,那么它将带上电 荷重新移回等电点。
蛋白质双向电泳的基本原理(一)
蛋白质双向电泳的基本原理(一)蛋白质双向电泳的基本原理蛋白质双向电泳是一种常用的分离和分析蛋白质的技术方法。
它通过利用蛋白质在电场中移动的特性,结合两个方向的电场,实现对复杂蛋白质混合物的分离和鉴定。
下面将从浅入深地解释蛋白质双向电泳的基本原理。
1. 电泳的基本原理电泳是一种基于物质在电场中迁移的原理,将带电粒子或分子分离开的技术。
在电泳过程中,带电的蛋白质分子会受到电场的作用力而移动,移动的速度与其电荷大小和分子质量有关。
2. 单向电泳的局限性在传统的单向电泳中,蛋白质样品被施加一个方向的电场,使得蛋白质分子按一维的方向进行迁移。
然而,由于蛋白质复杂性和电泳条件的限制,单向电泳难以有效地分离复杂的蛋白质混合物。
3. 双向电泳的优势双向电泳是为了克服单向电泳的局限性,实现更好的分离效果而发展起来的一种电泳技术。
它利用两个方向的电场交替施加,使得蛋白质分子在水平和垂直方向上均发生迁移,从而实现更高分辨率的蛋白质分离。
4. 蛋白质双向电泳的操作步骤•第一维电泳:将蛋白质样品在一个细长的电泳槽中垂直施加电场,使得蛋白质在水平方向上移动。
一般使用等电聚焦(IEF)技术,根据蛋白质的等电点来完成分离。
•电泳缓冲:在第一维电泳过程中,需要使用特定的电泳缓冲液,以确保蛋白质在移动过程中维持稳定的电荷状态。
•Gel转移:第一维电泳后,将蛋白质分离到一根细长的凝胶条上,凝胶条上有各种不同pH值的缓冲液。
•第二维电泳:将凝胶条垂直放置在另一个电泳槽中,施加另一个方向的电场。
凝胶条上的蛋白质会在垂直方向上继续移动,最终得到更高分辨率的蛋白质分离结果。
5. 蛋白质双向电泳的应用蛋白质双向电泳在生物医学和生命科学研究中得到广泛应用。
它被用于分离和鉴定复杂蛋白质混合物,寻找新的蛋白质标记物或生物标志物,研究蛋白质的功能和相互作用等。
6. 结论蛋白质双向电泳是一种重要的分离和鉴定蛋白质的技术方法,通过结合两个方向的电场,实现对复杂蛋白质混合物的高效分离。
双向电泳实验蛋白质样品制备要点
双向电泳实验蛋白质样品制备要点1.选择适合的样品预处理方法:蛋白质样品预处理的方法包括提取、富集和纯化等。
常见的方法有溶细胞法、组织破碎法和亲和层析法等。
根据具体实验目的和样品特点,选择适合的方法进行样品预处理是确保蛋白质样品质量的重要因素。
2. 选择合适的蛋白质溶液:根据目的不同,选择适于蛋白质分离的缓冲液和胶液。
常用的缓冲液有Tris-Glycine、Tris-Tricine和Tris-Acetate等,常用的胶液有聚丙烯酰胺凝胶和聚丙烯酰胺/聚丙烯酰胺共聚物凝胶等。
根据蛋白质的特性和实验要求,选择合适的缓冲液和胶液可以提高分离效果和样品质量。
3. 蛋白质样品质量检测:在进行双向电泳实验前,需要对蛋白质样品进行质量检测。
常见的检测方法包括BCA法、Lowry法和Bradford法等。
这些方法可以测定样品中的蛋白质浓度,以确保实验的准确性和可重复性。
4.样品处理与加载:在进行双向电泳实验时,需要将蛋白质样品进行处理和加载,以便进行分离和鉴定。
样品处理的方法包括蛋白质还原、脱脂和蛋白质标记等。
蛋白质还原可使用还原剂如二巯基乙酸、巴布威和三丁基磺酸等,蛋白质脱脂可使用胰酶和胰酶胰凝乳酶等。
加载样品时,需要控制样品数量和均匀性,避免过多或过少的加载,以避免样品定位和分离差异。
5.电泳条件的优化:电泳条件的选择和优化是双向电泳实验的关键。
根据样品特性和实验目的,调整电场强度、升温速率和电泳时间等参数,以获得较好的分离效果。
此外,还需要注意电泳温度的控制,避免样品的热失活和电场影响。
6.截胶和染色:双向电泳实验结束后,需要进行截胶和染色步骤,以检测和鉴定分离的蛋白质。
截胶可使用染色剂如胭脂红和银染等,染色后可以通过人工或自动扫描仪对蛋白质进行定量和定位。
7. 数据分析和解释:双向电泳实验获得的数据需要进行分析和解释。
常见的数据分析方法包括质谱分析、2D胶电泳图像比较和蛋白质鉴定工具(如万得鉴定和Mascot等)。
双向电泳的概念和原理
双向电泳的概念和原理双向电泳是一种应用在生物和化学实验中的分子电泳技术,它能够将完整的分子进行分离,从而实现提取特定的分子组份。
