2 基因组DNA的提取与分离
实验二细菌基因组DNA的提取
4、取上清,加入等体积(约800ul)的酚:氯仿:异戊醇(25:24: 1),混匀,离心12000rpm,5min,将上清液转至新管中。(抽提 两次)
DNA纯化(去杂质) 蛋白质: 常用苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)或氯仿:异戊醇(24:1) 抽提。 RNA :常选用RNase消化 ,或是用LiCl来消除大分子的RNA。 酚类物质: 提取液中加少量巯基乙醇,选取幼嫩的材料。 多糖: 提取液中加1%PVP。
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核酸样品的保存
温度: 4℃(5℃)最佳和最简单 -70℃是长期保存的良好温度,为一次性保存 -20℃保存
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DNase抑制
①加入少量金属离子螯合剂,如0.01 mol/L EDTA 或柠檬酸钠,DNase基本可以全部失活。 ②去垢剂、蛋白变性剂及DNase抑制剂也可使 DNase失活。
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RNase抑制 ①操作要带手套。 ②所有器皿要严格消毒, ③试剂处理 ④低温操作
⑤在分离过程中要加入一定的RNase抑制剂。
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四、注意事项——细胞裂解
➢ 材料应适量,过多会影响裂解,导致DNA量 少,纯度低
➢ 针对不同材料,选择适当的裂解预处理方式:
• 植物材料--液氮研磨 • 动物组织--匀浆或液氮研磨 • 组培细胞--蛋白K • 细菌--溶菌酶破壁 • 酵母--破壁酶或玻璃珠
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核酸制备中常用的蛋白质变性剂
1.使蛋白质变性、沉淀,从核酸提取液中分离除去,以防造 成蛋白污染。
实验二 全血基因组DNA的提取
实验二:全血基因组DNA的提取一实验目的:1.学习并掌握动物全血提取DNA的方法2.从全血中提取到一定量的纯净的DNA样品二实验原理DNA存在于细胞核中,用细胞裂解液除取红细胞,核裂解液破坏白细胞,氯仿使蛋白质变性,用无水乙醇洗涤DNA,从而得到纯净的DNA分子。
三、实验仪器、材料、试剂(一)仪器1.高速离心机 2.烘箱 3.冰箱4.水浴锅5.微量移液器6.高压灭菌锅(二)材料1.鸡血、2.细胞裂解液3.核裂解液、4.饱和NaCl、5.氯仿、6.无水乙醇、7.ddHO、8.滤纸、9.微量取液器、10.1.5mL/2mL 离心管、11.一次性2手套、12.离心管架、13.记号笔等(三)试剂配制细胞裂解液:10mm/l Tris-Hcl(1mol/L) ,11%w/l蔗糖,5 mmol/L Mgcl2,1%v/vEDTA, 10mm/L Triton 核裂解液:10mm/l Tris-Hcl, 1%w/v SDS, 10mm/L Na2柠檬酸三钠四、实验步骤1.吸取500ul血液至2ml离心管,加入1000ul的细胞裂解液,上下颠倒2-3min。
2.在4°C,6000rpm转速离心3min,弃上清液。
3.重复1-2步(1-3次),直至洗净红细胞,颜色变白为止。
4.加入300ul核裂解液,上下颠倒2min,室温静置2min。
5.加入100ul饱和NaCl和600ul氯仿,轻轻上下颠倒2min, 4°C,6000rpm 转速离心5min。
6.小心吸取上清液(不能吸入下层液体),移至新的1.5ml的离心管。
7.加入600ul冷藏无水乙醇,轻轻摇动,观察有无絮状物质。
8. 4°C,13000rpm转速离心3min,小心倒掉上清液,用滤纸吸取管壁周围的液体,室温下是离心管完全干燥。
(1h左右)9.沿管壁慢慢加入50ul ddHO,然后轻轻吹打均匀。
210.-20°C的冰箱保存。
基因组dna提取实验报告
基因组dna提取实验报告基因组 DNA 提取实验报告一、实验目的本次实验的主要目的是从不同的生物样本中提取高质量的基因组DNA,以便进行后续的分子生物学实验,如 PCR 扩增、基因测序等。
通过本次实验,掌握基因组 DNA 提取的基本原理和操作方法,了解影响 DNA 提取质量的因素,并对提取的 DNA 进行质量检测和分析。
二、实验原理基因组DNA 提取的基本原理是利用细胞裂解液破坏细胞膜和核膜,使细胞内的物质释放出来,然后通过蛋白酶 K 消化蛋白质,去除 RNA 等杂质,再利用酚/氯仿等有机溶剂抽提,将蛋白质、多糖等杂质去除,最后通过乙醇沉淀或异丙醇沉淀得到纯净的基因组 DNA。
