第5章 蛋白质一
分子生物学第5章蛋白质翻译
---aa 接受臂 ;
loading aa at 3‟ end ---TΨ C loop; contact with 5s rRNA
---DHU loop;
contact with AARS ---anti-codon loop;
34
---extra loop;
分类标准
tRNACys表示转运半胱氨酸的tRNA Cys-tRNACys 表 示 携 带 了 半 胱 氨 酸 的 tRNACys
●
Paracodon ---由若干Nt组成,存在于tRNA不定位置上 ---与AARS侧链基团的分子发生特异的“契合” ---成为tRNA准确负载氨基酸的机制之一
●
tRNA的“L”三维结构与功能 “L”构型的结构力 ---二级结构中双链区的碱基堆积力和氢键 ---二级结构中非双链区在“L”结构中,形成氢键结合
成为核糖体识别第一个 AUG的信号
细菌 16S
AMEAMECCUGCGGUUGGAUGACCUCCUU
哺乳动物 18S rRNA AMEAMECCUGCGGAAGGAUGAUUA
高度相似
5.2.3. mRNA
mRNA分子5‟端的序列对于起始密码子选择 有重要作用
● In Prokaryote
poly-cistron
a) 简并现象的概念; ---一种氨基酸受2个或2个以上codon编码的遗传现象 ---编码一种aa的4个codon间, 仅3rd Nt 不同, 称为codon family 例;Ser (6 codons) 1 codon family & 2 extra codons
密码子的简并性
b) 简并现象的机理;
5.3. Genetic Code
食品化学05第五章 蛋白质详解
按蛋白质的溶 解度分----考 虑蛋白质的营 养特性时采用
清蛋白(溶于水、稀盐、稀酸、稀碱) 球蛋白(不溶于水、溶于稀盐、稀酸、稀碱) 谷蛋白(不溶于水、盐、溶于稀酸、稀碱) 醇溶蛋白(溶于70-80%乙醇、稀酸、稀碱)
6
2
一. 概述 Introduction
2. 蛋白质的元素组成The elements of protein
C:50-55% H:6-7% O:20-23% S:0-4% N:12-19% 微量元素:P、Fe、Zn、Cu、I 等。
蛋白质完全水解的产物是a-氨基酸,它的侧链结构和性质
各不相同,大多数蛋白质由20种不同的氨基酸组成。蛋白质分
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二 氨基酸的一般性质
当G两e性n离e子r被al酸P滴r定operties当o两f 性A离m子i被n碱o滴A定c时id,s—
时, —COO-基变成去质
NH3+基变成去质子化,当—
3子酸化碱,性当—质COO-和—
NH3+ 和—NH2浓度相等时
COOH的浓度相等时的 氨pH基被酸称的为等pK电a1点((即p解I 离of amino
3. 蛋白质的分类 The classification of protein
按分子形状 分----考虑蛋 白质的质构 特点时采用
球蛋白:以球状或椭圆状态才能在的 蛋白质,这些形状是由多肽链自身折 叠而造成的。
纤维状蛋白:棒状分子,他们含有相 互缠绕的多肽链。
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一. 概述 Introduction
Lys,Arg,His
带负电荷侧链氨基酸: Asp,Glu
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二 氨基酸的一般性质 General Properties of Amino Acids
生物化学 第5章 蛋白质结构与功能
第五章蛋白质结构和功能的关系一、、肌红蛋白的结构与功能:1、肌红蛋白的三级结构哺乳动物肌肉中储氧的蛋白质。
由一条多肽链(珠蛋白,153个aa残基)和一个血红素辅基组成。
亚铁离子形成六个配位健,四个与N原子,一个与组氨酸,一个与氧配位。
球状分子,单结构域。
8段直的α-螺旋组成,分别命名为A、B、C…H,拐弯处是由1~8个氨基酸组成的松散肽段(无规卷曲)。
4个Pro残基各自处在一个拐弯处,另外4个是Ser、Thr、Asn、Ile。
血红素辅基血红素辅基,扁平状,结合在肌红蛋白表面的一个洞穴内。
CO 中毒CO 与肌红蛋白有更高的亲和性2、肌红蛋白的氧合曲线OMb 解离平衡常数:][]][[22MbO K =][2PO Mb K ∙=][2MbO 氧饱和度:[]2MbO Y =][][2Mb MbO +PO 2Y =2PO K +Y=0.5时,肌红蛋白的一半被饱和,PO 2=K =P 50=2.8t torr(托)解离常数K 也称为P 50,即肌红蛋白一半被饱和时的氧压。
3、Hill 曲线和Hill 系数YY K PO YK PO Y log log 1log 122-=-=-Hill曲线Log[Y/(1-Y)]=0时的斜率称Hill 系数(n H )肌红蛋白的n H =1二血红蛋白的结构与功能蛋白的结构与功能1、血红蛋白的结构:成人成人:HbA:α2β298%,a亚基(141),β亚基(146)HbA2:α2δ22%胎儿:HbFα2γ2早期胚胎:α2ε2▲接近于球体,4个亚基分别在四面体的四个角上,每个亚基上有一个血红素辅基。
▲α、β链的三级结构与肌红蛋白的很相似,一级结构具有同源性。
氧合造成盐桥断裂42、血红蛋白的氧合曲线四个亚基之间具有正协同效应因此它的氧合曲四个亚基之间具有正协同效应,因此,它的氧合曲线是S 型曲线。
Hill 曲线和Hill 系数。
协同效应可增加血红蛋白在肌肉中的卸氧量,使它能有效地输送氧气。
05第五章大豆蛋白质
(6)组织化作用
