病毒DNA提取

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小鼠血浆中HSV-1 DNA的提取

[目的] 掌握血浆中病毒DNA 提取的原理,熟悉其提取方法。

[原理] E.Z.N.A.®Viral DNA Kit

该试剂盒提供了从小于250ul血浆、血清、无细胞培养液等样品中快速简单地提取病毒DNA的方法,液体样品经Buffer BL和蛋白酶(OB)消化后,经乙醇调节结合条件,过柱吸附DNA,再经过两步快速洗涤后,最后用Elution Buffer (10mM Tris,pH8.5)溶解基因组DNA。纯化的DNA可直接用于PCR,Southern杂交,酶切等实验。

[试剂及仪器]旋涡混合振荡仪;微量DNA定量仪;台式离心机;65℃水浴锅。

1.5ml无菌EP管(2个/人);EP抗凝管(含100ul抗凝剂)(K);1000ul枪及枪头;。Hibind DNA 结合柱(1个/人);2ml收集管(3个/人);OB蛋白酶(OB);Buffer B L(含线性丙烯酰胺)(BL);乙醇(乙);Buffer HB(HB);DNA Wash Buffer(W);Elution Buffer(EB)。

[实验步骤]

一、血浆样品的制备:

1.用微量加样器取100ul抗凝剂加入1.5mlEP管中。

2.右手抓起小鼠尾巴,用左手固定动物,压迫眼球,尽量使眼球突出,右手用镊子迅速摘除

眼球,将流出的血液滴入含有抗凝剂的1.5ml EP管中,迅速混匀后,10000rpm,离心3min。

上层黄色透明的即为血浆。

二、DNA的提取

1.取血浆250ul(如不足250ul,用Elution Buffer补足250ul)于1.5ml无菌EP管中。

2.加入10ul OB蛋白酶和250ul BL Buffer(含4ul线性丙烯酰胺用于填补病毒DNA在吸附

柱上的本底吸附),于旋涡混合振荡仪上最大速度振荡15sec。

3.65℃孵育10min。孵育过程中,用旋涡混合振荡仪混匀一次。

4.加入260ul乙醇,旋涡混合振荡仪最大速度振荡20sec。12000×g离心10sec,使盖子上的

液体沉于管中。

5.将Hibind DNA结合柱装在2ml收集管中,将第4步离心的上清中所有液体(约760ul)

加入Hibind DNA结合柱装上,8000×g离心1min。卸下收集管,将收集管及其中的液体弃去。

6.将Hibind DNA结合柱装在另一个新的收集管中,向柱中加入500ul HB Buffer,8000×g

离心1min,卸下收集管,倒掉其中的液体后,将收集管重新装在柱子上。、

7.向柱中加入700ul DNA Wash Buffer,8000×g离心1min,卸下收集管,将收集管及其中

的液体弃去。

8.将Hibind DNA结合柱装在另一个新的收集管中,向柱中加入700ul DNA Wash Buffer,

8000×g离心1min,卸下收集管,倒掉其中的液体后,将收集管重新装在柱子上。

9.将空的Hibind DNA结合柱15000×g离心2min,以去掉其中残余的液体。卸下收集管,

将收集管及其中的液体弃去。----这一步非常重要

10.将Hibind DNA结合柱装在另一个新的无菌1.5ml EP管上(事先做好标记),加入50-100ul

65℃预热的Elution Buffer,室温静置5min后,8000×g离心1min,洗脱液中即含有病毒DNA。

三、DNA定量:

微量DNA定量仪。取1.5ul用于DNA定量。

[结果] DNA浓度(ng/μl)=

A260=1.0, ds DNA (double stranded DNA) = 50 mg/ml

DNA纯度判定:

1. A260 / A280>1.8 85%-95%

<1.8 蛋白或酚类污染

2. A260 / A230>2

<2 碳水化合物,多肽,苯酚污染

注意事项:

1.染毒动物及物品的处理:

2. 抗凝剂:

(1)EDTA是极大多数(降解DNA的)脱氧核糖核酸酶的强烈抑制剂,建议抗凝剂使用EDTA,终浓度一般为50~100 mmol /L。

(2)ACD抗凝剂,每100ml中含0.48g柠檬酸,1.32g柠檬酸钠和1.47g葡萄糖,用作抗凝时每6ml新鲜血液中加入1ml ACD。

(3)一般不用肝素抗凝。

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