PCR实验室建立及预防污染
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污染Fra Baidu bibliotek因
(二) PCR试剂的污染:主要是由于在PCR 试剂配制过程中,由于加样枪、容器、双 蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染.
污染原因
(三) PCR扩增产物污染: 这是PCR反应中 最主要最常见的污染问题,因为PCR产物 拷贝量 大,远远高于PCR检测数个拷贝的 极限,所以极微量的PCR产物污染,就可 造成假阳就可形成假阳性。
标本制备区
• • • • • • • • 2-8C冰箱、-20C或-80C冰箱 高速台式冷冻离心机 混匀器 水浴箱或加热模块 微量加样器(覆盖1-1000ul) 可移动紫外灯(近工作台面) 超净工作台 消耗品:一次性手套、一次性吸水纸、耐高压处理的离心 管和加样器吸头(带滤心) • 专用工作服和工作鞋 • 专用办公用品
PCR实验室的建立及如何预防 污染的发生
什么是PCR反应?
• 聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction ,PCR)是80年代中期发展起来的 体外核酸扩增技术。
PCR检测原理
PCR反应的特点
• 高度特异性 • 高度敏感性 • 高丰度产量
临床基因扩增检验实验室区域设置 原则
• PCR反应的最大特点是具有较大扩增能力 与极高的灵敏性,但令人头痛的问题是易 污染,极其微量的污染即可造成假阳性的 产生。
污染原因
(一) 标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本 的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢 于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉 污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪污 染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可 随气溶胶或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污 染。
• • • • 试剂储存和准备区 标本制备区 扩增反应混合物配制和扩增区 扩增产物分析区
如使用全自动分析仪,区域可适当合并。
进入各工作区域必须严格按照单一方向 进行,即试剂储存和准备区===>标本制备 区 ===>扩增反应混合物配制和扩增===> 扩增产物分析区。
试剂储存和准备区
• • • • • 2-8C和-20C冰箱 混匀器 微量加样器(覆盖1-1000ul) 移动紫外灯(近工作台面) 消耗品:一次性手套、一次性吸水纸、耐高压处 理的离心管和加样器吸头(带滤心) • 专用工作服和工作鞋 • 专用办公用品
(四) 防止操作人员污染,使用一次性手套、吸头、小离心管应 一次性使用。
(五) 设立适当的阳性对照和阴性对照,阳性对照以能出现扩增 条带的最低量的标准病原体核酸为宜,并注意交叉污染的可能 性,每次反应都应有一管不加模板的试剂对照及相应不含有被 扩增核酸的样品作阴性对照。
(六) 选择质量好的Eppendorf管,以避免样本外溢及外来核酸 的进入,打开离心管前应先离心,将管壁及管盖上的液体甩至 管底部。开管动作要轻,以防管内液体溅出。
污染原因
还有一种容易忽视,最可能造成PCR 产物污染的形式是气溶胶污染;在空气与液 体面摩擦时就可形成气溶胶,在操作时比 较剧烈地摇动反应管,开盖时、吸样时及 污染进样枪的反复吸样都可形成气溶胶而 污染.据计算一个气溶胶颗粒可含48000拷 贝,因而由 其造成的污染是一个值得特别 重视的问题.
防止污染的方法
扩增反应混合物配制和扩增区
• • • • 核酸扩增仪 微量加样器(覆盖1-1000ul) 可移动紫外灯(近工作台面) 消耗品:一次性手套、一次性吸水纸、耐高压处 理的离心管和加样器吸头(带滤心) • 专用工作服和工作鞋 • 专用办公用品
扩增产物分析区
视检验方法不同而定。基本仪器设备如下: 1、 微量加样器(覆盖1-1000ul) 2、 可移动紫外灯(近工作台面) 3、 消耗品:一次性手套、一次性吸水纸、 加样器吸头(带滤心) 4、 专用工作服和工作鞋 5、 专用办公用品
(一) 合理分隔实验室: 将样品的处理、配制PCR反应液、PCR循环 扩增及PCR产物的鉴定等步骤分区或分室进行,特别注意样本处理及 PCR产物的鉴定应与其它步骤严格分开。最好能划分①标本处理区; ②PCR反应液制备区;③PCR循环扩增区;④PCR产物鉴定区。其实验 用品及吸样枪应专用,实验前应将实验室用紫外线消毒以破坏残留的 DNA或RNA。 (二) 吸样枪: 吸样枪污染是一个值得注意的问题。由于操作时不慎将 样品或模板核酸吸入枪内或粘上枪头是一个严重的污染源,因而加样 或吸取模板核酸时要十分小心,吸样要慢,吸样时尽量一次性完成, 忌多次抽吸,以免交叉污染或产生气溶胶污染。 (三) 预混和分装PCR试剂:所有的PCR试剂都应小量分装,如有可能 ,PCR反应液应预先配制好,然后小量分装,-20℃保存。以减少重 复加样次数,避免污染机会。另外,PCR试剂,PCR反应液应与样品 及PCR产物分开保存,不应放于同一冰盒或同一冰箱。