凝固酶阴性葡萄球菌
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结论
16S rDNA以及sod A基因可作为鉴定CoNS 的基因标记,但不能用来作为致病性与非 致病性凝固酶阴性葡萄球菌的鉴别依据。 目前区分致病性与非致病性凝固酶阴性葡 萄球菌的基因标志仍是串联存在的ica D基 因片段,其可被认为是获得性医院感染相 关性CoNS特异的基因型或基因标志物。
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结果和讨论
37例CoNS样品进行了16S rDNA基因及sodA基因片段
的PCR扩增,电泳检测结果显示全部样品均能准确地 扩增出相应的片段,其片段大小分别为16S rDNA 926bp及sodA 482bp,且均为单一条带;
序列测定表明所有样品16S rDNA 及sod A PCR产物 序列均相同,未发现与感染相关的特异性分子序列。
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第二部分 材料和方法
1、研究对象
阴性对照:表皮葡萄球菌ATCC12228,购自中国 药品鉴定所,经基因组测序证明其ica操纵子缺失 ; 阳性对照:表皮葡萄球菌1-97-337,瑞金医院倪语 星教授惠赠,含有完整ica操纵子; 待测样本:自2006年1月至2007年9月,收集我院 临床各科室共114例疑是感染性标本。
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研究背景和意义
近年来由于介入性诊疗操作、免疫抑制剂及广谱抗生素 的广泛使用,CoNS已成为院内感染的重要病原菌,而 且耐药菌株比金黄色葡萄球菌更为多见。 叶联华等报道人工瓣膜术后心内膜炎中,约有40%50%由凝固酶阴性葡萄球菌引起; 2009年中国CHINET细菌耐药监测结果MRCoNS检 出率平均为71.7%,大于MRSA的52.7%。
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研究背景和意义
ica 基因结构
ica 基因座定位于细菌染色体,全长 3.4 kb,包括 icaR 调节 基因及串联存在的 icaA、icaD、icaB 和 icaC 结构基因。 其中,icaADBC 4 个基因构成一个操纵子,可以通过检测 icaADBC 基因来反映ica 操纵子的存在。
icaB 不直接参与胞间黏附素的合成,因为重组icaADC 就能 使细胞积聚; icaA 单独呈现低的N-乙酰葡糖胺转移酶活性; icaC涉及到把不断合成的多糖物质转运至细胞表面; 生物膜的形成要求icaD编码的产物具有最佳活性。
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材料和方法
3、主要仪器设备
PCR仪:PTC100 PCR仪,美国MJ Research Inc.;
恒压恒流电泳仪、电泳槽:DF-C型,北京东方特力科贸 中心;
凝胶成像系统:GDS8000 ,美国UVP Inc.;
核酸/蛋白定量仪:DU640,美国Beckman; 酶标仪:美国雷杜,深圳组装;
图2.3 : 部分样品的定性黏附性实验结果
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结果和讨论
表2.4 : 9例icaD( + )菌株半定量黏附性实验结果
实验例数
实验分类
黏附实验 阳性
黏附实验 阴性
ica D PCR(+), 刚果红(+)
ica D PCR(+), 刚果红(—) 合计
6
6
0
3
2
1
9
8
1
20
结果和讨论
通过体外半定量黏附实验测得88.9%(8/9) icaD( + )菌株是粘附株。
凝固酶阴性葡萄球菌
致病性分子标志物的建立与应用
姜美娟
中国人民解放军第401医院
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第一部分 研究背景和意义
1、立题依据
凝固酶阴性葡萄球菌(CoNS)广泛存在于人体皮肤、 黏膜等组织表面,常在血液、痰液、尿液、深静脉置 管等各种标本中检出。 文献报道,1995-1996年美国48个医学中心2596份 血标本中, CoNS的分离率达32.2%。 尽管血液等无菌体液培养出CoNS临床意义较大, 但据报道单次血培养CoNS污染的可能性仍高达85%。
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2、主要试剂
材料和方法
培养基: 哥伦比亚琼脂培养基、 刚果红琼脂 培养基、 LB肉汤增菌液。 引物: SodA引物 ( 5‘-CCITAYICITAYGAYGCIYTIGARCC-3’ 及 5‘-ARRTARTAIGCRTGYTCCCAIACRTC-3’); icaD引物 (5‘-AGGCAATA TCCAACGGTAA-3’及 5‘-GTCACGACCTTTCTTATATT-3’); 16S rDNA 引物 (5‘-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’及 5‘-CCGTCAATTCCATTTRAG TTT-3’)。
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29
15
结果和讨论
2、ica D基因片段的扩增
a b c d e f g
2000
1000 500 250 (bp) 图2.2 :部分样品的icaD基因片段的 PCR 扩增结果
16
结果和讨论
表2.2: 114例CoNS不同菌种icaD片段PCR扩增的结果
菌 种 表皮葡萄球菌 溶血葡萄球菌 例数 47 43 所占比例 (%) 41.2 37.7 icaD片段 PCR阳性 结果 20 8 PCR实验 各菌种阳性 率(%) 42.6 18.6
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第四部分
结论
