核酸分离与纯化
核酸提取与纯化试剂配方
核酸提取与纯化试剂配方核酸提取和纯化是分子生物学研究中常用的重要步骤。
核酸提取与纯化试剂包括溶解、提取、纯化和测定等步骤。
下面将详细介绍核酸提取与纯化试剂的配方和使用方法。
1. 细胞裂解缓冲液的配方:- 25mM Tris-HCl pH 8.0- 50mM EDTA- 1% SDS- 100μg/ml RNase A将以上试剂按比例混合制备成细胞裂解缓冲液,用于裂解细胞并保护核酸的完整性。
2. 提取缓冲液的配方:- 0.1M Tris-HCl pH 8.0- 0.14M NaCl- 0.001M EDTA- 1% SDS将以上试剂按比例混合制备成提取缓冲液,用于将细胞裂解液中的核酸与蛋白质分离。
3. 过滤缓冲液的配方:- 5M ammonium acetate- 100% isopropanol将5M乙酸铵与等量的100%异丙醇混合制备成过滤缓冲液,用于将核酸从提取液中沉淀。
4. 洗涤缓冲液的配方:- 70% ethanol将绝对乙醇与等量的去离子水混合制备成洗涤缓冲液,用于洗涤核酸沉淀,去除残留的盐类和蛋白质。
5. 纯化缓冲液的配方:- 10mM Tris-HCl pH 8.0- 1mM EDTA将以上试剂按比例混合制备成纯化缓冲液,用于重溶核酸并去除污染物。
使用步骤如下:1. 将待提取的细胞悬浮在细胞裂解缓冲液中,彻底裂解细胞膜。
2. 加入RNase A,在室温下孵育30分钟,酶解RNA。
3. 加入等体积的提取缓冲液,混合均匀后离心,将上清液转移至新离心管,保留上清液,其中含有DNA。
4. 加入等体积的过滤缓冲液,混合均匀后离心,将上清液抽取并丢弃,沉淀中包含核酸。
5. 加入洗涤缓冲液,混合均匀后离心,将上清液抽取并丢弃,重复一次洗涤步骤,确保去除残留的盐类和蛋白质。
6. 倒掉洗涤缓冲液,将离心管倒置在吸水纸上,待离心管底部的液滴完全干燥,避免残留的洗涤缓冲液影响纯化后的核酸。
7. 加入适量的纯化缓冲液,将沉淀重溶,确保核酸的完整性。
核酸分离与纯化
核酸的分离和纯化
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1.2 核酸分离与纯化的要求
(1) 为保证核酸的完整性,
化学因素? 生物因素? 物理因素?
(防止降解),在实验中应注意:
① 尽量简化步骤,缩短提取时间,减少各种 有害因素对核酸的破坏。
② 减少化学因素对核酸的降解,pH4-10。
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③ 防止核酸的生物降解(细胞内或外的 各种核酸酶水解)。
优点: 对盐类沉淀少,沉淀中所含迹量乙醇易挥发除 去,不影响以后实验。
缺点: 需要量大,一般要求低温操作。
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异丙醇
优点: 需体积小,速度快,适于浓度低、体积大的DNA 样品沉淀。一般不需低温长时间放置。
缺点: 易使盐类、蔗糖与DNA共沉淀.异丙醇难以挥
发除去。所以,最后用70%乙醇漂洗数次。
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使用酚时应注意
(1)使用注意 酚通常是透明无色的结晶,如果酚结晶呈
现粉红色或黄色,表明其中含有酚的氧化产物, 例如醌、二酸等。变色的酚不能用于核酸抽提 实验,因为氧化物可破坏核酸的磷酸二酯键。
(2)安全操作 酚腐蚀性很强,并可引起严重的灼伤,操
作时应戴手套。
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③ 去除对后续实验有影响的物质,如有机 溶剂和过高浓度的金属离子。
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2. 核酸制备的基本步骤
I.材料准备
破碎细胞
II.破碎细胞或包膜-内容物释放
提取
III.核酸分离
纯化
IV.沉淀或吸附核酸,纯化并去除杂质
V.核酸溶解在适量缓冲液或水中
核酸的分离和纯化
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2.1 破碎细胞
核酸分离纯化的原则
核酸分离纯化的原则
核酸的分离纯化原则主要包括以下几个方面:
1. 根据物理化学性质分离:包括碱基成分、大小、形态等,如使用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离DNA和RNA;利用离心、超滤和电泳等技术可分离DNA、RNA和蛋白质。
2. 根据碱基组成分离:由于不同物种、不同个体的DNA碱基组成不同,因此可以利用这一差异利用测序、杂交、PCR等方法进行分离。
3. 根据功能分离:可以根据DNA和RNA的功能和特异性进行分离。
例如,使用特异性结合染料或核酸探针选择性地富集DNA或RNA。
4. 根据生化特性分离:DNA和RNA在不同条件下的生化特性差异较大,可以利用这一特点进行分离纯化,如利用酸性或碱性溶液进行分离纯化。
5. 根据亲和性分离:根据DNA或RNA与某些物质的亲和性选择性地富集、分离纯化DNA或RNA,例如使用特异性结合蛋白质来富集特定DNA或RNA序列。
简述核酸分离纯化的主要步骤
简述核酸分离纯化的主要步骤核酸分离纯化的主要步骤其实就是一场与基因的“亲密接触”。
我们就像是在进行一场精密的科学“约会”,只不过对象是DNA或RNA,而不是人。
好啦,咱们来看看这个过程如何进行的吧。
1. 材料准备
1.1 样品收集
首先,你得找点样品,可能是植物、动物,甚至是细菌。
想象一下,就像挑选食材一样,你需要挑选新鲜的“原料”。
1.2 细胞裂解
接下来,咱们要“破壳”了!通过加入一些裂解缓冲液,把细胞膜弄开,释放出里面的核酸。
这个过程就像是打开一个“宝箱”,哇,里面可真丰富!
