基于特征干扰排除的蛋白质光谱分析仿真
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中 图 分类 号 : T P 3 5 6 文献标识码 : B
S i mu l a t i o n o n Pr o t e i n S p e c t r u m An a l y s i s Ba s e d o n
t h e C h a r a c t e r i s t i c d i s t u r b a n c e r e j e c t i o n
摘要 : 研究蛋 白质光谱准确检测优化问题。蛋白质 的光谱特征较为复杂 , 质谱特征很容易受到外界 因素的影响 , 造成质谱特 征 的波动 , 传统的基于谱 峰特征 的检测方法一旦受到 干扰 , 会造成质谱特征在多个特 征谱 中都存在 , 影 响光谱 分析的精度 。
为 了避免上述缺陷 , 提 出了一种基于梯度模 型控制 曲线算法 的蛋 白质光谱分析方法 。利 用最 小灰度差值方法 , 提取蛋 白质
t i c, i n t h e e v e n t o f i nt e r f e r e n c e。i t ma y c a u s e t h e p r o b l e m t h a t ma s s s p e c t r u m c ha r a c t e r i s t i c s p r e s e nt i n a pl u r li a t y o f
第3 O 卷 第l 2 期
文章编号 : 1 0 0 6—9 3 4 8 ( 2 0 1 3 ) 1 2—0 2 2 4— 0 4
计wk.baidu.com
算
机
仿
真
2 0 1 3 年1 2 月
基 于 特 征 干 扰 排 除 的 蛋 白质 光 谱 分 析 仿 真
秦 月, 何 鹏, 赵 岩, 惠鹏 飞
( 齐齐哈 尔大学通信学院 , 黑龙江 齐齐哈尔 1 6 1 0 0 6 )
ABS TRACT : I n t h i s p a p e r ,o p t i mi z a t i o n p r o b l e m o f a c c u r a t e d e t e c t i o n o f t h e p r o t e i n s p e c t r u m w a s s t u d i e d .T h e s p e c t r a l c h a r a c t e r i s t i c s o f t h e p r o t e i n i s mo r e c o mp l e x a n d ma s s s p e c t r a c h a r a c t e is r t i c s i s v u l n e r a b l e t o e x t e r n a l f a c — t o r s ,r e s u l t i n g i n l f u c t u a t i o n s i n ma s s c h a r a c t e r i s t i c s .B a s e d o n t h e t r a d i t i o n a l me t h o d o f d e t e c t i n g p e a k s e h a r a e t e r i s —
s p e c t u ms r .T h e a c c u r a c y o f s p e c t r a l a n a l y s i s wi l l b e i mp a c t e d .T o a v o i d t h e s e s h o r t c o mi n g s ,w e p r o p o s e d a n e w p r o — t e i n s p e c t r a l a n ly a s i s me t h o d b a s e d o n t h e g r a d i e n t mo d e l c o n t r o l c u r v e a l g o i r t h m.U s i n g mi n i mu m g r a y l e v e l me t h o d, t h e c h a r a c t e r i s t i c o f t h e p r o t e i n s p e c t r u m w a s e x t r a c t e d,S O a s t o p r o v i d e a n a c c u r a t e s p e c t r a l d a t a b a s e .An d t h e n U —
Q I N Y u e , H E P e n g , Z H A O y a n , HU I P e n g— f e i
( C o m mu n i c a t i o n I n s t i t u t e , Q i q i h a r U n i v e r s i t y , Q i q i h a r H e l f o n g j i a n g 1 6 1 0 0 6 , C h i n a )
光谱 中的特征 , 从而为光谱分析提供准确的数据基础 。利用梯度模型控制曲线方法 , 对蛋 白质光谱进行分割处理 , 从而实现 蛋 白质光谱分析。实验结果表 明, 采用改进算法能够有效提高蛋 白质光谱分析 的准确性 , 可为蛋 白质检测领域 带来了极大