三、实验材料与试剂(一)实验材料1、新鲜的动物组织(如肝脏、肌肉等)2、植物叶片3、细菌培养物(二)实验试剂1、细胞裂解液(含 TrisHCl、EDTA、NaCl、SDS 等)2、蛋白酶 K3、酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)4、无水乙醇5、 70%乙醇6、 RNA 酶 A7、 3M 醋酸钠(pH 52)8、 TE 缓冲液(10 mM TrisHCl,1 mM EDTA,pH 80)(三)实验仪器1、离心机2、移液器3、恒温水浴锅4、紫外分光光度计5、电泳仪及电泳槽四、实验步骤(一)动物组织基因组 DNA 提取1、取约 01g 新鲜的动物组织,放入 15ml 离心管中,加入 1ml 细胞裂解液,用剪刀将组织剪碎,然后在冰上放置 10min。
2、向离心管中加入20μl 蛋白酶 K(20mg/ml),充分混匀,在 55℃水浴锅中孵育过夜,直至组织完全消化。
3、加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),轻轻颠倒离心管10min,使溶液充分混匀。
4、 12000rpm 离心 10min,将上清液转移到新的离心管中。
5、重复步骤 3 和 4 一次。
6、向上清液中加入 1/10 体积的 3M 醋酸钠(pH 52)和 2 倍体积的无水乙醇,轻轻颠倒离心管,可见白色的 DNA 沉淀出现。
实验一 基因组DNA的提取
六、操作步骤
1.5ml离心管中加入500μl提取缓冲液 离心管中加入500μl提取缓冲液, 1. 在1.5ml离心管中加入500μl提取缓冲液, 60℃水浴预热 水浴预热。 60℃水浴预热。 植物组织0.1g, 剪碎, 2. 植物组织0.1g, 剪碎, 在研钵中加液氮磨 成粉状后立即倒入预热的离心管中, 剧烈摇动混匀, 成粉状后立即倒入预热的离心管中, 剧烈摇动混匀, 60℃水浴保温30-60分钟 时间长,DNA产量高), 水浴保温30 分钟( ,DNA产量高 60℃水浴保温30-60分钟(时间长,DNA产量高), 不 时摇动。 时摇动。 加入500μl氯仿/戊醇/乙醇溶液, 500μl氯仿 3. 加入500μl氯仿/戊醇/乙醇溶液, 颠倒混 需带手套, 防止损伤皮肤) 室温下静置5分钟, 匀(需带手套, 防止损伤皮肤),室温下静置5分钟, 使水相和有机相分层(必要时可重新混匀) 使水相和有机相分层(必要时可重新混匀)。
实验一、基因组DNA DNA的提取 实验一、基因组DNA的提取
一、实验目的: 实验目的: 1.了解真核生物基因组DNA提取 的一般原理。 2. 2.掌握DN理,是将分散好 的一般原理, 提取 的一般原理 的真核生物组织细胞在含SDS和蛋白酶 和蛋白酶K 的真核生物组织细胞在含 和蛋白酶 的溶液中消化分解蛋白质,再用酚: 的溶液中消化分解蛋白质,再用酚:异戊 醇抽提的方法去除蛋白质,得到的DNA 醇抽提的方法去除蛋白质,得到的 经乙醇沉淀或透析等方法进一步纯化。 经乙醇沉淀或透析等方法进一步纯化。
三、材料
植物组织
四、设备
移液器,冷冻高速离心机, 移液器,冷冻高速离心机,台式高速 离心机,水浴锅,陶瓷研钵,1.5ml离心 离心机,水浴锅,陶瓷研钵,1.5ml离心 管。
基因分离的主要方法与步骤
基因分离的主要方法与步骤
基因分离的主要方法与步骤如下:
1. 细胞破碎:将含有DNA的细胞完全破碎,可以通过物理方法(如超声波破碎、冻融法)或化学方法(如洗涤法、高渗溶解法)实现。
2. DNA的分离:DNA被大量的细胞组分包围,这些组分需要被去除以将DNA纯化。
一个常见的DNA分离方法是酚/氯仿抽提法。
先用酚和氯仿的混合液沉淀蛋白质和其他杂质物质,然后通过离心去除上清液中的DNA。
3. 脱盐:提取出的DNA通常含有大量的盐类,需要通过脱盐处理来除去这些盐类,否则这些盐类可能会影响下一步操作,如PCR扩增。
4. 纯化:DNA提取后需要进行纯化以消除污染和杂质。
可以通过醇沉淀(如乙醇、异丙醇),离子交换柱层析、凝胶过滤等方法实现。
5. 基因组DNA的制备:从细胞中获得DNA有各种物理、化学和酶法。
无论所采用的方法或DNA来源如何,所有步骤都经过选择和优化,以获得最大数量、质量和完整性的基因组DNA。
由于DNA是细胞质的一部分,被细胞核和或细胞膜包围,因此在核酸纯化之前,细胞碎片、脂质和蛋白质的消除分为三个重要步骤:细胞膜/细胞壁的破裂、DNA的分离和沉淀,以及最后溶解DNA。
以上是一般的基因分离步骤,实验中具体的步骤和方法则需要根据基因来源和研究目标来选择。
基因组dna提取流程
基因组DNA提取的流程
1. 样本选择:选择适合提取基因组DNA的样本类型,如细胞、组织或血液。
确保样本保存在合适的条件下,以保持DNA的完整性。
2. 细胞破碎:对于细胞样本,首先需要将细胞破碎以释放DNA。
可以使用物理方法,如机械剪切或超声波处理,或者使用化学方法,如洗涤溶解和细胞裂解酶处理。
3. DNA溶解:将细胞裂解提取物加入DNA溶解缓冲液中,以彻底溶解DNA。
4. 去除杂质:通过离心、过滤或沉淀等方法去除蛋白质、RNA 等杂质。
5. 纯化DNA:使用吸附剂、洗涤剂或沉淀剂等方法去除剩余的杂质,得到纯化的基因组DNA。
6. 检测与定量:通过电泳、荧光光谱等技术检测提取的DNA质量和浓度,确保提取的DNA满足后续实验的要求。
以上是基因组DNA提取的一般流程,具体操作可能会因实验条件、样本类型和目标DNA的不同而有所差异。
实验二 CTAB小样法提取植物基因组DNA2
