Gaussian菜鸟常见问题分析
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
Gaussian菜鸟常见问题分析
1.检查是否有初始文件错误
在命令行中加入%kJob L301 or %kJob L302
如果通过则一般初始文件ok。
常见初级错误:
a. 自旋多重度错误
b. 变量赋值为整数
c. 变量没有赋值或多重赋值
d. 键角小于等于0度,大于等于180度
e. 分子描述后面没有空行
f. 二面角判断错误,造成两个原子距离过近
g. 分子描述一行内两次参考同一原子,或参考原子共线
2.SCF(自洽场)不收敛
则一般是L502错误
省却情况做64个cycle迭代(G03缺省128 cycles)
a. 修改坐标,使之合理
b. 改变初始猜 Guess=Huckel 或其他的,看Guess关键词。
c. 增加叠代次数SCFCYC=N (对小分子作计算时最好不要增加,很可能结构不合理)
d. iop(5/13=1)这样忽略不收敛,继续往下做。
3.分子对称性改变
a. 修改坐标,强制高对称性或放松对称性
b. 给出精确的、对称性确定的角度和二面角。如CH4的角度给到109.47122
c. 放松对称性判据 Symm=loose
d. 不做对称性检查iop(2/16=1) (最好加这个选项)
iop(2/16=2) 则保持新的对称性来计算
4.Opt时收敛的问题
a. 修改坐标,使之合理
b. 增加叠代次数optcyc=N
5.优化过渡态,若势能面太平缓,则不好找到。
iop(1/8=10) 默认30(下一个结构和该结构的差别0.3Å),可改成10。如果每一步都要用到小的步长,应该加opt(notrustupdate)
6.在CI(组态)方法中
如QCISD(T),CCSD(T),CID方法中,省却最大循环50,若出错(L913错误)
解决方法:#P QCISD(maxcyc=N) 注:N≤512
7.优化过渡态
opt=TS (给出过渡态)
opt=qst2 (给出反应物和产物)
opt=qst3 (给出反应物和产物和过渡态)
a. 用G03时的出错opt=ts 必须加FC (force constant)
写法:opt=(TS, calcFc)
or opt=(TS,calchffc)计算HF力常数,对QCISD,CCSD等方法用;
or opt=(TS,modRedundant) (最好写这个)
b. 如果计算采用QCISD计算(不好计算FC)
则写为QCISD opt=(TS, calcHFFC) (用HF计算FC)
8. 无法写大的Scratch文件RWF
a. 劈裂RWF文件%rwf=loc1,size1,loc2,size2,……..,locN,-1
b. 改变计算方法MP2=Direct可以少占硬盘空间
c. 限制最大硬盘maxdisk=N GB,****MB,有些系统写2GB会出错,可以写2000MB
9. FOPT出错原因是变量数与分子自由度数不相等。可用POPT 或直接用OPT
10. 优化过渡态只能做一个STEP 原因是负本征数目不对添加iop(1/11)=1或者noeigentest
我是初学者,看到这个图,然后参考高斯用户参考手册,一点自己的解释和看法,请多多指教。上面的图应该是从L301说起的,即图中的“基组”,L301的作用是产生基组信息。
(在这之前还有L1:处理计算执行路径,创建执行链接的列表,并初始化scratch文件;L101:读取标题和分子说明部分;L103:berny优化到最小值;L202:重新定位坐标,计算对称性,检查变量)“基组”之后是“分子结构”即L401,形成初始的分子轨道初猜。
第一个框中有“分子轨道”和“能量”两项,我想这应该指的是L502即迭代求解SCF方程。
下面红线圈的框中则是迭代求解的具体过程。
每次迭代完毕都得到一个能量。
即(SCF Done: E(RHF) = -xx.xxxx A.U. after xx cycles)
然后是L103判断力和位移是否满足收敛条件。如果满足(即四个yes),则进行布居分析等,并完成计算。
如果不满足,则继续调整分子结构(L401),再次进行迭代求解,反复这个过程,直到满足力和位移收敛条件为止。
如果不是HF方法而是多体微扰,CI等后-scf方法的话,在每次迭代(L502)完成后还要多一步相关能的计算,以MP2为例,迭代完成后多出:L801(双电子积分变换的初始化),L906(半直接的MP2)和L1002(迭代求解CPHF方程)等计算。
对于楼主的图,我觉得力和位移判断为NO以后,箭头应该指向最头上的“基组”,因为实际过程中,每次构型调整都会重新定位坐标和产生基组信息。
对于楼上说图看不清楚,可以把图拷下来然后用看图软件放大看。