荧光定量全程详细讲解
荧光定量法
荧光定量法一、引言在生物医学研究中,荧光定量法是一种常用的实验技术,用于测量样品中特定物质的浓度。
荧光定量法基于荧光现象,通过测量样品发出的荧光强度来确定目标物质的含量。
本文将详细介绍荧光定量法的原理、应用以及优缺点。
二、原理荧光定量法基于荧光现象,即当物质受到激发光照射后,能够吸收光能并发出辐射光。
荧光现象是由于物质的电子在激发态和基态之间跃迁所导致的。
在荧光定量法中,使用荧光染料或荧光标记的抗体等荧光探针与目标物质结合后,通过测量荧光强度来确定目标物质的浓度。
荧光定量法的基本原理如下: 1. 激发:使用特定波长的激发光照射样品,使样品中的荧光探针被激发到激发态。
2. 荧光发射:被激发的荧光探针从激发态跃迁回基态时,会发出荧光。
荧光的波长和强度与样品中目标物质的浓度相关。
3. 检测:使用荧光仪测量样品发出的荧光强度,并将其与标准曲线进行比较,从而确定目标物质的浓度。
三、应用荧光定量法在生物医学研究中有广泛的应用,以下是一些常见的应用领域:1. 生物分析荧光定量法可用于测量生物样品中的蛋白质、核酸、细胞等目标物质的浓度。
例如,可以使用荧光探针标记的抗体来定量检测特定蛋白质在细胞中的表达水平,或者使用荧光探针检测核酸序列的浓度。
2. 药物研发荧光定量法在药物研发中起着重要的作用。
通过荧光定量法可以测量药物在体内的药物浓度,评估药物的代谢和排泄情况,从而优化药物剂量和给药方案。
3. 环境监测荧光定量法可用于环境监测中,例如测量水样中的污染物浓度。
通过使用荧光探针与目标污染物结合,可以快速、准确地测量水样中的污染物含量,为环境保护提供重要参考。
4. 食品安全荧光定量法在食品安全领域也有应用。
例如,可以使用荧光探针检测食品中的有害物质,如重金属、农药残留等。
荧光定量法具有高灵敏度和高选择性,能够有效地检测食品中的微量有害物质。
四、优缺点荧光定量法作为一种常用的实验技术,具有以下优点: - 高灵敏度:荧光探针的荧光强度可以非常敏感地反映目标物质的浓度变化。
荧光定量法
荧光定量法摘要:一、荧光定量法的概述二、荧光定量法的原理三、荧光定量法的应用领域四、荧光定量法的优缺点五、荧光定量法的发展前景正文:一、荧光定量法的概述荧光定量法是一种生物学研究中常用的实验技术,它的主要作用是通过检测荧光信号的强度,来定量分析样本中特定目标物质的含量。
这种方法具有高灵敏度、高特异性和高重复性等优点,被广泛应用于分子生物学、生物化学、免疫学等领域。
二、荧光定量法的原理荧光定量法的原理主要基于荧光信号的特性。
荧光信号是一种光信号,当特定波长的光照射在荧光物质上时,荧光物质会吸收光能,然后以另一种波长的光形式释放出能量,这种释放的光就是荧光信号。
荧光定量法就是通过检测这种荧光信号的强度,来定量分析样本中特定目标物质的含量。
三、荧光定量法的应用领域荧光定量法在生物学研究中的应用领域非常广泛,包括但不限于以下几个领域:1、基因表达分析:通过荧光定量法,可以定量分析基因的表达水平,以研究基因在生物过程中的作用。
2、蛋白质分析:荧光定量法可以用于检测和定量蛋白质,从而研究蛋白质的生物学功能。
3、细胞分析:通过荧光定量法,可以定量分析细胞的数量和活性,以研究细胞的生物学特性。
四、荧光定量法的优缺点荧光定量法的主要优点包括:高灵敏度,可以检测到非常低浓度的目标物质;高特异性,可以针对特定的目标物质进行定量分析;高重复性,可以进行大量的重复实验。
然而,荧光定量法也存在一些缺点,例如:需要特定的实验设备,操作相对复杂;可能会受到荧光物质的毒性影响等。
五、荧光定量法的发展前景随着科学技术的发展,荧光定量法在生物学研究中的应用前景非常广阔。
未来,随着荧光物质的研发和改进,荧光定量法的灵敏度和特异性将会进一步提高。
荧光定量PCR原理及操作步骤.课件
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荧光定量PCR的原理
• 在PCR反应过程中,随着DNA的扩增,荧光染料或荧光探针会 与新合成的DNA结合,产生荧光信号。荧光信号的积累与DNA 的扩增数量呈线性关系,通过荧光信号的实时监测,可以精确 地计算出起始模板的浓度。
荧光定量PCR的应用
• 荧光定量PCR广泛应用于基因表达分析、突变检测、病原体 检测和基因分型等领域。通过实时监测PCR反应进程,可以 精确定量目标基因的表达水平,检测基因突变,以及鉴定病 原体种类和基因型等。
实验结果解读注意事项
数据解读与处理
荧光定量PCR实验产生的数据需要进行解读和处理。实验人员应熟悉数据分析方 法,正确解读实验结果,避免因数据处理不当导致误判。
结果报告与交流
荧光定量PCR实验结果应按照相关规定进行报告和交流。实验人员应确保结果的 准确性和可靠性,避免因结果报告不准确导致误导或决策失误。同时,实验人员 还应与其他相关人员进行有效沟通,共同探讨实验结果和问题解决方案。
案例二:突变检测
总结词
荧光定量PCR是突变检测的有效手段,能够快速准确地检测DNA序列中的点突变、插入或缺失。
详细描述
针对目标基因的特定区域,设计包含突变信息的引物或探针,通过荧光定量PCR扩增后,利用熔解曲 线或高分辨率溶解分析等技术,判断是否存在突变。这种方法在遗传性疾病诊断、癌症研究等方面具 有重要应用。
解决方案3
对于引物二聚体问题,可以通过优化引物设计、 降低引物浓度等方法来解决。
建议3
在实验前对引物进行充分的评估和验证,避免使 用易形成二聚体的引物。
问题解决方案及建议
解决方案4
对于假阳性结果问题,可以通过 增加重复实验次数、设置阴性对 照等方法来避免。
荧光定量PCR应用指南
荧光定量PCR应用指南荧光定量PCR(Fluorescent quantitative PCR)是依靠荧光信号的强度来定量PCR产物的一种PCR技术。
该技术通过在PCR反应体系中添加特异性荧光探针,利用荧光信号的强度来反映PCR产物的数量。
荧光定量PCR在生物医学研究、基因表达分析、致病微生物检测等领域有着广泛的应用。
下面将介绍荧光定量PCR的原理、实验步骤和一些注意事项。
一、原理:荧光定量PCR最常用的荧光探针是TaqMan探针,TaqMan探针是由两个DNA引物和一个荧光标记的探针组成。
当PCR反应进行到延伸阶段时,引物和探针结合到靶序列上形成荧光信号。
荧光信号的强度与PCR产物的数量成正比,通过检测荧光信号的强度可以定量PCR产物的数量。
二、实验步骤:1.设计引物和探针:选择特异性的引物和探针对目标序列进行扩增。