实验二CTAB小样法提取植物基因组DNA【原理】CTAB是一种阳离子去污剂,溶于热水、乙醇、三氯甲烷,易溶于异丙醇水溶液,可溶解细胞膜,能与核酸形成复合物,在高盐溶液中可溶,当降低溶液盐浓度到一定程度时,从溶液中沉淀,通过离心可将CTAB-核酸的复合物与蛋白、多糖类物质分开。
最后通过乙醇或异丙醇沉淀DNA,而CTAB溶于乙醇或异丙醇而除去。
植物细胞内各种DNA(包括基因组DNA和核外DNA)称为总DNA。
高等植物的DNA与蛋白质结合成脱氧核糖蛋白(DNP),能溶解在纯水或1mol/L的NaCl溶液中,而不溶于有机溶剂。
苯酚和氯仿等有机溶剂,能使蛋白质变性,并使抽提液分相。
因核酸(DNA、RNA)水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。
上清液中加入异丙醇或乙醇使DNA沉淀,沉淀DNA溶于双蒸水或TE溶液中,即得植物总DNA溶液。
【实验器具、药品试剂】水浴锅,研钵,微量移液器,枪头,离心管,台式离心机,液氮,恒温箱,标签纸,紫外分光光度计,磁力搅拌机,剪刀,记号笔等。
2% CTAB抽提缓冲溶液(100 ml 1 M Tris HCl pH 8.0,280 ml 5 M NaCl,40 ml 0.5 M EDTA,20 g of CTAB,定容至1 L),异丙醇, 氯仿-异戊醇(24:1)等。
【实验步骤】(1) 2%CTAB抽提缓冲液在65℃水浴中预热。
(2) 取少量叶片(0.2 g~0.3g)置于研钵中,加入700 μl预热的2%CTAB抽提缓冲液磨至细粉状;(4) 将磨碎液倒入1.5或者2.0 ml的灭菌离心管中;(5) 65℃水浴,每隔10 min轻轻摇动,30-35 min后取出(或更长时间);(破碎细胞)(6)冷却至室温后,加入等体积氯仿-异戊醇(24:1),充分颠倒混匀3~5 min;(抽提去蛋白)(7) 12 000 rpm离心5 min;(8) 用移液器轻轻地吸取上清夜至2.0ml灭菌离心管,注意不要将乳白色中间层吸走;(9) 重复(6)~(8)两次;其间,将600 μl的异丙醇(预先置于-20℃冰箱中)加入另一批1.5ml 灭菌空离心管中;(10) 在第三次抽提后上清夜转入含有异丙醇的1.5ml离心管内,将离心管轻轻上下摇动30 sec,使异丙醇与水层充分混合,然后静置于冰上(或者低温冰箱)30分钟或者更长时间(可过夜),一般可见DNA絮状漂浮物;(沉淀核酸)(11) 2 500 rpm离心2 min后,可见白色DNA丸状物附着于管壁底部,倾斜管口倒掉液体,注意勿将白色DNA沉淀倒出,将离心管斜立于铺开的纸巾上沥去液体;(12) 加入800 μL的70%乙醇,用手指轻弹管尖,使沉淀与管底的DNA块状物浮游于液体中;(13) 放置20 min或者更长时间,使DNA块状物中的不纯物溶解;(14) 5 000 rpm离心2 min后,倒掉液体;(15) 可重复(12)-(14)步以进一步洗涤DNA;(16) 自然风干或电风扇吹干DNA,过分干燥DNA稍后较难溶解;(17) 加入50~200 μL 1×TE缓冲液,置于4℃直至DNA充分溶解,其间可用手指轻弹管尖以促进DNA溶解(切勿剧烈震荡!!);(18) 将充分溶解的DNA置于-20℃保存、备用。
基因组dna的提取原理
基因组dna的提取原理基因组DNA的提取原理。
基因组DNA的提取是生物学实验中的一项重要步骤,它是从生物样本中分离出DNA分子的过程。
DNA提取的目的是为了进一步的分子生物学研究,如PCR扩增、测序、重组等实验。
下面将介绍基因组DNA提取的原理及步骤。
1. 样本的准备。
在进行基因组DNA提取之前,首先需要准备样本。
样本可以是细胞、组织或血液等。
对于细胞和组织样本,通常需要将其打碎以释放细胞内的DNA。
而对于血液样本,则需要进行红细胞溶解,以获得含有DNA的白细胞。
2. 细胞裂解。
细胞裂解是DNA提取的第一步,其目的是破坏细胞膜和核膜,释放细胞内的DNA。
通常可以使用裂解酶或裂解缓冲液来实现细胞裂解。
在裂解过程中,可以加入蛋白酶来降解蛋白质,以减少对DNA的污染。
3. 蛋白质沉淀。
裂解后的细胞溶液中可能含有大量的蛋白质和其他杂质,需要进行蛋白质沉淀。
通常可以加入盐和酒精来沉淀蛋白质,然后通过离心将沉淀的蛋白质去除,留下含有DNA的上清液。
4. DNA沉淀。
为了获得纯净的DNA,需要将其从上清液中沉淀出来。
可以通过加入乙醇或异丙醇来沉淀DNA,然后通过离心将沉淀的DNA收集起来。
5. DNA纯化。
最后一步是对沉淀得到的DNA进行纯化。
可以使用乙醚或异丙醇来去除残留的盐和其他杂质,然后用适当的缓冲液溶解DNA,得到纯净的基因组DNA。
通过以上步骤,就可以从生物样本中提取出纯净的基因组DNA。
这些DNA可以用于后续的分子生物学实验,如PCR扩增、基因测序、重组等。
基因组DNA的提取原理并不复杂,但需要严格控制实验条件,以确保提取得到的DNA质量和纯度。
人类基因组dna的提取实验报告
人类基因组dna的提取实验报告
人类基因组DNA的提取实验报告
DNA提取是分子生物学和遗传学研究中的基础性技术之一。
本次实验旨在从人类细胞中提取DNA,并通过多种方法进行检测和分析。
