生物化学酶PPT
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生物化学之酶ppt课件
非竞争性抑制剂
与酶活性中心以外的部位结合,改变酶的空间构象,使酶活性降低或 丧失,如磺胺类药物对二氢叶酸合成酶的抑制。
酶抑制剂的应用
医学领域
用于治疗疾病,如酶抑制剂作为抗病毒药 物、抗肿瘤药物和抗菌药物等。
生物工程领域
用于改造和优化生物催化剂的性能,提高 生物催化过程的效率和选择性。
农业领域
用于研发新型农药和除草剂,提高农作物 产量和品质。
来调节细胞内酶的含量。
酶抑制剂的分类与作用
不可逆抑制剂
与酶共价结合,使酶永久失活,如有机磷农药对乙酰胆碱酯酶的抑制 。
可逆抑制剂
与酶非共价结合,可通过物理或化学方法去除抑制剂而恢复酶活性, 包括竞争性抑制剂、非竞争性抑制剂和反竞争性抑制剂。
竞争性抑制剂
与底物竞争酶的活性中心,降低酶对底物的亲和力,如丙二酸对琥珀 酸脱氢酶的抑制。
环境领域
用于治理环境污染,如利用酶抑制剂降解 有毒有害物质。
04
酶在生物体内的代谢
酶与生物氧化
酶催化生物氧化反应
生物氧化是在生物体内进行的氧化反 应,酶作为生物催化剂能够加速这些 反应的进行。
酶与抗氧化系统
生物体内存在抗氧化系统以抵抗氧化 应激,酶如超氧化物歧化酶(SOD) 等在此系统中发挥重要作用。
酶的结构与功能
结构
酶分子通常具有复杂的四级结构,包括一级结构(氨基酸序列)、二级结构( α-螺旋、β-折叠等)、三级结构(整体折叠形态)和四级结构(亚基组成)。
功能
酶通过降低化学反应的活化能来加速反应速率,具有高效性、专一性和可调节 性等特点。此外,酶还能参与信号传导、物质运输和能量转换等生物过程。
酶抑制剂筛选方法
基于活性的筛选
与酶活性中心以外的部位结合,改变酶的空间构象,使酶活性降低或 丧失,如磺胺类药物对二氢叶酸合成酶的抑制。
酶抑制剂的应用
医学领域
用于治疗疾病,如酶抑制剂作为抗病毒药 物、抗肿瘤药物和抗菌药物等。
生物工程领域
用于改造和优化生物催化剂的性能,提高 生物催化过程的效率和选择性。
农业领域
用于研发新型农药和除草剂,提高农作物 产量和品质。
来调节细胞内酶的含量。
酶抑制剂的分类与作用
不可逆抑制剂
与酶共价结合,使酶永久失活,如有机磷农药对乙酰胆碱酯酶的抑制 。
可逆抑制剂
与酶非共价结合,可通过物理或化学方法去除抑制剂而恢复酶活性, 包括竞争性抑制剂、非竞争性抑制剂和反竞争性抑制剂。
竞争性抑制剂
与底物竞争酶的活性中心,降低酶对底物的亲和力,如丙二酸对琥珀 酸脱氢酶的抑制。
环境领域
用于治理环境污染,如利用酶抑制剂降解 有毒有害物质。
04
酶在生物体内的代谢
酶与生物氧化
酶催化生物氧化反应
生物氧化是在生物体内进行的氧化反 应,酶作为生物催化剂能够加速这些 反应的进行。
酶与抗氧化系统
生物体内存在抗氧化系统以抵抗氧化 应激,酶如超氧化物歧化酶(SOD) 等在此系统中发挥重要作用。
酶的结构与功能
结构
酶分子通常具有复杂的四级结构,包括一级结构(氨基酸序列)、二级结构( α-螺旋、β-折叠等)、三级结构(整体折叠形态)和四级结构(亚基组成)。
功能
酶通过降低化学反应的活化能来加速反应速率,具有高效性、专一性和可调节 性等特点。此外,酶还能参与信号传导、物质运输和能量转换等生物过程。
酶抑制剂筛选方法
基于活性的筛选
生物化学 第三章 酶(共65张PPT)
概念: 抑制剂和底物的结构相似,能与底物竞争酶的活性中心,从而阻碍酶底物复合物的形成,使酶的活性降低。
含多条肽链则为寡聚酶,如RNA聚合酶,由4种亚基构成五聚体。
(cofactor)
别构酶(allosteric enzyme):能发生别构效应的酶
