2022侵袭性真菌病实验室诊断方法临床应用专家共识(完整版)
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2022侵袭性真菌病实验室诊断方法临床应用专家共识(完整版)
摘要
侵袭性真菌病的诊断引起临床多学科关注,早期确切诊断是改善患者预后的关键。其方法主要包括真菌直接镜检、真菌培养和鉴定、真菌血清学检查、分子生物学检测和组织病理学检查。为了促进临床医师深入了解并合理应用这些方法,提高侵袭性真菌病诊断水平,我们邀请多学科专家共同编写了此共识。本共识对侵袭性真菌病诊断方法的应用人群、送检要求、结果解读及临床意义进行了介绍并提出建议,强调对于侵袭性真菌病高危患者,应综合应用多种诊断方法、正确取材送检、提高结果解读能力、了解不同方法的临床意义,以便合理应用,更好地服务于患者。
侵袭性真菌病的患病率及病死率呈持续上升趋势,严重威胁患者健康。常见的病原真菌包括念珠菌、曲霉、隐球菌和毛霉等。这些致病真菌引发的疾病临床特征迥异;新发致病菌及多药耐药菌种不断出现,增加了诊疗难度。侵袭性真菌病起病隐匿且临床症状不典型,早期诊断困难。国内外近期推出的针对侵袭性真菌病临床诊疗指南或共识指出,对侵袭性真菌病的诊断均需依靠适宜的微生物学、组织病理学及影像学方法[1, 2, 3, 4]。2020年,欧洲癌症研究和治疗组织(EORTC)和真菌病研究组教育研究协会(MSGERC)发布侵袭性真菌病诊疗共识修订版,该版共识除上述常规方法外,更强调分子生物学诊断的价值[1]。我国医院内进行真菌相关微生物检查的实验室主要为检验科微生物室。近期对全国348家医院微生
物室真菌检验能力的调查显示,我国常规真菌检验项目(真菌涂片染色、真菌培养)及部分血清学检查(真菌1,3-β-D葡聚糖检测)覆盖率在70%以上,但真菌其他检验方法以及整体诊断能力较为欠缺,与国外差距较大[5]。在进一步加强微生物实验室能力建设基础上,也需要将有重要价值的诊断方法介绍给广大临床医师,帮助大家加深认识,合理应用,提高侵袭性真菌病的诊断水平。为此,我们邀请来自感染、呼吸、血液、重症等领域专家与医学真菌和临床微生物专家们共同参与制定本共识。旨在明确目前国内侵袭性真菌病诊断方法的应用价值,促进临床医师对这些方法的合理应用,加强实验室与临床之间的联系,提高我国侵袭性真菌病的诊疗水平。经讨论,对侵袭性真菌病诊断方法:微生物学检查(真菌直接镜检、真菌培养和鉴定、真菌血清学检查、分子生物学方法)和组织病理学检查的临床应用达成以下共识(表1)。
一、微生物学检查的临床应用
(一)真菌直接镜检
真菌直接镜检操作简便、适用多种临床样本[支气管肺泡灌洗液(BALF)、痰液、尿、粪、分泌物、脑脊液、引流液等]、可快速报告结果,有重要临床价值,但存在假阴性、敏感性不高等问题。
●怀疑真菌感染患者BALF及无菌体液(除血液外)标本,应做真菌直接镜检,同时做真菌培养及血清学检查。
●非无菌部位标本(痰、尿、粪等),如果做真菌培养,需要在培养同时做真菌直接镜检。
●真菌直接镜检敏感性不高,多次送检能提高检出率。
●活检组织标本在进行组织病理和真菌培养检查的同时,应做直接压片,荧光染色后进行真菌直接显微镜检查。
荧光染色可显著提高真菌镜检的敏感性[6],临床应用价值更大,但需要注意:在皮肤、呼吸道等非无菌部位,荧光染色检查发现个别孢子有可能是定植真菌,非致病真菌,需要结合临床综合判断。呼吸道标本的直接涂片镜检也可以采用革兰染色。怀疑肺孢子菌肺炎的患者,对诱导痰或BALF 涂片后进行六胺银染色(GMS)。怀疑隐球菌性脑膜炎患者,脑脊液直接
