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雷帕霉素增强RSL3对睾丸癌细胞I-10的增殖、侵袭与迁移的抑制作用

雷帕霉素增强RSL3对睾丸癌细胞I-10的增殖、侵袭与迁移的抑制作用

睾丸癌是青年人群中最常见的恶性肿瘤[1]。

西方国家发病率在过去20年中上升,手术和以顺铂为基础的化学疗法的结合使得睾丸癌患者的治愈率大于90%[2]。

尽管如此,10%~20%患有转移性疾病的睾丸癌患者不能通过基于顺铂的化疗治愈[3]。

因此,探索治疗睾丸肿瘤的新方法具有研究价值。

铁死亡是一种铁依赖形式的非凋亡细胞死亡,其特征是脂质ROS 的积累[4]。

在细胞和小鼠中进行的遗传学研究确定硒酶谷胱甘肽过氧化物酶(GPX4)是这种形式的细胞死亡的关键调节因子。

GPX4将脂质氢过氧化物转化为脂质醇,这一过程阻止了铁(Fe 2+)依赖的有毒脂质活性氧(ROS )的形成。

GPX4功能的抑制导致脂质过氧化,并可诱导铁死亡[5,6]。

近年来,人们在设计和开发基于铁死亡诱导的抗癌药物方面做了大量工作,在癌症治疗中引入铁死亡具有很好的治疗潜力[7]。

RSL3是一种常用的铁死亡诱导剂,通过抑制谷胱甘肽Rapamycin enhances inhibitory effect of RSL3on proliferation,invasion and migration of testicular cancer I-10cells in vitroLI Bin,WANG Yue,HOU Fengwei,DU Jiaru,TONG XuhuiSchool of Pharmacy,Bengbu Medical College,Anhui Provincial Engineering Research Center for Biochemical Pharmaceuticals,Bengbu 233030,China摘要:目的探究雷帕霉素增强RSL3对睾丸癌细胞I-10的增殖、侵袭与迁移能力的抑制作用。

方法MTT 法检测RSL3(Type II )及合用雷帕霉素(RAPA )作用后I-10细胞的存活率。

将RSL3(0~16μmol/L )分别以及联合16μmol/L 雷帕霉素作用于睾丸癌细胞I-10,采用MTT 法检测I-10细胞增殖抑制情况,利用集落克隆形成实验检测细胞增殖能力,采用划痕实验和Transwell 小室检测I-10细胞的迁移与侵袭能力,采用流式细胞术检测I-10细胞的脂质活性氧水平,采用GSH 和MDA 检测试剂盒检测细胞中GSH 和MDA 含量,利用Western blot 检测细胞GPX4蛋白表达。

FlowJo中文使用说明书

FlowJo中文使用说明书

FlowJo中文实用手册(软件版本:FlowJo7.6.5 2012/06/20 更新)第一章 FlowJo简介 (1)一、FlowJo对电脑配置的要求 (1)二、FlowJo的安装过程(Windows) (1)三、FlowJo的工作台 (5)第二章 FlowJo分析单标样本 (6)一、由原始数据生成单参数直方图的过程 (6)二、图形的输出和保存 (10)第三章 FlowJo分析多色标记样本 (13)一、由原始数据生成二维点图的过程 (13)二、二维点图的设门原则 (16)三、多色标记分析说明 (16)第四章 FlowJo软件荧光补偿 (18)一、用FlowJo做荧光补偿并进行数据分析的步骤 (18)二、FlowJo荧光补偿的具体步骤 (18)三、双指数转换 (24)第五章 FlowJo的批处理功能 (27)一、设门分析的批处理 (27)二、表格分析的批处理 (32)三、图形分析的批处理 (35)第六章 FlowJo分析细胞凋亡样本 (43)一、细胞凋亡概述 (43)二、FlowJo分析凋亡数据的过程 (44)三、凋亡数据结果分析 (45)第七章 FlowJo软件分析细胞周期样本 (47)一、细胞周期分析概述 (47)二、FlowJo分析细胞周期数据的过程 (48)三、细胞周期拟合的调整方法和步骤 (51)四、细胞周期结果分析 (53)第一章 FlowJo简介FlowJo是美国斯坦福大学Leonard Herzenberg(FACS机器的发明者)实验室在90年代研发的一款流式数据分析软件。

FlowJo由于功能强大,简单易用,已经被领域内的科学家、实验室广泛引用;同时FlowJo也是各高影响力核心期刊引用最多的流式数据分析软件。

一、FlowJo对电脑配置的要求1. PC电脑:操作系统:Windows XP,Vista,Windows7内存:512MB及以上网络连接:使用试用序列号及联网序列号必需要有网络连接;加密狗无需网络2. 苹果电脑:操作系统:OSX10.3或者更高版本内存:512MB及以上网络连接:使用试用序列号及联网序列号必需要有网络连接加;密狗无需网络二、FlowJo的安装过程(Windows)•请到我们的网站上下载最新版本:/content/download在此,我们下载V7.6.5 为例/sites/default/files/7.6.5_X32.exe 将文件下载到桌面之后,就可以看到FlowJo安装程序图标。