(7)面团作用 (8)黏着性、附着性和弹性
第三节、大豆蛋白的提取工艺
现在提取的蛋白质有浓缩大豆蛋白和分离大豆蛋白。 (一)浓缩大豆蛋白的生产 脱脂后的豆粕含有的成分:蛋白质、可溶性糖类、灰份、其 他微量成分、纤维素、半纤维素等。 浓缩大豆蛋白含义: 经低温脱溶后的豆粕,如除去其中的可溶性糖、灰分及 微量元素,所得的产品为浓缩大豆蛋白,其中蛋白含量为 70%,还有一些纤维和半纤维。 生产方法:乙醇萃取法、酸洗法(等电点法)。
消泡剂
在制浆的过程中,会产生大量的气泡,对后续加工影响较大, 煮浆容易造成假沸,点脑时影响凝固剂分散.以前使用过的消泡剂有: 油脚﹑油脚膏﹑硅有机树脂﹑脂肪酸甘油酯等,目前国标(GB2760-
只有高碳醇脂肪酸 酯复合物(DSA-5),最大使用量为1.6g/kg。
1996)允许在豆制品中的消泡剂
其他
2.蛋白质分散法(PDI) PDI(蛋白质分散度指数)=(水分散蛋白质/样品中总 蛋白质)×100% 热处理对大豆蛋白变性的影响
酸碱变性:大豆蛋白在PH为1或14的极端情况下引起变 性。
酒精有促进蛋白质变性的作用
(四)、大豆蛋白的功能特性
(1)凝胶化 (2)乳化性 (3)发泡性 (4)吸收脂肪 (5)吸收水分
大豆蛋白质的浓度及组成是凝胶能否形成的决定性因素。含量 8.0-16.0%的大豆蛋白质溶胶,经过一定的加热过程,冷却后即可 形成凝胶;低于8.0%时,紧用加热的方法是不能形成凝胶的,只有 在加热后及时调节pH或离子强度,才能形成凝胶。
(五)蛋白质与油、水关系
1.蛋白质与脂质的相互作用
形成脂络合物(豆浆加热时所形成的浆膜)
3 制浆
(2)滤浆 目的是把豆糊中的豆渣除去
第05章 蛋白质讲解
•
赖:+H3N-CH2-CH2-CH2-CH2-
•
精、 组
• D.带负电荷(酸性氨基酸)
•
谷: -OOC-CH2CH2-
•
天门冬: -OOC-CH2-
2.酸碱性质
氨基酸为两性电解质,既表现出酸性, 又表现出碱的性质
• 除α-羧基(pKa1)、α-氨基(pKa2)外,酸 性及碱性氨基酸的侧链也含有可离子化基团
• (三)界面性质 Interfacial Properties
• 1、乳化性质 Emulsifying Properties (1)蛋白质的表面活性
一般而言,P的疏水性越强,P在界面的浓度越大,表面张 力愈低,乳状液愈稳定。
疏水值↑,表面张力↓,乳化活力↑(乳化活性指数,m2/g)
表
乳
面
化
张
活
力
F、一定蛋白质起始浓度: 一般为0.5%
Pro一般对O/W型乳化液的稳定性较好。
0.2mol/LNaCl 1mol/LNaCl pH
变性涉及二、三、四级结构的变化。
2、变性热力学
N(天然)==== D(变性) K=[D] / [N] ΔGo= -RTlnK
ΔGo=ΔHo - TΔSo
例:25℃,pH=9时,肌红蛋白变性
ΔGo=56.8千焦/摩尔
K=0.113
3、变性因素
(1)热
T升高,则氢键下降,静电力下降,范德华力下降,而疏水 键上升,ΔH? ↑↓
如11S大豆蛋白、乳蛋白
水能促进蛋白质的热变化(干的稳定)
大豆粉 10%H2O Td=115℃ 40%H2O Td=97℃
单体球状蛋白质的热变性在短时热时是可逆的。
(2)静水压 因为蛋白质具有柔性和可压缩性(球状),所 以压力可引起变性,但是可逆
5第五章 蛋白质的三维结构
第5章蛋白质的三维结构§1.8 蛋白质的三维结构蛋白质三维结构由氨基酸序列决定,且符合热力学能量最低要求,与溶剂和环境有关。
①主链基团之间形成氢键。
②暴露在溶剂中(水)的疏水基团最少。
③多肽链与环境水(必须水)形成氢键。
(一)研究蛋白质构象的方法(1)X-射线衍射法:是目前最明确揭示蛋白质大多数原子空间位置的方法,为研究蛋白质三维结构最主要的方法。
步骤为:蛋白质分离、提纯→单晶培养→晶体学初步鉴定→衍生数据收集→结晶解析→结构精修→结构表达。
(2)其他方法:NMR、紫外差光谱、荧光和荧光偏振、圆二色性、二维结晶三维重构。
(二)稳定蛋白质三维结构的作用力(1)弱相互作用(或称非共价键,或次级键)1. 氢键2. 疏水作用(熵效应)3. 范德华力4. 离子键(盐键)(2)共价二硫键(三)酰胺平面和二面角(1)酰胺平面(肽平面):肽键上的四个原子和相连的Cα1和Cα2所在的平面。
(2)两面角:每个氨基酸有三个键参与多肽主链,一个肽键具有双键性质不易旋转,另两个键一个为Cα1与羰基形成的单键,可自由旋转,角度称为ψ,另一个为NH与Cα2形成的单键也可自由旋转,角度称为φ,ψ和φ称为二面角或构象角,原则上可取-1800~+1800之间任意值(实际受立体化学和热力学因素所限制),肽链构象可用两面角ψ和φ来描述,由ψ和φ值可确定多肽主链构象。
(四)二级结构多肽链折叠的规则方式,是能量平衡和熵效应的结果。
主链折叠由氢键维持(主要),疏水基团在分子内,亲水基团在分子表面。
常见的二级结构元件:α-螺旋,β-折叠片,β-转角和无规卷曲。
(1)α-helix:蛋白质含量最丰富的二级结构。
肽链主链围绕中心轴盘绕成螺旋状紧密卷曲的棒状结构,称为α-螺旋。
1.两面角ψ和φ分别在-570和-470附近(φ:从Cα向N看,顺时针旋转为正,逆时针为负;ψ:从Cα向羰基看,顺时针为正,逆时针为负。
)2.每圈螺旋含约3.6个氨基酸残基,由H键封闭的环中原子数为13,此种α-螺旋又称3.613-螺旋,每周螺距为0.54nm,R基均在螺旋外侧。
医学生物化学 第一章到第九章简答 医学生必看
碱基和核糖(脱氧核糖)通过糖苷键连接形成核苷(脱氧核苷);核苷(脱氧核苷)和磷酸以磷酸酯键连接形成核苷酸(脱氧核苷酸);核苷酸之间以磷酸二酯键连接形成多核苷酸链,即核酸。
第三章:
(1)酶与一般催化剂比较有哪些特点?