引物和探针的设计需要遵循一些原则,如避免引物和探针之间的自互补性、探针需选择合适的荧光染料等。
2.准备PCR反应体系:根据PCR反应需要,准备PCR反应体系。
一般包括模板DNA、引物、探针、聚合酶、缓冲液等。
3.荧光定量PCR反应:将PCR反应体系加入到荧光定量PCR仪中,进行PCR反应。
PCR反应的条件需要根据目标序列的特性进行优化,包括温度、延伸时间等。
4.数据分析:通过荧光定量PCR仪记录荧光信号的强度,根据荧光信号的强度可以反应PCR产物的数量。
通过数据分析软件对荧光信号进行定量计算,获得PCR产物的数量。
三、注意事项:1.引物和探针的设计需要严格控制,确保其特异性,避免与非靶序列结合。
2.PCR反应的条件需要进行优化,不同的目标序列可能需要不同的温度、延伸时间等。
3.控制实验中的阳性对照和阴性对照,确保实验结果的可靠性。
4.严格遵守无菌操作,避免PCR反应体系受到外源性污染。
5.选择合适的荧光定量PCR仪进行实验,确保获得准确的荧光信号强度数据。
6.实验过程中需严格按照操作规程进行,避免操作失误对实验结果产生影响。
荧光定量法
荧光定量法是一种常用的实验技术,用于测量和定量分析样品中的特定荧光信号。
这种方法基于荧光分子的性质,通过激发样品中的荧光分子,并测量它们产生的荧光信号的强度来得出定量结果。
荧光定量法的基本原理是利用荧光分子的特性。
荧光分子具有吸收光子能量后发出比吸收能量低的荧光能量的特点。
当样品中的荧光分子受到特定波长的激发光照射时,荧光分子会吸收光子能量并跃迁到激发态。
随后,荧光分子会在极短的时间内从激发态返回到基态,并释放出荧光能量。
这个过程是一个自发发光的过程。
荧光定量法的步骤如下:1.激发光源:选择合适波长的激发光源,可以是可见光或紫外光。
根据需要,可以选择不同的波长来激发不同的荧光分子。
2.样品制备:将待测样品制备成适合荧光测量的形式。
这可能涉及到样品的稀释、提取或染色等处理。
3.荧光测量:将样品放置在荧光测量仪器中,通过激发光源照射样品,并收集样品发出的荧光信号。
荧光信号的强度与样品中荧光分子的浓度成正相关。
4.数据分析:使用合适的荧光定量软件或算法处理所得数据,得出目标物质在样品中的浓度。
荧光定量法具有以下优点:1.高灵敏度:荧光分子具有较高的荧光量子产率,荧光定量法能够检测到低浓度的目标物质,通常比其他定量方法更加灵敏。
2.高选择性:通过选择激发光源的波长和使用特定的荧光探针,可以实现对特定目标物质的选择性定量分析。
3.宽线性范围:荧光信号的强度与荧光分子的浓度之间通常具有良好的线性关系,可以实现宽范围内的定量分析。
4.实时监测:荧光定量法通常具有快速的响应速度,可以在实时监测过程中进行定量分析。
荧光定量法在许多领域中得到广泛应用,例如生物学、环境监测、药物发现和医学诊断等。
它可以用于测量蛋白质、核酸、细胞分子和微生物等生物分子的浓度,也可以用于测量环境中的污染物浓度。
由于其高灵敏度、高选择性和实时监测的特点,荧光定量法成为了研究和应用领域中不可或缺的工具。
总之,荧光定量法是一种基于荧光分子特性的定量分析方法。
实时荧光定量PCR详细操作步骤流程!
实时荧光定量PCR详细操作步骤流程!原理实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
步骤一、样品RNA的抽提1. 取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其完全溶解。
2. 两相分离每1 ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2 ml的氯仿,盖紧管盖。
手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟。
4℃下12 000 rpm离心15分钟。
离心后混合液体将分为下层的红色酚氯仿相,中间层以及无色水相上层。
RNA全部被分配于水相中。
水相上层的体积大约是匀浆时加入的TRIZOL试剂的60%。
3. RNA沉淀将水相上层转移到一干净无RNA酶的离心管中。
加等体积异丙醇混合以沉淀其中的RNA,混匀后15到30℃孵育10分钟后,于4℃下12 000 rpm 离心10分钟。
此时离心前不可见的RNA 沉淀将在管底部和侧壁上形成胶状沉淀块。
4. RNA清洗移去上清液,每1 mlTRIZOL试剂裂解的样品中加入至少1 ml的75%乙醇(75%乙醇用DEPCH2O配制),清洗RNA 沉淀。
混匀后,4℃下7 000 rpm离心5分钟。
5. RNA干燥小心吸去大部分乙醇溶液,使RNA沉淀在室温空气中干燥5-10分钟。
6. 溶解RNA沉淀溶解RNA时,先加入无RNA酶的水4 0ul用枪反复吹打几次,使其完全溶解,获得的RNA溶液保存于-80℃待用。
二、 RNA质量检测1. 紫外吸收法测定先用稀释用的TE溶液将分光光度计调零。
然后取少量RNA溶液用TE稀释(1:100)后,读取其在分光光度计260nm和280nm处的吸收值,测定RNA溶液浓度和纯度。
(1)浓度测定A260下读值为1表示40 ug RNA/ml。
样品RNA浓度(μg/ml)计算公式为:A260 x 稀释倍数 x 40 ug/ml。
具体计算如下:RNA溶于40 ul DEPC水中,取5 ul,1:100稀释至495 ul的TE 中,测得A260 = 0.21RNA 浓度= 0.21 x 100 x 40 ug/ml = 840 ug/ml 或 0.84 ug/ul 取5 ul用来测量以后,剩余样品RNA为35 ul,剩余RNA总量为:35 ul x 0.84 ug/ul = 29.4 ug(2)纯度检测RNA溶液的A260/A280的比值即为RNA纯度,比值范围1.8到2.1。
荧光定量pcr的原理和过程
荧光定量pcr的原理和过程荧光定量PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种基于PCR技术的改进方法,通过引入荧光探针来实现对PCR反应的实时监测和定量分析。
荧光定量PCR广泛应用于基因表达分析、病原体检测、基因突变检测等领域,具有高灵敏度、高特异性、高准确性等优势。
荧光定量PCR的原理基本与传统PCR相同,都是通过不断复制DNA片段来扩增目标序列。
但是,荧光定量PCR在PCR反应体系中加入了特异性的荧光探针,这种探针能够与目标序列特异性结合,并在PCR反应过程中发出荧光信号。
通过实时监测荧光信号的强度,可以准确地定量PCR反应中的目标序列数量。
