Sds-page电泳过程解析
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+ 12. 为什么电泳电压很高而电流却很低呢? 这种现象一般初学者易出现。比如电压50v以上,可电流却在5mA以下。主要 是由于电泳槽没有正确装配,电流未形成通路。包括:a.内外槽装反;b.外槽 液过少;c.电泳槽底部的绝缘体未去掉(比如倒胶用的橡胶皮)。 处理办法:电泳槽正确装配即可。 13. 浓缩胶与分离胶断裂、板间有气泡对电泳有影响吗? 这主要出现在初学者中,一般对电泳不会有太大的影响。前者主要原因是拔 梳子用力不均匀或过猛所致;后者是由于在解除制胶的夹子后,板未压紧而 致空气进入引起的。 14. 凝胶时间不对,或慢或快,怎么回事? 通常胶在30MIN-1H内凝。如果凝的太慢,可能是TEMED,APS剂量不够或者失 效。APS应该现配现用,TEMED不稳定,易被氧化成黄色。 如果凝的太快, 可能是APS和TEMED用量过多,此时胶太硬易裂,电泳时易烧胶。 15. 电泳时间比正常要长? 可能由于凝胶缓冲系统和电级缓冲系统地PH选择错误,即缓冲系统地PH和被 分离物质的等电点差别太小,或缓冲系统的离子强度太高。
+ 3. SDS-PAGE电泳凝胶中各主要成分的作用? 聚丙烯酰胺的作用:丙烯酰胺与为蛋白质电泳提供载体,其凝 固的好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境密切相关; 制胶缓冲液:浓缩胶选择pH6.7,分离胶选择pH8.9,选择tris- HCL系统,TEMED与AP:AP提供自由基,TEMED是催化剂,催 化自由基引起的聚合反应进行;十二烷基硫酸钠(SDS):阳离 子去污剂,作用有四:去蛋白质电荷、解离蛋白质之间的氢键、 取消蛋白分子内的疏水作用、去多肽折叠。 4. 提高SDS-PAGE电泳分辨率的途径? 聚丙烯酰胺的充分聚合,可提高凝胶的分辨率。建议做法:待 凝胶在室温凝固后,可在室温下放置一段时间使用。忌即配即 用或4度冰箱放置,前者易导致凝固不充分,后者可导致SDS结 晶。一般凝胶可在室温下保存4天,SDS可水解聚丙烯酰胺。 一般常用的有氨基黑、考马斯亮蓝、银染色三种染料,不同染 料又各自不同的染色方法,具体可参照郭尧君编著的《蛋白质 电泳技术手册》P82-103。
7.样品处理
把样品稀释到合适浓度,按样品和样品缓冲 液3:1的比例加入
MARKER 10UL水+1ULMARKER+5UL还原 BAFFUR
沸水煮5分钟,离心8000RPM/5分钟,然后 上样
8.凝胶板剥离与染色:电泳结束后,撬开玻璃 板,将凝胶板做好标记后放在塑料盒内, 加入染色液,染色过夜。 脱色:染色后的凝胶,弃掉染色液,加入 脱色液在摇床上再脱色,直到蛋白质区带 清晰。 ※剥胶时要小心,保持胶完好无损,染色要充 分.
+ ※凝胶配制过程要迅速, 催化剂TEMED要在注胶前再加入,否则 wenku.baidu.com结无法注胶.注胶过程最好一次性完成,避免产生气泡.
+ ※水封的目的是为了使分离胶上延平直,并排除气泡 ※凝胶聚合好的标志是胶与水层之间形成清晰的界面. 倒出水并用滤纸把剩余的水分吸干,按比例配好浓缩胶,连续平稳 加入浓缩胶至离边缘5mm处,迅速插入样梳,静置40分钟. ※样梳需一次平稳插入,梳口处不得有气泡,梳底需水平.
+ 9. 什么是“鬼带”,如何处理? “鬼带”就是在跑大分子构象复杂的蛋白质分子时,常会出现在泳道顶 端(有时在浓缩胶中)的一些大分子未知条带或加样孔底部有沉淀, 主要由于还原剂在加热的过程中被氧化而失去活性,致使原来被解离 的蛋白质分子重新折叠结合和亚基重新缔合,聚合成大分子,其分子 量要比目标条带大,有时不能进入分离胶。但它却于目标条带有相同 的免疫学活性,在WB反应中可见其能与目标条带对应的抗体作用。 处理办法:在加热煮沸后,再添加适量的DTT或Beta巯基乙醇,以补 充不足的还原剂;或可加适量EDTA来阻止还原剂的氧化。 10. 为什么溴酚蓝不能起到指示作用? 我们在实验中常会遇到溴酚蓝已跑出板底,但蛋白质却还未跑下来的 现象。主要与缓冲液和分离胶的浓度有关。 处理办法:更换正确pH值的Buffer;降低分离胶的浓度。 11. 为什么电泳的条带很粗? 电泳中条带很粗是常见的事,主要是未浓缩好的原因。 处理办法:适当增加浓缩胶的长度;保证浓缩胶贮液的pH正确 (6.7);适当降低电压;
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+ 在不连续体系SDS-PAGE中,分离胶与浓缩胶中均含有TEMED和 AP,试述其作用?