9 D-葡萄糖6-磷酸酮醇异构酶 磷酸葡萄糖异构酶
esterase)活性中心丝氨酸残基上的羟基结合,使酶失活。
酶蛋白
酶的磷酸化与脱磷酸化
五、酶原激活
概念
酶原(zymogen):细胞合成酶蛋白时或者初分 泌时,不具有酶活性的形式
酶原 切除片段 酶
(–)
(+)
酶原激活
本质:一级结构的改变导致构象改变,激活。
胰蛋白酶原的激活过程
六、同工酶
同工酶(isoenzyme)是指催化相同的化学反应, 而酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质 不同的一组酶。
正协同效应(positive cooperativity) 后续亚基的构象改变增加其对别构效应剂
的亲和力,使效应剂与酶的结合越来越容易。
负协同效应(negative cooperativity) 后续亚基的构象改变降低酶对别构效应剂
的亲和力,使效应剂与酶的结合越来越难。
协同效应
正协同效应的底物浓度-反应速率曲线为S形曲线
/ 即: Vmax = k3 [Et]
Km 和 Vmax 的测定
双倒数作图法 Lineweaver-Burk作图
将米氏方程式两侧取倒数
1/v = Km/Vmax[S] + 1/Vmax = Km/Vmax •1/ [S] + 1/Vmax 以 1/v 对 1/[S] 作图, 得直线图
斜率为 Km/Vmax
含多条肽链则为寡聚酶,如RNA聚合酶,由4种亚基构成五聚体。
(cofactor)
别构酶(allosteric enzyme):能发生别构效应的酶
9 D-葡萄糖6-磷酸酮醇异构酶 磷酸葡萄糖异构酶
esterase)活性中心丝氨酸残基上的羟基结合,使酶失活。
酶蛋白
酶的磷酸化与脱磷酸化
五、酶原激活
概念
酶原(zymogen):细胞合成酶蛋白时或者初分 泌时,不具有酶活性的形式
酶原 切除片段 酶
(–)
(+)
酶原激活
本质:一级结构的改变导致构象改变,激活。
胰蛋白酶原的激活过程
六、同工酶
同工酶(isoenzyme)是指催化相同的化学反应, 而酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质 不同的一组酶。
正协同效应(positive cooperativity) 后续亚基的构象改变增加其对别构效应剂
的亲和力,使效应剂与酶的结合越来越容易。
负协同效应(negative cooperativity) 后续亚基的构象改变降低酶对别构效应剂
的亲和力,使效应剂与酶的结合越来越难。
协同效应
正协同效应的底物浓度-反应速率曲线为S形曲线
/ 即: Vmax = k3 [Et]
Km 和 Vmax 的测定
双倒数作图法 Lineweaver-Burk作图
将米氏方程式两侧取倒数
1/v = Km/Vmax[S] + 1/Vmax = Km/Vmax •1/ [S] + 1/Vmax 以 1/v 对 1/[S] 作图, 得直线图
斜率为 Km/Vmax
生物化学PPT课件 酶
2、非竞争性抑制
3、反竞争性抑制
七、酶活性测定:
难以测定,常用的衡量方式:
酶在最适条件下,单位时间内,单位体积中底 物的减少量或产物的生成量。
酶的活性单位: 国际单位(IU):每分钟转化1μmol底物所需的酶 量为一个国际单位(1IU),即1μmol/min
Kat单位:每秒钟转化1mol底物所需的酶量 1 Kat=1mol/sec 1 IU=16.67×10-9Kat
(2)酶的储存形式
(二) 别构调节
催化部位(活 性中心)
EE
(激活或抑制) 酶活性改变
酶结构改变
调节部位
别构效应剂
(三)酶促化学修饰调节
类型:
(1)磷酸化与脱磷酸(最常见) (2)乙酰化与脱乙酰 (3)甲基化与去甲基 (4)腺苷化与脱腺苷 (5)SH与-S-S互变