一、双向电泳的概念双向电泳是一种分子技术,它能够将分子分开并且分离出它们内部的活性组分。
利用电泳技术,可以把一些我们有利用价值的分子聚集到集簇中,把其它不要的环境分子分离出去。
通常情况下,电泳是通过具有某种特殊电势的电流来将分子分离的。
由于双向电泳技术,可以利用液相层析原理,将不同的分子聚集到不同的集簇中,从而把其它的不需要的或者有害的分子挤出去。
二、双向电泳的原理双向电泳的原理是利用电流来将分子进行分离,因此在实践过程中,首先需要构建一个体系,在该体系中,利用某种特殊的电流,生成一种能够将分子分解的条件。
首先,将样品加入到某种带有类似电流的环境中,当样品中的分子接触到了这种带有电流的环境,就会形成一种吸引力,从而使分子受到电流的作用,接着分子中的活性组分也会朝着电流的方向而移动。
而由于这种电流的作用,活性组分会被吸引到这种电流的反方向,使得活性组分能够从样品中分离出来,这就是双向电泳的原理。
三、双向电泳的应用双向电泳技术在生物和化学实验中都有广泛的应用,在蛋白质纯化实验、肽段分离实验等实验中,都可以利用双向电泳技术实现分子的精确分离。
此外,双向电泳技术在疾病的早期筛查中也可以发挥着重要的作用,比如癌症的筛查,可以利用双向电泳技术来检测出肿瘤细胞中的活性组分,为早期筛查提供重要的依据。
四、双向电泳的优势双向电泳技术有着诸多优势,首先,双向电泳技术具有准确性高的优势,可以把不同组分的分子成功地分离出来;其次,双向电泳技术操作简单,可以节省大量的实验时间;最后,双向电泳技术可以把活性分子完美的纯净,大大提高了实验的效率。
总之,双向电泳是一种广泛应用的分子技术,它能够把完整的分子进行分离,从而实现提取特定的分子组份。
双向电泳技术实用性强,可以应用在生物和化学试验中,为后续实验提供重要的依据和有效的结果。
简述双向电泳的原理
简述双向电泳的原理
双向电泳是一种在凝胶电泳中使用的技术,用于分离和分析DNA、RNA、蛋白质等生物分子。
其原理是利用两个方向的电场来推动待分离的生物分子,以便在凝胶中获得更好的分离效果。
在双向电泳中,首先在一个方向上施加电场,使待分离的生物分子向一个方向移动。
然后,改变电场的方向,使其在另一个方向上移动。
这样,生物分子会在两个方向上进行移动,从而实现更好的分离效果。
双向电泳的原理涉及到凝胶电泳和电泳技术。
在凝胶电泳中,待分离的生物分子会在凝胶矩阵中随着电场的作用而移动,根据其大小和电荷的不同而被分离开来。
而双向电泳则是在凝胶电泳的基础上,通过改变电场的方向,使生物分子在两个方向上移动,以获得更好的分离效果。
双向电泳在生物分子分离和分析中具有重要的应用,尤其在蛋白质分离和分析中,可以帮助科研人员更准确地分离和鉴定不同的蛋白质。
通过掌握双向电泳的原理和技术,科研人员可以更好地开展生物分子研究,为生命科学领域的发展做出贡献。
总之,双向电泳的原理是利用两个方向的电场来推动待分离的生物分子,在凝胶中实现更好的分离效果,具有重要的生物分子分离和分析应用。
双向电泳操作步骤
双向电泳操作步骤双向电泳是一种常用的蛋白质分离和纯化方法。
下面是一篇超过1200字的双向电泳操作步骤:双向电泳是一种通过两个不同方向的电场来进行蛋白质分离的方法。
它可以更好地区分具有不同等电点和分子质量的蛋白质,并用于研究蛋白质组学以及生物化学等领域。
以下是一般的双向电泳操作步骤:1.确保准备充足的电泳装置,包括双向电泳槽、平衡缓冲液、电泳缓冲液、电泳细胞等。
2.准备样品:将待分离的蛋白质样品进行适当的前处理,包括样品提取、蛋白质浓缩、去除干扰物等。
将样品溶解在适当的电泳缓冲液中。
3.将样品加载到电泳槽中:在准备好的电泳缓冲液中加入样品,然后将样品加载到电泳槽中的样品孔中。
注意,为了保持电泳稳定性,在样品孔加载样品后,要尽快将缓冲液加入到其他储备槽以保持全面和均匀的电解质浓度。
4.进行等电点电泳:将电泳槽中的样品浸没在平衡缓冲液中,并在两侧分别连接正负极。
设置合适的电流和电压,开始进行等电点电泳。
在等电点电泳过程中,蛋白质根据它们的等电点被定向地分离。
5.停止等电点电泳:根据需要进行电泳时间的设定,一般情况下为2-3小时。
等电点电泳时间结束后,关闭电源,并小心地取出电泳舱。