3.实验试剂 水:当天纯化水 A液: B液: C液:1%SDS(要配置成10%的母液) D液: E液: 10%AP: F液: TEMED 染色液:考马斯亮蓝(先用50ML的乙酸溶解再加甲醇和水) 脱色液:50ML的乙酸+200ML的甲醇+250ML水
4.器材 JUNYI-1600电源 BOI-RAD电泳槽
+ 5.“ 微笑”(两边翘起中间凹下)形带原因? 主要是由于凝胶的中间部分凝固不均匀所致,多出现于较厚的 凝胶中。 处理办法:待其充分凝固再作后续实验。 6. “皱眉”(两边向下中间鼓起)形带原因? 主要出现在蛋白质垂直电泳槽中,一般是两板之间的底部间隙 气泡未排除干净。 处理办法:可在两板间加入适量缓冲液,以排除气泡。 7. 为什么带出现拖尾现象? 主要是样品融解效果不佳或分离胶浓度过大引起的。 处理办法:加样前离心;选择适当的样品缓冲液,加适量样品 促溶剂;电泳缓冲液时间过长,重新配制;降低凝胶浓度。 8. 为什么带出现纹理现象? 主要是样品不溶性颗粒引起的。 处理办法:加样前离心;加适量样品促溶剂。
实验结果分析:凝胶成像系统
SDS-PAGE电泳过程中影响结果的因素: 1. 配胶缓冲液系统对电泳的影响?
在SDS-PAGE不连续电泳中,制胶缓冲液使用的是Tris-HCL缓 冲系统,浓缩胶是pH6.7,分离胶pH8.9;而电泳缓冲液使用的 Tris-甘氨酸缓冲系统。在浓缩胶中,其pH环境呈弱酸性,因此 甘氨酸解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低;而CL离子 却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二 者之间泳动。由于导电性与电场强度成反比,这一区带便形成 了较高的电压剃度,压着蛋白质分子聚集到一起,浓缩为一狭 窄的区带。当样品进入分离胶后,由于胶中pH的增加,呈碱性, 甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直接紧随氯离子之后,同时 由于分离胶孔径的缩小,在电场的作用下,蛋白分子根据其固 有的带电性和分子大小进行分离。 所以,pH对整个反应体系的影响是至关重要的,实验中在排除 其他因素之后仍不能很好解决问题的情况,应首要考虑该因素。
培训人:刘小强
1.实验目的
学习SDS-PAGE测定蛋白质分子量的原理。 掌握垂直板电泳的操作方法。 运用SDS-PAGE测定蛋白质分子量及染色鉴定
2.实验原理 带电质点在电场中向带有异相电荷的电极移动,这种现
象称为电泳。 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引
进SDS(十二烷基磺酸钠), SDS能断裂分子内和分子 间氢键,破坏蛋白质的二级和三级结构,强还原剂能使 半胱氨酸之间的二硫键断裂,蛋白质在一定浓度的含有 强还原剂的SDS溶液中,与SDS分子按比例结合,形成带 负电荷的SDS-蛋白质复合物,这种复合物由于结合大量 的SDS,使蛋白质丧失了原有的电荷状态形成仅保持原 有分子大小为特征的负离子团块,从而降低或消除了各 种蛋白质分子之间天然的电荷差异,由于SDS与蛋白质 的结合是按重量成比例的,因此在进行电泳时,蛋白质 分子的迁移速度取决于分子大小。
5.技术参数 250V电压 浓缩胶使用15MA电流(每块胶),分离胶使 用30MA电流 电泳时间:在溴酚蓝跑到浓缩胶和分离胶交界 的地方调高电流继续电泳,等溴酚蓝跑的玻璃 板底部停止。
6.制胶 将玻璃板用蒸馏水洗净晾干 把玻璃板在灌胶支架上固定好. ※固定玻璃板时,两边用力一定要均匀,防止夹坏玻璃板. 按比例配好分离胶,用移液管快速加入
+
+ 思考题:
+ 在不连续体系SDS-PAGE中,当分离胶加完后,需在其上加一层水, 为什么?
+ 电极缓冲液中甘氨酸的作用?
+ SDS-PAGE中样品液和浓缩胶选TRIS/HCL缓冲液,电极液选TRIS/ 甘氨酸,电泳开始后,HCL解离成氯离子,甘氨酸解离出少量 的甘氨酸根离子。蛋白质带负电荷,因此一起向正极移动,其 中氯离子最快,甘氨酸根离子最慢,蛋白居中。电泳开始时氯 离子泳动率最大,超过蛋白,因此在后面形成低电导区,而电 场强度与低电导区成反比,因而产生较高的电场强度,使蛋白 和甘氨酸根离子迅速移动,形成以稳定的界面,使蛋白聚集在 移动界面附近,浓缩成一中间层。
+ 2. 样品如何处理? 根据样品分离目的不同,主要有三种处理方法:还原SDS处理、 非还原SDS处理、带有烷基化作用的还原SDS处理。 1)还原SDS处理:在上样buffer中加入SDS和DTT(或Beta巯基乙 醇)后,蛋白质构象被解离,电荷被中和,形成SDS与蛋白相结 合的分子,在电泳中,只根据分子量来分离。一般电泳均按这 种方式处理,样品稀释适当浓度,加入上样Buffer,离心,沸水 煮5min,再离心加样。 2)带有烷基化作用的还原SDS处理:碘乙酸胺的烷基化作用可 以很好的并经久牢固的保护SH基团,得到较窄的谱带;另碘乙 酸胺可捕集过量的DTT,而防止银染时的纹理现象。100ul样品 缓冲液中10ul 20%的碘乙酸胺,并在室温保温30min。 3)非还原SDS处理:生理体液、血清、尿素等样品,一般只用1 %SDS沸水中煮3min,未加还原剂,因而蛋白折叠未被破坏, 不可作为测定分子量来使用。