ANNEXIN V-FITC PI 凋亡检测试剂盒说明书

ANNEXIN V-FITC PI 凋亡检测试剂盒说明书

第1页,共3页ANNEXINV-FITC/PI 凋亡检测试剂盒说明书注意:本产品试剂浓度发生变化,使用前请仔细阅读说明书。

货号:CA1020规格:20T/50T /100T保存:2-8°C ,避光保存,有效期1年。

产品说明:细胞凋亡早期改变发生在细胞膜表面,这些细胞膜表面的改变之一是磷脂酰丝氨酸(PS)从细胞膜内转移到细胞膜外,使PS 暴露在细胞膜外表面。

PS 是一种带负电荷的磷脂,正常主要存在于细胞膜的内面,在细胞发生凋亡时细胞膜上的这种磷脂分布的不对称性被破坏而使PS 暴露在细胞膜外。

Annexin V 具有易于结合到磷脂类如PS 的特性,对PS 有高度的亲和性。

因此,该蛋白可充当一敏感的探针检测暴露在细胞膜表面的PS 。

PS 转移到细胞膜外不是凋亡所独特的,也可发生在细胞坏死中。

两种细胞死亡方式间的差别是在凋亡的初始阶段细胞膜是完好的,而细胞坏死在其早期阶段细胞膜的完整性就破坏了。

因此,可以采用Annexin V 与PI 双染的方法,通过流式检测细胞早期凋亡。

操作步骤:1.细胞样品的准备:a)对于贴壁细胞:小心收集细胞培养液到一离心管内备用。

用不含EDTA 的胰酶消化细胞,至细胞可以被轻轻用移液管或枪头吹打下来时,加入前面收集的细胞培养液,吹打下所有的贴壁细胞,并轻轻吹散细胞。

再次收集到离心管内。

1000rpm 左右离心5min ,沉淀细胞。

对于特定的细胞,如果细胞无法完全离心至离心管底,可以适当延长离心时间或稍稍加大离心力。

小心吸除上清,可以残留约50µl 左右的培养液,以避免吸走细胞。

加入约1ml 4℃预冷的PBS ,重悬细胞,再次离心沉淀细胞,小心吸除上清。

b)对于悬浮细胞:1000rpm 左右离心5min ,沉淀细胞。

对于特定的细胞,如果细胞无法完全离心至离心管底,可以适当延长离心时间或稍稍加大离心力。

小心吸除上清,可以残留约50µl 左右的培养液,以避免吸走细胞。

流式细胞术基本原理与实用技术

流式细胞术基本原理与实用技术

流式细胞术基本原理与实用技术流式细胞术(Flow Cytometry)是一种常用的细胞分析技术,它基于光学、电子和计算机技术,能够对单个细胞进行快速、准确的多参数分析。

本文将介绍流式细胞术的基本原理和实用技术。

一、基本原理流式细胞术的基本原理是利用细胞在液体中悬浮的特性,在流动状态下通过一个细胞计数器,同时对细胞进行多参数的检测和分析。

其主要包括以下几个步骤:1. 细胞样品的制备:将待检测的细胞样品进行预处理,如离心、洗涤等,以获得单细胞悬浮液。

2. 细胞的进样:将细胞悬浮液通过微细管道进入流式细胞仪的流动系统中,形成单细胞的液体流。

3. 细胞的定位和聚焦:利用激光束对细胞进行定位和聚焦,使其逐个通过探测区域。

4. 细胞的激发和发射:通过激光束的照射,激发细胞中的荧光染料或标记物,使其发射特定波长的荧光信号。

5. 光信号的收集和处理:收集细胞发射的荧光信号,并经过光学系统进行分光、分束、分光和聚焦,最后通过光电倍增管或光电二极管转换为电信号。

6. 数据的获取和分析:将电信号转化为数字信号,并通过计算机系统进行数据采集、存储和分析,得到细胞的各项参数及相关统计学分析。

二、实用技术1. 细胞标记技术:为了能够准确地检测和分析细胞的特定性质,常常需要对细胞进行特异性的染色或标记。

常用的标记方法包括荧光染料、抗体标记和基因表达标记等。

2. 多参数分析技术:流式细胞术可以同时检测多个参数,如细胞大小、形态、表面标记物的表达、细胞周期等。

通过合理选择和配置荧光染料和滤光片组合,可以实现多重标记和多参数分析。

3. 数据分析软件:流式细胞术产生的数据量庞大,需要借助计算机软件进行数据的分析和解读。

常用的数据分析软件有FlowJo、CellQuest、ModFit等,它们可以对细胞的分布、比例、相关性等进行统计学分析和图形展示。

4. 高通量流式技术:随着科学研究的深入和技术的发展,高通量流式技术逐渐兴起。

它通过提高仪器的样品处理速度和自动化程度,实现对大量样品的快速检测和分析,广泛应用于生物医学研究和临床诊断。

flowjo里面geometric mean的用法

flowjo里面geometric mean的用法

flowjo里面geometric mean的用法FlowJo中的geometric mean什么是geometric mean?Geometric mean(几何均值)是一种统计概念,用于度量一组数据的中心趋势。

