动物组织DNA的提取与鉴定
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(3)TE缓冲液(pH 8.0):高压灭菌,室温贮 存。
(4)酚:氯仿:异戊醇(25:24:1) (5)异丙醇、冷无水乙醇、70%乙醇、灭菌水。 盐酸,醋酸钠,琼脂糖,溴酚蓝,溴化乙锭。
*主要的试剂及配置:
• DNA提取液SET: 10mmol/LTris.Cl(pH8.0)、
100mmol/lEDTA、500mmol/lNaCl、20%SDS
3.加等量的酚:氯仿:异戊醇振荡混匀,离心12000 rpm,5min。 4.取上层溶液至另一管,加入等体积的氯仿异戊醇, 振荡混匀,离心12000 rpm,5min5. 取上层溶液来自百度文库另 一管,加入1/2体积的7.5mol/L乙酸氨加入2倍体积的 无水乙醇,混匀后室温沉淀2min ,离心12000 rpm ,10min。
5.小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上,将 附于管壁的残余液滴除掉。
6.用1ml 70%乙醇洗涤沉淀物1次,离心12000 rpm , 5min。
7.小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上, 将附于管壁的残余液滴除掉,室温干燥。 8.加200ul TE重新溶解沉淀物,然后置于4℃或 20℃保存备用。 9.将提取物置于紫外分光光度计上检测其纯度。
5、加样 将DNA样品与加样缓冲液按4:1混匀后,用微量移液器将混 合液加到样品槽中,每槽加10-20μl,记录样品的点样次序和 加样量。 6、电泳 安装好电极导线,点样孔一端接负极,另一端接正极,打 开电源,调电压至3-5V/cm,电泳1-3hr,当溴酚蓝移到距凝胶 前沿1-2cm时,停止电泳。 7、染色和观察 取出凝胶,放在含有溴化乙锭的染色液中染色30min,即可 在254nm的紫外灯下观察,有橙红色荧光条带的位置,即为 DNA条带,或在紫外灯下照相记录电泳图谱。溴化乙锭是致 癌剂,操作时要小心,必须戴手套。
*鉴定:
1、安装电泳槽 将有机玻璃的电泳凝胶床洗净,晾干,用胶带将两端的 开口封好,放在水平的工作台上,插上样品梳。 2、琼脂糖凝胶的制备 称取琼脂糖溶解在电泳缓冲液中,(按0.3-1.5%的琼脂 糖含量,1-25kb大小的DNA用1%的凝胶,20-100kb的 DNA用0.5%的凝胶,200-2000bp的DNA用1.5%的凝胶) 置微波炉或沸水浴中加热至完全溶化(不要加热至沸 腾),取出摇匀。 3、灌胶 将冷却到60℃的琼脂糖溶液轻轻倒入电泳槽水平板上 4、待琼脂糖胶凝固后,在电泳槽内加入电泳缓冲液,然 后拔出梳子。
冰无水乙醇
可以吸收分子之间的水,使DNA沉淀析出, 无水乙醇使用前冰冻,可以减少DNA沉淀析 出过程释放热量DNA的损伤。
75%乙醇:
洗涤DNA的作用,主要去盐和有机杂质。
四、实验步骤
*提取:
1. 取新鲜或冰冻动物组织块0.1g(0.5cm3),尽 量剪碎。置于玻璃匀浆器中,加入1ml的细胞 裂解缓冲液匀浆至不见组织块,转入1.5ml 离 心管中,加入蛋白酶K (500ug/ml)20μl,混 匀。在65℃恒温水浴锅中水浴30min,也可转 入37℃水浴12~24h,间歇振荡离心管数次。 于台式离心机以12000 r/min离心5min,取上清 液入另一离心管中。 2.加2倍体积异丙醇,倒转混匀后,可以看见丝 状物,用100ul 吸头挑出,凉干,用200ul TE 重 新溶解。
• TE缓冲液(pH8.0): 100mmol/lTris.Cl(pH8.0)、1mol/lEDTA (pH8.0)、室温保存; • 氯仿-异戊醇(23:1):体积23:1 • 其他试剂:Tris饱和酚(购买)、无水乙醇、 75%乙醇。
*各种试剂的作用
EDTA(乙二胺四乙酸)
(1)螯合细胞膜和骨架上的Ca2+、Mg2+,从而 使细胞更易破碎。 (2)螯合Mg2+使得内源性Dnase没有Mg2+不 能发挥作用,保持DNA的稳定性,Tris起缓存 pH值的作用。
动物组织DNA的提取与鉴定
一、实验目的
• 1.了解并掌握提取动物基因组 DNA的原理和常用方法。
• 2.学习和掌握琼脂糖电泳法鉴定 DNA的原理和方法。
二、实验原理
• 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基 硫酸钠)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/ 异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从 溶液中析出。 • 琼真核生物的一切有核细胞(包括培养细胞)都能用来制备基 因组 DNA。真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内, 因此,制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等 分离,又要保持DNA分子的完整。 • 脂糖凝胶电泳是用于分离、鉴定和提纯DNA片段的标准方法。 琼脂糖是从琼脂中提取的一种多糖,具亲水性,但不带电荷, 是一种很好的电泳支持物。DNA在碱性条件下(pH8.0的缓冲液) 带负电荷,在电场中通过凝胶介质向正极移动,不同DNA分子 片段由于分子和构型不同,在电场中的泳动速率液不同。溴化 乙锭(EB)可嵌入DNA分子碱基对间形成荧光络合物,经紫外 线照射后,可分出不同的区带,达到分离、鉴定分子量,筛选 重组子的目的。
(1)主要用于DNA提取时蛋白质的去除,抑制DNA酶活性; (2)苯酚溶于有机溶剂,微溶于水; (3)提取DNA前苯酚用Tris-Hcl饱和,防止吸收过多DNA, 降低DNA的损失率; (4)氯化苯酚会破坏DNA。
氯仿;异戊醇(23:1)
(1)主要用于DNA或者RNA提取时蛋白的去除; (2)DNA提取时候,氯仿起变性蛋白质和将第一次抽提 后的水相中的酚带走的作用。异戊醇能降低分子表面张 力,能减少抽提过程中的泡沫产生,同时异戊醇有助于 分相,增加界面的稳定性
蛋白酶K
水解蛋白质的作用,消化DNA酶和细胞中的 蛋白质
SDS(十二烷基硫酸钠)
SDS是离子型表面活性剂,主要作用是: (1)破坏细胞膜及核膜; (2)解聚细胞中的核蛋白; (3)与蛋白质结合,使蛋白质变性而沉淀下 来; (4)抑制DNA酶活性,使DNA分子尽量完整 的分离出来。
苯酚:蛋白质强变性剂
三、实验仪器及试剂
• 1. 仪器: 恒温水浴锅、台式离心机、紫外分光光度 计、移液器、玻璃匀浆器、离心管(灭 菌)、吸头(灭菌)、 电泳仪,电泳槽、 紫外透射反射仪、微波炉、微量进样器
2. 试剂: (1)细胞裂解缓冲液: Tris (pH8.0) 100 mmol/L EDTA (pH 8.0) 500 mmol/L NaCL 20 mmol/L SDS 10% 胰RNA酶 20ug/ml (2)蛋白酶K:称取20mg蛋白酶k溶于1ml灭菌 的双蒸水中,20℃备用。