2ATP
2ADP
磷酸化酶b激酶
P
磷酸化酶 b(二聚体)
无活性
磷酸化酶a磷酸酶
P
磷酸化酶 a(二聚体)
高活性
2Pi
2H2O
磷酸化酶的活性调节
cAMP信号与糖原降解
二、酶蛋白含量的调节
1. 酶蛋白合成的诱导与阻遏 (1)诱导剂、诱导作用 (2)阻遏剂、阻遏作用
2. 酶蛋白的降解 (1)溶酶体蛋白酶降解途径 (2)泛素参与的降解途径
六、抑制剂(inhibitor, I)
——使酶活性下降但又不使酶蛋白变性的物质 与酶的必须基团结合,抑制酶的催化活性。去除 后,酶表现原有活性。
(一)不可逆抑制作用
• 概念:抑制剂与酶活性中心必需基团共价 结合,不能用透析、超滤等物理方法将其 除去恢复酶活性。
• 常见抑制剂:
巯基酶抑制剂(如某些重金属离子、路易士气等) ——解毒:二巯基丙醇
酶(生物化学)PPT课件
详细描述
酶的活性中心是酶分子中具有特定空间结构的区域,能够与底物特异结合,并 通过催化反应将其转化为产物。活性中心的氨基酸残基通常是高度保守的,对 酶的催化活性至关重要。
酶的专一性
总结词
酶的专一性是指一种酶只能催化一种或一类化学反应的性质 。
详细描述
酶的专一性是酶的重要特性之一,它决定了酶在生物体内的 功能。一种酶通常只能催化一种或一类化学反应,这是因为 酶的活性中心具有特定的空间结构和化学环境,只能够与特 定的底物结合并催化相应的反应。
食品保鲜
酶可用于食品保鲜,如抑制果蔬 中酶的活性,延缓成熟和腐烂过 程;也可用于食品中农药残留的
降解。
功能性食品开发
酶可用于开发功能性食品,如通 过酶促反应生产低糖、低脂或高
纤维食品。
酶在环保领域的应用
有毒有害物质降解
酶可用于降解有毒有害物质,如重金属离子、有机溶剂和农药等, 降低其对环境和生物体的危害。
的诊断。
药物生产
酶可用于药物的生产和制造过程中, 如抗生素、激素和蛋白质药物等, 通过酶促反应提高生产效率和纯度。
生物治疗
酶在某些生物治疗过程中起到关键 作用,如基因疗法和细胞疗法中, 酶可促进特定基因的表达或改变细 胞代谢。
酶在食品工业中的应用
食品加工
酶在食品加工过程中起到重要作 用,如淀粉的改性、蛋白质的水 解和油脂的加工等,可改善食品 的口感、营养价值和加工性能。
计算机辅助设计
计算机辅助设计是一种利用计算 机模拟技术来预测和优化酶性能
的方法。
通过计算机模拟,可以预测酶的 催化机制、反应路径和动力学行
为,从而指导酶的优化设计。
计算机辅助设计与其他技术结合, 如量子化学计算和分子动力学模 拟,可进一步提高酶优化效率。
酶的活性中心是酶分子中具有特定空间结构的区域,能够与底物特异结合,并 通过催化反应将其转化为产物。活性中心的氨基酸残基通常是高度保守的,对 酶的催化活性至关重要。
酶的专一性
总结词
酶的专一性是指一种酶只能催化一种或一类化学反应的性质 。
详细描述
酶的专一性是酶的重要特性之一,它决定了酶在生物体内的 功能。一种酶通常只能催化一种或一类化学反应,这是因为 酶的活性中心具有特定的空间结构和化学环境,只能够与特 定的底物结合并催化相应的反应。
食品保鲜
酶可用于食品保鲜,如抑制果蔬 中酶的活性,延缓成熟和腐烂过 程;也可用于食品中农药残留的
降解。
功能性食品开发
酶可用于开发功能性食品,如通 过酶促反应生产低糖、低脂或高
纤维食品。
酶在环保领域的应用
有毒有害物质降解
酶可用于降解有毒有害物质,如重金属离子、有机溶剂和农药等, 降低其对环境和生物体的危害。
的诊断。
药物生产
酶可用于药物的生产和制造过程中, 如抗生素、激素和蛋白质药物等, 通过酶促反应提高生产效率和纯度。
生物治疗
酶在某些生物治疗过程中起到关键 作用,如基因疗法和细胞疗法中, 酶可促进特定基因的表达或改变细 胞代谢。