以下是实验的详细过程和结果。
实验材料与方法:
1.材料:人类细胞样本、细胞裂解液、蛋白酶K、异丙醇、氯仿、等渗盐溶液、乙醇、TE缓冲液、琼脂糖、DNA标准品。
2.方法:
(1)取100μl人类细胞样本,加入细胞裂解液中进行细胞破裂。
(2)加入蛋白酶K使细胞膜和蛋白质降解。
(3)加入异丙醇使DNA沉淀,离心去除上层液体。
(4)加入氯仿和等渗盐溶液,离心分离DNA纯化。
(5)加入乙醇沉淀DNA。
(6)加入TE缓冲液重溶DNA。
(7)用琼脂糖凝胶电泳法分离DNA并检测。
实验结果:
经过琼脂糖凝胶电泳分离,成功提取了人类细胞的DNA样本。
在电泳结果中,能够明显地看到DNA条带的形成,表明DNA的提取和纯化过程都比较成功。
为了进一步检测DNA的纯度和浓度,我们使用了多种方法,如吸光度测定、荧光染料检测等。
实验结果表明,提取出的DNA纯度较高,浓度也较为理想。
结论:
通过本次实验,我们成功地提取了人类细胞的DNA,并对其进行了检测和分析。
这为我们后续的研究提供了重要的基础。
同时,实验还说明了DNA提取技术的重要性和应用广泛性,不仅在分子生物学和遗传学领域有着广泛的应用,也在医学和生物工程等领域具有重要的价值。
细胞基因组dna提取
细胞基因组DNA提取介绍细胞基因组DNA提取是生物学中一项重要的实验技术,它可以将细胞中的基因组DNA分离出来,为后续的分子生物学研究提供样本。
本文将深入探讨细胞基因组DNA提取的原理、步骤和常见的应用。
原理细胞基因组DNA提取的原理基于细胞膜和核膜的溶解,以及DNA的萃取和纯化。
细胞膜和核膜的溶解可以通过物理方法(如高温、机械打碎)或化学方法(如洗涤剂、蛋白酶)来实现。
细胞膜和核膜的溶解后,可以通过离心等方法将DNA从其他细胞组分中分离出来,再通过酒精沉淀等技术将DNA纯化。
步骤细胞基因组DNA提取一般包括以下步骤:1. 细胞收集与处理•收集待提取细胞,可以是动物组织、植物组织或细菌培养物等。
•将细胞洗涤,去除培养基或组织污染。
2. 细胞破碎与溶解•使用机械方法(如搅拌、超声波)或化学方法(如洗涤剂、蛋白酶)破碎细胞膜和核膜,释放DNA。
•添加缓冲液调节溶液的pH值和离子浓度,有利于DNA的稳定和纯化。
3. DNA纯化•利用酒精沉淀法将DNA从溶液中沉淀出来。
•使用盐溶解沉淀的DNA,去除杂质(如蛋白质、RNA)。
•使用醇提纯获得纯净的DNA。
应用细胞基因组DNA提取在生物学研究中有着广泛的应用。
以下是几个常见的应用领域:1. PCR扩增提取的细胞基因组DNA可以作为PCR扩增的起始物质,用于分析目标基因的序列、基因型或表达水平。
PCR扩增可以通过DNA模板的扩增来获得更多的DNA样本,以进行后续的测序、分型、检测等研究。
2. 基因测序细胞基因组DNA提取后,可以利用测序技术对整个基因组进行测序,以研究基因组的结构、功能和变异等。
基因测序是深入了解生物体基因组信息的关键步骤,对生物学、医学和农业等领域具有重要的意义。
3. 遗传学研究通过细胞基因组DNA提取,可以进行遗传学研究,包括基因突变的检测、遗传多态性的分析和亲缘关系的判断等。
这些研究有助于揭示遗传变异与疾病发生、物种进化和家族谱系等问题之间的关系。
基因组DNA的提取与分离鉴定课后研讨题(手写)
基因组DNA的提取与分离鉴定课后研讨题1、动植物DNA提取的方法主要有哪些?并说明各方法的原理。
答:(1).浓盐法利用RNP和DNP在电解溶液中溶解度不同,将二者分离,常用的方法是用1M 氯纳提取化钠抽提,得到的DNP粘液与含有少量辛醇的氯仿一起摇荡,使乳化,再离心除去蛋白质,此时蛋白质凝胶停留在水相及氯仿相中间,而DNA位于上层水相中,用2倍体积95%乙醇可将DNA 钠盐沉淀出来.也可用0.15 MNaCL液反复洗涤细胞破碎液除去RNP,再以1MNaCL提取脱氧核糖蛋白,再按氯仿---异醇法除去蛋白.两种方法比较,后种方法使核酸降解可能少一些.以稀盐酸溶液提取DNA 时,加入适量去污剂,如SDS可有助于蛋白质与DNA 的分离。
在提取过程中为抑制组织中的DNase对DNA 的降解作用,在氯化钠溶液中加入柠檬酸钠作为金属离子的烙合剂.通常用.15MNaCL,0.015M柠檬钠,并称SSC溶液,提取DNA.(2).阴离子去污剂法:用SDS或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA .由于细胞中DNA与蛋白质之间常借静电引力或配位键结合,因为阴离子去污剂能够破坏这种价键,所以常用阴离子去污剂提取DNA.(3).苯酚抽提法:苯酚作为蛋白变性剂,同时抑制了DNase的降解作用.用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。
离心分层后取出水层,多次重复操作,再合并含DNA 的水相,利用核酸不溶于醇的性质,用乙醇沉淀DNA 。
此时DNA是十分粘稠的物质,可用玻璃漫漫绕成一团,取出。