真菌镜检一般采用墨汁染色。
真菌直接镜检报告阴性,由于敏感性问题,不能完全排除真菌感染。报告阳性时,如果是无菌部位标本,可以确诊存在真菌感染,但确认致病真菌种类还需要真菌培养结果;如果是非无菌部位,则需要结合患者免疫状态、临床表现、真菌培养结果及真菌血清学检查综合判断;BALF来源于肺部,非完全无菌部位,但免疫抑制人群(尤其是血液病、骨髓移植、化疗患者)出现阳性结果,且根据镜检时真菌形态提示为曲霉时,对诊断肺曲霉病有重要意义;对于痰、尿、粪等非无菌标本,真菌直接镜检阳性,根据形态提示念珠菌时,要考虑局部真菌定植问题。鼻窦组织标本由于培养阳性率较低,更建议做真菌直接镜检。少量肺部穿刺组织直接压片,进行荧光染色后镜检,可快速发现肺部曲霉或毛霉等丝状真菌感染,有确诊意义,适用于高度怀疑肺部真菌感染患者。
真菌直接镜检中真菌形态的描述对某些菌种有提示意义,但不能替代真菌培养。
(二)真菌培养及鉴定
真菌培养是真菌感染的重要诊断方法,对于诊断感染以及确认致病真菌种类有重要价值[7]。培养出的真菌还可以进行体外药敏检测,指导临床药物选择。真菌培养存在耗时较长、阳性率低以及难以区分定植与感染的问
题。因此建议:
●在送检真菌培养检查同时,应尽可能同时送检真菌直接镜检。
●组织标本进行组织病理检查时,同时应进行真菌培养检查。
●真菌培养所需时间长于细菌培养,一般需要7 d,特殊情况需要2~4周以上,如果怀疑双相真菌感染(马尔尼菲篮状菌、组织胞浆菌等),应同时在28 ℃和37 ℃两个温度下培养。
●非无菌部位真菌培养阳性,存在污染菌或定植菌可能,所以需要对培养出的真菌进行判断,是否有临床意义(即致病真菌),需要结合真菌直接镜检、组织病理检查、患者临床表现以及真菌致病性等进行综合判断。
●真菌鉴定一般需要鉴定至种或复合群(complex)水平。根据菌种类型,参考相应真菌感染诊疗指南选择抗真菌药物治疗。少见真菌或从疑难重症患者分离到的致病真菌应做体外药敏实验,作为临床用药参考。
真菌培养与细菌培养不同,需要适宜真菌生长的温度、培养基和时间,所以如果怀疑真菌感染的患者送检标本(尤其是组织标本)时应做标注,提示实验室用于真菌培养。真菌培养的标本取材方法与细菌培养类似,原则上越多越好。培养物取材后应及时送检(一般2 h内),组织、无菌体液
或骨髓等标本采集后立刻送检(最好15 min内),组织标本要注意禁止福尔马林固定。真菌生长慢于细菌,念珠菌、曲霉、马尔尼菲篮状菌一般需要7 d,组织胞浆菌需要时间较长,一般要3~6周,其他致病真菌培养时间介于1~3周之间,肺孢子菌难以体外培养。
真菌培养敏感度不高,阴性结果不能完全排除真菌感染。特别应注意在使用抗真菌药物之前送检标本。出现阳性结果时,要关注真菌种类,结合临床判断是否有临床意义。判断时应考虑真菌直接镜检或组织病理提示,是否与真菌培养结果相符;临床上,培养真菌是否可以导致相应临床表现;是否存在定植菌或污染可能。难以判断时,可多次重复送检。
真菌血培养阳性时要判断是致病菌还是污染菌。血培养可以培养出酵母菌、双相真菌。如果血培养培养出丝状真菌,则需要进一步判断,如果是曲霉或毛霉,污染菌的可能性很大。如果是镰刀菌或赛多孢霉,致病菌的可能性很大。
真菌培养后鉴定一般鉴定至种或复合群水平,常规微生物实验室均可完成。真菌复合群中包含若干个种。例如曲霉是属水平,烟曲霉是复合群水平,烟曲霉复合群中还包括若干个种。如果存在复合群,进一步鉴定至种水平时需要DNA测序,仅限特殊情况时应用[8]。
某些真菌存在天然耐药,一般根据菌种鉴定结果,参考各种真菌感染诊治