荧光定量PCR的过程主要包括:样品制备、引物设计、反应体系配置、PCR扩增、荧光信号检测和数据分析等步骤。
首先,样品制备是荧光定量PCR的第一步。
样品可以是DNA、RNA或cDNA等,需要根据实验的目的选择合适的样品类型,并进行样品提取和纯化。
接下来,引物设计是荧光定量PCR的关键步骤之一。
引物是用于扩增目标序列的短DNA片段,通常由两个引物组成:前向引物和反向引物。
引物的设计需要根据目标序列的特点,如长度、GC含量、特异性等进行合理选择,并使用生物信息学工具进行引物序列的合成。
然后,反应体系配置是荧光定量PCR的另一个重要步骤。
反应体系通常包括模板DNA、引物、荧光探针、核苷酸三磷酸(dNTPs)、聚合酶和缓冲液等组分。
其中,荧光探针是荧光定量PCR的关键组分,它通常由荧光染料和荧光信号抑制剂构成。
荧光染料可以与目标序列特异性结合,并在PCR反应过程中发出荧光信号;而荧光信号抑制剂可以抑制未结合的荧光染料发出的背景信号。
接着,进行PCR扩增。
PCR扩增是通过不断循环进行三个温度阶段的反应来扩增目标序列。
首先是变性阶段,将反应体系中的DNA变性为单链DNA;然后是退火阶段,使前向引物和反向引物与目标序列特异性结合;最后是延伸阶段,聚合酶在适当温度下将dNTPs加入到引物结合的DNA链上,从而合成新的DNA链。
荧光定量pcr原理和步骤
荧光定量pcr原理和步骤荧光定量PCR(quantitative polymerase chain reaction,qPCR)是一种常用的分子生物学技术,能够快速、准确地定量检测DNA或RNA的含量。
下面将介绍荧光定量PCR的原理和步骤。
荧光定量PCR的原理主要基于传统PCR技术和荧光探针技术的结合。
传统PCR通过不断复制DNA模板,使其数量呈指数增加,但并不能定量测定模板初始含量。
为了解决这一问题,qPCR引入了特定的荧光标记探针,该探针可与扩增产物特异性结合,通过荧光信号的增加来反映模板的初始数量。
荧光定量PCR的步骤如下:1. DNA模板制备:从待检测样本中提取DNA,并进行纯化处理,确保所得到的DNA质量较高。
2. 反应体系配置:根据实验需要,准备PCR反应液,包括DNA模板、引物(forward primer和reverse primer)、DNA聚合酶、核苷酸和缓冲液等。
3. 反应条件设定:根据引物序列的特性和所需扩增产物的长度,确定PCR反应的温度周期条件,包括退火温度、延伸时间和循环次数等。
4. 荧光探针设计:根据待检测序列的特点,设计合适的荧光探针,通常这些探针包括一个荧光染料和一个猪尾巴。
5. 温度循环程序:将配置好的PCR反应液放入热循环仪中,根据反应条件进行温度循环,使DNA发生退火、延伸和复性,并产生大量的扩增产物。
6. 荧光检测:热循环仪会不断读取PCR反应体系中荧光信号的变化,通过荧光强度来定量检测DNA的含量。
荧光信号的强度与模板DNA的初始含量成正比。
7. 数据分析:通过计算荧光信号和模板DNA的标准曲线,可以得到待检测样本中目标序列的初始含量。
8. 结果解读:根据数据分析的结果,可确定待检测样本中目标DNA的绝对或相对含量。
荧光定量PCR凭借其高度敏感和快速准确的特点,已广泛应用于基因表达分析、病原体检测、遗传病筛查等领域。
随着技术的不断发展,荧光定量PCR将在医学诊断和疾病预测中发挥更加重要的作用。
万字长文讲清荧光定量pcr
万字长文讲清荧光定量pcr荧光定量PCR(Polymerase Chain Reaction,聚合酶链式反应)是一种基于PCR技术的定量分析方法,它可以对DNA或RNA样品中的目标序列进行定量测定。
与传统PCR方法相比,荧光定量PCR具有更高的灵敏度和准确性。
在荧光定量PCR中,首先需要设计一对引物,它们能够特异性地结合到目标序列的两个相邻区域上。
引物的设计需要考虑多个因素,如引物长度、GC含量、Tm值等。
引物的合成通常由专业实验室完成,确保其质量和纯度。
在PCR反应中,首先将DNA或RNA样品与引物、荧光探针和酶进行混合。
然后,在一台PCR仪中,通过一系列的温度变化,使DNA 或RNA样品经历一系列的变性、退火和延伸过程,从而得到目标序列的扩增产物。
在PCR反应过程中,荧光探针发挥着重要的作用。
荧光探针通常由一个引物序列和一个荧光染料序列组成。
当荧光探针结合到目标序列上时,荧光染料与引物序列之间的约束被打破,导致荧光信号的释放。
荧光信号的强度与目标序列的数量成正比,可以通过荧光定量PCR仪进行检测和定量分析。
荧光定量PCR仪是一种专门用于测量荧光信号的仪器。
它可以实时监测PCR反应过程中的荧光信号强度,并根据荧光信号的变化来确定目标序列的初始浓度。
荧光定量PCR仪通常配备有相应的软件,可以自动分析和处理荧光信号数据,生成定量分析结果。
荧光定量PCR在许多领域都得到了广泛应用。
例如,在生物医学研究中,荧光定量PCR可以用于检测病原体的存在和数量,帮助诊断和治疗疾病。
在农业科学中,荧光定量PCR可以用于检测转基因作物的存在和数量,以及检测植物病原体的感染情况。
在环境科学中,荧光定量PCR可以用于监测水体和土壤中的微生物污染情况。
荧光定量PCR的发展和应用为科学研究和实验室诊断提供了重要的工具。
它不仅提高了DNA或RNA分析的灵敏度和准确性,还大大加快了实验的进行速度。
随着技术的不断改进和创新,相信荧光定量PCR将在更多的领域发挥重要作用,为人类的健康和环境保护做出更大的贡献。
荧光定量法
荧光定量法(最新版)目录一、荧光定量法的概述二、荧光定量法的原理三、荧光定量法的应用领域四、荧光定量法的优缺点五、荧光定量法的发展前景正文一、荧光定量法的概述荧光定量法是一种利用荧光物质在特定波长下产生的荧光强度与物质的浓度成正比的原理,对样品进行定量分析的方法。
该方法具有高灵敏度、高精度、快速等特点,被广泛应用于生物学、化学、环境科学等领域。
二、荧光定量法的原理荧光定量法的原理主要基于荧光物质在特定波长下的荧光强度与物质的浓度之间的相关性。
当荧光物质与待测样品混合后,荧光物质的荧光强度会受到样品中荧光物质浓度的影响。
通过测量荧光强度,可以推算出样品中荧光物质的浓度,从而实现对样品的定量分析。
三、荧光定量法的应用领域荧光定量法在多个领域具有广泛的应用,主要包括以下几个方面:1.生物学领域:荧光定量法可用于检测蛋白质、核酸等生物大分子的浓度,为生物科学研究提供重要手段。
2.医学领域:荧光定量法可用于检测血液、尿液等生物样本中的疾病标志物,为疾病的诊断和监测提供依据。