酶在食品工业中的应用
食品加工
酶在食品加工过程中起到重要作 用,如淀粉的改性、蛋白质的水 解和油脂的加工等,可改善食品 的口感、营养价值和加工性能。
计算机辅助设计
计算机辅助设计是一种利用计算 机模拟技术来预测和优化酶性能
的方法。
通过计算机模拟,可以预测酶的 催化机制、反应路径和动力学行
为,从而指导酶的优化设计。
计算机辅助设计与其他技术结合, 如量子化学计算和分子动力学模 拟,可进一步提高酶优化效率。
生物化学第二章酶ppt课件
叶酸和叶酸辅酶 ⑦ 酶原转变成酶的过程称为酶原的激活。
酶全催酶化 (ho作lo用en的zy中m维间e)产生=(酶络蛋素合白)B+物辅1学1因说又子 称叶酸,作为辅酶的是叶酸加氢的还原产 物四氢叶酸。 (3)抗体酶(abzyme):
(3)酶原和酶原的激活
根据其催化底物来命名;
H 维生素B6包括吡哆醇、吡哆醛和吡哆胺。
多数维生素维生素作为辅酶和辅基的组成成分,参与体内 的物质代谢。
维生素一般习惯分为脂溶性和水溶性两大类。其中脂溶性 维生素在体内可直接参与代谢的调节作用,而水溶性维生 素是通过转变成辅酶对代谢起调节作用。
某些小分子有机化合物与酶蛋白结合在一起并协同实施催 化作用,这类分子被称为辅酶(或辅基)。
(2)传递氢(递氢体):如 硫辛酸;
FMN/FAD、NAD/NADP、C0Q、
(3)传递酰基体:如 C0A、TPP、硫辛酸; (4)传递一碳基团:如 四氢叶酸;
(5)传递磷酸基:如 ATP,GTP;
(6)其它作用: 转氨基,如 VB6 ;传递CO2,如 生物素。
维生素和辅酶
维生素是机体维持正常生命活动所必不可少的一类小分子 有机物质。
OH OH
OHOHOH O
CH2CHCHCHCH2OPOCH2 O
N
N
NN
OH
CH3
CO
N
N
CH3
NH
NC
NH2
O
FMN
FAD
③ 泛酸和辅酶A(CoA)
维生素B3又称泛酸,是由,-二羟基---二甲 基丁酸和一分子-丙氨酸缩合而成。
CH3OH O
O
CH2 C CH C NH CH2 CH2 C COOH
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HH MM
LDH3 (H2M2)
HM MM
LDH4 (HM3)
MM MM
LDH5 (M4)
乳酸脱氢酶的5种同工酶(LDH1~ LDH5)
人体心、肝和骨骼肌LDH同工酶谱
组织器官 LDH1 LDH2 LDH3
LDH4 LDH5
( 占总 LDH活性的百分比)
心 35~70 28~45 2~16
0~6
0~5
按照与酶蛋白的结合程度,辅助因子又可分为: ① 辅酶(Coenzyme):
✓ 与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤方法除去。
② 辅基(Prosthetic g二、酶的活性中心
酶的活性中心(active center)
必需基团:指酶分子中氨基酸残基侧链上的一些与酶 催化活性密切相关的化学基团。
肝
0~8
2~10 3~33
6~27 30~8
骨骼肌 1~10 4~18 8~38
9~36 40~97
正常血清 27.1±2.8 34.7 ± 4.3 20.9 ± 2.4 11.7 ± 3.3 57 ± 2.9
临床意义
酶 活 性
心肌梗死酶谱
正常酶谱 肝病酶谱
12 3 4 5
心肌梗死和肝病病人血清LDH同工酶谱的变化
NAD+(NADP+)的递氢机制
NAD+或NADP+ (氧化型)
NADH或NADPH (还原型)
(3)泛酸(遍多酸) 辅酶A(CoA),是酰基转移酶的辅酶
巯基乙胺
泛酸
3’-P-ADP
第三节 酶促反应速度的特点与机制
一、酶促反应的特点