(1)酶作为生物催化剂和一般催化剂相比,又具有本身的特点。
(3)RNA和DNA有何异同点?
化学组成:DNA由腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶、D-2-脱氧核糖和磷酸组成,RNA由腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、尿嘧啶、D-2-脱氧核糖和磷酸组成。结构上: DNA分子由两条相互平行但走向相反的脱氧多核苷酸链组成,RNA是单链结构。功能上:DNA的基本功能是以基因的形式荷载遗传信息,并作为基因复制和转录的模板。RNA主要与遗传信息的传递和表达有关
(5)糖有氧氧化的生理意义?
答:糖的有氧氧化是机体产生能量最主要的途径,它不仅产能效率高,而且由于产生的能量逐步分次释放,相当一部分形成ATP,所以能量的利用率也高,简言之,即“供能“。
(6)肌糖原能否直接补充血糖?若能是怎样转变成血糖的?
肌糖原不能直接补充血糖,因为肌肉缺乏葡萄糖-6-磷酸酶。肌糖原分解出6-磷酸葡萄糖后,经糖酵解途径产生乳酸,乳酸进入血液循环到肝脏,以乳酸为原料经糖异生途径转变为葡萄糖并释放入血补充二级,三级和四级结构.
蛋白质分子的一级结构指构成蛋白质分子的氨基酸在多肽链中的排列顺序和连接方式。
蛋白质分子的二级结构是指蛋白质多肽链主链原子的局部空间排列。
多肽链在二结构的基础上进一步卷曲折叠,形成具有一定规律性的三维空间结构,即为蛋白质的三级结构。
第四章:
(1)血糖有哪些来源与去路?血糖浓度为什么能保持动态平衡?
生物化学(第三版) 第五章 蛋白质的三维结构课后习题详细解答 复习重点
第五章蛋白质的三维结构提要每一种蛋白质至少都有一种构像在生理条件下是稳定的,并具有生物活性,这种构像称为蛋白质的天然构像。
研究蛋白质构像的主要方法是X射线晶体结构分析。
此外紫外差光谱、荧光和荧光偏振、圆二色性、核磁共振和重氢交换等被用于研究溶液中的蛋白质构像。
稳定蛋白质构像的作用有氢键、范德华力、疏水相互作用和离子键。
此外二硫键在稳定某些蛋白质的构像种也起重要作用。
多肽链折叠成特定的构像受到空间上的许多限制。
就其主链而言,由于肽链是由多个相邻的肽平面构成的,主链上只有α-碳的二平面角Φ和Ψ能自由旋转,但也受到很大限制。
某些Φ和Ψ值是立体化学所允许的,其他值则不被允许。
并因此提出了拉氏构像,它表明蛋白质主链构象在图上所占的位置是很有限的(7.7%-20.3%)。
蛋白质主链的折叠形成由氢键维系的重复性结构称为二级结构。
最常见的二级结构元件有α螺旋、β转角等。
α螺旋是蛋白质中最典型、含量最丰富的二级结构。
α螺旋结构中每个肽平面上的羰氧和酰氨氢都参与氢键的形成,因此这种构象是相当稳定的。
氢键大体上与螺旋轴平行,每圈螺旋占3.6个氨基酸残基,每个残基绕轴旋转100°,螺距为0.54nm。
α-角蛋白是毛、发、甲、蹄中的纤维状蛋白质,它几乎完全由α螺旋构成的多肽链构成。
β折叠片中肽链主链处于较伸展的曲折(锯齿)形式,肽链之间或一条肽链的肽段之间借助氢键彼此连接成片状结构,故称为β折叠片,每条肽链或肽段称为β折叠股或β股。
肽链的走向可以有平行和反平行两种形式。
平行折叠片构象的伸展程度略小于反平行折叠片,它们的重复周期分别为0.65nm和0.70nm。
大多数β折叠股和β折叠片都有右手扭曲的倾向,以缓解侧链之间的空间应力(steric strain)。
蚕丝心蛋白几乎完全由扭曲的反平行β折叠片构成。
胶原蛋白是动物结缔组织中最丰富的结构蛋白,有若干原胶原分子组成。
原胶原是一种右手超螺旋结构,称三股螺旋。
弹性蛋白是结缔组织中另一主要的结构蛋白质。
5.蛋白质
第一章蛋白质蛋白质变性蛋白质变性是指当天然蛋白质受到物理或化学因素的影响时,使蛋白质分子内部的二、三、四级结构发生异常变化,不包括一级结构上肽键的断裂,从而导致生物功能丧失或物理化学性质改变的现象。
变性对其结构和功能的影响:1.由于疏水基团暴露在分子表面,引起溶解度下降2.改变对水结合的能力3.改变生物活性4.易受蛋白酶攻击,增加对酶水解的敏感性5.特征粘度上升6.不能结晶影响变性的因素物理因素:①热;②静水压;③;剪切④辐照;1.热和变性(如鸡蛋清加热凝固,瘦肉加热凝固变硬)发生在40~80度温度范围和0.1MPa下温度导致变性的影响机制:主要涉及非共价相互作用的去稳定作用。
1)氢键,静电和范德华相互作用:在高温下稳定而低温下去稳定。
2)疏水相互作用:在60~70度左右达到最高,温度升高其稳定效力被其他相互作用破坏。
3)多肽键的构象熵:随温度升高,多肽链热动能增加,极大地促进了肽链的展开,导致蛋白质去稳定,发生变性。
当一个蛋白质溶液被逐渐地加热并超过临界温度时,它产生了从天然状态至变性状态的剧烈转变。
在此转变中点的温度被称为变性温度。
在变性温度下,蛋白质的天然和变性状态的浓度之比为12.静水压与变性(用于灭菌和蛋白质的胶凝)在充分高的压力下,压力诱导变性发生在25℃导致变性的影响机制:主要是蛋白质是柔性的和可压缩的。
特点:压力诱导的蛋白质变性是可逆的;压力加工不会损害蛋白质中必需氨基酸或天然风味和色泽,不会导致有毒化合物的生成。
