蛋白质折叠

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肽链中的某一区域可以形成“折叠晶核”, 以它们为核心,整个肽链继续折叠进而获得 天然构象。
所谓“晶核”实际上是由一些特殊的氨基酸 残基形成的类似于天然态相互作用的网络结 构,这些残基间不是以非特异的疏水作用维 系的,而是由特异的相互作用使这些残基形 成了紧密堆积。晶核的形成是折叠起始阶段 限速步骤。
蛋白质折叠的问题
蛋白质折叠:热力学和动力学问题 在生理条件下多肽链折叠是热力学上有利
的过程 多肽链折叠是一个动力学的问题 一个在热力学上可以成立的反应由于动力
学能障在实际上未必可以完成。 蛋白质在体外折叠和在细胞内折叠的问题 理论研究和实验研究的问题
蛋白质折叠的原理
Anfinsen学说:自组装(self-assembly)
级结构单元,称为“flickering cluster” 随后二级结构靠近, 形成稳定的二级结构框架 最后二级结构框架相互拼接,渐紧缩,形成三
级结构。 这个模型认为即使是一个小分子的蛋白也可以
一部分一部分的进行折叠, 其间形成的亚结构 域是折叠中间体的重要结构。
疏水塌缩模型
(Hydrophobic Collapse Model)
蛋白质折叠
Protein folding
21世纪的生物学的重要课题
蛋白质合成的基本步骤
蛋白质折叠前后
蛋白质折叠定义
蛋白质折叠:狭义是蛋白质特定三维空间结构 形成的规律、稳定性和与其生物活性的关系。 蛋白质折叠是物理过程。多肽折叠成特定功能 的三维结构, “分子伴侣”的发现和鉴定改变了蛋白质折叠 研究的经典概念
Collision-Adhesion Model) 成核-凝聚-生长模型(Nuclear-
Condensation-Growth Model) 拼版模型(Jig-Saw Puzzle Model)
框架模型(Framework Model)
假设蛋白质局部构象依赖于局部的氨基酸序列 在多折叠的起始阶段, 先迅速形成不稳定的二
在疏水塌缩模型 中,疏水作用力被认为是 在蛋白质折叠过程中起决定性作用的力的 因素。
在形成任何二级结构和三级结构之前首先 发生很快的非特异性的疏水塌缩。
扩散-碰撞-粘合机制
Diffusion-Collision-Adhesion Model)
蛋白质的折叠起始于伸展肽链上的几个位点,在这些位 点上生成不稳定的二级结构单元或疏水簇,主要依靠局 部序列(3-4个残基)相互作用来维系。
拼版模型 (Jig-Saw Puzzle Model)
中心思想是多肽链可以沿多条不同的途径进行 折叠, 在沿每条途径折叠的过程中都是天然结 构越来越多, 最终形成天然构象
每条途径的折叠速度都较快, 与单一途径折叠 方式相比, 多肽链速度较快, 另一方面, 外界 生理生化环境的微小变化或突变等因素可能会 给单一折叠途径造成较大的影响 这些变化可能 给某条折叠途径带来影响, 但不影响另外的折 叠途径, 因而不会从总体上干扰多肽链的折叠
细胞内的蛋白质折叠
体内折叠过程往往与翻译共启始,因此,N-末 端蛋白开始折叠,而C-末端部分仍在合成。 氨基酸序列与折叠密切相关 化学修饰往往与肽链的折叠密切相关 折叠是有序的、由疏水力推动的协同过程。 最近的理论提出了蛋白质折叠氢键的贡献 伴侣分子在折叠中起着辅助性的作用 折叠在越膜转运过程中:解开折叠后才能越膜。
疏水簇以非特异性布朗运动方式扩散、碰撞、相互黏附, 导致大的结构生成并增加稳定性。
进一步碰撞形成具有疏水核心和二级结构的类熔球态中 间体。
球形中间体调整为致密的、无活性的类似天然结构的高 度有序熔球态结构。
最后无活性高度有序熔球态转变为完整有活力的天然态。
成核-凝聚-生长模型
(Nuclear-Condensation-Growth Model)
蛋白质折叠的途径
蛋白质折叠的途径
独立折叠 热休克蛋白70辅助蛋白质折叠 HSP70和伴侣协助配合下折叠
蛋白质折叠的理论模型
框架模型(Framework Model) 疏水塌缩模型(Hydrophobic Collapse
Model) 扩散-碰撞-粘合机制 (Diffusion-
目前为止,对蛋白质折叠机制的认识仍是不完整的, 甚至有些方面还存在着错误的观点。
蛋白质折叠与生物信息流
在生物体内,生物信息流动可分为两个部分: 第一部分是存储于DNA序列中的遗传信息通过
转录和翻译传入蛋白质的一级序列中,这是一 维信息之间的传递,三联子密码介导了这一传 递过程 第二部分是肽链经过疏水塌缩、空间盘曲、侧 链聚集等折叠过程形成蛋白质的天然构象,同 时获得生物活性,从而将生命信息表达出来 蛋白质折叠是一维信息向三维信息的转化过程
Anfinsen's dogma
按照自组装学说,一级结构决定空间结构的密 码叫作“第二遗传密码”。
按照自组装学说,每个蛋白多肽翻译从基因序 列开始生成线性的氨基酸链,这种多肽没有三 维结构。然而链中氨基酸具有总的化学特征: 疏水的,亲水性,或带电,可被认为蛋白质折 叠机制
按照自组装学说,每一步折叠都是正确的,充 分的,必要的。实际上折叠过程是一个正确和 错误途径相互竞争过程。边合成边折叠同时进 行的协调的动态过程。
Ellis1987年提出了蛋白质“辅助性组装学说”。体内蛋 白质折叠往往需要其他辅助因子参与,并伴有ATP的 水解。因此,蛋白质折叠Fra Baidu bibliotek一个热力学过程,也受动 力学控制。
有的学者基于有些相似氨基酸序列的蛋白质具有不同 的折叠结构,而一些不同氨基酸序列的蛋白质在结构 上却相似的现象,提出了mRNA二级结构可能作为一 种遗传密码从而影响蛋白质结构的假说。
蛋白质折叠的发现
1961年Anfinsen表现核糖核酸酶 可变性后重折 叠,同时保持酶活性,从而表明蛋白折叠所有要 求的信息在其一级结构内。
在折叠时,在环境条件(温度,溶剂和组成等) 一定 ,天然结构是一个独特的、稳定的和动力 学自由能最低的。
Anfinsen原理:Anfinsen's dogma,自组装 (self-assembly)学说,“自组装热力学假说”, 是分子生物学的一个假设:顺序决定构象。 Anfinsen因此而获得1972年诺贝尔化学奖。
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