它通过将所有数据取对数后进行平均,并然后再求出平均的指数值来计算,以减小极端值的影响。

FlowJo中的几何均值FlowJo是一种流式细胞仪数据分析软件,其中的geometric mean 功能可以用来对流式细胞仪实验生成的数据进行处理和分析。

使用geometric mean的优势•减小极端值的影响:通过将数据取对数,geometric mean可以减小异常值对结果的影响,使得结果更加健壮可靠。

•适应非对称分布:当数据呈现非对称分布时,geometric mean可以更准确地代表数据的中心趋势。

在FlowJo中使用geometric mean的常见场景1.在流式细胞仪实验中,对荧光信号进行处理时,常常会使用geometric mean来计算样本中各细胞亮度的中心趋势。

2.在细胞蛋白质表达分析中,使用geometric mean可以有效地处理亮度值的偏斜分布,得到更准确的结果。

3.在细胞计数的过程中,使用geometric mean可以减小离群值的影响,从而得到更可靠的细胞数统计结果。

使用方法在FlowJo中使用geometric mean非常简单。

只需按照以下步骤操作:1.在FlowJo软件中打开待处理的数据文件。

2.选择需要进行geometric mean计算的样本或数据。

3.在菜单栏中选择“统计(Statistics)”。

4.在统计选项中找到“geometric mean”并点击。

5.FlowJo会自动计算并显示geometric mean的结果。

注意事项•在使用geometric mean时,需要注意数据是否符合对数正态分布,以确保结果的可靠性。

•如果数据中存在零值或负数,需要进行数据的修正或转换,以保证geometric mean的计算正确。

Invitrogen Attune NxT 流式细胞仪应用手册说明书

Invitrogen Attune NxT 流式细胞仪应用手册说明书

Invitrogen Attune NxT流式细胞仪应用手册成就稀有细胞超灵敏高通量分析梦想实现全血样本无需裂解无需洗涤夙愿21人全血样本免洗免裂解白细胞分析(三种方法)...............................................................................................2人全血6色T 细胞无需补偿且免洗免裂解检测................................................................................................6人全血10色免疫表型分析.....................................................................................................................10人全血13色免疫表型分析.....................................................................................................................13人全血吞噬细胞检测...........................................................................................................................17小鼠脾细胞10色免疫表型分析...............................................................................................................22小鼠调节性T 细胞检测........................................................................................................................25藻类存活率分析...........................................................................................................................28使用Attune NxT 流式细胞仪进行荧光蛋白检测...........................................................................................30hPSC 来源的心肌细胞分化过程中转录因子表达的流式细胞分析......................................................................37利用Attune NxT 流式细胞仪检测全血中的血小板............................................................................................42利用Attune NxT 流式细胞仪设计T 细胞基础配色方案......................................................................51利用Attune NxT 流式细胞仪快速准确地进行植物细胞核DNA 含量分析................................................................59使用 ModFit LT 软件分析 Attune NxT FCS 数据文件的操作指南 . (66)利用Invitrogen Attune NxT 流式细胞仪对单细胞生物中的中性脂进行检测 (74)利用Attune NxT 流式细胞仪进行精确浓度测定的推荐方法 (78)Attune NxT 自动进样器实现流式高通量自动化检测:在所有板孔和微孔板之间保持结果的一致性 (80)使用FlowJo 软件分析Invitrogen Attune NxT FCS 数据文件的操作指南 (88)使用FCS Express 6软件分析Attune NxT FCS 数据文件 (96)目录2人全血免洗免裂解白细胞分析(三种方法)无需洗涤/裂解检测人全血中的白细胞简介从人的全血中分离并检测白细胞的传统方法十分耗时,且通常需要大量处理和富集方可进行分析。