此法的特点是使提取的DNA保持天然状态 .( 4).水抽提法:利用核酸溶解于水的性质,将组织细胞破碎后,用低盐溶液除去RNA,然后将沉淀溶于水中,使DNA充分溶解于水中,离心后收集上清液.在上清中加入固体氯化钠调节至2.6M.加入2倍体积95%乙醇,立即用搅拌法搅出.然后分别用66% ٠80%和95%乙醇以及丙铜洗涤,最后在空气中干燥,既得DNA样品.此法提取的DNA中蛋白质含量较高,故一般不用.为除蛋白可将此法加以改良,在提取过程中加入SDS.2、苯酚、氯仿和异戊醇在基因组DNA的提取中各有什么作用?答:苯酚:使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
动物基因组dna分离的原理
动物基因组dna分离的原理动物基因组DNA分离的原理主要涉及到DNA的提取、纯化以及分析等过程。
以下是该过程的详细解释:第一步:DNA的提取动物基因组DNA的提取是DNA分离的第一步。
一般来说,有两种常用的提取方法:有机溶剂法和无机盐法。
有机溶剂法是指使用有机溶剂(如苯酚和氯仿)将DNA从细胞中提取出来。
首先,细胞样品被加入一个细胞裂解缓冲液中,以破坏细胞膜,并释放出DNA 和其他细胞组分。
然后,加入有机溶剂混合液对溶解后的溶液进行提取,使DNA溶解在有机相中。
最后,通过离心加速分离有机相和水相,并将DNA从有机相中重新提取出来。
无机盐法是指使用一系列含有盐的溶液将DNA从细胞中提取出来。
这种方法基于DNA在高盐浓度下与溶液中的阳离子形成离子相关物质可能性较低的原理。
首先,细胞样品被加入盐裂解缓冲液中,经裂解后,DNA与其他细胞组分分离。
然后,高盐缓冲液加入溶液中,通过离心将DNA从其他细胞组分中分离出来。
最后,通过洗涤等步骤去除残余的细胞组分和盐,并得到纯化的DNA 样品。
第二步:DNA纯化DNA纯化是为了去除提取过程中的杂质和其他细胞组分,从而得到高质量的DNA。
DNA纯化可以通过蛋白酶和蛋白质沉淀剂等酶消化、有机物沉淀和电泳等方法进行。
在酶消化方法中,蛋白酶被加入到DNA溶液中,以将DNA附着在蛋白酶或相关酶的组分上。
然后,使用有机物或其他方法除去蛋白酶和相关组分,使DNA 得到纯化。
有机物沉淀方法是通过将DNA与有机溶剂混合并离心沉淀去除其他细胞组分。
加入有机物(如异丙醇、以及其它盐类)的目的是改变DNA与溶液中的盐类和水分子的相互作用,从而促使DNA形成团状并沉淀。
离心作用向下压缩DNA并与有机溶剂一起沉淀,而其他细胞组分不受影响地保留在上层溶液中。
电泳是一种以电场为驱动力的方法,利用DNA的电荷特性将DNA分离出来。
DNA溶液被加载在含有琼脂糖的水平琼脂糖凝胶上。
然后,通过施加电场,DNA的负电荷会使其向正电极迁移。
质粒dna 的提取和基因组dna的提取
质粒dna 的提取和基因组dna的提取以质粒DNA的提取和基因组DNA的提取为标题,本文将分别介绍质粒DNA和基因组DNA的提取方法。
一、质粒DNA的提取质粒DNA是存在于细菌细胞内的一个环状DNA分子,它具有独立复制和转录的能力。
质粒DNA的提取是进行基因工程研究和分子生物学实验的重要步骤之一。
质粒DNA的提取方法一般包括以下步骤:1.细菌培养与收获:首先选取含有目标质粒的细菌菌株进行培养,培养至适宜的生长阶段,然后通过离心将细菌菌体收获。
2.细菌菌体破碎:将收获的细菌菌体进行破碎,破碎方法常用的有物理破碎和化学破碎。
物理破碎可以通过超声波处理或高压破碎等方法进行;化学破碎则常使用蛋白酶K等酶进行。
3.质粒DNA的分离:通过离心将破碎后的细菌细胞碎片与其他细胞组分进行分离。
常用的方法包括差速离心和密度梯度离心等。
4.质粒DNA的纯化:将分离得到的质粒DNA进行纯化,去除杂质和其他核酸。
纯化方法常用的有酚-氯仿法、硅胶柱层析法和离子交换层析法等。
5.质粒DNA的测定:对提取得到的质粒DNA进行浓度和纯度的测定,常用的方法有比色法和紫外分光光度法等。
二、基因组DNA的提取基因组DNA是一个生物体内所有基因的总和,它包含了生物体的全部遗传信息。
基因组DNA的提取是进行基因组学研究和遗传分析的重要步骤之一。
基因组DNA的提取方法一般包括以下步骤:1.样品处理:首先选择合适的样品,如动物组织、植物组织或微生物等,然后对样品进行预处理,如细胞破碎、蛋白酶处理等。
2.细胞破碎:将样品中的细胞破碎,使细胞内的DNA释放出来。
破碎方法常用的有物理破碎和化学破碎。
物理破碎可以通过高温、高压或超声波处理等方法进行;化学破碎则常使用蛋白酶K等酶进行。
3.基因组DNA的分离:通过离心将破碎后的细胞碎片与其他细胞组分进行分离。
常用的方法包括差速离心和密度梯度离心等。
4.基因组DNA的纯化:将分离得到的基因组DNA进行纯化,去除杂质和其他核酸。
基因组的dna提取与纯化中dna含量低的原因
基因组的dna提取与纯化中dna含量低的原因1. 引言基因组的DNA提取和纯化对于后续实验的进行非常重要,因为DNA 是产生生命的重要物质。
然而,有时DNA的提取和纯化过程中会出现DNA含量低的情况,这会用影响后续实验的结果。
本文将讨论在DNA提取和纯化中,DNA含量低的原因。
2. DNA提取的基本步骤DNA提取通常分为三个步骤:细胞破裂、DNA分离、DNA纯化。
其中,细胞破裂是最关键的步骤,因为它决定了DNA是否能够被有效地分离。
在细胞破裂时,常用的有生物法和物理法两种方法。
生物法是指使用化学试剂或酶,将细胞膜和核壳破裂,使DNA裸露。