3.环境科学领域:荧光定量法可用于检测水中重金属离子、有机污染物等环境污染物的浓度,为环境监测和污染治理提供技术支持。
4.化学领域:荧光定量法可用于分析化学品中的荧光物质含量,为化学品的生产和质量控制提供依据。
四、荧光定量法的优缺点荧光定量法具有以下优点:1.高灵敏度:荧光定量法能够检测到非常低浓度的荧光物质,具有很高的灵敏度。
2.高精度:荧光定量法可以实现对荧光物质浓度的精确测量,有利于提高分析结果的可靠性。
3.快速:荧光定量法能够在短时间内完成对样品的定量分析,具有较高的分析效率。
然而,荧光定量法也存在一定的缺点:1.仪器设备要求较高:荧光定量法需要使用专门的荧光光谱仪等设备,对仪器设备要求较高。
2.易受干扰:荧光定量法在实际应用过程中,可能会受到其他物质的荧光干扰,影响分析结果的准确性。
五、荧光定量法的发展前景随着科学技术的不断发展,荧光定量法在理论研究和应用技术方面都将取得新的突破。
万字长文讲清荧光定量pcr
万字长文讲清荧光定量pcr荧光定量PCR(qPCR)是一种广泛应用于生物学研究的分子生物学技术。
它通过测量PCR反应体系中的荧光信号强度,来定量检测DNA或RNA的存在量。
qPCR是传统PCR的改进版,它能够在PCR反应进行的同时,实时监测荧光信号的强度。
这种实时监测的能力使得qPCR具有高灵敏度、高特异性和高精确性。
与传统PCR相比,qPCR可以快速、准确地确定目标分子的存在量,而无需进行后续的凝胶电泳分析。
在qPCR中,荧光信号来自于引物与模板DNA或RNA的结合。
在PCR反应的早期阶段,引物与目标分子结合,产生一个新的DNA或RNA双链。
这个双链结构中的荧光探针会发出荧光信号。
随着PCR 反应的进行,荧光信号的强度会随着目标分子的扩增而增加。
为了准确测量荧光信号的强度,qPCR系统通常会使用一个叫做“荧光阀值”的指标。
荧光阀值是一个设定的阈值,当荧光信号的强度超过这个阈值时,系统会自动记录荧光信号,这个时刻被称为“Ct值”(Cycle threshold value)。
Ct值越小,表示目标分子的起始数量越多。
为了提高qPCR的准确性,研究者通常会设计一个合适的引物和荧光探针。
引物是用来扩增目标分子的片段,而荧光探针则是用来检测目标分子的存在。
荧光探针通常含有一个荧光染料和一个荧光淬灭剂。
当荧光探针与目标分子结合时,荧光染料会发出荧光信号;而在分子扩增的过程中,荧光淬灭剂会与荧光染料结合,从而使荧光信号减弱。
除了引物和荧光探针的设计,qPCR还需要进行一系列的质控步骤来确保结果的准确性。
例如,研究者通常会设计一个阴性对照来排除假阳性的可能性。
阴性对照是一个不含目标分子的样品,如果阴性对照的Ct值超过了荧光阀值,那么可以判定实验结果是可靠的。
总的来说,荧光定量PCR是一种非常重要的分子生物学技术,它在基因表达分析、病原体检测、基因突变鉴定等领域都得到了广泛的应用。
通过实时监测荧光信号,qPCR可以准确、快速地定量检测目标分子的存在量,为生物学研究提供了强有力的工具。
荧光定量PCR实验及数据分析
荧光定量PCR实验及数据分析荧光定量PCR(Fluorescence Quantitative PCR,qPCR)是一种常用于检测和定量分析DNA或RNA浓度的技术。
该技术利用荧光探针与靶分子结合产生荧光信号,通过荧光信号的强度可以确定靶分子的数量。
本文将介绍荧光定量PCR实验及数据分析过程。
实验步骤:1.样品制备:根据研究需要选择DNA或RNA样品,提取并纯化目标DNA或RNA,并将其浓度测定。
2.酶切反应:如果需要对目标DNA或RNA进行酶切,可在此步骤中将其酶切为较小的片段。
3.扩增反应体系的准备:根据实验设计和厂家提供的建议,配置扩增反应所需的试剂。
4.PCR扩增:将目标DNA或RNA与引物和荧光探针一起添加到PCR反应管中,并进行PCR扩增。
根据实验设计,设置反应的温度梯度和时间。
5.实时荧光检测:在PCR扩增的过程中,使用实时PCR仪不断监测PCR反应管中的荧光信号,记录其强度变化。
6.构建标准曲线:选取一系列已知浓度的标准样品进行PCR扩增,并记录每个标准样品的荧光信号强度。
根据标准曲线绘制荧光信号强度和目标分子浓度的对应关系。
7.分析样品数据:将样品的荧光信号强度与标准曲线进行比较,可以计算样品中目标分子的浓度。
根据实验目的,可以对样品数据进行统计分析,如计算平均值、标准差等。
数据分析:1.标准曲线分析:使用标准曲线中的已知浓度和相应的荧光信号强度,通过拟合曲线或插值方法,可以计算出待测样品中目标分子的浓度。
2.相对定量分析:若需要比较不同样品之间目标分子的相对表达水平,可选取一个内参基因作为参照,通过计算目标分子基因和内参基因相对表达量的比值,进行比较分析。
3.统计分析:根据实验设计和样品数量,可以使用合适的统计方法对数据进行分析。
常见的统计方法包括t检验、方差分析等。
总结:荧光定量PCR技术在生物学研究中具有重要的应用价值,能够快速、准确地定量测定DNA或RNA的浓度。
在进行实验时,需要注意实验步骤的正确操作,并合理选择实验设计和数据分析方法,以确保结果的可靠性和准确性。
荧光定量PCR完全攻略
荧光定量PCR完全攻略荧光定量PCR完全攻略1、什么是定量PCR?以参照物为标准,对PCR终产物进行分析或对PCR过程进行监测,从而达到评估样本中靶基因的拷贝数,称为定量PCR.定量PCR的可行性定量一般是在PCR扩增的指数期进行的.2、定量PCR定量的理论依据是什么?特定的待扩增基因片段起始含量越大,则指数扩增过程越短,当扩增速率趋于稳定后,则无论原来样品中起始模板含量多少,最终扩增片段的含量通常是一样的. 理想的扩增结果:Y=X*2n其中Y代表扩增产物量, X代表PCR反应体中的原始模板数n为扩增次数; 理论上PCR扩增效率为100%,PCR产物随着循环的进行成指数增长,但实际上:DNA的每一次复制都不完全,即每一次扩增中,模板不是呈 2 的倍增长;实际应为:Y= X(1+E)n,其中E 代表扩增效率:E = 参与复制的模板/总模板,通常E≤1,E在整个PCR扩增过程中不是固定不变的.通常X 在1~105 拷贝、循环次数n≤30 时,E 相对稳定,原始模板以相对固定的指数形式增加,适合定量分析,这也就是所谓的指数期;随着循环次数n的增加(>30次),E值逐渐减少,Y 呈非固定的指数形式增加,最后进入平台期.3、荧光定量PCR定量的理论模式又是什么?PCR 是对原始待测模板核酸的一个扩增过程,任何干扰PCR 指数扩增的因素都会影响扩增产物的量,使得PCR 扩增终产物的数量与原始模板数量之间没有一个固定的比例关系,通过检测扩增终产物很难对原始模板进行准确定量.