流式淋巴细胞亚群检测技术原理

流式淋巴细胞亚群检测技术原理

荧光染料标记法
荧光染料的选择
根据抗原特异性选择相应的荧光染料,如异硫氰酸荧光素 (FITC)、藻红蛋白(PE)等。
标记过程
将荧光染料与特异性抗体结合,形成荧光标记的抗体,再 与待检测的淋巴细胞样本反应,使抗原抗体结合,形成荧 光标记的淋巴细胞亚群。
检测结果
通过流式细胞仪检测荧光信号,实现对淋巴细胞亚群的定 性和定量分析。
数据分析
使用专业软件对原始数据进行分析,包括细胞亚群的识别、计数和比 例计算等。根据实验结果,可以对患者的免疫状态进行评估和诊断。
05 流式淋巴细胞亚群检测技 术应用领域
免疫学领域应用
免疫细胞分型
利用流式细胞术对淋巴细胞进行分型,研究不 同亚群的免疫学特性。
免疫细胞功能研究
通过检测淋巴细胞亚群的表面标志物和胞内因 子,研究其在免疫反应中的功能。
喷嘴和流动室
喷嘴是连接样品管和流动室的通道, 它的直径通常很小,以便形成高速流 动的细胞悬液。流动室是检测细胞的 场所,它通常是一个透明的石英玻璃 管,内部充满鞘液。当细胞悬液通过 喷嘴进入流动室时,它们会被鞘液包 裹并排列成单行,以便后续的光学检 测。
信号检测与处理
信号检测
在流式细胞术中,信号检测通常包括前向散射光、侧向散射光和荧光信号的检测。前向散射光与细胞的大小和折 射率有关,侧向散射光与细胞的内部结构和颗粒度有关,而荧光信号则与细胞内特定成分的含量和性质有关。这 些信号可以通过光电倍增管等光电转换器件转换为电信号进行后续处理。
数据处理软件介绍及操作指南
01
FlowJo软件
功能强大的流式数据分析软件,支持多种格式数据导入和导出,提供丰
富的数据处理和分析工具。
02
Cytobank平台

流式细胞凋亡检测步骤

流式细胞凋亡检测步骤

流式细胞凋亡检测步骤引言:细胞凋亡是一种正常的生理现象,它在维持机体稳态和调节细胞数量方面起着重要作用。

流式细胞凋亡检测是一种常用的方法,用于定量测量细胞凋亡程度。

本文将介绍流式细胞凋亡检测的步骤,并详细阐述每一步的操作方法和注意事项。

一、细胞准备在进行流式细胞凋亡检测之前,首先需要获得待检测的细胞样品。

这些细胞可以是体外培养的细胞系,也可以是从动物或人体组织中分离得到的原代细胞。

细胞样品应该在合适的培养条件下生长,确保其细胞活力和凋亡状态的稳定。

二、细胞收集细胞收集是流式细胞凋亡检测的关键步骤之一。

常用的方法有机械剥离、消化酶处理和离心等。

在收集过程中,需要注意尽量减少细胞损伤和凝聚物的形成。

收集的细胞应该进行适当的洗涤,以去除培养基中的残留物。

三、细胞固定细胞固定是为了防止细胞在后续处理过程中的损伤和凋亡。

常用的固定剂有甲醛、乙醛和乙酸等,可根据实验需要选择合适的固定剂和浓度。

固定处理后的细胞需要进行洗涤,以去除固定剂的残留物。

四、细胞染色细胞染色是流式细胞凋亡检测的核心步骤。

常用的染色剂有荧光素酶标记的Annexin V和PI(propidium iodide)等。

Annexin V 用于检测细胞外磷脂外翻的现象,而PI则用于判断细胞膜完整性。

染色剂的选择应基于实验目的和细胞类型,同时需要根据厂家提供的说明书进行操作。

五、流式细胞仪检测流式细胞仪是流式细胞凋亡检测的重要工具。

在进行检测之前,需要对流式细胞仪进行校准,包括激光功率、流速和检测通道的设置等。

校准后,将染色后的细胞悬浮液注入流式细胞仪中,通过激光的照射和细胞的流动,测量细胞的荧光强度和散射信号。

六、数据分析流式细胞仪检测得到的数据需要进行后续的分析和解释。

常用的数据分析软件有FlowJo、ModFit和Cyflogic等。

通过设置门,可以将细胞分为不同的亚群,分析细胞的凋亡率和凋亡类型等。

此外,还可以进行统计学分析,比较不同实验组之间的差异。

flowjo软件使用方法

flowjo软件使用方法

flowjo软件使用方法FlowJo 是基于Windows 和Mac OSX 的流动式细胞仪试剂盒数据分析软件。

它不仅可用于普通细胞仪,还可以将其拓展到多种平台,例如集成FACSDIVA, 装配FlowCore 和BioLegend。

FlowJo 还带来了前沿技术,使抗原鉴定和样本智能整合更加简单。

它可以帮助实验室节省时间,提高效率。

FlowJo 将流式数据文件转化为典型的、易于使用的数据表。

由于它们可以在任何地方使用和共享,因此,FlowJo 将为实验室的研究人员和研究学生带来更多的便利。

使用FlowJo 的步骤如下:一、安装 FlowJo首先,您需要下载 FlowJo 运行文件,然后将其安装在PC 或Mac 电脑上。

安装FlowJo 之后,您可以使用它在PC 或Mac 平台上对细胞计数数据进行绘图,并将这些数据和分析结果输出到 Microsoft Excel 或一般文本文件中。