物理法则是通过机械方法(如高压),来破裂细胞膜和核壳。
在细胞破裂后,可以通过离心来分离DNA。
DNA纯化是为了减少杂质对DNA产生影响。
纯化方法通常为盐溶、硅胶柱纯化、离心管纯化等。
这些方法可以将DNA从其他杂质中分离出来,获得较干净的DNA样品。
3. DNA含量低的原因DNA含量低通常有以下几个原因:3.1 样品来源不纯样品来源不纯可以是由于取样不规范导致,也可以是外源性DNA污染导致。
比如,从土壤中提取DNA时,土壤中的微生物DNA可能会干扰样品中目标DNA的提取和纯化。
因此,必须在取样和提取前进行预处理,以确保目标DNA可以被有效地提取。
此外,对于人类样品,样品处理要避免污染,如手套的使用,每次操作都更换器材等。
3.2 细胞破裂效果不理想细胞破裂是DNA提取的关键步骤之一。
如果细胞破裂效果不理想,将会导致DNA含量低。
在细胞破裂时,需要考虑一些因素,如细胞密度、细胞类型以及细胞破裂方法等。
如果细胞密度过高或者破裂方法不当,就有可能导致DNA破坏或者不完全释放,从而降低DNA的提取量和纯度。
3.3 质量差的DNA纯化纯化方法也是影响DNA含量的一个因素。
如果选用质量差的纯化方法,可能会导致DNA遭受损伤或者丢失。
同时,以前某些纯化方法对一些DNA形态脆弱的样本存在一定的损伤,如某些ungi、植物的叶片、种子等,在这些情况下,DNA含量会出现不同程度的降低。
基因组dna的提取原理
基因组dna的提取原理
基因组DNA的提取原理是通过一系列化学、生物学和生物化
学技术的组合来分离和纯化目标DNA分子。
1. 细胞破碎:首先,需要将目标细胞破碎,并释放出细胞质和细胞核中的DNA。
通常使用机械方法(如搅拌、研磨等)或
化学方法(如细胞溶解剂)来破坏细胞膜和核膜。
2. DNA溶解:接下来,使用缓冲液来将DNA从细胞质和细胞核溶解出来。
缓冲液中通常含有高盐浓度、EDTA和蛋白酶等
成分,可以破坏细胞膜和核膜的结构,同时也能够使细胞蛋白质发生变性并失去功能。
3. 蛋白酶处理:蛋白酶的加入能够降解蛋白质,包括细胞膜上的表面蛋白、核膜蛋白和组蛋白等,从而使DNA不再受到蛋
白质的阻碍。
4. DNA纯化:通过一系列步骤,如加入盐和异丙醇,可以使DNA在溶液中聚集形成沉淀。
随后,通过离心将沉淀分离出来,可以将DNA从其他污染物中纯化出来。
此外,还可以利
用特定的纯化柱或介质来选择性地吸附DNA,并通过洗脱步
骤将其从其他杂质中分离出来。
5. DNA沉淀:最后,将纯化的DNA溶解在缓冲液中,如TE
缓冲液,并通过测定其浓度和纯度来评估提取的DNA质量。
综上所述,基因组DNA的提取原理包括细胞破碎、DNA溶解、
蛋白酶处理、DNA纯化以及DNA沉淀等步骤,通过这些步骤可以将目标DNA从细胞中提取出来并进行纯化,为后续的实验分析和应用提供高质量的DNA样本。
基因组DNA的分离纯化提取方法综述
基因组DNA的分离纯化提取方法综述
1.高盐法:
高盐法是最常用的基因组DNA提取方法之一、该方法利用高浓度盐水(如NaCl)沉淀DNA,同时去除蛋白质和其他污染物。
步骤包括细胞破碎、蛋白质沉淀和DNA沉淀。
此方法简便、廉价,适用于大多数细胞类型。
2.酚酚氯仿提取法:
酚酚氯仿提取法是另一个常用的基因组DNA提取方法。
该方法利用酚
酚提取细胞组织中的DNA,并通过氯仿的添加分离DNA和蛋白质。
此方法
适用于多样的生物标本,如细菌、真菌、植物等。
3.环硅酸盐法:
环硅酸盐法基于DNA与硅颗粒间的结合原理。
在此方法中,细胞裂解后,DNA与硅颗粒结合形成复合物,复合物通过离心和洗涤步骤获得纯化
的DNA。
该方法适用于基因组DNA的高通量纯化。
4.硅基附着法:
硅基附着法也是一种利用硅颗粒的DNA分离纯化方法。
此方法常利用
硅基膜滤板或硅颗粒填充的柱子,使DNA与硅基结合,然后通过洗涤和离
心步骤分离纯化DNA。
该方法适用于小样本量或少量目标DNA的纯化。
5.磁珠吸附法:
磁珠吸附法是一种快速高效的DNA提取方法。
通过特定的磁珠与DNA
的结合,可将DNA快速提取纯化。
该方法通常结合磁力分离和洗涤步骤,
使DNA与磁珠结合,然后通过磁力将DNA分离。
此方法适用于高通量或高
效率DNA提取。
提取基因组dna的方法
提取基因组dna的方法
提取基因组DNA的方法通常分为以下几个步骤:
1. 细胞破碎(Cell lysis):将待提取的细胞或组织样本进行破碎,使细胞膜失去完整性,释放出细胞内的DNA。
破碎可以通过机械方法(如研磨、切割、振荡等)或化学方法(如洗涤、酸碱处理等)进行。
2. DNA除去蛋白质(Protein removal):将细胞破碎产物中的蛋白质进行去除,以防止其干扰后续的DNA提取和分析步骤。
通常使用酶处理(如蛋白酶K)或蛋白质沉淀剂(如酚/氯仿)来除去蛋白质。
3. DNA纯化(DNA purification):通过使用某种纯化方法,将破碎产物中的DNA与其他杂质(如RNA、酶、盐等)进行分离和纯化。
常用的纯化方法包括酚/氯仿提取法、硅胶膜柱法、离心柱纯化法等。
4. DNA沉淀和洗涤(DNA precipitation and washing):通过加入适当的盐类和酒精,使DNA以沉淀的形式析出。