3.剪切与变性如何产生:振动,捏合,打擦产生的机械剪切导致变性的影响机制:由于空气泡的并入和蛋白质分子吸附至气—液界面。
由于气—液界面能量高于体相能量,因此蛋白质在界面上发生构象变化。
构象变化的程度取决于蛋白质的柔性。
特点:剪切速度越高,蛋白质变性程度越高;高温和剪切力结合导致蛋白质不可逆变性。
4.辐照与变性(用于食品杀菌)导致变性的影响机制:用磁射线导致蛋白质构象改变导致蛋白质变性。
第五章 蛋白质结构解析
血红蛋白分子就是由二个由141个氨基酸残基组成的α亚基和二个由146个氨基酸 残基组成的β亚基按特定的接触和排列组成的一个球状蛋白质分子,每个亚基中 各有一个含亚铁离子的血红素辅基。四个亚基间靠氢键和八个盐键维系着血红蛋 白分子严密的空间构象。
NMR基本原理
核 磁 共 振 ( Nuclear Magnetic Resonance),
就是处于某个静磁场中的 自旋核系统受到相应频率 的射频磁场作用时 ,共振 吸收某一特定频率的射频 辐射的物理过程。
核磁共振波谱是测量原子核对 射频辐射(约4600MHz)的吸收, 这种吸收只有在高磁场中才能 产生。 核磁共振波谱仪
电镜三维重构、各种光谱技术、显微
技术和计算机模拟
蛋白质三维结构解析过程
第一节 X-射线衍射测定蛋白质结构
1895年11月8日 ,德国物 理学家,50岁的伦琴在 自己的实验室中偶然发 现 一种从阴极射线管 中辐射出的新型射线, 由于对管子发出的“东 西”性质不确定,伦琴 就把这种射线命名为 “X射线” 。
3、衍射数据收集和处理
第三代同步辐射光源的应用使得用20-40 um大小的晶体解析高分辨率结构已经成为 现实 目前世界上比较著名的同步辐射工作站有 多个: APS(USA); ESRF(France); SPring-8 (Japan)
4、位相求解
1. 分子置换法(MR) 2. 多对同晶型置换法(MIR) 3. 多波长反常散射法(MAD)
核磁共振可以方便地在溶液中研究分子结构并且是唯一 可以使试样不经受任何破坏的结构分析方法。 目前核磁共振成象技术已能以活人为观察对象,扫描身 体中任何器官或组织的任何一个断面的核磁共振参数,成 为一种引人注目的癌症早期诊断技木。
第五章 蛋白质
温度导致蛋白质变性主要涉及到非共价相互作用
的去稳定作用。氢键、静电和范德华相互作用在高温 下不稳定在低温下稳定,而疏水相互作用随温度升高 作用力增强(在60-70℃达到最高)。 一般认为,温度越低,蛋白质的稳定性越高。然 而也有例外。如肌红蛋白和突变型噬菌体T4溶菌酶分 别在30 ℃和12.5 ℃时显示最高稳定性。
第五章
第一节 第二节 第三节 第四节 第五节 第六节 第七节 第八节
蛋白质
引言 氨基酸的物理化学性质 蛋白质的结构 蛋白质的变性 蛋白质的功能性质 蛋白质的营养性质 在食品加工中蛋白质的物理、化学和营养变化 食品蛋白质
本章重点
1、基本概念;
2、蛋白质变性的机理及影响因素; 3、蛋白质功能性质产生的机理、影响因素及在食品 工业上的具体应用; 4、蛋白质在食品加工和贮藏中发生的物理、化学和 营养变化以及如何利用和防止这些变化; 5、常见食品蛋白质的特点。
三、氨基酸的性质
1、氨基酸的酸-碱性质
氨基酸具有两性性质。氨基酸在溶液中净电荷为 零时的pH值为氨基酸的等电点pI 。 pH值在等电点以上,氨基酸带净负电荷,低于等 电点,氨基酸带净正电荷。
2、氨基酸的疏水性
氨基酸从乙醇转移至水的自由能变化△Gt 可用 来表示氨基酸的疏水性,△Gt是一个加和函数。
第一节
一、蛋白质的功能
引言
1、是生物细胞的主要成分;
2、部分蛋白质作为生物催化剂; 3、机体内生物免疫作用所必须的物质; 4、在食品加工中,蛋白质除具有营养价值外,对食品 的质地、色、香、味等方面有着重要的功能作用。
山东大学分子生物学章节习题及参考答案05蛋白质的生物合成(翻译)
第五章蛋白质的生物合成(翻译)一、选择题1.仅有一个密码子的氨基酸是A.色氨酸、赖氨酸B.苏氨酸、甘氨酸C.甲硫氨酸、甘氨酸D.亮氨酸、丙氨酸E.色氨酸、甲硫氨酸2.密码与反密码配对时,不遵从碱基配对规律,称为A.密码的简并性B.密码的偏爱性C.密码的连续性D.密码的摆动性E.密码的通用性3.真核生物核蛋白体中没有的rRNA是A.18SB.23SC.5SD.28SE.5.8S4.反密码存在于A.DNAB.tRNAC.mRNAD.rRNAE.cDNA5.不符合密码的通用性的细胞器是A.细胞核B.微粒体C.线粒体D.内质网E.高尔基体6.氨基酰-tRNA合成酶的校正活性是A.水解酯键B.水解3’,5’磷酸二酯键C.水解磷酸酯键D.形成酸酐键E.形成磷酸酯键7.关于核蛋白体,错误的是A.由rRNA和多种蛋白质组成B.分为大小亚基C.是翻译的场所D.在细胞核内起作用E.一个mRNA上可附着多个核蛋白体8.能促使大小亚基解离的因子是A.IF1B.IF2C.IF3D.EF-TsE.IF1与IF39.EF-Tu的功能是A.协助氨基酰-tRNA进入A位B.促进核糖体亚基聚合C.促进核糖体解聚D.促进mRNA与核糖体分离E.促进肽酰-tRNA移位10.延长因子EFG具有哪种酶的活性A.转肽酶B.酯酶C.转位酶D.转甲酰酶E.转氨酶11.肽链延长过程的叙述,错误的是A.又称为核蛋白体循环B.