安装完成之后,您需要根据您要分析的文件类型选择FlowJo 的设置选项。

FlowJo 提供了多种不同的设置选项,比如 CSV、XML、TXT 和其他类型的文件,具体的选择取决于您要处理的数据类型。

三、导入数据将 FlowJo 安装好之后,您然后就可以在软件中导入要分析的流式数据,例如,用FlowJo 进行细胞数据分析时,您可以使用FlowJo 导入适当的 FCS 数据文件,进行细胞数据分析时可以分析要求和整合各种细胞系数,而样本数据分析可以从其他数据框导入FlowJo。

四、对数据进行分析一旦完成数据导入,就可以继续进行 FlowJo 中的数据分析。

在进行数据分析之前,您可以使用 FlowJo 中的工具,选择要进行分析的抗原(如细胞标记物)和样品,以及在抗原和样品间进行分析的方法(例如因素分析)。

使用这些工具,您可以对您的数据进行深入的分析,并获得有效的分析结果。

五、绘制图表在完成 FlowJo 的分析之后,您可以使用 FlowJo 的图表功能绘制图表,以突出强调您的结果,并将分析结果输出到 Excel 或 Word 文档中,以获得一个完整的分析报告。

小鼠脾脏th17和treg检测标准流程

小鼠脾脏th17和treg检测标准流程

小鼠脾脏th17和treg检测标准流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。

文档下载后可定制随意修改,请根据实际需要进行相应的调整和使用,谢谢!并且,本店铺为大家提供各种各样类型的实用资料,如教育随笔、日记赏析、句子摘抄、古诗大全、经典美文、话题作文、工作总结、词语解析、文案摘录、其他资料等等,如想了解不同资料格式和写法,敬请关注!Download tips: This document is carefully compiled by theeditor.I hope that after you download them,they can help yousolve practical problems. The document can be customized andmodified after downloading,please adjust and use it according toactual needs, thank you!In addition, our shop provides you with various types ofpractical materials,such as educational essays, diaryappreciation,sentence excerpts,ancient poems,classic articles,topic composition,work summary,word parsing,copy excerpts,other materials and so on,want to know different data formats andwriting methods,please pay attention!小鼠脾脏Th17和Treg细胞检测的标准流程小鼠脾脏中的Th17和Treg细胞是免疫调节的重要组成部分,它们在多种疾病模型中起着关键作用。

如何用FlowJo分析AccuriC6数据

如何用FlowJo分析AccuriC6数据

如何用FlowJo分析Accuri C6数据作者:蔡何清, FlowJo 技术专员目前市场有很多流式仪器,包括几家大的公司如BD,贝克曼等。

FlowJo做为一款优秀的流式数据分析软件,可以兼容几乎所有流式仪器采集的数据,可以弥补其它机器自带软件的分析功能不足的缺憾,这也是FlowJo备受欢迎及推崇的原因。

今天将详细介绍如何用FlowJo来分析BD公司的机器Accuri C6采集的数据。

Accuri C6是一款全功能、双激光的小型桌面流式细胞仪,有其独特的优势。

但是Accuri C6自带的CFlow软件在分析流式数据方面还存在一些进步的空间,比如:缺乏完善的图片叠加功能,尤其是其直方图叠加的效果有待加强;缺乏细胞周期分析工具、增殖分析工具以及动力学分析工具。

FlowJo是目前直接可以和它兼容的流式数据分析专业软件,满足用户的数据分析要求。

实际上,用FlowJo分析Accuri C6的流式数据与用FlowJo分析其他流式细胞仪采集的流式数据是一样的。

只不过由于Accuri C6在采集数据的时候不需要设置电压等特点,在分析Accuri C6数据的时候要做一些简单的处理。

这篇博文将对这些处理步骤做详细的介绍。

一、在Accuri C6将数据导出为FCS格式ISAC制定的流式数据的标准格式为FCS格式,Accuri C6的CFlow软件默认的数据保存格式为其特有的C6格式。

因此,在用FlowJo分析Accuri C6数据之前,需要将数据转换为FCS格式。

可参考下面的操作步骤:1. 打开CFlow软件,点击File菜单,在下拉菜单中选择Open CFlow File or Template,导入采集到的C6格式的数据2. 点击File菜单,在下拉菜单中选择Export FCS File或者Export ALL Sample as FCS二者的区别是:Export FCS File:将选定的某个 data well (sample) 输出为FCS格式的数据,并保存到用户自建的文件夹里Export ALL Sample as FCS:将所有的data well (sample) 输出为FCS格式的数据,并保存到“CFlow-FCS Exports”文件夹里,这个文件夹一般在桌面上图1二、调节坐标轴的范围由于Accuri C6在采集数据的时候不需要设置电压,而且C6能够采集到的信号范围位于1-16777216(100-107.22),流式图中的细胞群可能会由于坐标轴的范围过大而被压缩在左下角的位置,如图2所示:图2这时我们需要合理调节坐标轴的范围,使细胞群显示于流式图的中间位置,从而能明显地看到细胞分群,便于我们设门。