近年来研究人员通过大量的实践,研究了相对准确的定量PCR 方法,即荧光定量PCR.PCR扩增通式: ①Tn=T0(1+E)n②Tn=Tn-1(1+E)n注:[0<E< 1]其中E表示扩增效率,n为循环数,Tn表示在n个周期后PCR产物的数量,Tn-1表示在n-1 个周期后PCR产物的数量,T0为原始模板数量.设定PCR到达指数扩增期时,产生一定的荧光(荧光依赖于某一循环扩增产物的总量,即特定的拷贝数K,为常数,大约在1010左右)高于背景为仪器所识别,此时的循环数为CP(crossing point),也就是K= T0(1+E)CP,取对数即:lg K=lg T0+CP*lg(1+E)CP=- 1/lg(1+E)*lg T0 +lgk/lg(1+E)由于对一特定的PCR而言,E与K均为常数,故上式为循环数(CP)对原始模板拷贝数的对热线电话:021-5446 0831 8009881995 E-mail:master@ 网址:1数(lg T0)一次方程,其标准形式y=kx+b,该直线的斜率为- 1/lg(1+E),在横坐标上的截距为lgk/lg(1+E),也是荧光定量PCR所谓的标准曲线.例如下图为单管实时荧光定量RT-PCR的标准曲线:目前荧光定量PCR 均采用外标定量外标法定量PCR扩增效率的计算,由于标准曲线的斜率(Slope)为- 1/lg(1+E),可知E=10-1/Slope-1 ,如从标准曲线中知道Slope=-3.337,则可推知扩增效率E=101/3.337-1=0.99,也有作者将(1+E)直接视为扩增效率E,则E=10-1/Slope,求得的E值均在1—2 之间,有时也有大于2的结果,如下图所示.另外也可直接根据系列稀释外标在该次实时荧光PCR的结果来大略分析扩增效率的高低,例如系列10 倍稀释外标在PCR扩增时有N2=N0En2, N3=(10*N0)En3,在扩增到指数期时荧光值相同则代表此点的终末拷贝数相同,即N2=N3,En2-n3=10,取对数得到⊿n gE=1, E=10l 1/⊿n,E=2,⊿n=3.32; E=1.8,⊿n=3.91.反之亦然.如图所示.热线电话:021-5446 0831 8009881995 E-mail:master@ 网址:24、定量PCR根据反应体系是否设有参照物以及是否与标本在同一管中进行扩增,定量PCR 可分为四种方法:①有限稀释法,即倍比稀释法:通过稀释阳性样品直至靶基因不能再扩增为止,来设置已知浓度的参照品;根据阳性结果的最大稀释度及内参标或外参标的极限检出底线,计算出待检标本中原始模板的分子数;利用最大稀释度来进行标本核酸定量时的注意点A、PCR 产物的最低可检测极限须有重复性;B、对每个稀释度必须作多次PCR ,一般先对模板DNA 作10倍连续稀释后作PCR,首先找到PCR 结果呈阴性的接近稀释点,然后再对各稀释度作系列的2倍稀释,每个稀释点作 5 次PCR;C、必须严格控制污染 .优点:不需要特殊设备;缺点:扩增反应条件的标准化、严格注意污染,避免假阳性的产生.②使用外参照物的定量PCR,以已知浓度的目的基因为模板,按一定的倍比稀释,然后做出标准曲线图,未知的标本按这标准曲线找出对应的拷贝数.荧光定量PCR 通常使用该法做标准曲线.③使用非竞争性内参照物的定量:PCR 反应条件同样,在同一试管内,用两对引物,同步扩增来自同一DNA 的一段靶序列和另一段内标序列.通过比较两种序列的扩增产量可对靶序列定量.方法: A、设计并合成PCR 扩增靶基因及无关基因的引物,优化引物配比的条件.B、在指数增长期实现对靶基因及一系列已知含量无关基因的PCR 扩增. C、PCR 产物琼脂糖凝胶电泳,EB 染色. D、电泳条带的紫外光下分析. E、二者荧光强度相等管的DNA 含量亦相等. 该方法只有当靶序列和内标序列以相同的量存在时,才能对两者相对定量;也可以分成哪几类?热线电话:021-5446 0831 8009881995 E-mail:master@ 网址:3是对处于扩增指数期的PCR 产物定量.④使用竞争性内参照物的定量PCR:同样的反应条件,同一个试管,用同一对引物,同步扩增靶序列和内参照序列.靶基因的量可通基本条件是靶序列和竞争性序列均用相同的引物以相同的效率扩增,两序列的初始化比值在整个反应过程中保持不变. 目的DNA 内参照DNA 变性(同一对引物) PCR 竞争性模板的设置:通过改变克隆的靶基因的序列来设计竞争性模板插入新的限制性酶切位点或使原来的酶切位点缺失通过基因重组技术插入一个与特异性蛋白结合的DNA 片段,或者使靶序列发生定点诱变人工合成竞争性模板竞争性模板设计目的:使其与靶基因的PCR 扩增产物相区别(通过酶切、杂交、显色等手段实现).根据PCR 扩增过程中是否加入某种标记物、标记物的种类以及最后检测的信号的不同可分为四种类型:①直接定量检测法,②同位素标记定量③酶标记定量检测法④荧光定量PCR 技术荧光定量PCR 主要原理发射波长与受体荧光染料光染料吸收供体荧光传递的能量而激发出另一波长的荧光,同时将供体荧光淬灭.依据PCR 过程的监测检测模式又可分为如下几种(1) Sybr Green I 检测模式SYBR Green I 是一种能与双链DNA 结合发光的荧光大增强.因此, SYBR Green I 的检测出PCR 体系存在的双链DNA 数量.SYBR Green I 的最大吸收波长约为497nm,发射波长最大约为520nm.PCR 扩增程序一般为94℃~55℃~72℃三步法,40 个循环.SYBR Green I 的缺点:由于SYBR Green I 没有特异性,不能识别特定的双链,只要是双链就会结合发光,对PCR 反应中的非特异性扩增或引物二聚体也会产生荧光,通常本所以在临床上使用可能会有假阳性发生.SYBR Green I 的优点:SYBR Green I 的优点是因为其缺点产生,由于它能所有的双链DNA 相结合,所以对不同模板不需特别定制不同的这对科研是很有利的,因此国内外在科研中使用比较普遍.过与产生相同产物的竞争物的量相比较而得到.其检测法,:荧光共振能量转移,外来光源激发供体荧光染料发出荧光,当其的吸收波长部分重叠,且两者距离很近(约10~100 埃)时,受体荧染料.其与双链DNA 结合后, 荧光大荧光信号强度与双链DNA 的数量相关,可以根据荧光信号底较高,特异性探针,通用性较好,并且价格相对较低.