实时荧光等温扩增技术

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现在日本Eiken公司网站www.eiken.co.jp/en/ index.html已经开发了包括禽流感、SARS、西尼罗河病 毒、牛胚胎性别检测等19种LAMP检测产品试剂盒出售 国内也报道研制出沙门氏菌、副溶血弧菌、大肠杆 菌O157等的快速检测试剂盒。
疟原虫的检测
在该文献中,研究者直接将50uL的血液在99℃加热十 分钟,然后吸取2uL上清液直接做LAMP 。为了验证这种 方法,研究者又提取这些样本的DNA,并进行了PCR。
PCR(DNA提 取物) 101(+)
101(-)
LAMP(裂 sensitivity 解上清液) specificity 96(+) 95%
65℃反应, 移至80℃热浴10min 终止反应。
wk.baidu.comRNA模板:只需在里面加入逆转录酶即可反应。
RT-LAMP扩增FMDV结果的检测方法
LAMP能扩增1-10个拷贝的起始模板浓度 ;RT-LAMP的灵敏度比end-point RT-PCR高10 倍,比常规RT-PCR高10-100倍。从反应速度来 看,RT-LAMP胜过于TaqMan-RT-PCR,而且利用 将96孔板放在实时热循环仪上操作,可以实 现样本的高通量检测。 RT-LAMP不会受到提取RNA过程中的污染 物的限制,该文献提示现行的核酸提取方法 过于复杂,需要开发更简单的程序。
环介导等温扩增技术(LAMP)
学生: 罗乐
指导老师:聂凯老师
2000年,日本学者Notomi 等发明了一种全新的 核酸扩增方法—环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification ,LAMP)。该法能在等温条 件下高特异,高灵敏的扩增DNA。其特点是针对靶 基因的六个区域设计4种特异性引物,利用一种链 置换DNA聚合酶在等温条件(65℃左右)保温一小 时,即可完成核酸扩增反应。
100(-) 99%
LAMP(裂解上 清液) 13(+)
PCR(裂解上 清液 7(+)
PCR(DNA提 取物 13(+)
因此,LAMP不需要抽提纯化DNA就可以进行DNA的高效扩 增,它明显的降低了成本和循环时间;而且LAMP具有较强的 抗干扰能力,可能是由于Bst DNA Polymerase的缘故。
阳性对照组(含有待测基因的拷贝数已知的质粒) 60℃2小时
(LA-200) 浊度 40cycles 亮度
临床样本 条件同上
阳性样本
阴性样本
含待测基因的 质粒阳性对照
应用
LAMP 法已经被广泛应用于动物胚胎性别 鉴定,人、动物和植物致病微生物以及寄生 虫的检测,转基因食品,疾病基因诊断,环 境监测食品卫生检疫及基因芯片的开发。
引物设计
Primer Explorer version 4.0 软件
扩增机制
1.循环扩增始发物的形成
2.循环延伸
操作程序
DNA模板:首先将模板DNA、引物、dNTP 和缓
冲液按比例配制, 混匀后置95℃中5min( 参与反应
的模板仍然是未变性的DNA) ; 然后冰浴5~10min
退火; 而后加入适量的BstDNA 聚合酶, 于60℃~
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