广谱流式flowjo调补偿

广谱流式flowjo调补偿

广谱流式flowjo调补偿
广谱流式flowjo调补偿是在对样本进行流式细胞术分析时,为了准
确地定量细胞表面分子、细胞因子、染色质状态等参数,需要对样本
进行补偿处理。

在广谱流式分析中,由于激光波长和荧光染料的选择
多样性较大,可能会出现某些染料的光谱重叠,导致误判或误差。

因此,调整补偿是必不可少的步骤,可以提高实验结果的准确性和可靠性。

调补偿的流程如下:
1. 数据质量控制
在补偿前,需要进行数据质量控制。

主要包括排除质量差的事件、纠
正电子仪器漂移等。

2. 调节光谱重叠
通过调整荧光染料的激发波长、发射波长等,可以避免光谱重叠,提
高数据质量。

当激发波长和发射波长相似时,可能会出现光谱重叠,
此时可以选择不同的光源或调整激发/发射波长。

3. 调节补偿值
通过计算染料之间的光谱重叠和荧光衰减,可以计算出相应的补偿值。

不同的补偿值可以根据染料的性质和相互作用进行调节,以提高数据
的准确性和可靠性。

4. 验证结果
进行补偿后,需要对结果进行验证。

可以使用单一染料进行补偿后检查其它染料的结果,验证补偿的准确性。

总之,调补偿是广谱流式分析中必不可少的步骤,可以提高实验结果的准确性和可靠性。

在补偿前,需要进行数据质量控制,调节光谱重叠并且调节补偿值。

最终结果需要进行验证。

小鼠在免疫抗原后机体产生的特异性免疫应答研究

小鼠在免疫抗原后机体产生的特异性免疫应答研究

实验目的:验证小鼠在接受抗原之后机体产生了特异性免疫反应,并观察小鼠各项生理指标以及免疫器官的反应状况,再观察T细胞和B细胞在此应答的反应状况。

实验假设:小鼠免疫灭活疫苗之后,机体会逐渐产生特异性免疫应答,一方面T 细胞在接受抗原刺激之后,经过阳性和阴性选择,T细胞从CD4,CD8双阳性选择为单阳性T细胞,并逐步转移,最终到达淋巴结等组织产生效应;另一方面,B细胞也会发育分化为浆细胞和记忆细胞,相应的浆细胞产生抗体以应对抗原。

由于小鼠在接受抗原之后,免疫细胞在胸腺和脾脏内的数量和种类将发生变化,另外小鼠血清中也会产生相应的抗体。

因此假设,在排出其他偶然因素引起的误差的情况下,有以下结果:1. 免疫后的小鼠胸腺大小比对照组更小,脾脏大小比对照组更大;另外免疫后小鼠的淋巴结比对照组更大。

2. 免疫后的小鼠胸腺免疫细胞数量小于对照组,脾脏免疫细胞数量大于对照组。

3. 免疫后小鼠胸腺中的单阳性淋巴细胞比对照组单阳性淋巴细胞更多,双阳性淋巴细胞比对照组更少;免疫后小鼠的脾脏中单阳性淋巴细胞数量多于对照组单阳性淋巴细胞数量。

4. 免疫后小鼠血清里面的抗体检测呈阳性,对照组小鼠血清抗体检测呈阴性。

预期结果:预计结果与假设一致,即:1. 免疫后的小鼠胸腺大小比对照组更小,脾脏大小比对照组更大;另外免疫后小鼠的淋巴结比对照组更大。

2. 免疫后的小鼠胸腺免疫细胞数量小于对照组,脾脏免疫细胞数量大于对照组。

3. 免疫后小鼠胸腺中的单阳性淋巴细胞比对照组单阳性淋巴细胞更多,双阳性淋巴细胞比对照组更少;免疫后小鼠的脾脏中单阳性淋巴细胞数量多于对照组单阳性淋巴细胞数量。

4. 免疫后小鼠血清里面的抗体检测呈阳性,对照组小鼠血清抗体检测呈阴性。

实验方法:一、小鼠免疫后与对照组的中枢和外周免疫器官的观察实验原理:实验采取DH5α灭活菌液为抗原,对小鼠进行注射,小鼠在接受抗原之后,机体会对其产生免疫应答,然而抗原在体内具有一定的半衰期,重复注射可以提高机体的免疫应答强度。

flowjo中文使用手册

flowjo中文使用手册

flowjo中文使用手册摘要:一、引言1.介绍FlowJo软件2.软件在我国的应用领域3.中文使用手册的目的和作用二、FlowJo软件基本操作1.软件的安装与启动2.界面布局与功能模块3.基本操作与快捷键三、数据导入与预处理1.数据文件格式支持2.数据导入步骤与方法3.数据预处理功能与技巧四、数据分析和可视化1.数据分析方法与工具2.数据可视化类型与技巧3.自定义图表与报告五、FlowJo软件的高级功能1.高级数据分析方法2.数据存储与导出3.软件配置与优化六、常见问题与解决方案1.软件运行中遇到的问题2.数据处理与分析中的常见问题3.解决问题的方法和技巧七、总结与展望1.软件的优势与不足2.在我国的发展前景3.对用户的使用建议和展望正文:一、引言FlowJo是一款功能强大的流式细胞术数据分析和可视化软件,广泛应用于生命科学研究、临床检测和药物研发等领域。