每循环一次延长一个氨基酸C.分为进位,成肽和转位三步D.需要EFT、EFGE.需要ATP供能12. 翻译终止时激活转肽酶为酯酶活性的是A.RF-1B.RF-2C.RF-3D.RF-4E.RR13. 蛋白质合成中不消耗能量的阶段是A.氨基酸活化B.翻译起始C.进位D.成肽E.转位14. 关于多肽链一级结构的翻译后修饰,描述错误的是A.蛋白质合成过程中N端总是甲酰甲硫氨酸B.天然蛋白质N端多数不是甲酰甲硫氨酸C.脱甲酰基酶可除去N端甲酰基D.氨基肽酶可除去N端氨基酸E.翻译终止才能除去N端甲酰基15. 鸦片促黑皮质素原水解加工生成的是A.胰岛素B.糖蛋白C.脂蛋白D.ACTHE.TSH16. 可被信号肽酶裂解的部位是A.加工区B.疏水核心区C.碱性氨基末端区D.酸性羧基末端区E.亲水区17.关于信号肽识别粒子(SRP)的描述,错误的是A.由蛋白质与RNA组成的复合体B.能特异识别结合信号肽C.具有暂停蛋白质合成的作用D.可将正在合成蛋白质的核蛋白体带至膜外E.SRP需与对接蛋白结合18. 白喉毒素可共价修饰的因子是A.EF3B.eEF1C.EF1D.eEF2E.EF219. 干扰素通过何种方式使eIF2失活A.甲基化B.ADP核糖基化C.羧化D.磷酸化E.乙酰化20. 可辨认结合分泌蛋白新生肽链N端的是A.转肽酶B.信号肽识别颗粒C.GTP酶D.RNA酶E.对接蛋白二、名词解释1. 多聚核蛋白体(polyribosome)2. 信号肽(signal peptide)3.开放阅读框架(open reading frame, ORF)三、问答题1.三种RNA在蛋白质合成中各起何作用?2.原核与真核生物翻译起始阶段各有何异同?3.细胞核蛋白合成后如何靶向输送到细胞核?4.举例说明抗生素在翻译水平抑菌的作用机理。
生物化学第5章
二、稳定蛋白质三维结构的作用力
R基团间的相互作用及稳定蛋白质三维构象的作用力
a.盐键 b.氢键 c.疏水键 d.范得华力 e.二硫键
氢键是两个极性基团之间的弱键,也就是一个偶极 (dipole) 的带正电荷的一端被另一偶极带负电荷的一端所吸引形成的 键。存在于肽链与肽链之间,亦存在于同一螺旋肽链之中。 氢键虽然是弱键,但蛋白质分子中的氢键很多,故对蛋白质 分子的构象起着重要的作用。
锌指锌指zinefingerzinefinger基元基元znphehishisargcyscysleu锌指基元中cys和his残基构成结合锌的位点锌指与dna的作用亮氨酸拉链亮氨酸拉链leucinezipperleucinezipper基元基元亮氨酸拉链蛋白结合在一个回文的靶dna序列上的模式图回文的靶dna序列亮氨酸拉链蛋白螺旋区螺旋区环环螺旋螺旋hlhhlh和和dnadna的相互作用的相互作用hlh同源二聚体螺旋螺旋螺旋转角螺旋螺旋转角螺旋helixhelixturnturnhelixhelix二结构域在二级结构及超二级结构的基础上多肽链进一步卷曲折叠组装成几个相对独立近似球形的三维实体
范德华力只有当两个非键合原子处于一定距离时才能 达到最大。
疏水键是蛋白质分子中疏水性较强的一些氨基酸(如缬氨酸、 亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸等)的侧链避开水相自相粘附聚 集在一起,形成孔穴,对维持蛋白质分子的稳定性起一定作 用。
它在维持蛋白质的三级结 构方面占有突出的地位。
盐健或称离子键,它是正电荷与负电荷之间的一种静电相 互作用。 生理 pH 下, Asp 、 Glu 侧链解离成负离子,L ys 、 Arg 、 His离解成正离子。多数情况下,这些基团分布在球状蛋 白质分子的表面,与水分子形成排列有序的水化层。偶 尔有少数带相反电荷的侧链在分子的疏水内部形成盐键。
食品化学第5章蛋白质化学
八、蛋白质与风味物质的结合
蛋白质
+
风味
蛋白质----风味
良好风味载体
与不良风味结合
第四十页,编辑于星期五:二十一点 三十三分。
结合方式
干蛋白粉
物理吸附 范德华力和毛细管作用吸附 化学吸附 静电吸附、氢键结合和共价结合。
液态或高水分食品中蛋白质
非极性配位体与蛋白质表面的疏水性小区相互作用
通过氢键相互作用
静电相互作用 共价键
第四十一页,编辑于星期五:二十一点 三十三 分。
影响蛋白质与风味结合的因素
1. 蛋白质的构象 2. 水:促进极性挥发物的结合。 3. pH:碱性pH比在酸性pH更能促进与风味物的结合 。 4. 热:热变性蛋白质显示较高结合风味物的能力 。 5. 化学改性:化学改性会改变蛋白质的风味物结合性质。
大豆组织蛋白的结构 第三十四页,编辑于星期五:二十一点 三十三 分。
六、面团的形成
面筋蛋白
(占Pr80%)
麦谷蛋白:分子质量大,二硫键(链内、链间
),决定面团的弹性、黏合性和抗张强度
麦醇溶蛋白:链内二硫键,促进面团的流
动性、伸展性和膨胀性。
过度黏结
过度延展
第三十五页,编辑于星期五:二十一点 三十三 分。
2.pH
pI—凝结块类凝胶
极端pH—弱凝胶,半透明
形成凝胶的最适pH约7~8
3.蛋白质的浓度 浓度越大,越易形成凝胶 4.金属离子
Ca2+强化了凝胶结构
过量钙桥产生凝结块
第二十九页,编辑于星期五:二十一点 三十三 分。