一、酶催化作用的特点
(一)与一般催化剂的共性
1. 在催化反应的过程中自身的质和量保持不变; 2. 只能催化热力学上允许的反应; 3. 只能缩短达到化学平衡的时间,但不改变反应的平
✓ 在转录水平上促进酶生物合成的作用称为诱导作 用;在转录水平上减少酶生物合成的作用称为阻 遏作用。
2. 酶蛋白的降解 ✓ 酶蛋白的降解与一般蛋白质的降解途径相同,主 要包括溶酶体蛋白酶降解途径(不依赖ATP的降 解途径)和非溶酶体蛋白酶降解途径(依赖ATP 和泛素的降解途径)。
六、维生素与辅酶
维生素与辅助因子
五、变构酶
酶的变构调节(Allosteric regulation)
概念: ✓小分子物质与酶蛋白的活性中心以外的某一 部位特异地结合,引起酶蛋白分子构象变化, 进而改变酶的活性,此现象称为变构效应或 变构作用。 ✓受变构调节的酶即称作变构酶或别构酶。 ✓导致变构效应的小分子物质称为变构效应剂。 ✓变构效应剂结合的位点称为变构位点。 ✓酶的活性中心所在的位点称为催化位点。
实例: ✓乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase, LDH)
乳酸脱氢酶(LDH)
✓LDH是最先发现的同工酶,为四聚体酶。其亚 基有两型:骨骼肌型(M 型)和心肌型(H 型),这两型亚基以不同的比例组成五种同工 酶LDH1~LDH5。
HH HH
LDH1 (H4)
HH HM
LDH2 (H3M)
全酶 holoenzyme
从化学本质上来讲,辅助因子可分为两类:
① 金属离子:是最常见的辅助因子,约2/3的酶 含有金属离子。
✓ 金属酶:金属离子和酶结合紧密。如羧基肽酶。 ✓ 金属激活酶:金属离子与酶的结合不甚紧密。
如己糖激酶等。
② 小分子有机化合物:通常为维生素或其体内 代谢转变生成的衍生物,见后。
概念:酶是具有催化功能的生物分子。 ✓约4000余种,催化生物体内的众多化学反应, 并受到精确调节,保证体内代谢的高效有序 进行。
SE P
* 酶促反应: 由酶催化的反应 * 底物(substrate):酶所催化的物质 * 产物(product):酶所催化的底物的转变物
酶的化学本质: ✓几乎所有酶均为蛋白质,部分为核酸。
许多研究者开始鉴定酶的生物化学特性,发现与蛋白 质有关;但一些人认为酶不是蛋白质,辩称蛋白质只 是酶分子的携带者,蛋白质本身并不具有催化活性。
1926年,James B. Sumner发现脲酶是一个纯的蛋白质; 并于1937年再次发现过氧化氢酶也是蛋白质。约翰.诺 斯罗普和温德尔.斯坦利则确认胃蛋白酶、胰蛋白酶和 胰凝乳蛋白酶是蛋白质。
酶与一般催化剂催化效率的比较
底物
催化剂 反应温度 反应速度常数
尿素
H+
62
7.4 10-7
脲酶
21
5.0 106
过氧化氢
Fe 2+
22
56
过氧化氢酶 22
3.5 107
与不加催化剂相比提高108~1020,与普通催化剂相比提高107~1013
✓ 酶催化高效率的原因:酶比一般催化剂能更有效地降 低反应活化能,促进底物形成过渡态而加快反应速度。 • 活化能:分子从初态转变为激活态所需的能量。
✓ 酶:【五音集韻】酒母也。
1700s,观察到:胃液对肉的消化;植物提取物和唾液 使淀粉转变为糖。
1878年,Wilhelm首次提出酶(enzyme)的概念。
1897年,爱德华意外发现并证明发酵过程并不需要 完整的活细胞存在。这一贡献彻底推翻“活力论” 观点。也打开了通向现代酶学与现代生物化学的大 门,1907年的诺贝尔化学奖。
衡点即平衡常数; 4. 加速反应的机制都是降低反应的活化能。
SE P
(二)酶与一般催化剂的区别—即酶的特性
1. 高效性 2. 专一性(高度特异性) 3. 可调节性 4. 不稳定性