热线电话:021-5446 0831 8009881995 E-mail:master@ 网址:4SYBR GREEN I 工作原理(2) 水解探针模式(Taqman)TaqMan 探针是一种寡核苷酸探针'末端, 而淬灭剂则在3'末端.当探针与靶序列配对时,荧光基团发射的荧光因与3'端的淬灭剂接近而被淬灭.在进行延伸反应时,聚合酶的5'外切酶活性将探针切断, 使得荧光基团与淬灭剂分离,发射荧光.一分子的产物生成就伴随着一分子的荧光信号的产生.随着扩增循环数的增加,释放出来的荧光基团不断积累.因此Taqman 探针检测的是积累荧光.PCR 扩增程序通常是:94℃~60 ℃40 个循环.常用的荧光基团是FAM,TET,VIC,HEX.Taqman 探针工作原理(3) 杂交探针模式(Beacon、FRET)分子信标是一种呈发夹结构的茎环因此标记在一端的荧光基团与标记在另一端的淬灭基团紧紧靠近.荧光基团被激发后产生的光子被,荧光基团连接在探针的5双标记寡核苷酸探针,两端的核酸序列互补配对,热线电话:021-5446 0831 8009881995 E-mail:master@ 网址:5淬灭剂淬灭,由荧光基团产生的能量以红构中,环一般为15-30 个核苷酸长,并与目标序列互补;茎一般5-7 个核苷酸长,并相互配对形成茎的结构.荧光基团标记在探针的一端,而淬灭剂则标记在另一端.在复性温度下,因为模板不存在时形成茎环结构,当加热变性会互补配对的茎环双链解开,如果有模板存在环序列将与模板配对.与模板配对后,分子信标将成链状而非发夹状,使得荧光基团与淬灭剂分开.当荧光基团被激发时,因淬灭作用被解除,发出激发光子.由于是酶切作用的存在,分子信标也是积累荧光.常用的荧光基团:FAM ,Texas Red .PCR 扩增程序通常是:94~55~72 ℃三步法,40 个循环.外而不是可见光形式释放出来.分子信标的茎环结ET 探针又称双杂交探针,FRET 探针由两条相邻探针组成,在一条探针的5`端标记FAM 荧光基团,另一探针的3`端标记Red 640 荧光基团.当复性时,探针结合在模板上,FAM 基团和Red640 基团相邻,激发FAM 产生的荧光,作为Red640 基团的激发光被吸收,使Red640 分子信标工作原理FR发出波长为640 的荧光.当变性时,探针游离,两基团距离远,不能产生640 波长的荧光.由于FRET 探针是靠近发光,所以检测信号是实时信号,非累积信号.常用的荧光基团是:LC-Red640,LC-Red705.热线电话:021-5446 0831 8009881995 E-mail:master@ 网址:6FRET 工作原理能用于实时荧光PCR 定量的方法很多,各有优缺点,应根据实验的需要和当前的实验条件选择适合自己的方法.SYBR GREEN FRET 探针Taqman 分子信标性质可逆荧光积累荧光熔点分析能不能特异性引物(非特异性扩增或引物二聚体有影响)引物+2 探针引物+探针引物+探针探针不需要需要需要需要通用性通用专用专用专用5、为什么要用荧光定量PCR 技术进行定量?它与传统的定量PCR 有什么不同?如前所述的,传统的定量PCR 有很多,主要是倍比稀释法、内参照法、竞争法、PCR-ELISA 法,但这些定量PCR 技术的难点主要在于:(1)如何确定PCR 正处于线性扩增范围内(只有在此范围内PCR 产物信号才与初始模板的拷贝数成比例).(2)一旦线性扩增范围确定热线电话:021-5446 0831 8009881995 E-mail:master@ 网址:7以后,如何找到一个合适的方法检测结果.为了保证线性,研究者要扩增一系列梯度稀释的cDNA 或者对每个基因的扩增循环数作适当的调整;有的研究者加一个竞争性模板,有的做限制性的稀释梯度分析,或者加一个PCR 模拟(mimic)反应,即用相似的引物与目标产物共扩增,而扩增产物的检测通常在跑胶以后通过染料、放射活性或者探针进行检测.(3)大多数是终点检测,即PCR 到达平台期后进行检测,而PCR 经过对数期扩增到达平台期时, 检测重现性极差.同一个模板在96 孔PCR 仪上做96 次重复实验,所得结果有很大差异(如下图所示),因此无法直接从终点产物量推算出起始模板量;虽然加入内标后,可部分消除终产物定量所造成的不准确性.但即使如此,传统的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法,所以传统定量PCR 的缺点是:劳动强度大、定量不准确、重复性差.而荧光定量PCR有如下显著的优点:1、特异性好,使用特异性探针对定量分子进行识别,具有很高的准确性.同时,靶序列由引物和探针双重控制,特异性好、假阳性低.2、灵敏度高,荧光PCR检测技术是综合了PCR技术、荧光标记技术、激光技术、数码显象技术为一体的技术,因此它的检测灵敏度很高.3、线性关系好、线性范围宽,由于荧光信号的产生和每次扩增产物成一一对应的关系,通过荧光信号的检测可以直接对产物进行定量;定量范围可在0-1010拷贝/毫升.4、操作简单、安全、自动化程度高、防污染.扩增和检测可以在同一管内检测,不需要开盖,不易污染;同时扩增和检测一步完成,不需要后期处理,不再需要担心放射性污染.。
荧光定量PCR原理及实验步骤
荧光定量PCR原理及实验步骤
一、实时荧光定量PCR原理
常规PCR技术对PCR扩增反应的终点产物进行定量和定性分析无法对起始模板准确定量,无法对扩增反应实时检测。
实时定量PCR技术,在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,通过Ct值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析。
几个概念:
(1)扩增曲线:
(2)荧光阈值:
(3)Ct值:
(4)标准曲线
SYBR Green工作原理:
1、SYBR Green 能结合到双链DNA的小沟部位
2、SYBR Green 只有和双链DNA结合后才发荧光
3、变性时,DNA双链分开,无荧光
4、复性和延伸时,形成双链DNA,SYBR Green 发荧光,在此阶段采集荧光
信号。
二、实验步骤
1. 实验前先在大型仪器共享平台上预约多元荧光定量PCR仪。
1、将所需引物和SYBgreen(避光)拿出,解冻。
计算好所有引物和SYBgreen
的用量。
2、反应体系(25μL)如下:
H2O 11μL
SYBgreen 12.5Μl
上游引物0.25μL
下游引物0.25μL
cDNA 1μL
可先将H2O 和SYBgreen按照所需量配好后,分装,再根据需要加引物和模板。
4、加完所有试剂后,盖上盖子,混匀,离心。