五、蛋白质的织构化
蛋白质的织构化是在开发利用植物蛋白 和新蛋白质中要特别强调的一种功能性 质。
5蛋白质
加热
适当热诱导蛋白质变性, 适当热诱导蛋白质变性,可增强其乳化作用
乳清蛋白质的自然状态(左侧 及变性状态 右侧) 乳清蛋白质的自然状态 左侧)及变性状态 右侧 左侧 及变性状态(右侧
乳清蛋白特别是占乳清蛋白总量50%的β - 乳球蛋白,其热 的 乳球蛋白, 乳清蛋白特别是占乳清蛋白总量 敏性较强,当在65℃加热时,就开始变性, 敏性较强,当在 ℃加热时,就开始变性,在90℃温度下保持 ℃温度下保持5 分钟则几乎全部变性。 分钟则几乎全部变性。
三、蛋白质的界面性质
3.乳化性质
影响蛋白质乳化作用的因素 : 蛋白质的溶解度 pH
pH=PI 溶解度减少时,降低其乳化作用 溶解度减少时, pH=PI 溶解度增加,增加其乳化作用 溶解度增加, 例如:血清清蛋白、明胶、蛋清蛋白在pH=PI,具有较高 例如:血清清蛋白、明胶、蛋清蛋白在 , 的溶解度,此时,乳化作用增加。 的溶解度,此时,乳化作用增加。
第五节 蛋白质功能性质
概念( 概念(p252): 指食品体系在加工、储藏、 ): 指食品体系在加工、储藏、
制备和消费过程中蛋白质对食品产生需要特性的 那些物理和化学性质。 那些物理和化学性质。
蛋白质功能性质分三大类(p253): 蛋白质功能性质分三大类( ):
水合特性:水吸收、保持、溶胀性、 水合特性:水吸收、保持、溶胀性、溶解性等 流体动力学性质:胶凝、粘度、 流体动力学性质:胶凝、粘度、弹性等 表面性质:乳化性、起泡性、 表面性质:乳化性、起泡性、溶解度等
蛋白质(Protein) 第五章 蛋白质
第五章 蛋白质
第一节 第二节 第三节 第四节 第五节 第六节 第七节 概述 氨基酸的物理化学性质 蛋白质的结构 蛋白质的变性 蛋白质的功能性质 在食品加工中蛋白质的物理、 在食品加工中蛋白质的物理、化学和营养变化 非普通蛋白质的来源
第5章 翻译
一、 mRNA是蛋白质生物合成的直接模板 (一)mRNA结构
• 不同生物mRNA序列,都具有5-端非翻译 区、开放阅读框架区和3-端非翻译区。 • 真核生物mRNA的5-端有帽子结构, 3-端 有多聚腺苷酸(polyA)尾。 1961年,Nirenberg 证明 了mRNA的模板作用。
5'
一、原核生物的肽链合成过程
(一)肽链合成的起始
• 指 mRNA 和起始氨基酰-tRNA分别与核糖体结合 而形成翻译起始复合物 (translational initiation complex)的过程。 • 参与起始物质:30S小亚基、50S大亚基、mRNA、 fMet-tRNAfMet、起始因子、GTP和Mg2+。
摆动配对
密码子、反密码子摆动配对
tRNA反密码 子第1位碱基
U
I
U
G
A C
mRNA密码 子第3位碱基
C,A,U A,G C,U U G
二、核糖体是蛋白质生物合成的场所
核糖 体的 组成
核糖体的组成
核蛋 白体 原核生物 蛋白质 S值 真核生物
rRNA 蛋白质
S值
rRNA
小亚基
大亚基
核蛋白体
21种
36种
同义密码子
为同一种氨基酸编码的各密码子,亦称简并性密码子。 • 前两个碱基均相同,只是第三个碱基不同。 • 若头两个碱基发生点突变,可译出不同氨基酸,而第 三个碱基的突变,不会影响氨基酸的翻译。 •遗传密码的特异性主要取决于前两位碱基。 密码子简并性的生物学意义:减少基因突变对蛋白质功 能的影响。 GCU ACU
ORF 编码区
AUG UAA
3'
m7Gppp
分子生物学 第五章 蛋白质的生物合成
密码利用率(codon usage)
从一般规律看,当密码子的第1、2碱基 为嘧啶碱基,生物在进化过程中往往选择 第3碱基为嘌呤碱基的密码子来编码结构基 因的氨基酸信息。
了解不同生物的密码子使用率对实施遗 传转化,基因表达,基因工程以及蛋白质 工程研究具有重要的理论指导意义。
(三)rRNA和核蛋白体
蛋白质生物合成的 场所。
核糖体的主要作用
一是提供tRNA,mRNA和相关蛋白质因子的 结合位置,使它们在核糖体上保持正确的相对位 置;
二是包括rRNA在内的组分具有催化功能,能 执行翻译中许多关键的化学反应。
核糖体在胞内除了以多聚核糖体形式参 与蛋白质合成外,还有一部分以游离状态 存在,游离状态的核糖体占总核糖体20% 左右。
当第2661个核苷酸由G突变为C后,氨 基酰tRNA-EF-Tu-GTP复合体进入A位的速 度明显减慢,当第2252、第2253位的G双 突变为C,将对转肽酶的活性产生抑制。
核 糖 体 的 组 装
• 大肠杆菌核糖体的
空间结构为一椭圆 球体,其30S亚基 呈哑铃状,50S亚 基带有三角,中间
凹陷形成空穴,将 30S小亚基抱住, 两亚基的结合面为
遗传密码的连续性
遗传密码的摆动配对
密码的简并性具有的生物学意义
它允许生物体的DNA碱基有较大变异 的余地,使基因突变可能造成的为害降至 最低程度,而不影响物种形状的表达,对 环境的适应和物种遗传的稳定。
例如细菌DNA中G+C含量变动很大, 但不同G+C含量的细菌却可以编码出相同 的多肽链。
这归因于同义密码子的分布规则。
除了少数例外(如脊椎动物线粒体基 因组编码的tRNA),所有tRNA分子都有三 叶草式的二级结构。