1. 酶具有极高的催化效率(高效性)
✓ 酶的催化效率比非催化反应高约108~1020倍,比一 般催化剂高约107~1013倍。
OH OH
HH
黄素单核苷酸(FMN)
H
H
Flavin mononucleotide
OH OH
黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)
Flavin adenine dinucleotide
FMN和FAD递氢机制
O
H3C
5
N
10
4 NH
891
+ 2H
H3C
N NO
R
FMN/FAD
(氧化型)
O
H
H3C
5
N
10
4 NH
① B族维生素主要参与形成酶的辅助因子,具体见下表。
维生素与常见的辅酶/辅基
(1)VitB2(核黄素) FMN和FAD,是黄素酶的辅基(传递氢)。
异咯嗪 O
H 3C
N
5 10
4 NH
8
9
1
H 3C
N NO
HCH
NH2 腺嘌呤
核 H C OH 醇 H C OH
N
N
H C OH O
O
N
N
CH2 O P O P O CH2 O
H2O
Thr Ser -O-PO32Tyr
磷酸化的 酶蛋白
四、同工酶
同工酶(isoenzyme)
定义: ✓指催化相同的化学反应,但酶蛋白的分子结构、理 化性质、免疫学性质及组织学分布等不同的一组酶。
部位: ✓同工酶往往存在于同一种属或同一个体的不同组织 或同一细胞的不同亚细胞结构中。
临床意义: ✓用于临床诊断。
1989年度 诺贝尔化学奖
Thomas R. Cech Sidney Altman
1902年,维克多.亨利提出了酶动力学的定量理论, 但没有得到有力的实验证实。
1913年,雷奥诺.米歇里斯和其博士后莫得证实了 Henri的理论并扩展为米氏方程。随后,布里格斯和 霍尔丹又对其进行了扩展。
二、酶的概念及化学本质
一级结构
胰凝乳蛋白酶的活性中心 Chymotrypsin Active center
空间结构
活性中心
酶分子中的化学基团:
结合基团:结合底物
活性中心内
必需
催化基团:催化底物转变成产物
基团
所有
活性中心外的必需基团:维持酶空间构象等
基团
其它
三、酶原与酶原的激活
酶原及其激活
酶原(zymogen): ✓在细胞内合成和初分泌的无活性的酶的前体。
核酶(ribozyme):具有催化功能的RNA。
第二节 酶的分子结构与功能
重点:活性中心、必需基团、辅酶/辅基等 概念;维生素→辅酶/辅基→作用
一、酶的分子组成
一、酶的不同存在形式
• 单体酶:由一条多肽链组成。 • 寡聚酶:含两条或以上多肽链,即多个相
同或不同亚基以非共价键连接形成的酶。 • 多酶体系:由几种不同功能的酶彼此聚合
随后发现的2千余种酶均证明是蛋白质。
1946年度 诺贝尔化学奖
1980s,托马斯.切赫和西德尼. 奥尔特曼分别在四膜虫 的RNA前体加工和细菌核糖核酸酶P复合物研究中发 现:RNA具有催化作用,并提出了核酶的概念。
1994年,杰拉尔德.乔伊斯等发现了具有催化活性的 DNA(为人工合成),称为脱氧核酶。
变构酶的特点:
✓①变构酶通常是调节代谢的关键酶,在细胞内控制 着代谢通路的闸门,催化的反应常是不可逆反应。
✓②其动力学特征不符合米氏方程,V与[S]关系为S形 曲线(米氏方程为矩形双曲线)。
0.11
别构酶与米氏酶的动力学曲线比较
二、酶含量的调节
1. 酶蛋白合成的诱导与阻遏 ✓ 是对编码酶蛋白的基因的表达进行调节。
酶促反应活化能的改变
2. 高度专一性:即酶对底物的高度选择性或特异性。
✓ 即一种酶仅作用于一种或一类化合物,或一定的 化学键,催化一定的化学反应,生成一定的产物。
✓ 常见类型: • 绝对专一性、相对专一性 • 立体异构体专一性 • 光学异构体专一性