6.水平电泳:停止等电点电泳后,将样品塘从上清洗掉,并用水平电泳缓冲液进行冲洗。
然后,在两侧连接正负极,设置合适的电流和电压,开始水平电泳。
在水平电泳过程中,蛋白质根据它们的分子质量被定向地分离。
7.停止水平电泳:根据需要进行电泳时间的设定,一般情况下为4-5小时。
水平电泳时间结束后,关闭电源,并小心地取出电泳舱。
8.染色和图像采集:将分离完毕的样品进行染色,常用的染色方法包括银染和荧光染色。
然后,使用图像采集系统获取电泳图像,可根据需要调整采集参数。
9.数据分析和解释:通过对电泳图像的分析,包括珠状图、分子质量标准物的修正和待测蛋白质的标定等,将分离出来的蛋白质鉴定和定位。
10. 验证和验证:对其中感兴趣的蛋白质进行验证和验证。
双向电泳的原理及应用
双向电泳的原理及应用1. 原理双向电泳是一种重要的分析技术,常用于蛋白质分离与分析。
其原理基于电泳的基本原理,即物质在电场中受到电荷、质量和形状等因素的共同作用,从而在电场中发生运动。
双向电泳通过对样品进行两个方向的电场应用,实现更高分辨率和更好的分离效果。
在双向电泳中,通常使用一种特殊的电泳胶介质,如聚丙烯酰胺凝胶。
这种凝胶具有较低的电导率,在电场作用下可以形成均匀的凝胶基质。
样品中的蛋白质等分子在凝胶中进行移动,并且根据其电荷、大小和形状等特性,会在凝胶中形成不同的运动带。
双向电泳分为两个步骤:水平电泳和垂直电泳。
在水平电泳过程中,样品在水平方向上进行迁移,此时电场垂直于凝胶表面。
水平电泳的主要目的是将样品在水平方向上分离。
在水平电泳完成后,凝胶需要旋转90度,以改变电场的方向。
然后进行垂直电泳,在垂直方向上进行迁移实现更好的分离效果。
2. 应用双向电泳在生化研究、蛋白质分析和疾病诊断等领域有着广泛的应用。
以下是双向电泳的几个主要应用:2.1 蛋白质分离与分析双向电泳被广泛用于蛋白质的分离与分析。
由于双向电泳具有更高的分辨率和更好的分离效果,因此可以更准确地分离出复杂的蛋白质混合物。
通过双向电泳,可以确定蛋白质的分子量、等电点和表达量等参数,从而有助于对蛋白质的功能和调控机制进行研究。
2.2 蛋白质组学研究蛋白质组学是研究生物体内所有蛋白质的组成、结构、功能和相互作用等的科学研究领域。
双向电泳作为蛋白质组学研究中的一种重要技术,可以用于发现新的蛋白质、识别蛋白质变异以及研究蛋白质表达与疾病之间的关系。
2.3 差异蛋白质的筛选差异蛋白质是指在不同生物状态或疾病状态下表达差异显著的蛋白质。
双向电泳技术可以用于筛选并分离出差异蛋白质,通过比较不同样品中的蛋白质模式,可以挖掘出与特定生物过程、疾病发生和进展相关联的差异蛋白质。
2.4 新药研发与药物安全性评价双向电泳技术可以应用于新药研发以及药物安全性评价等领域。
双向电泳的应用和原理
双向电泳的应用和原理应用双向电泳是一种常用的生物分析技术,常用于蛋白质分析和DNA分析等领域。
以下是双向电泳的一些主要应用:1.蛋白质分析:双向电泳被广泛用于蛋白质分析。
通过将样品中的蛋白质分离成不同的带,可以进一步研究蛋白质的结构和功能。
2.DNA测序:双向电泳也可以用于DNA测序。
通过将DNA片段分离成不同的带,可以确定DNA的序列。
3.肿瘤标记物检测:双向电泳可以用于检测肿瘤标记物,从而帮助早期诊断和治疗。
4.药物筛选:双向电泳可以用于筛选新药物的研究。
通过比较不同试验条件下的蛋白质表达,可以确定新药物的作用机制。
5.疾病研究:双向电泳可以用于研究不同疾病的发生机制和治疗靶点。
通过比较患者样本和正常对照的蛋白质表达,可以发现与疾病相关的蛋白质变化。
原理双向电泳是将电泳技术应用于两个方向的分离,以实现更高分辨率的分析。
以下是双向电泳的基本原理:1.等位点电泳:双向电泳始于等位点电泳(IEF),即根据蛋白质的等电点将其分离成不同的带。
蛋白质在直流电场下会在电极之间移动,直到达到与环境中的离子浓度相等的位置。
这样,蛋白质就能被固定在凝胶中的特定位置。
2.SDS-PAGE:随后,使用聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)将蛋白质按照其分子量进一步分离。