2. 去除杂质
2.1 去除蛋白质
这一步,你得用一些蛋白酶,把细胞里的蛋白质都搞定。
想象一下,就像是把不需要的东西清理出去,只留下最闪亮的宝物。
2.2 沉淀核酸
然后,咱们需要加入酒精,通常是乙醇。
核酸会跟酒精“亲密接触”,沉淀下来。
这个时候你会发现,核酸就像是被请出舞池的主角,闪闪发光!
3. 洗涤与重溶
3.1 洗涤
在沉淀后的核酸上,加点洗涤液,就像给它洗个澡,把残留的杂质都冲走。
你得小心翼翼,别让它“滑了”!。
3.2 重溶
最后一步,是把洗净的核酸重新溶解在缓冲液中。
这个过程就像是给核酸穿上新衣服,焕然一新,准备出门见客!
完成这些步骤后,你的核酸就“出炉”啦!感觉就像是一场成功的约会,满载而归。
希望这个过程能让你对核酸分离纯化有个更轻松的了解。
就这样,你成功地和基因建立了“深厚的友谊”,为后续的实验打下了良好的基础!。
核酸分离与纯化的技术路线与原则
核酸分离与纯化的技术路线与原则核酸包括DNA 、RNA两类分子,在细胞内均与蛋白质结合成核蛋白。
真核生物基因组中,95%DNA 为双链线性分子,存在于细胞核中,5%为双链环状分子,存在于细胞器中;原核生物DNA 及质粒DNA 为双链或单链环状分子;RNA 为单链线性分子,主要存在于细胞质中。
DNA 与RNA 性质的不同导致对其分离与纯化的条件也不相同。
一、核酸分离与纯化的原则(1)保证核酸一级结构的完整性。
生物的遗传信息全部贮存在核酸一级结构中,而且核酸的一级结构还决定其高级结构的形式及和其他大分子结合的方式。
所以,所提取的核酸一级结构的完整性直接影响着后续实验中对其结构与功能研究的质量。
因此,在制备核酸的过程中,要做到:尽量简化操作程序,缩短提取过程;避免过酸、过碱等化学因素对核酸链中磷酸二酯键的破坏,在pH 值4~10条件下进行操作;操作时动作要轻缓,提取的样品小包装保存,以免诸多的物理因素对核酸的降解;避免细胞内及环境中核酶对核酸的生物性降解。
(2)排除其他生物大分子的污染,如蛋白质、多糖和脂类分子的污染应尽可能降低到最低程度,特别是提取DNA 分子时应除去RNA 分子,反之亦然。
(3)排除核酸样品中有机溶剂和过高浓度的金属离子。
二、分离与纯化的技术路线(一)核酸的释放通常情况下DNA 及RNA 均位于细胞内,因此核酸分离与纯化的第一步就是制备单个细胞,再破碎细胞,从而释放核酸。
破碎细胞的方法包括机械法与非机械法两大类。
机械法又可分为液体剪切法与固体剪切法;非机械法可分为干燥法与溶胞法。
由于溶胞法采用适宜的化学试剂与酶,能有效地裂解细胞,方法温和,能保证较高的核酸获得率,并能较好地保持核酸的完整性,从而得到广泛的应用。
(二)核酸的分离与纯化利用核酸与其他物质性质上的差异,可以分离与纯化核酸。
这种差异包括细胞定位与组织分布上的差异,物理、化学性质上的不同,以及各自独特的生物学特性。
操作过程中,既可以从复杂样品中抽提出核酸分子,也可以将样品中的非核酸成分(非核酸的生物大分子、非需要的核酸分子及在操作过程中加入的溶液与试剂)逐步清除。
简述核酸分离纯化的主要步骤。
简述核酸分离纯化的主要步骤。
在生物实验中,核酸分离纯化可谓是一个神奇的过程,像是把“混乱的书房”整理成一间“整洁的书房”,让我们能从一堆杂乱的物质中找出我们需要的那一部分。
要想搞清楚这个过程,我们得从头说起。
先别急,跟我来,我们一块儿来聊聊这些神奇的步骤。
1. 核酸提取的开篇首先,我们得“扒拉扒拉”样品。
也就是说,要从样本里提取出核酸。