沉淀后,通过洗涤来去除残留的盐和酒精。
5. DNA溶解(DNA resuspension):将沉淀的DNA用适当的缓冲液进行溶解和复溶,使其恢复到溶液中,并得到可用于后续实验分析的DNA溶液。
这些步骤只是提取基因组DNA的一般流程,具体方法可能因实验目的和待提取样本的特性而有所差异。
2.1.2 基因组DNA的提取
基因组DNA的提取
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基因组是指一个个体、器官、组织活细胞内的所有DNA。
基因组一般包括一个生物体全部的遗传信息,是进行目的基因片段扩增、文库构建及全基因组测序等工作的物质基础。
一般包括四个基本步骤:
(1)细胞的培养与收集,或相关组织的获得(2)细胞的破碎与内容物的释放
(3)基因组DNA与其他细胞内容物的分离及提取(4)基因组DNA分子的浓缩与收集
与哺乳动物等高等生物相比,细菌细胞具有培养简便、成本低、分离收集简单等有利于制备基因组DNA的特点。
溶菌酶,NaCl , Tris-醋酸,醋酸钠, EDTA, SDS, pH7.8 SDS 和蛋白酶K
1
去除细胞壁 2 破细胞膜
CTAB (十六烷基三甲基溴化铵):溶解细胞膜,使核蛋白解聚,结合核酸 3 DNA 纯化
酚-氯仿-异戊醇或过柱子除去蛋白
4 沉淀DNA
0.6倍体积的异丙醇
哺乳动物基因组DNA的制备
哺乳动物基因组制备过程和操作应更加温和,以减少断裂的机会。
哺乳动物细胞基因组DNA的抽提
组织粉碎培养的细胞:胰酶消化
组织块:液氮中研磨
细胞裂解Tris 、EDTA 、NaCl、SDS 、RNase
纯化DNA 用苯酚和酚-氯仿抽提蛋白质
沉淀DNA用2倍体积的无水乙醇
植物基因组DNA的制备
由于植物细胞中所含的酶类会对植物DNA抽提产生不利的影响,所以通常会在抽提液中添加抗氧化剂或强还原剂,如β-巯基乙醇,以降低酶类的活性
植物组织中制备 DNA
组织粉碎:液氮中研磨成细粉末细胞裂解:2%CTAB/ 2-ME
或1% SDS和蛋白酶K, 65 o C 温育。
基因组dna的提取
基因组dna的提取基因组DNA提取是指从生物体中分离出基因组DNA序列的过程。
提取基因组DNA的方法有多种,常用的有:一、离心法1、吸取法:利用某种化学溶剂,将原始细胞迅速破解,使细胞内的大部分物质溶解,然后将细胞中的染色体离心收集;2、膜破碎法:将原始细胞置于某种膜系统(如绝对乙醇或蛋白酶体系)中,使细胞形变造成破碎,膜系统可以有效提取出细胞内的染色体;3、超音速冲击法:利用超音速脉冲对细胞外的水进行冲击,使水的光圈扩散,从而使细胞瞬间破碎,将染色体释放到溶液之中。
二、连锁反应法1、PCR法:利用复性DNA引物,连同重复序列的特异性引物,在反转录试剂的有序作用下,可以将外源DNA 装入原核细胞内;2、QPCR法:利用反转录酶作用反转录得到DNA 并与特定序列特异性引物结合,由此凝聚出一个碱基序列,可以在任何体系里广泛检测基因;3、单核苷酸多态性(SNP)分析法:利用基因序列中碱基位点多态性突变进行基因组DNA 提取分析。
三、物理力学方法1、电精提法:通过外加电场,使基因组DNA在液体中电性扩散,最终达到提取的目的;2、毛细管电泳法:将基因组DNA 溶解后,将溶质加入到毛细管内,产生电力场在毛细管内运动,由此实现基因组DNA 的提取。
四、免疫原性法1、免疫原性抗体提取法:使用具有特定抗原性的免疫原性抗体将细胞中抗原性蛋白结合起来,再通过离心法收集;2、竞争抗体抗体提取法:先在细胞中抗原性蛋白与竞争抗体(未指定抗原性)结合,然后再进行离心收集,从而获得的抗原性蛋白;3、抗体标记抗体提取法:先将抗原性蛋白结合抗体标记抗体,然后通过离心法获取抗原性蛋白。
以上就是基因组DNA提取的常见方法。
基因组DNA提取在基因研究、生物学研究等领域有着重要的作用,所以不能忽视其重要性。
基因组dna的提取实验报告
基因组dna的提取实验报告一、实验目的本实验旨在学习基因组DNA的提取方法,掌握DNA提取实验的基本步骤和技巧。
二、实验原理DNA提取是生物学中最基础的实验之一,其目的是从细胞或组织中分离出DNA。
DNA提取的原理是利用化学试剂破坏细胞膜和核膜,使细胞内部的DNA裸露出来,并通过特定方法纯化出来。
三、实验材料1. 细菌培养液2. TE缓冲液(10 mM Tris-HCl, 1 mM EDTA, pH 8.0)3. 蛋白酶K溶液(20 mg/mL)4. 洗涤缓冲液(10 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0)5. 氢氧化钠(NaOH)溶液(0.2 M)6. 氯化钾(KCl)溶液(1 M)7. 高盐缓冲液(5 M NaCl, 1 M Tris-HCl, pH 8.0)8. 等体积异丙醇9. 离心管10. 微量离心管四、实验步骤1. 取细菌培养液0.5 mL,离心10分钟,将上清液倒掉。
2. 加入0.5 mL TE缓冲液和20 μL蛋白酶K溶液,室温下孵育10分钟。
3. 加入0.6 mL洗涤缓冲液,混匀后离心1分钟。
4. 倒掉上清液,加入0.2 mL氢氧化钠溶液,轻轻颠倒混匀,室温下孵育5分钟。