的经 济 效 益 。
关键词 : 蛋 白质光谱 ; 灰度 差值 ; 图像分割
S i mu l a t i o n o n Pr o t e i n S p e c t r u m An a l y s i s Ba s e d o n
t h e C h a r a c t e r i s t i c d i s t u r b a n c e r e j e c t i o n
摘要 : 研究蛋 白质光谱准确检测优化问题。蛋白质 的光谱特征较为复杂 , 质谱特征很容易受到外界 因素的影响 , 造成质谱特 征 的波动 , 传统的基于谱 峰特征 的检测方法一旦受到 干扰 , 会造成质谱特征在多个特 征谱 中都存在 , 影 响光谱 分析的精度 。
为 了避免上述缺陷 , 提 出了一种基于梯度模 型控制 曲线算法 的蛋 白质光谱分析方法 。利 用最 小灰度差值方法 , 提取蛋 白质
t i c, i n t h e e v e n t o f i nt e r f e r e n c e。i t ma y c a u s e t h e p r o b l e m t h a t ma s s s p e c t r u m c ha r a c t e r i s t i c s p r e s e nt i n a pl u r li a t y o f
第3 O 卷 第l 2 期
文章编号 : 1 0 0 6—9 3 4 8 ( 2 0 1 3 ) 1 2—0 2 2 4— 0 4
计wk.baidu.com
算
机
仿
真
2 0 1 3 年1 2 月
基 于 特 征 干 扰 排 除 的 蛋 白质 光 谱 分 析 仿 真
秦 月, 何 鹏, 赵 岩, 惠鹏 飞
( 齐齐哈 尔大学通信学院 , 黑龙江 齐齐哈尔 1 6 1 0 0 6 )
ABS TRACT : I n t h i s p a p e r ,o p t i mi z a t i o n p r o b l e m o f a c c u r a t e d e t e c t i o n o f t h e p r o t e i n s p e c t r u m w a s s t u d i e d .T h e s p e c t r a l c h a r a c t e r i s t i c s o f t h e p r o t e i n i s mo r e c o mp l e x a n d ma s s s p e c t r a c h a r a c t e is r t i c s i s v u l n e r a b l e t o e x t e r n a l f a c — t o r s ,r e s u l t i n g i n l f u c t u a t i o n s i n ma s s c h a r a c t e r i s t i c s .B a s e d o n t h e t r a d i t i o n a l me t h o d o f d e t e c t i n g p e a k s e h a r a e t e r i s —
s p e c t u ms r .T h e a c c u r a c y o f s p e c t r a l a n a l y s i s wi l l b e i mp a c t e d .T o a v o i d t h e s e s h o r t c o mi n g s ,w e p r o p o s e d a n e w p r o — t e i n s p e c t r a l a n ly a s i s me t h o d b a s e d o n t h e g r a d i e n t mo d e l c o n t r o l c u r v e a l g o i r t h m.U s i n g mi n i mu m g r a y l e v e l me t h o d, t h e c h a r a c t e r i s t i c o f t h e p r o t e i n s p e c t r u m w a s e x t r a c t e d,S O a s t o p r o v i d e a n a c c u r a t e s p e c t r a l d a t a b a s e .An d t h e n U —
Q I N Y u e , H E P e n g , Z H A O y a n , HU I P e n g— f e i
( C o m mu n i c a t i o n I n s t i t u t e , Q i q i h a r U n i v e r s i t y , Q i q i h a r H e l f o n g j i a n g 1 6 1 0 0 6 , C h i n a )
光谱 中的特征 , 从而为光谱分析提供准确的数据基础 。利用梯度模型控制曲线方法 , 对蛋 白质光谱进行分割处理 , 从而实现 蛋 白质光谱分析。实验结果表 明, 采用改进算法能够有效提高蛋 白质光谱分析 的准确性 , 可为蛋 白质检测领域 带来了极大
的经 济 效 益 。
关键词 : 蛋 白质光谱 ; 灰度 差值 ; 图像分割