上机。
荧光定量实验全流程
荧光定量实验全流程一. RNA提取准备工作1. 1mL、200ul、10ul枪头盒,浸泡在0.1% DEPC处理水中过夜,报纸包好高压灭菌,入烘箱烘干。
2. 配制0.1%DEPC水,0.1%DEPC水=1000ml双蒸水+1ml DEPC,通风橱放置过夜,高压灭菌,灭菌时将瓶盖拧松但不脱落,灭菌结束后迅速将瓶盖拧紧,冷却至室温后放入4℃冰箱冷却,使用前在超净台内分装成小管待用,避免污染。
3. 配制75%乙醇(DEPC水配置),配好放入4℃冰箱预冷保存。
4. 氯仿、异丙醇4℃冰箱预冷。
注意:DEPC试剂毒性较强,操作时注意做好防护措施,避免吸入和溅到皮肤,浸泡枪头盒的0.1% DEPC处理水需要高压灭菌后才能倒入下水道。
二、提取RNA1. 磨样:将组织样品在研钵中磨成粉,装入有1ml Trizol 的1.5ml无菌无酶EP 管中,震荡混匀,静置5-10min;细胞样品直接加入1ml 预冷的Trizol,震荡混匀,静置5min。
2. 装有样品的1.5ml EP管中加入200ul 氯仿,震荡1min,冰上静置5min,离心(12000g,4℃,10min)3. 离心后液体分层:上层无色液体(RNA),中层白色(DNA),下层红色(protein)。
小心吸取上层无色液体,不要触碰到中层白色,加入新的无菌无酶EP管中,约400ul。
4. 加入等体积的异丙醇(400ul),混匀,用力震荡,冰上静置10-15min,离心12000g,4℃,15min)5. 弃掉上清液,加入1ml 75% 乙醇,振荡,洗涤,离心8000g,4℃,10min)6. 重复步骤5洗涤7. 小心弃去上清液,超净台内EP管倒置在滤纸上干燥使75%乙醇完全挥发。
8. 根据RNA沉淀大小,加入适量0.1%DEPC水反复吹打直至溶解,50ul左右。
9. 测定RNA浓度三、RNA电泳鉴定RNA很容易讲解,跑电泳的时候也容易降解,最好换新的电泳液。
实时荧光定量PCR详细操作步骤
实时荧光定量PCR详细操作步骤1.实验前准备a.首先,准备所需的引物和探针。
引物是用于扩增待测DNA或RNA序列的短链DNA片段,而探针是荧光标记的DNA分子,用于标记和检测扩增产物。
可以使用商业引物和探针,或者设计自定义的引物和探针。
b.准备样品。
样品可以是DNA或RNA提取物,也可以是cDNA反应产物。
确保样品的质量和纯度,避免污染和降解。
c. 准备Master Mix。
Master Mix是一个预混合的反应液,包含引物、探针、核酸酶、逆转录酶、聚合酶和其他所需的试剂。
根据实验设计确定Master Mix的配方和浓度。
2.反应管设定a. 将适量的Master Mix加入每个反应管中。
根据实验设计,确定每个反应管中所需Master Mix的体积。
b.加入适量的模板DNA或RNA溶液。
根据实验设计,确定每个反应管中所需模板溶液的体积。
c.加入适量的引物和探针。
根据实验设计,确定每个反应管中所需引物和探针的体积。
d.加入适量的缓冲溶液和其他试剂。
根据实验设计,确定每个反应管中所需缓冲溶液和其他试剂的体积。
3.PCR程序设定a.设定PCR程序。
根据引物和探针的特性,确定PCR程序的温度和时间参数。
通常包括一个初始变性步骤(95°C,5分钟),40个循环的扩增步骤(95°C,30秒;温度调节,30秒;扩增,30秒-1分钟),以及最终的降温步骤(4°C或25°C)。
b.设定数据采集方式。
实时荧光定量PCR系统可以实时监测PCR反应过程中的荧光信号变化,并实时记录和分析数据。
根据实验设计和PCR程序,选择合适的数据采集方式,在合适的时间点记录荧光信号。
4.实验操作a.将反应管安置在实时荧光定量PCR仪中。
确保反应管正确放置在PCR仪的样品槽中,并密封好。
b.启动PCR程序。
根据PCR仪的操作说明,启动PCR程序并开始反应。
c. 监测PCR反应过程。
实时观察PCR反应过程中的荧光信号变化。
万字长文讲清荧光定量pcr
万字长文讲清荧光定量pcr荧光定量PCR(Fluorescent Quantitative Polymerase Chain Reaction,qPCR)是一种基于PCR技术的快速、高灵敏度和高特异性的DNA 定量方法。
它利用DNA扩增和荧光探针结合的原理,可以快速准确地定量目标DNA的含量。
荧光定量PCR主要分为两个步骤:扩增和检测。
在扩增步骤中,通过PCR反应使目标DNA被放大成大量的拷贝,并引入荧光标记的引物。
在检测步骤中,通过荧光探针与扩增产物结合,并测量荧光信号的强度,从而确定目标DNA的含量。
具体步骤如下:1. 反应体系的准备:根据实验需要,制备PCR反应液,包括引物、荧光探针、缓冲液、dNTPs、酶等。
2. DNA模板的准备:从待测样本中提取DNA,并进行纯化和浓缩。
3. PCR扩增反应:将DNA模板与引物和荧光探针加入PCR反应液中,进行PCR扩增反应。
PCR反应可以选择不同的温度程序,包括变性、退火和延伸等步骤。
4. 荧光信号检测:在PCR扩增反应过程中,荧光探针与目标DNA 结合形成双链结构,荧光信号被激发并发射。
荧光信号可以通过荧光实时定量PCR仪器进行检测和记录。
5. 数据分析:根据荧光信号的强度,可以计算目标DNA的含量。
通常,荧光信号的强度与目标DNA的初始浓度成正比。
荧光定量PCR的优势在于其高灵敏度、高特异性和高准确性。
由于荧光信号可以实时检测和记录,所以可以在PCR反应过程中实时监测目标DNA的含量变化。
此外,荧光定量PCR可以同时检测多个目标DNA,并且可以定量非常低浓度的DNA样本。
荧光定量PCR在生物医学研究、临床诊断、基因表达分析等领域得到了广泛的应用。
它可以用于检测病原体、基因表达水平、突变等,对于研究疾病的发生机制、筛选药物靶点、预测疾病进展等具有重要意义。
同时,荧光定量PCR也是一种常用的基因分型方法,可以用于DNA指纹鉴定、亲子鉴定等。
荧光定量PCR作为一种快速、高灵敏度和高特异性的DNA定量方法,已经成为生命科学研究和临床诊断的重要工具。
荧光定量法
荧光定量法摘要:一、荧光定量法的概念与原理1.荧光定量法的定义2.荧光定量法的原理二、荧光定量法的实验流程1.实验材料准备2.实验操作步骤三、荧光定量法的应用领域1.基因表达分析2.蛋白质检测3.药物筛选与评价四、荧光定量法的优缺点1.优点2.缺点五、荧光定量法与其他定量方法的比较1.比较对象2.比较结果六、荧光定量法的发展前景1.发展趋势2.前景展望正文:荧光定量法是一种基于荧光信号的定量分析方法,广泛应用于生物学、化学和医学等领域。
