实用pcr流程表
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临床PCR检验流程记录表
检验日期:检验项目: HBV-DNA 扩增仪中保存文件名
使用说明:①严格按单一流向进行实验,即试剂准备区→标本制备区→扩增区,严禁逆向移动。本记录表的流向亦遵循此流程;②各项工作执行后在相应项目前的方框内打“√”;③本记录表最后归档保存在PCR实验室扩增区的专用文件夹中,以备查找。
1. 操作步骤:
1.2.1取n个1.5ml的灭菌离心管,作好标记。(n=样本数+1管HCV阴性对照+1管HCV
强阳性对照+1管HCV临界阳性对照)
1.2.2向上述离心管中分别加入25ul蛋白酶溶液。
1.2.3分别加入待测样本、HCV阴性对照、HCV临界阳性对照和HCV强阳性对照各200ul.
1.2.4加入200ul新鲜配制的裂解液工作液,盖上盖子,振荡15秒,充分混匀。(注意:
不要把蛋白酶溶液直接加入裂解液工作液中)。
1.2.556摄氏度温浴15分钟。瞬时离心,以去除管盖上的滴液。
1.2.6加入250ul无水乙醇,盖上盖子,彻底混匀(振荡15秒)。在室温下静置5分钟
(15-25摄氏度)。注意:如果环境温度超过25摄氏度,无水乙醇需预冷。瞬时离心,以去除管盖上的滴液。
1.2.7将n个核酸提取柱放入收集管中,小心地将步骤1.2.6中的液体移入核酸提取柱
中。盖上盖子,6000*g离心1分钟。倒掉收集管中的废液,将提取柱重新放入收集管中。(如果离心后核酸提取柱中仍有部分液体,以更高的速度再次离心,确保提取柱中无残余的液体)
1.2.8小心的打开核酸提取柱的盖子,加入500ul洗液1,盖上盖子,6000*g离心1分
钟,倒掉收集管中的废液,将提取柱重新放入收集管中。
1.2.9小心的打开核酸提取柱的盖子,加入500ul洗液2,盖上盖子,6000*g离心1分
钟,倒掉收集管中的废液,将提取柱重新放入收集管中。
1.2.10小心的打开核酸提取柱的盖子,加入500ul无水乙醇,盖上盖子,6000*g离心1
分钟,丢弃收集管,将提取柱放入新的收集管中。
1.2.1120000*g高速离心3分钟,彻底去除乙醇。
1.2.12丢弃收集管,将核酸提取柱放入干净的1.5ml离心管中,打开提取柱的盖子,
56摄氏度温浴3分钟,以彻底去除残余的液体。
1.213 将核酸提取柱放入另一干净的1.5ml离心管中,小心打开提取柱的盖子,加入60ul
洗脱液(请将洗脱液加到膜的中央),盖上盖子,室温静置5分钟。20000*g高速离心1分钟收集滤出液,做好标记,4摄氏度保存备用。提取的病毒核酸应在2小时内用于PCR扩增,或在-70摄氏度下可以保存一个月。
2. 扩增试剂准备(PCR前准备区)
从试剂盒中取出HCV RT-PCR反应液、Enzyme Mix , 在室温下融化后,2000*g离心5秒。设所需要的PCR反应管数(玻璃毛细管)为n(n=样本数+1管空白对照+1管HCV 阴性对照+1管HCV强阳性对照+1管HCV临界阳性对照+4管HCV定量标准品),每个测试反应体系配制如下表:
计算好各试剂的使用量,加入到一适当体积试管中,充分混匀均匀后2000*g离心10秒,向各玻璃毛细管中分装15ul,转移至样本处理区。
3.加样(样本处理区)
吸取10ul样本处理步骤1.2.13中收集得到的RNA溶液及HCV定量标准品分别加入到上述反应管中(空白对照直接加入10ul洗脱液),盖紧反应管管盖,连同Roche专用金属反应管套放在离心机中,于2000*g离心10秒,将毛细管转移到检测区。将毛细管排放好放入荧光PCR检测仪内,记录样本摆放顺序。
4. RT-PCR反应(检测区)
4.1 循环条件设置
反应体系为25ul.具体设置方法请参照各仪器使用说明书。
4.2仪器检测通道选择
选择F1检测通道:HCV内对照(IC)选择F2检测通道。
4.3样本的设定
在扩增开始前条件设定时,将HCV定量标准品设为“Standard”并输入试剂盒内给定浓度值,待检样本和对照品设定为“Unknown”。
结果分析条件设定
1.对HCV的曲线和HCV内对照(IC)的曲线进行分别分析。
2.分析方式选择Fit Points,基线调整选择Arithmetic,阈值(threshold)设定原则
以阈值线刚好超过正常HCV阴性对照曲线的最高点,且正常HCV阴性对照病毒滴度为0.0IU/ml为准。具体设置方法请参照各仪器使用说明书。
质控标准
1.将HCV定量标准品1-4的浓度值输入,仪器将自动以HCV定量标准品的浓度值为横坐
标,以其实际测得的外标Ct值为纵坐标给出标准曲线,标准曲线的拟和度绝对值应大
于等于0.980,四个HCV定量标准品的Ct值都应<38.0,否则视为定量结果无效。
2.HCV阴性对照、空白对照HCV RNA应为0.0IU/ml;HCV强阳性对照HCV RNA应为
5.0E+05-1.0E+07IU/ml;HCV临界阳性对照应为1.0E+03-1.0E+05 IU/ml;且HCV阴
性对照、HCV临界阳性对照中HCV内对照(IC)的Ct值都应小于等于33,否则此次实验视为无效。所有实验从样本处理开始重做。
结果判断
1.检测样本中1.0E+03 IU/ml小于等于HCV RNA小于等于5.0E+07 IU/ml,测定结果有
效,可直接报告相应的浓度值。
2.检测样本中HCV RNA大于5.0E+07 IU/ml,可按实际测得值报告相应的病毒滴度,亦
可将该样本用正常人血浆按10倍梯度稀释到本试剂盒定量检测线性范围内后重新测定,测定结果应以稀释倍数进行校正。
3.检测样本中0.0IU/ml小于HCV RNA小于1.0E+03 IU/ml,且HCV内对照(IC)的Ct
值都应小于等于33,表明病毒载量较低,可直接报告浓度值,但注明该病毒滴度量仅供参考。
4.检测样本中HCV RNA等于0.0IU/ml,且HCV内对照(IC)的Ct值都应小于等于33,
应报告为小于试剂盒最低检测限。
5.检测样本中HCV内对照(IC)的Ct值大于33或Ct值为无数值,且HCV RNA小于等
于1.0E+03 IU/ml(包含0.0IU/ml或无数值)时,则此样本的定量结果视为无效,应查找并排除原因,并对此样本进行重复实验。
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