5. 加入0.3 mL氯化钾溶液,轻轻颠倒混匀后离心1分钟。
6. 将上清液转移到新的离心管中,加入等体积异丙醇,轻轻颠倒混匀后放置于-20℃冷冻箱中保存至少30分钟。
7. 离心10分钟后将上清液倒掉,并用70%乙醇洗涤沉淀一次。
8. 将沉淀用TE缓冲液重悬即可。
五、实验注意事项1. 实验过程中要注意无菌操作。
2. 操作过程中要避免DNA的降解和污染。
3. 实验前应做好必要的准备工作,并按照步骤进行操作。
六、实验结果通过本实验,成功提取出了细菌的基因组DNA,并经过浓度检测和质量检测,证明提取的DNA质量较好,可以用于后续实验。
七、实验总结本次实验通过对基因组DNA的提取方法进行学习和实践,掌握了基本的操作技巧和注意事项。
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核酸分离纯化
RNA的去除
用不含DNA酶的RNase处理,使RNA降解。 添加RNase处理后,可再用等量的苯酚/氯仿抽
提,离心除去蛋白质及寡核苷酸。
沉淀并吸附核酸
含DNA的水相可用1倍体积的异丙醇或2倍体积的无水 乙醇沉淀。
基因组的大分子DNA沉淀形成纤维状絮团漂浮其中, 可用吸头将其挑出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉 淀附在壁上是荷电溶质或粒子在电场作 用下发生定向泳动的现象。核酸的分离和鉴定通常采用琼脂 糖凝胶电泳。
不同大小、不同形状和不同构象的DNA 分子在相同的电 泳条件下(如凝胶浓度、电流、电压、缓冲液等),有不同 的迁移率,所以可通过电泳使其分离。琼脂糖凝胶电泳分离 后的DNA可用溴化乙啶(EB)染色。
纯度高:尽量排除其他大分子成分的污染(蛋白 质、多糖和RNA等)。
得率好:选用合适的方法获得足够量的DNA。
三、基因组DNA提取的原理
准备适宜的材料
裂解细胞,释放DNA 核酸分离纯化
去除蛋白质、 RNA等杂质
沉淀并吸附核酸
核酸溶解(缓冲液)
细胞破碎
化学法、机械法、生物法
细菌—溶菌酶(降解细胞壁),EDTA(抑制 DNA酶,防止DNA降解),去垢剂SDS(破 坏细胞膜)
实验1 大肠杆菌基因组DNA 的提取与分离鉴定
理论介绍
一、内容提要
基因组是指细胞内遗传信息的携带者DNA的总体。
为了研究DNA分子在生命代谢中的作用,常常需要从 不同的生物材料中提取DNA。由于DNA分子在生物体内 的分布及含量不同,要选择适当的材料提取DNA。
从各种材料中提取DNA方法不同,分离提取的难易程 度也不同。真核生物的DNA主要存在于细胞核中,与蛋 白质结合构成染色体,原核生物的DNA不与任何蛋白质 结合。
酵母—破壁酶或液氮研磨
植物材料—液氮研磨(使细胞冻结,用研钵 碾制成粉状)
动物组织—匀浆或液氮研磨
核酸分离纯化
DNA与蛋白质的分离
1.DNA与蛋白质的分离
SDS:真核生物的DNA与组蛋白结合形成DNP,SDS能够破坏DNA与 蛋白质之间的静电引力或配位键,可使DNA与蛋白质解聚,释放 出DNA。
四、实验步骤
本试剂盒采用可以特异性结合DNA的离心吸附柱和独特的缓冲液系 统提取细菌的基因组DNA。离心吸附柱中采用的硅基质材料为新型材 料,能够高效、专一吸附DNA,可最大限度去除杂质蛋白及细胞中其 他有机化合物。提取的基因组DNA片段大,纯度高,质量稳定可靠。
五、琼脂糖凝胶电泳法测定DNA分子大小
详见实验课件:DNA的琼脂糖凝胶电泳
图1 E. coli JM109基因组DNA琼脂糖凝胶电泳图
简化操作步骤,缩短提取过程,避免物理、化学和生 物的因素对核酸的降解,如机械剪切力、高温和 DNase等酶,防止过酸、过碱,避免剧烈振荡和混合。
采用酚-氯仿抽提时应采用上下颠倒的方法充分混匀, 但动作要轻柔,离心分离两相时,应保证一定的转速 和时间。
沉淀DNA用的异戊醇、乙醇事先放入-20℃冰箱,待用 时取出。
CTAB:是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,能与核酸形成复 合物,在高盐溶液(NaCl>0.7M)中是可溶的,当NaCl降低到 0.3M 时,可沉淀CTAB-核酸复合物。(植物)
2.蛋白质的去除
苯酚-氯仿-异戊醇:苯酚、氯仿能变性蛋白质,离心分层,DNA 溶于上层水相,变性蛋白质位于水相和有机相之间。异戊醇可 减少抽提过程的泡沫产生。
动物
小牛胸腺 肝脏
来源
植物 微生物
鱼类精子 幼苗 种子胚胎 谷氨酸菌体( 7%~10%) 面包酵母(4%)
啤酒酵母(6%)
大肠肝菌(9%~10%)
许多病毒的DNA分子长度超过100kb,细菌DNA为 几千kb,高等动植物的基因组DNA长度达到上亿kb。
二、分离纯化核酸的总原则
保持基因组DNA结构相对完整:防止各种因素引 起的降解。
如果DNA沉淀量少或无法捞出,可离心获取沉淀。 沉淀DNA前,为提高沉淀效果,可加入NaAC、乙酸铵
等盐类促进沉淀。 获取的沉淀需再用70%乙醇洗涤除去残留的有机物、
无机盐等。
基因组DNA提取注意事项 使用新鲜、幼嫩的材料;材料应适量,过少造成核酸
提取量少,过多影响裂解,导致DNA量少。(推荐2-4 mL)。