在SDS-PAGE中,SDS(十二烷基硫酸钠)会使蛋白质带负电荷,从而使蛋白质按照其分子量在电场下移动。
3.双向电泳:在双向电泳中,IEF和SDS-PAGE两个步骤结合在一起。
首先,将样品在一维的IEF凝胶中进行等位点电泳分离。
然后,将等位点电泳的凝胶旋转90度,将其置于SDS-PAGE凝胶上。
这样,样品就可以在两个方向上进行电泳分离。
4.分析结果:双向电泳结束后,可以通过染色或质谱分析等方法来可视化和分析分离的蛋白质带。
比较不同样品的带的强度和位置可以得出有关蛋白质表达和组成的信息。
双向电泳的原理和应用使其成为生物学和生物医学研究中不可或缺的工具。
双向电泳的基本原理
双向电泳的基本原理
双向电泳是蛋白质组学研究中最重要的技术,在蛋白质组学研究中发挥了重要作用。
其基本原理是:样品中含有两种或两种以上不同分子量的蛋白质,它们的分子量分布不同,在加有等电聚焦(IEF)等电聚焦缓冲液的一台凝胶电泳仪(如UMEACO)上,蛋白质分子按其大小和分子量进行分离,并可在不同的pH 范围内进行电泳。
由于等电聚焦缓冲液具有强的选择性,不同分子量的蛋白质在同一胶上得到分离,经凝胶染色后在垂直于凝胶的方向上能显示出清晰的条带。
蛋白质分子量大的向小的方向移动,分子量小的向大的方向移动。
每一条带就是一个独立的分子。
双向电泳技术可以大大缩短实验时间、降低实验成本、提高分析效率。
例如:已知蛋白序列为a/b/c,对某一蛋白进行研究,只需分离出a/b/c三条带,再经双向电泳技术分离后即可得到含有三条带的蛋白质条带。
双向电泳技术是蛋白质组学研究中最重要的技术之一,其基本原理是:将样品制备成胶后,在垂直于凝胶电泳方向上将蛋白进行分离。
—— 1 —1 —。
《蛋白质双向电泳》课件
目录 Contents
• 蛋白质双向电泳概述 • 实验流程与技术 • 双向电泳的优缺点 • 双向电泳的应用实例 • 未来展望与研究方向
01
蛋白质双向电泳概述
定义与原理
定义
蛋白质双向电泳是一种分离和鉴定蛋白质混合物的技术,通过两次不同pH值 的电泳分离蛋白质。
原理
利用蛋白质的电荷和分子量差异,在电场中实现分离。在第一向电泳中,蛋白 质根据等电点不同被分离;在第二向电泳中,蛋白质根据分子量被分离。
蛋白质组学与其他技术的结合
与质谱技术联用
01
将蛋白质双向电泳技术与质谱技术联用,实现蛋白质
的精准鉴定和定量分析。
与基因组学、代谢组学等多学科交叉
02 将蛋白质双Hale Waihona Puke 电泳技术与基因组学、代谢组学等多学
科交叉,全面解析生命活动的调控机制。
与单细胞技术结合
03
将蛋白质双向电泳技术与单细胞技术结合,揭示单个
蛋白质定量
选择合适的蛋白质定量方法:如BCA 法、Lowry法等,确保准确性。
按照定量方法操作步骤进行定量,记 录数据并进行分析。
蛋白质溶解与分离
溶解蛋白质
将蛋白质样品溶解于适当的缓冲液中 ,以便进行电泳分离。
电泳分离
将溶解的蛋白质样品进行等电聚焦电 泳和SDS-PAGE电泳,实现蛋白质的 分离。
凝胶染色与图像分析
凝胶染色
采用银染、考马斯亮蓝染色等方法对凝胶上的蛋白质进行染 色。
图像分析
对染色后的凝胶进行拍照,并利用相关软件进行蛋白质点的 检测、匹配和比较分析。
03
双向电泳的优缺点
优点
高分辨率
双向电泳可以根据蛋白质的等电 点和分子量进行分离,具有较高 的分辨率,能够分离出更多的蛋 白质。
双向电泳的原理和应用
双向电泳的原理和应用1. 原理双向电泳(Bidirectional Electrophoresis)是一种常用的电泳技术,可以有效分离和分析复杂样品中的蛋白质和核酸。
其原理是基于物质在电场中的带电性质和不同分子的迁移速度差异。
双向电泳采用两个电场分别作用于样品,一个在水平方向,另一个在垂直方向。
这两个电场的方向相反,使得样品分子在两个方向上均受到电场力的作用。
在水平方向上,电场力使得样品分子在凝胶中做两个方向的扩散;在垂直方向上,电荷的作用力使得样品分子沿凝胶向电极方向迁移。
通过双向电泳,样品分子在水平和垂直方向上的运动会发生偏移,从而实现蛋白质和核酸的分离。
根据分子的大小、形状和电荷等特性,不同的分子在双向电泳中会有不同的迁移速度,从而形成不同的带状图案。