该方法通过测量荧光物质在特定条件下的荧光强度,从而定量分析目标物质的含量。
一、荧光定量法的概念与原理荧光定量法是利用荧光物质在特定条件下发射荧光的强度与目标物质的浓度成正比这一原理来进行定量分析。
荧光物质在吸收激发光后,从基态跃迁到激发态,经过一定的寿命后,回到基态并发射荧光。
通过测量荧光强度,可以推算出目标物质的浓度。
二、荧光定量法的实验流程1.实验材料准备:包括荧光探针、目标物质、实验细胞或组织等。
2.实验操作步骤:首先进行样品的处理和准备,然后进行荧光探针的标记、孵育和激发,最后进行荧光信号的检测和数据分析。
三、荧光定量法的应用领域荧光定量法在基因表达分析、蛋白质检测和药物筛选与评价等领域具有广泛应用。
例如,通过荧光定量PCR 技术可以实时、定量地检测基因的表达水平;荧光定量免疫层析法可以快速检测蛋白质的表达和活性;荧光定量药理学实验可以用于药物筛选和药效评价。
四、荧光定量法的优缺点优点:荧光定量法具有较高的灵敏度和准确度,操作简便,实验时间较短。
缺点:荧光定量法可能受到仪器设备、实验条件等因素的影响,存在一定程度的误差。
此外,荧光探针的选择和荧光信号的检测也具有一定的局限性。
五、荧光定量法与其他定量方法的比较荧光定量法与放射性同位素标记法、生物发光法等定量方法相比,具有无放射性污染、实验安全性高等优点。
然而,荧光定量法在某些方面的准确性和灵敏度略逊于放射性同位素标记法。
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三、数据分析: 1、△CT=CT(样品)-CT(内参) 2、△△CT=△CT(样品)-CT(对照) 3、相对表达量=2- △△CT 在excell中 相对表达量=power(2,- △△CT )
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总分数在89,主要原因是GC含量差别太大,造成退火 温度相差太大,我们再点击编辑,进行修改,去掉其 中一个G,点击analyze—prime进行分析
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一、引物的设计 1、注意事项: 发卡结构 引物二聚体 自我配对 引物的GC含量和退火温度 引物的长度、特异性 产物的长度
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2、利用)
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How many targets do you want to quantify in the reaction plate?
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3、引物的特异性检测 通过ncbi中的blast数据库检测所涉引物的特异性, 网址:/Blast.cgi
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4、将PCR管放入仪器的时候,要带新的一次性手套 5、仪器内8连管和96孔板使用不同的管架,主要区分 6、定量结束,禁止在大房间打开PCR管或PCR板 7、两次实验之间尽量至少休息半个小时,不要关机 关闭软件,待机休息 8、荧光定量PCR结束要及时关闭软件,防止长时间 在运作状态,对仪器电路板损伤比较大 9、设计程序时,溶解曲线后面加一步:温度降到 10-37℃之间,减少对仪器的损伤,
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选择Primer---search,修改条件,点击两次OK
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荧光定量PCR全程操作详解
报告人:宋瑞龙
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一、引物的设计 二、RNA的提取 三、荧光定量操作
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2、RNA的提取方法 (1)注意事项: 所用的枪头、离心管等与RNA接触的东西尽量避免RNA酶 的污染 操作时一定带口罩、手套、穿工作服(原因) 上清为RNA,中层为DNA,下层为蛋白质,要少吸取上清 ,不要贪多,避免将DNA吸进RNA中 提取的RNA要及时的转录一部分,剩余的放-80℃保存
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三、荧光定量PCR操作 1、软件的设置:
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切记:设计完成后要点击左侧的 对话框看看有没有设计错误,否则 你的样品可能因为你设计错了而毁掉
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二、荧光定量PCR操作注意事项: 1、不要在荧光定量的八连管或者96孔板上做任何标记 2、加样之前要把可以混在一起的试剂尽量混合后加样 这样一方面可以节省枪头(6毛钱呀呀呀!!),另一 方面增加加样的准确性, 3、加样循序最好是SYBR先加,引物最后加,模板尽 量在引物之前添加,这样相同模板可以用一个枪头, 相同引物可以用一个枪头,还会减少误差以及操作带 来的溶解曲线的双峰
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SCI文章中,荧光定量PCR可能会要到的数据: 1、RNA完整性检测 2、引物的好坏(荧光定量PCR中的溶解曲线) 3、CT值,通过CT得到的分析数据以及用以分 析数据的方法 4、退火温度,在文章中可能需要提一下
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RNA切勿反复冻融。 在用trizol提取RNA过程中,加入氯仿后,用手剧烈摇匀 切勿用涡旋仪摇,避免不分层 RNA风干过程中,不要吹的太干10-15min左右 进行琼脂糖电泳的时候,加样量不要太多, (2)RNA提取的好坏主要看两个方面: 吸光度260/280=1.8~2.0之间 琼脂糖电泳:28S:18S~2:1,5s可多可少,无要求