第十三章蛋白质的生物合成
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第十三章蛋白质的生物合成
一、教学基本要求
解释翻译的概念。
写出蛋白质生物合成体系的组成,论述mRNA,tRNA和核蛋白的作用原理。
复述蛋白质生物合成过程。
简要写出真核与原核生物蛋白质合成异同及肽链合成后的加工过程。
解释分子病,并举例说明。
简要叙述蛋白质合成阻断剂作用原理。
二、教材内容精要
(一)蛋白质的生物合成:
1.蛋白质的生物合成的概念
在生物体细胞内,以mRNA为模板合成蛋白质多肽链的过程即蛋白质的生物合成。在蛋白质的生物合成过程中,多肽链的氨基酸顺序是模板mRNA中的核苷酸排列顺序决定的,因此这一过程又称翻译(translation)。
2.蛋白质的生物合成体系
除合成原料氨基酸外,蛋白质的生物合成体系还包括mRNA、tRNA核(糖核)蛋白体、有关的酶、蛋白质因子、ATP、GTP等功能物质及必要的无机离子。
(1)mRNA:它是蛋白质多肽链合成的模板。mRNA5′至3′方向,若有AUG开始,可以称为一个开放读码框架(open reading),读码框架内每3个核苷酸组成一个密码子,如AAA 或AAG代表赖氨酸;5′端第一个AUG表示起动信号(initiator codon),并代表甲酰蛋氨酸(细菌)或蛋氨酸(高等动物);UAA,UAG或UGA表示终止信号(terminator codon)。为氨基酸编码的密码子具有如下特点:①简并性(degenerate),即一个以上密码子体现一个氨基酸遗传信息的现象。②连续性(commaless),密码的三联体不间断,须3个一组连续读下去。③通用性(universal)从病毒、植物到人类,所有生物在蛋白质生物合成中都使用一套遗传密码。模板上的密码子可与tRNA的反密码子(anticodon)互补结合。
(2)tRNA及核(糖核)蛋白体:tRNA是氨基酸的运载体。一种tRNA可携带一种氨基酸;而一种氨基酸可由数种tRNA携带。tRNA反密码子与mRNA密码子第三个核苷酸配对时,除A-U,G-C外,还可有U-G,I-C,I-A等不稳定配对(wobble base pair)。核(糖核)蛋白体是多肽链的“装配机”。由大、小亚基组成,亚基又分别由不同的rRNA分子与多种蛋白质分子构成。原核小亚基为30S,真核为40S;原核大亚基为50S,真核为60S。整个原核核(糖核)蛋白体大小为70S,真核为80S。在细胞内,一类核(糖核)蛋白体附着于内质网,参与分泌蛋白质的合成;另一类游离于胞质中。
(3)蛋白质因子:现以原核生物中蛋白质生物合成为例,介绍参与这一过程的蛋白质因子。A1:启动因子(initiation factor)参与起动。
①IF1:促使携带氨基酰的起动tRNA与小亚基结合。
②IF2:功能同上,并有GTP酶活性。
③IF3:促进小亚基与mRNA特异结合;在终止阶段后促使脱落的核蛋白体解离为大、小亚基。
B1:延长因子(elongation factor)。
④EFTu和EFTs延长因子(elongation factor)作用于肽链延长阶段。促进氨基酰-tRNA 进人核蛋白体的“受位”(acceptorsate),具有GTP酶活性。
⑤EFG作用于肽链延长阶段。具有GTP酶活性,使转肽后失去肽链或蛋氨酰-tRNA从“给位”(donor site)上脱落,并促进移动。
C:释放因子。
⑥)RF:识别终止信号,使大亚基转肽酶(transpeptidase)将“给位”上已合成的肽链水解释放。
3.蛋白质多肽链的生物合成过程
蛋白质的翻译过程包括氨基酸的活化与转运,以及核蛋白体循环(ribosome cycle)。核蛋白体循环是本章重点内容。
(1)氨基酸的活化与转运—即参加蛋白质合成的氨基酸在特异的氨基酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase)催化下由ATP供能并与相应得tRNA结合。氨基酰-tRNA合成酶具有绝对的专一性,酶对氨基酸、tRNA两种底物都能高度特异的识别。氨基酰-tRNA合成酶还有校对活性,当tRNA携带了错误的氨基酸时,氨基酰-tRNA合成酶具有水解错误氨基酸酯键的功能,换上与密码子相对应的氨基酸。
(2)核蛋白体循环可分为启动(initiation)、肽链延长(elongation)及终止(termination)3个阶段。
1)启动过程中形成启动复合体,此时需要GTP,真核体系中还需ATP.
具体步骤:mRNA与小亚基结合,并有IF1和IF3辅助,与此同时fmet-RNA辨认结合于mRNA的起始密码子AUG上,此时IF3脱落,而IF2与GTP参与反应;50S的大亚基与小亚基结合,启动因子IF1、IF2脱落。fmet-RNA携带的第一个蛋氨酸位于核蛋白体的给位(donor site)又叫肽位(peptidyl site),它位于核蛋白体的左半部分,给位的右侧称受位(acceptor site),在核蛋白体的右侧。
2)肽链延长阶段,每增加一个氨基酸,就按进位、转肽、脱落和移位这四个步骤重复进行。具体步骤:进位:第二个氨基酸进人受位,此步需要延长因子EFTu和EFTs及GTP、Mg2十参加。转肽:50S大亚基给位有转肽酶的存在,可催化肽键形成。经转肽酶催化,给位上的甲酰蛋氨酸被转移到受位上,与受位的氨基酸的氨基形成肽键,此步需要Mg2十和K+。
脱落:在给位上的RNA fmet脱落。
移位:核蛋白体向mRNA的3′端移动一个密码子,下一个密码子进人受位,同时携有肽链的tRNA由受位移至给位,反应需要延长因子EFG、GTP与tRNA由受位移至给位,反应需要延长因子EFG\GTP与Mg2十
3)终止阶段,需终止因子RF参与,RF使给位的转肽酶变为水解作用,合成好的肽链被水解并从核蛋白体上释放。从mRNA上脱落的核蛋白体,分解为大、小两个亚基,核蛋白体的解缔过程需要启动因子3(IF3)。蛋白质合成是需能反应,每生成一个肽键,共需消耗四个高能磷酸键。
4)真核生物的蛋白质合成与原核大同小异,它的核蛋白体为80S;有启动作用的氨基酰-tRNA不需要甲酰化,而原核生物需要甲酰化;真核生物的延长因子为EFT1和EFT2;其终止因子为RF,它可以识别3种终止密码子,而原核生物的终止因子有3种,即RF1,RF2和RF3。蛋白质合成具有方向性,即由N端向C端延伸。
4.肽链合成后的加工(processing)
某些蛋白质经此过程方能形成有生物学活性的分子。该过程包括:多肽链的切除修饰、C端氨基酸酰胺化修饰、N末端乙酰化修饰,以及加糖、加脂、磷酸化、羟化、甲基化与羟甲基化等。单纯蛋白质是由多条肽链组成,多个亚单位构成的蛋白质需经亚基聚合过程,复合蛋白尚有辅助成分参与组成。
5.蛋白质合成与医学的关系
(1)分子病(molecular diseases)的概念:由于基因缺陷,则可出现RNA与蛋白质合成异常,最终导致机体某些结构与功能变异引起的疾病,称为分子病,例如镰刀状红细胞贫血。这类患者血红蛋白β链N端的第六个氨基酸残基由谷氨酸转变为缬氨酸,这是因结构基因