这些图案可以被进一步分析和检测。
2. 应用双向电泳在生物科学研究和生物医学应用中具有广泛的应用,主要体现在以下几个方面:2.1 蛋白质分析双向电泳是蛋白质分析的一种重要方法。
通过双向电泳,可以将混合蛋白质样品进行分离,从而得到各自独立的蛋白质条带。
根据蛋白质条带的位置和数量可以推测样品中不同蛋白质的类型和相对含量。
这对于研究蛋白质的功能和相互作用非常有帮助。
2.2 新药开发双向电泳可以用于筛选和分析药物作用的靶向蛋白质。
通过比较药物处理前后的双向电泳图案,可以确定哪些蛋白质与药物有关。
这对于新药的开发和评估起到了重要的作用。
2.3 基因分析双向电泳也可以用于基因分析。
通过将DNA样品置于双向电泳中,可以将DNA的不同片段分离和检测。
这对于研究基因的结构、功能和突变等起到了关键作用。
2.4 生物标记物检测在临床诊断中,双向电泳可以用于检测特定蛋白质标记物,如肿瘤标志物。
通过分析血液或组织中的蛋白质条带,可以辅助诊断和评估疾病的发展和治疗效果。
结论双向电泳以其独特的分离原理和广泛的应用领域,在生物科学研究和生物医学领域发挥着越来越重要的作用。
它在蛋白质分析、新药开发、基因分析和生物标记物检测等方面具有广阔的应用前景。
双向电泳操作步骤蛋白质技术
双向电泳操作步骤-蛋白质技术水化上样(被动上样)1 .从冰箱中取出IPG胶条,室温放置IOmin o2 .沿水化盘槽的边缘从左向右线性加入样品,槽两端各Icm左右不加样,中间的样品液一定要连贯。
注意:不要产生气泡,否则会影响胶条中蛋白质的分布。
3 .用银子轻轻撕去IPG胶条上的保护层。
注意:碱性端较脆弱,应小心操作。
4 .将IPG胶条胶面朝下轻轻置于水化盘中样品溶液上。
注意:不要将样品溶液弄到胶条背面,因为这些溶液不会被胶条吸收;还使胶条下面的溶液产生气泡。
如产生了气泡,用镜子轻轻地提起胶条的一端,上下移动胶条,直到气泡被赶走。
5 .放置30~45min大部分样品被胶条吸收,沿着胶条缓慢加入矿物油,每根胶条约3m1(17cmIPG),防止胶条水化过程中液体蒸发。
6 .置等电聚焦仪于-20。
C水化11〜15h。
第一向等电聚焦1 .将纸电极置于聚焦盘的正负极上,加ddH205~8μ1润湿。
2 .取出水化好的胶条,提起一端将矿物油沥干,胶面朝下,将其置于刚好润湿的滤纸片上杂交以去除表面上的不溶物。
3 .将IPG胶条胶面朝下置于聚焦盘中,胶条的正极(标有+)对应于聚焦盘的正极,确保胶条与电极紧密接触。
4 .在每根胶条上覆盖2-3m1矿物油。
5 .对好正、负极,盖上盖子。
设置等电聚焦程序。
6 .聚焦结束的胶条,立即进行平衡、第二向SDS-PAGE电泳。
或将胶条置于样品水化盘中,-20。
水箱保存,电泳前取出胶条,室温放置10分钟,使其溶解。
第二向SDS-PAGE电泳1 .配制12%的丙烯酰胺凝胶。
2 .待凝胶凝固后,倒去分离胶表面的MiI1iQ水、乙醇或水饱和正丁醇,用MiIIiQ水冲洗。
3 .配制胶条平衡缓冲液I4 .在桌上先放置干的厚滤纸,聚焦好的胶条胶面朝上放在干的厚滤纸上。
将另一份厚滤纸用Mi1IiQ水浸湿,挤去多余水分,然后直接置于胶条上,轻轻吸干胶条上的矿物油及多余样品,这样可以减少凝胶染色时出现的纵条纹。
双向电泳法
双向电泳法双向电泳法(Bidimensional Electrophoresis,2-DE)是一种常用的蛋白质分离技术,可以同时分析样品中上千种蛋白质。
本文将详细介绍双向电泳法的原理、步骤和应用。
原理双向电泳法结合了等电聚焦(IEF)和SDS-PAGE两种技术,通过两个维度的分离将复杂的蛋白质混合物分解为一系列单独的斑点。
在第一维度中,根据蛋白质的等电点(pI)进行分离;在第二维度中,根据蛋白质的分子量进行分离。
通过将这两个维度的分离结果叠加,可以获得高分辨率的蛋白质图谱。
双向电泳法的关键步骤如下:1.等电聚焦(IEF):在第一维度中,使用等电聚焦技术将样品中的蛋白质按照其等电点进行分离。
等电聚焦是一种基于蛋白质在电场中向氧化物离子(OH-)或氢离子(H+)方向移动的分离方法。
在等电聚焦过程中,蛋白质会在pH梯度中向其等电点迁移,直到净电荷为零。