随着在我国的应用逐渐普及,为了方便广大用户更好地使用该软件,我们推出了中文使用手册,旨在帮助用户快速掌握软件的使用方法,提高数据分析效率。

二、FlowJo软件基本操作FlowJo软件的安装过程简单,只需根据安装向导完成操作。

安装完成后,启动软件,用户可以看到简洁直观的界面,以及丰富的功能模块。

在软件中,用户可以进行基本操作,如数据导入、预处理、分析和可视化等。

此外,软件还提供了快捷键功能,方便用户快速操作。

三、数据导入与预处理FlowJo支持多种数据文件格式,如FCS、CSV、TXT等。

用户可以根据需要选择合适的数据文件导入软件。

数据导入后,可以通过软件提供的预处理功能对数据进行清洗、筛选和归一化等操作,为后续分析做好准备。

四、数据分析和可视化FlowJo提供了丰富的数据分析工具和方法,如聚类分析、细胞周期分析、凋亡分析等。

用户可以根据需求选择合适的方法对数据进行分析。

同时,软件支持多种数据可视化类型,如散点图、直方图、热图等。

用户可以灵活运用这些可视化工具,展示数据分析结果。

FlowJo 中文实用手册

FlowJo 中文实用手册

FlowJo中文实用手册(软件版本:FlowJo7.6.5 2012/06/20 更新)第一章 FlowJo简介 (1)一、FlowJo对电脑配置的要求 (1)二、FlowJo的安装过程(Windows) (1)三、FlowJo的工作台 (5)第二章 FlowJo分析单标样本 (6)一、由原始数据生成单参数直方图的过程 (6)二、图形的输出和保存 (10)第三章 FlowJo分析多色标记样本 (13)一、由原始数据生成二维点图的过程 (13)二、二维点图的设门原则 (16)三、多色标记分析说明 (16)第四章 FlowJo软件荧光补偿 (18)一、用FlowJo做荧光补偿并进行数据分析的步骤 (18)二、FlowJo荧光补偿的具体步骤 (18)三、双指数转换 (24)第五章 FlowJo的批处理功能 (27)一、设门分析的批处理 (27)二、表格分析的批处理 (32)三、图形分析的批处理 (35)第六章 FlowJo分析细胞凋亡样本 (43)一、细胞凋亡概述 (43)二、FlowJo分析凋亡数据的过程 (44)三、凋亡数据结果分析 (45)第七章 FlowJo软件分析细胞周期样本 (47)一、细胞周期分析概述 (47)二、FlowJo分析细胞周期数据的过程 (48)三、细胞周期拟合的调整方法和步骤 (51)四、细胞周期结果分析 (53)第一章 FlowJo简介FlowJo是美国斯坦福大学Leonard Herzenberg(FACS机器的发明者)实验室在90年代研发的一款流式数据分析软件。

FlowJo由于功能强大,简单易用,已经被领域内的科学家、实验室广泛引用;同时FlowJo也是各高影响力核心期刊引用最多的流式数据分析软件。

一、FlowJo对电脑配置的要求1. PC电脑:操作系统:Windows XP,Vista,Windows7内存:512MB及以上网络连接:使用试用序列号及联网序列号必需要有网络连接;加密狗无需网络2. 苹果电脑:操作系统:OSX10.3或者更高版本内存:512MB及以上网络连接:使用试用序列号及联网序列号必需要有网络连接加;密狗无需网络二、FlowJo的安装过程(Windows)•请到我们的网站上下载最新版本:/content/download在此,我们下载V7.6.5 为例/sites/default/files/7.6.5_X32.exe 将文件下载到桌面之后,就可以看到FlowJo安装程序图标。

如何在flowjo中导出图片生成图片报告及导出高质量可发表的图片 (2)

如何在flowjo中导出图片生成图片报告及导出高质量可发表的图片 (2)

流式数据分析完毕之后,我们需要导出流式图片,用于学术报告及实验记录等,我将在这篇博文中说明如何在FlowJo里导出图片及生成图片报告,同时我也将在此讲解在FlowJo中怎样导出用于发表文章高质量的图片。

一、FlowJo里的图片导出1. 直接从图形窗口导出1.1 在图形窗口的“文件”菜单栏中选择“另存为”或者“Export To App”1.2 选择图片文件存放的路径,给文件重命名,以及更改图片格式备注:通常我们不是很建议用这种方式保存图片,一个原因是各个图片都要单个保存,非常的不方便,我们建议你采用在布局页里编辑再导出图片的方式。