ica操纵子可出现在多种CoNS中,临床实验室 建立并常规进行CoNS致病性分子标志物的检 测方法是有意义、有必要的; 通过本实验我们确立了的敏感、准确、快速的 医院感染相关性CoNS基因诊断新方法,即ica D基因扩增方法;
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结论
本研究首次报道了除表皮葡萄球菌以外的其 他种的凝固酶阴性葡萄球菌产生多糖胞间粘 附因子的情况; 表皮葡萄球菌在临床CoNS中检出最多,是携 带icaD操纵子的主要菌种,其致病性应引起 足够重视;
a b c d e
2000
1000 500
100 (bp) 图2.5:部分样品的16S rDNA片段 PCR扩增结果
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结果和讨论
a b c d e
2000 1000 500
250 (bp)
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图2.6: 部分样品的sodA 片段PCR 扩增结果
结果和讨论
图7: 部分样品sodA PCR扩增产物的测序图谱
因此,我们选择了icaD 作为本试验的目的基因片段。
6
研究背景和意义
2、实验目的
获得CoNS特异的致病性分子标志物;
确立敏感、准确、快速的医院感染相关性 CoNS特异基因诊断方法;
能够准确鉴定致病性与非ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ病性CoNS。
7
研究背景和意义
3、临床意义
研究CoNS的生物标志物对该菌在医院获 得性感染中的临床微生物学诊断与鉴定,追 踪传染源,探索其在医院感染中的确切作用 和地位、传播与感染规律,从而对控制传播 途径、建立准确有效的防治措施具有重要实 际意义和经济价值。
刚果红试验 各菌种阳性 率(%)
38.3 6.98
人葡萄球菌
木糖葡萄球菌 沃氏葡萄球菌 头状葡萄球菌 中间葡萄球菌 山羊葡萄球菌 缓慢葡萄球菌 合计
11
3 2 3 1 2 2 114
9.65
2.63 1.75 2.63 0.86 1.75 1.75 100
1
0 0 1 1 0 0 24
9.09
- - 33.3 100 - -
可见以半定量黏附试验结果作为生物膜形成能 力的判定标准,ica 操纵子的存在与CoNS粘附 及其生物膜形成密切相关。 体外黏附性实验用光吸收原理检测生物膜成分, 但生物膜本身的结构会受到破坏;且由于方法 比较复杂,需要严格控制实验条件才能获得较 好的重复性,不适合临床常规应用。
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结果和讨论
4、16S rDNA及sodA基因片段扩增
ATB Expression:法国bioMé rieux Inc;
生物安全柜:BSC-1500Ⅱ B2,济南鑫贝西生物技术有限 公司;
全自动快速微生物培养检测系统:BacT/ALERT 3D 60, 法国bioMé rieux Inc;
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材料和方法
4、实验设计及方法
标本采集 阴、阳性对照
菌种鉴定
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结果和讨论
刚果红试验通过培养48h后菌落的颜色变化来反映 CoNS 表达多糖胞间黏附素的情况,进而间接地反映其 致病性。 114例样品中刚果红试验阳性率21.1%,由于CoNS分泌 的PIA在培养过程中可以丢失,使阳性结果偏低;另外, 其方法学本身易于受多种因素影响,比如:蔗糖的浓 度、氯化钠和琼脂的浓度、气体条件等,干扰了实验 结果的正确性,不能满足临床要求。
其中CoNS产生的多糖胞间黏附素(polysacchatide intercellular adhesion,PIA)是细菌生物膜形成聚集阶 段所必需的物质,在感染过程中起重要的作用,是鉴定 其致病性的物质基础。
Heilmann 等发现 ica 操纵子对合成 PIA 以及在细菌形 成成熟的生物膜中起到非常重要的作用。
3
研究背景和意义
CoNS 作为皮肤黏膜定植菌,在越来越多的标本中被 分离出来,常常引起临床困惑。其是否能作为感染的 病原菌是临床关心的问题。 有鉴于此,实验室建立对CoNS污染菌和致病菌界定 的方法十分必要,是临床明确诊断和制定合理治疗方 案的重要前提 。
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研究背景和意义
CoNS致病物质
在 CoNS 感染的发病过程中,细菌先黏附继而形成难以 清除的生物膜是其最为重要的致病机制 ;
人葡萄球菌
木糖葡萄球菌 沃氏葡萄球菌 头状葡萄球菌 中间葡萄球菌 山羊葡萄球菌
11
3 2 3 1 2
9.65
2.63 1.75 2.6 0.86 1.75
2
0 0 2 1 0
18.2
- - 66.7 100 -
缓慢葡萄球菌
合计
2
114
1.75
100
0
33
-
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结果和讨论
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结果和讨论
3、体外黏附性实验
PIA检测
PCR扩增
icaD基因 sodA基因 16SrDNA序列
DNA测序、 生物信息学分析 生物膜形成实验 比较分析 确定特征片段 临床验证
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1、刚果红试验
第三部分 结果和讨论
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图2.1: 部分样品刚果红试验结果
结果和讨论
表2.1: 114例CoNS的菌种组成及刚果红试验结果
菌 种 表皮葡萄球菌 溶血葡萄球菌 例数 47 43 刚果红试验 所占比例(%) 阳性 41.2 37.7 18 3