通过控制pH梯度和应用的电压,可以将蛋白质在等电聚焦过程中分离开。
2.SDS-PAGE分离:在第二维度中,将第一维度的等电聚焦凝胶与SDS-PAGE凝胶垂直叠加。
在SDS-PAGE凝胶中,蛋白质通过聚丙烯酰胺凝胶的孔隙随着电场的作用向阳极迁移。
由于SDS(十二烷基硫酸钠)的存在,蛋白质在SDS-PAGE凝胶中的迁移速度与其分子量成反比。
因此,蛋白质在SDS-PAGE 凝胶中会根据其分子量进行分离。
3.染色和分析:经过双向电泳分离后,凝胶可以通过染色方法显示出一系列斑点,每个斑点代表一个蛋白质。
常用的染色方法包括银染法、荧光染色、贵金属染色等。
对于银染法,它在灵敏度和线性范围上具有优势。
染色后可以使用成像设备捕捉图像并进行定量分析。
通过对斑点的比较和定量,可以识别不同样品之间的差异和变化。
步骤双向电泳法的步骤如下:1.样品制备:将待分析的生物样品(如细胞提取物)进行蛋白质提取,并使得蛋白质在石蜡中可溶解。
常用的方法包括总蛋白提取、亲和层析、激光捕获等。
2.等电聚焦(IEF):将蛋白质样品与具有连续pH梯度的凝胶进行接触。
蛋白质双向电泳
模块五蛋白质双向电泳1. 实验目的掌握双向电泳能根据等电点和分子量分离蛋白质的原理,第一向等电聚焦电泳(IEF)和第二向聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)操作步骤,掌握凝胶染色方法,掌握凝胶分析软件的使用,了解对分离出的特异蛋白质的进一步分析方法,了解利用电泳技术分析生物大分子的方法。
2. 实验原理从广义上讲,双向电泳是将样品电泳后为了不同的目的在垂直方向再进行一次电泳的方法。
目前蛋白质双向电泳常用的组合第一向为等电聚焦(载体两性电解质pH梯度或固相pH梯度),根据蛋白质等电点进行分离,第二向为SDS-PAGE,根据相对分子质量分离蛋白质。
这样经过两次分离后,在凝胶上显示出的蛋白点可以获得蛋白质等电点和相对分子质量信息。
双向电泳技术作为分离蛋白质的经典方法,目前得到了相当广泛的应用。
在植物研究中,成功建立了拟南芥、水稻、玉米等植物种类的双向电泳图谱数据库,对推动植物蛋白质组研究起到重要作用。
第一向等电聚焦:等电聚焦(isoelectrofocusing,IEF)是在凝胶柱中加入一种称为两性电解质载体(ampholyte)的物质,从而使凝胶柱在电场中形成稳定、连续和线性pH梯度。
以电泳观点看,蛋白质最主要的特点是它的带电行为,它们在不同的pH值环境中带不同数量的正电荷或负电荷,只有在某一pH时,蛋白质的净电荷为零,此pH即为该蛋白质的等电点(isoeletric point,PI)。
在电场中,蛋白质分子在大于其等电点的pH环境中以阴离子形式向正极移动,在小于其等电点的pH 环境中以阳离子形式向负极移动。
如果在pH梯度环境中将含有各种不同等电点的蛋白质混合样品进行电泳,不管混合蛋白质分子的原始分布如何,都将按照它们各自的等电点大小在pH梯度某一位置进行聚集,聚焦部位的蛋白质质点的净电荷为零,测定聚焦部位的pH即可知道该蛋白质的等电点。
第二向SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳:SDS是一种阴离子表面活性剂,当向蛋白质溶液中加入足够量的SDS时,形成了蛋白质-SDS复合物,这使得蛋白质从电荷和构象上都发生了改变。
双向电泳的原理
双向电泳的原理双向电泳是一种用于分离和分析蛋白质和核酸的技术。
它通过两个方向上的电场来实现分离,是一种高效的电泳技术。
双向电泳的原理涉及到凝胶电泳和两个方向上的电场,下面将详细介绍双向电泳的原理。
首先,双向电泳使用凝胶作为分离介质。
凝胶电泳是一种利用凝胶作为分离介质的电泳技术,通过凝胶孔隙的大小和形状来实现对分子的分离。
凝胶可以是聚丙烯酰胺凝胶、琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶等。
在双向电泳中,凝胶可以根据需要调整孔隙大小和形状,以实现对不同大小和电荷的分子的分离。
其次,双向电泳使用两个方向上的电场。
在双向电泳中,样品在水平方向上进行电泳分离,然后在垂直方向上进行电泳分离。
这样可以使得样品在两个方向上都得到有效的分离,提高了分离效率和分辨率。