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讲授提纲蛋白质概述氨基酸的结构与重点氨基酸的一般结构与特性(重点)肽氨基酸与蛋白质的分析分离(了解)蛋白质的结构( 重点与难点)蛋白质结构与功能的关系(重点与难点)第一节概述、蛋白质的定义(Protein)一蛋白质的定义蛋白质:是一切生物体中普遍存在的,由天然氨基酸通过肽键连接而成的生物大分子;其种类繁多,各具有连接而成的生物大分子;其种类繁多,各具有一定的相对分子质量,复杂的分子结构和特定的生物功能;是表达生物遗传性状的一类主要物质。
★结构★功能二、蛋白质在生命中的重要性早在1878年,思格斯就在《反杜林论》中指出:“生命是蛋白体的存在方式,这种存在方式本质上就在于这些蛋白是蛋白体的存在方式这种存在方式本质上就在于这些蛋白体的化学组成部分的不断的自我更新。
”可以看出:第,蛋白体是生命的物质基础;第一,蛋白体是生命的物质基础;第二,生命是物质运动的特殊形式,是蛋白体的存在方式;第三,这种存在方式的本质就是蛋白体与其外部自然界不断的新陈代谢。
1、蛋白质是生物体内必不可少的重要成分蛋白质占干重人体中(成年人)人体45%水55%细菌50%~80% 蛋白质19%真菌14%~52% 脂肪19%酵母菌14%~50% 糖类<1%白地菌50% 无机盐7%2、蛋白质的生物学功能※催化:生命中所有的反应都是由酶催化的※调节:调节蛋白,生长激素;胰岛素※运输: 血红蛋白,脂蛋白对脂的转运※运动: 肌肉收缩:肌动蛋白、肌球蛋白;游动:微管蛋白运动肌肉收缩肌动蛋白肌球蛋白游动微管蛋白※贮存:卵清蛋白为鸟类胚胎发育提供氮源,母乳中酪蛋白※受体:接受、传递信息的受体※结构:毛发、角、指甲的a-角蛋白;腱、皮肤的胶原蛋白※防御和进攻:抗体,免疫球蛋白最近研究成果★法发现免疫系统一特殊蛋白质(启动或瘫痪)★科学家发现存储记忆脑蛋白(关键作用)学家发存储脑白关键作★瑞士科学家发现两种大肠癌蛋白(引发)★美国科学家发现糖尿病相关蛋白质(引发)★日本发现蛋白质相互作用导致疑难病症★日发现感光蛋白质植物在光弱处能生存★科学家首次完整测出古动物化石蛋白质★★★★★★三、蛋白质的元素组成蛋白质是一类含氮有机化合物,除含有碳、氢、氧外,还蛋白质是一类含氮有机化合物除含有碳氢氧外还有氮和少量的硫。
某些蛋白质还含有其他一些元素,主要是磷、铁、碘、锌和铜等。
这些元素在蛋白质中的组成百分比约为:铁碘锌和铜等这些元素在蛋白质中的组成百分比约为碳50%氢7%氧23%氮16%硫0—3%其他微量三、蛋白质的元素组成★蛋白质含量的测定:凯氏定氮法(测定氮的经典方法)优点:对原料无选择性,仪器简单,方法也简单:易将无机氮(如核酸中的氮),都归入蛋白质中, 缺点易将无机氮都归入蛋白质中不精确。
一般来说蛋白质含氮量平均在取其倒数般来说,蛋白质含氮量平均在16%,取其倒数100/16=6.25,即为蛋白质换算系数,其含义是样品中每存在1g元素氮,就说明含有6.25g 蛋白质。
※蛋白质含量=氮的量×6.25四、蛋白质的分类1、按组成单纯蛋白质:仅由氨基酸组成,水解为α-氨基酸,如球蛋白。
结合蛋白质=单纯蛋白质+辅基(非蛋白质部分称为辅基或配体)。
2、根据物理特性与功能纤维蛋白:一般不溶于水,线性结构,分子具有韧性,如α-角蛋白。
球蛋白:大多是水溶性的,多肽链紧密折叠,形状近似球形或椭球形。
细胞中大多数可溶性蛋白,如胞质酶类。
五、蛋白质中的氨基酸是通过肽键连接的肽键(酰胺键)氨基酸残基肽键形成动画六、蛋白质的结构(构象和构型?)七、蛋白质的水解1、酸水解常用6mol/L的盐酸或4mol/L的硫酸在105-110℃条件下进行水解,反应时间约20小时。
优点:不容易引起水解产物的消旋化;缺点:色氨酸被沸酸完全破坏。
含有羟基的氨基酸如丝氨酸或苏氨酸有一小部分被分解;天冬酰胺和谷氨酰胺侧链的酰胺基被水解成了羧基。
2、碱水解一般用5mol/L氢氧化钠煮沸10-20小时。
由于水解过程中许多氨基酸都受到不同程度的破坏,产率不高。
优点:色氨酸在水解中不被破坏。
缺点:部分水解产物发生消旋化。
3、酶水解蛋白水解酶(proteolytic enzyme)或称蛋白酶(proteinase)。
优点:不会破坏氨基酸,也不会发生消旋化。
缺点:产物为较小的肽段,水解不彻底。
第二节氨基酸氨基酸是蛋白质水解的最终产物,是组成蛋白质的基本单位。
从蛋白质水解物中分离出来的氨基酸有二十种,除解物中分离出来的氨基酸有二十种除脯氨酸和羟脯氨酸外,这些天然氨基酸在结构上具有共同特点。
一、氨基酸的结构(Pro除外)-α碳原子α-氨基酸基本结构通式氨基酸的旋光性及立体异构体y)A、氨基酸都具有旋光性(Gly。
B、每一种氨基酸都具有D-型和L-型两种立体异构体。
镜面二、氨基酸的分类(按侧链基团)(1)R为脂肪烃基的氨基酸(5种)A、R基均为中性烷基,R基对分子酸碱性影响很小,它们几乎有相同的等电点(6 .0±0.03)。
它们乎有相的等电点B、Gly是唯一不含手性碳原子的氨基酸,因此不具旋光性(在蛋白质构象中起着独一无二的作用)。
C、从Gly至Ile,R基团疏水性增加。
D、Ile具有2个手性碳原子。