2. 在布局页导出图片将需要导出的图片拖到布局页里进行导出,请参考第二部分内容(在FlowJo中生成报告)。

3. 在偏好设置中更改导出图片的格式3.1 可导出的图片格式有6种:PNG,JPG, GIF, SVG, EMF, PDF3.2 默认的图片格式为PNG,如果需要更改,到“编辑”菜单栏里选择“偏好设置>文件格式”,在“布局编辑器”的输出格式类型中选择需要的格式,如下图所示二、在FlowJo中生成报告1. 在布局页生成报告的步骤:1.1 打开布局编辑器:点击布局编辑器按钮,或者到“窗口”菜单栏里选择“打开布局编辑器”1.2 在工作台中,单击选中需要输出的项目,并将其拖到布局编辑器1.3 对布局编辑器中的图形进行排版:可以通过布局编辑器“排齐”菜单中的选项进行“顶端对齐”和“底端对齐”等操作1.4 到布局编辑器“文件”菜单栏中选择“Scale To Page”,将所有图片都放到同一个页面里,避免出现分页的情况1.5 保存并导出图片:点击“保存”按钮,或者到布局编辑器的“文件”菜单栏选择“图片另存为”2. 布局页可生成报告的格式2.1 点击Batch按钮进行批处理2.2 可以将批处理的结果导出到FlowJo、PowerPoint、打印机、PDF文件、Web 页面和Quicktime动画视频中三、生成高质量可发表图片的方法及建议建议将图片保存为PDF格式,再在专业的图片编辑器如Photoshop或者Illustrator里面进行编辑,再输出为杂志要求的文件格式,一般为JPG,现在也有杂志倾向于接收PDF图片。

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flowjo处理数据步骤-回复
FlowJo处理数据步骤
FlowJo是一款专业的流式细胞术数据分析软件,广泛用于分析和可视化流式细胞仪产生的多变量数据。

本文将为您详细介绍FlowJo的数据处理步骤,帮助您更好地理解和应用该软件。

一、导入数据
首先,我们需要将流式细胞仪产生的原始数据导入到FlowJo中。

FlowJo 可以支持多种常见的文件格式,如FCS、CSV、BDF等,您可以选择适合您数据格式的方式导入数据。

通过打开FlowJo软件,您可以在主界面上选择“导入”按钮,然后选择合适的数据文件格式进行导入。

导入后,您可以为数据设置适当的标题和实验说明,以便更好地管理和识别数据。

二、数据矫正和清洗
在导入数据后,您可能需要进行一些数据矫正和清洗的步骤,以确保数据的准确性和一致性。

FlowJo提供了一系列的工具和功能,用于处理和清洗数据。

例如,您可以通过设置门(Gates)来排除噪声或异常数据,选择适当的控制样品进行数据矫正,调整仪器设置等。

您还可以使用FlowJo 提供的统计学算法,如均值、中位数、百分位数等,对数据进行清洗和排除异常值。

三、标记和分组
数据导入和清洗后,您可以开始对样本进行标记和分组。

流式细胞术通常使用多种荧光染料来标记不同的细胞亚群或生物标记物。

FlowJo提供了丰富的标记和分组工具,以便您对数据进行分类和组织。

您可以根据染色体类型、标记物的强度或共表达等特征创建标记或分组策略。

FlowJo还支持自定义标注方法,让您根据实验设计和目标需求进行个性化标记和分组。

四、绘制和分析
标记和分组完成后,您可以开始使用FlowJo的分析功能进行数据可视化和绘制图形。

FlowJo提供了多种绘图工具,如散点图、直方图、线图等,用于可视化和展示您的数据。

您可以在图表中添加坐标轴标记、图例、标题等,以便更好地展示数据信息和结果。

FlowJo还支持多种数据分析方法,如聚类分析、细胞分型、统计学测试等,帮助您从数据中提取更多的信息和结论。

五、结果解释和导出
最后,分析和绘制图表后,您可以开始解释并导出您的结果。

FlowJo提供了丰富的结果解释和报告功能,允许您创建专业的图表和报告,以便与团队成员或其他研究人员共享和交流。

您可以选择导出图像文件、表格数据、PDF文件等多种格式,根据自己的需求和要求进行结果导出和共享。

总结
以上就是使用FlowJo处理流式细胞术数据的基本步骤。

导入数据、数据矫正和清洗、标记和分组、绘制和分析以及结果解释和导出是关键步骤,可以帮助您更好地理解和应用FlowJo软件。

通过应用FlowJo的分析功能,您可以深入挖掘流式细胞术数据的潜力,更好地解读和理解细胞亚群的组成和功能。

希望本文对您在使用FlowJo处理数据时有所帮助。

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