通过在两个方向上施加不同的电场,可以实现对样品的双向分离。
双向电泳的原理是基于分子的大小和电荷来实现分离。
在水平方向上,分子根据大小被分离,较小的分子移动得更快,较大的分子移动得更慢。
在垂直方向上,分子根据电荷被分离,带正电荷的分子向一个方向移动,带负电荷的分子向另一个方向移动。
通过这种方式,可以实现对复杂混合物中不同分子的高效分离。
双向电泳在生物学和生物化学领域有着广泛的应用。
它可以用于分离和鉴定复杂混合物中的蛋白质和核酸,对于研究细胞信号转导、蛋白质相互作用、基因表达调控等具有重要意义。
双向电泳的原理和技术不断得到改进和完善,使得其在生命科学研究中发挥着越来越重要的作用。
总之,双向电泳是一种基于凝胶电泳和双向电场的分离技术,利用分子的大小和电荷来实现高效的分离。
它在生物学和生物化学领域有着广泛的应用前景,为研究复杂混合物中的蛋白质和核酸提供了重要的技术支持。
随着技术的不断进步,双向电泳将会发挥越来越重要的作用,为生命科学研究带来新的突破和进展。
实验八 蛋白质双向电泳
蛋白质双向电泳【实验目的】1、学习和掌握蛋白质双向电泳的基本原理和方法。
2、了解双向电泳技术在蛋白质组学研究中的应用。
【实验原理】蛋白质的双向电泳的第一向为等电聚焦(Isoelectrofocusing, IEF),根据蛋白质的等电点(pI,isoelectric point)不同进行分离;第二向为SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),按蛋白质亚基分子量大小(Mr, relative molecule)进行分离。
经过电荷和分子量两次分离后,可以得到蛋白质分子的等电点和分子量信息。
等电聚焦(IEF, isoelectric focusing)是一种特殊的聚丙烯酰胺凝胶电泳,其特点是在凝胶中加入一种两性电解质载体,从而使凝胶在电场中形成连续的pH梯度。
蛋白质是典型的两性电解质分子,它在大于其等电点的pH环境中以阴离子形式向电场的正极移动,在小于其等电点的pH环境中以阳离子形式向负极移动。
这种泳动只有在等于等电点的pH环境中才停止。
如果在一种pH梯度的环境中将含有各种不同等电点的蛋白质混合样品进行电泳,那么在电场作用下,不管这一群混杂的蛋白质分子原始分布如何,各蛋白质分子将按照它们各自的等电点大小在pH梯度相对应的位置进行聚集经过一定时间后,不同的蛋白质组分便分割在不同的区域之中。
这个过程称作等电聚焦,蛋白质聚集的部位蛋白质所带电荷为零,测定此部位的pH值,即可知该蛋白质的等电点。
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),主要用于测定蛋白质亚基分子量,SDS是一种阴离子去污剂,作为变性剂和助溶剂,它能断裂分子内和分子间的氢键,使分子去折叠,破坏蛋白质分子的二级和三级结构。
强还原剂(DTT,二硫苏糖醇)则能使半光氨酸残基之间的二硫键段裂。
在样品和凝胶中加入SDS和还原剂后,分子被解聚成它们的多肽链。
解聚后的氨基酸侧链与SDS充分结合形成带负电荷的蛋白质-SDS胶束,所带的负电荷大大超过了蛋白质分子原有的电荷量,这就消除了不同分子之间原有电荷的差异。
生物检测 5蛋白质双向电泳
三、实验步骤
5、染色检验 、
硝酸银染色 优点:灵敏度高, 优点:灵敏度高, 缺点:重复性差, 缺点:重复性差,质谱兼容性低 硝酸银染色图谱 考马斯亮兰染色: 考马斯亮兰染色: 优点:重复性好, 优点:重复性好,质谱兼容性高 缺点: 缺点:灵敏度低 荧光染色: 荧光染色: 优点:重复性好,质谱兼容性高、 优点:重复性好,质谱兼容性高、灵敏度高 缺点: 缺点:价格贵 考马斯亮蓝染色图谱 其它染色方法: 其它染色方法: 胺基黑染色、印度墨水染色、 胺基黑染色、印度墨水制备 、
最关键步骤之一 双向电泳的最关键 双向电泳的最关键步骤之一
制备原则:尽可能多地提取出总蛋白质,尽 制备原则:尽可能多地提取出总蛋白质, 可能简单的操作步骤, 可能简单的操作步骤,注意防止样品提取过 程中的各种化学修饰,去除样品中核酸、 程中的各种化学修饰,去除样品中核酸、盐 离子等干扰物质。 离子等干扰物质。