(2)R中含有羟基和硫的氨基酸(共4种)Ser的-CH2 OH基(pKa=15)在生理条件下不解离,但在大多数酶的活性中心都发现有Ser残基存在。
Ser和Thr的-OH往往与糖链相连,形成糖蛋白。
★Cys的R中含巯基(-SH),具有两个重要性质:(1)在较高pH值条件,巯基离解。
(2)两个Cys的巯基氧化生成二硫键,生成胱氨酸。
Cys与结石★Met在生物合成中是一种重要的甲基供体。
(3)R中含有酰胺基团(2种)酰胺基中氨基易发生氨基转移反应,基转移反应与其他极性氨基酸侧链上的原子形成氢健。
(4)R中含有酸性基团(2种)Asp侧链羧基pKa为3.86,Glu侧链羧基pKa为4.25它们是唯一在生理条件下带有负电荷的两个氨基酸,这两个aa经常出现在蛋白表面。
(5)R中含碱性基团(3种)Lys侧链氨基的pKa为10.53,生理条件下,Lys侧链带有一个正电荷+)有个正电荷(—NH3),侧链的氨基反应活性增大。
是碱性最强的氨基酸,侧链上的胍基是已知碱性最Arg是碱性最强的氨基酸侧链上的强的有机碱,pKa值为12.48,生理条件下完全质子化。
His是pKa值最接近生理pH值的一种(游离氨基酸中为6.00,在多肽链中为7.35 ),是在生理pH条件下7.35唯一具有缓冲能力的氨基酸。
His在酶的酸碱催化机制中起重要作用。
(6)芳香族氨基酸在280nm处,Trp吸收最强,Tyr次之,Phe最弱(260nm)。
(7)杂环族氨基酸(1种)Pro的α-亚氨基是环的一部是环的部分,具有特殊的刚性结构。
一般出现在两段α-螺旋之间的转角处,Pro残基所在位置引进转折的变化*根据氨基酸的极性进行分类(P125)非极性不带电荷极性带正电荷带负电荷非极性氨基酸(9种)在维持蛋白质的三维结构中起着重要作用(蛋白质的疏水核心)。
(2)不带电荷的极性氨基酸(6种)侧链都能与水形成氢键因键,因此很容易溶于水。
(3)带负电荷的极性aa(酸性aa)(4)带正电荷的aa(碱性aa)*营养学角度分类必需aa :人体不能合成,必须由食物供给人体以合成非必需aa :人体可以合成I le M et V al L eu T rp P he T hr L ys 一家写两三本书来完全蛋白含必需齐全数量充足比例适当(奶蛋 婴儿期:A rg 和H is (Tip MTV Hall):含必需aa 齐全,数量充足,比例适当(奶、蛋、鱼、肉等)不能提供人体必需的全部如胶原蛋白不完全蛋白:不能提供人体必需的全部aa,如胶原蛋白。
巧记氨基酸单字母符号:笨——F ool……F苯丙氨酸l赖氨酸:赖皮——砍(K an)他……K)精氨酸:精子——人(R en)……R色氨酸:色狼——W olf……Wll)酪氨酸:奶酪——黄色(Y ellow)……Y天冬氨酸:天——地(D i)……D谷氨酸:谷子里面有很多酶——E nzyme……E 天冬酰胺:As n……N谷氨酰胺:Gln ……QAsp/Asn:两个A加一块=BGlu/Gln:总是低人一头,排老末吧:Z几种不常见的蛋白质氨基酸非蛋白质氨基酸(P129)不组成蛋白质,但有生理功能(1)L-型α–氨基酸的衍生物L瓜氨酸、L鸟氨酸是尿素循环的中间物。
L-L-(2)D-型氨基酸D-Glu、D-Ala(肽聚糖中)、D-Phe(短杆菌肽S)。
D Gl D Al)D Ph)(3)β-、γ-、δ-氨基酸β-Ala(泛素的前体)、γ-氨基丁酸(神经递质)。
各种氨基酸的大小Gly Ala Val Leu IlePhe Tyr Trp Cys MetCStryer (1995) Biochemistry (4e) p.20总结十种氨基酸的结构特点总结:二十种氨基酸的结构特点¾支链氨基酸:缬氨酸、亮氨酸,异亮氨酸¾含羟基的氨基酸:丝氨酸、苏氨酸¾含硫的氨基酸:半胱氨酸(含巯基)、甲硫氨酸(含硫甲基)¾含苯环的氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸¾含胍基的氨基酸:精氨酸¾含咪唑基的氨基酸:组氨酸¾亚氨基酸:脯氨酸¾含酰胺的氨基酸:天冬酰胺、谷氨酰胺¾含吲哚基的氨基酸:色氨酸含ε-氨基的氨基酸:¾赖氨酸作业:1、写出20种AA的结构式(侧链分类)。
构2、写出Ile、Thr 的立体异构体。
三、氨基酸的重要理化性质三1、一般物理性质α–氨基酸都是白色晶体,其形状因构型而异。
(1)溶解性:一般都能溶于水,除胱氨酸(Cys-Cys)、Tyr,并能溶解于稀酸或稀碱中,但不能溶解于有机溶剂。
但不能溶解于有机溶剂(2)熔点:氨基酸的熔点极高,一般在200℃以上。
(3)味感:其味随不同氨基酸有所不同,有的无味、有的甜、其味随不同氨基酸有所不同有的无味有的甜有的味苦,谷氨酸的单钠盐有鲜味,是味精的主要成分。
(4)旋光性:()旋光性除甘氨酸外,氨基酸都具有旋光性,能使偏振光平面向左或向右旋转,左旋者通常用(-)表示,右旋者用(+)表示。
(5)(5) 、光吸收:构成蛋白质的20种氨基酸在可见光区都没有光吸收,但在远紫外区(<220nm)均有光吸收。
在近紫外区(220-(220300nm)只有酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有吸收光的能力。