第5讲 蛋白质双向电泳
肺癌细胞
膀胱腺癌
基本内容
一、蛋白质组学的相关知识 二、双向电泳的原理 三、实验步骤 四、课堂小结 五、作业
一、蛋白质组学的相关知识
1、什么是蛋白质组学? 、什么是蛋白质组学? 指应用各种技术手段来研究蛋白质组的 一门新兴科学。 一门新兴科学。 目的是从整体的角度分析细胞内动态 是从整体的角度 其目的是从整体的角度分析细胞内动态 变化的蛋白质组成成份、表达水平与修饰状 变化的蛋白质组成成份、 了解蛋白质之间的相互作用与联系 相互作用与联系, 态,了解蛋白质之间的相互作用与联系,揭 示蛋白质功能与细胞生命活动规律。 示蛋白质功能与细胞生命活动规律。 不同的时间和空间! 不同的时间和空间! 时间
三、实验步骤
3、胶条平衡
等电聚焦结束后进行SDS-PAGE电泳之前需进 等电聚焦结束后进行SDS-PAGE电泳之前需进 SDS 行胶条平衡,以便于被分离的蛋白质与SDS充分 蛋白质与SDS 行胶条平衡,以便于被分离的蛋白质与SDS充分 结合,保证SDS-PAGE电泳的顺利进行。 结合,保证SDS-PAGE电泳的顺利进行。 SDS 电泳的顺利进行
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胶条平衡
等电聚焦结束后进行SDS-PAGE电泳之前需 进行胶条平衡,以便于被分离的蛋白质与 SDS充分结合,保证SDS-PAGE电泳的顺利 进行 步骤:一般采用两步平衡法,用含SDS、 DTT、尿素和甘油等的缓冲液先平衡一次, 再用碘乙酰胺取代DTT后再平衡一次
SDS-PAGE电泳
使得蛋白质按照分子量的大小不同而分离, 与普通SDS-PAGE相似 在双向电泳系统中无需浓缩胶,因为第一 向等电聚焦已经使得蛋白得到浓缩
等电聚焦
通过10000V高压使得蛋白质按照其等电点特 性进行聚焦 步骤:胶条水化、低压除盐、高压聚焦、低 压维持 聚焦时间:聚焦时间太短,会导致水平和垂 直条纹,过长会造成蛋白图谱变性,在胶条 碱性端产生水平条纹以及蛋白丢失。最佳时 间的确定需要根据蛋白样品类型、蛋白载样 量、PH范围和胶条长度来确定。
图像分析
常用软件: Image-Master (GE Healthcare) PDquest (Bio-Rad) 分析步骤:胶点检测和定量、凝胶匹配、比 较分析
分子量 提取的总蛋 白溶液
2DE图谱
硝酸银染色图谱
考马斯亮蓝染色图谱
双向电泳(DIGE)示意图
样品1: Cy3标记 将标记的 样品混合 样品2: Cy5标记
双向电泳分离
荧光扫描仪扫描
图像重叠分析
DIGE图谱
样品制备
双向电泳的最关键步骤之一 制备原则:尽可能多地提取出总蛋白质,尽 可能简单的操作步骤,注意防止样品提取过 程中的各种化学修饰,去除样品中核酸、盐 离子等干扰物质
差异蛋白点选取
蛋白酶解及质谱分析 差异蛋白点的成功鉴定
生物学问题的解释
双向电泳(2DE/DIGE)
目前进行蛋白质组学分析的最常规实验技术 能实现多达10000种不同蛋白质进行分离分析
双向电泳(2DE)示意图
等电聚焦,实现蛋白质按等电 蛋白质按分 子量大小排 序 小 通过双向电泳使得不同等电点和分子量的 蛋白质根据其自身特性分布到凝胶的不同 位置从而实现蛋白质的双向分离
蛋白检测
理想显色剂的7S 安全(safety) 灵敏(sensitivity) 简单(simplicity) 特异性(specificity) 快速(speed) 稳定(stability) 兼容性(synergy)
蛋白检测
硝酸银染色 优点:灵敏度高, 缺点:重复性差,质谱兼容性低 考马斯亮兰染色: 优点:重复性好,质谱兼容性高 缺点:灵敏度低 荧光染色: 优点:重复性好,质谱兼容性高、灵敏度高 缺点:价格贵 其它染色方法: 胺基黑染色、印度墨水染色、金属盐负染等
蛋白质双向电泳知识 学习
蛋白质组学(proteomics)
概念:是从整体角度分析生物体蛋白质组动态变 化的一门科学 研究内容:蛋白质的识别、定量;蛋白质的定位、 修饰;蛋白质之间的相互作用并根据这些研究最 终确定它们的功能
技术流程
提出 生物学问题 实验组和对照组 样品制备 凝胶图像分析
双向电泳(2DE/DIGE)