这一步就像是把原料放到面粉筛里筛选一样,我们得把细胞破坏开,释放里面的核酸。
这里用的工具有点像“万用刀”,既可以是研磨机,也可以是液氮冷冻破碎机,总之就是要让细胞壁的“防线”彻底崩溃。
像打破冰层一样,把里面的核酸暴露出来。
1.1 细胞破碎:好比“猛兽入笼”细胞破碎的过程,听起来就像是猛兽入笼,猛烈而直接。
为了完成这个步骤,我们可以使用各种各样的试剂,比如说细胞裂解液。
这个液体就像是一把万能钥匙,能把细胞膜一举撬开,释放里面的核酸。
当然,有时候我们也可以用物理手段,比如说搅拌、超声波破碎等,像摇晃沙袋一样,把核酸搞出来。
1.2 去除杂质:清除“杂草”一旦细胞壁被破坏,里面的核酸和其他成分混杂在一起。
接下来,我们要做的就是清除那些“杂草”。
这时候我们会用到一些化学试剂,比如说酚/氯仿混合液。
这些试剂像是高效的“除草剂”,能够把蛋白质和其他杂质从核酸中分离出来。
我们会把样品离心分层,这样就能把核酸分离出来。
记得,离心就像洗衣机的脱水功能,快速旋转让东西分开。
2. 核酸纯化的妙招接下来是核酸纯化的部分了。
这个过程可以说是给核酸做一个“美容”,让它看起来干净又光鲜。
纯化的方式有很多,其中最常用的是柱子纯化。
我们把样品经过特制的柱子,就像是把泥土过滤掉,把精华留下来一样。
柱子的材料有一种特殊的性质,能吸附核酸,而把其他杂质排除在外。
2.1 柱子纯化:像“过滤咖啡”柱子纯化的过程其实就像是过滤咖啡。
你把咖啡粉放到过滤纸里,然后慢慢滴下清水,最终只剩下干净的咖啡液。
类似地,我们把核酸溶液通过柱子,里面的核酸会被柱子吸附,而其他的杂质会被洗掉。
第六章核酸的分离与纯化
三、鉴定、保存与应用
(一)核酸的鉴定
1.浓度鉴定核酸浓度的定量鉴定可通过紫外分光光度法与荧光光度法进行。
(1)紫外分光光度法:紫外分光光度法是基于核酸分子成分中的碱基均具有一定的紫外线吸收特性,最大吸收波长在250nm~270nm之间。这些碱基与戊糖、磷酸形成核苷酸后,其最大吸收波长不变。由核苷酸组成核酸后,其最大吸收波长为260nm,该物理特性为测定溶液中核酸的浓度奠定了基础。在波长260nm的紫外线下,1个OD值的光密度大约相当于50µg/ml的双链DNA,38µg/ml的单链DNA或单链RNA,33µg/ml的单链寡聚核苷酸。如果要精确定量已知序列的单链寡核苷酸分子的浓度,就必须结合其实际分子量与摩尔吸光系数,根据朗伯-比尔定律进行计算。若DNA样品中含有盐,则会使A260的读数偏高,尚需测定A310以扣除背景,并以A260与A310的差值作为定量计算的依据。紫外分光光度法只用于测定浓度大于0.25µg/ml的核酸溶液。
2.纯度鉴定紫外分光光度法还是荧光光度法,均可用于核酸的纯度鉴定。
核酸的分离与纯化讲解
• 二.质粒和噬菌体DNA的提取和纯化
• (一)质粒DNA的提取 • 基本步骤 • 1.细菌的培养 • 2.细菌的收集与裂解 • 3.质粒DNA的纯化 • 提取方法
• 煮沸法: • 碱法:最常用的质粒DNA提取方法。 • SDS法:
• (二)噬菌体DNA的提取
• 1.细菌培养 • 2.细菌的感染及裂解 • 3.噬菌体的沉淀及纯化 • 4.噬菌体DNA的提取
• 图1 玻璃砂研磨提取总DNA的电泳结果
• 1-4孔为低pH值法,5-8孔为CTAB法,9-12孔为苯酚法 • 1,2为西洋参;3.鲜品布渣叶;4.干品布渣叶
• 图2 氧化铝研磨提取总DNA的电泳结果
• 1-4孔为低pH值法,5-8孔为CTAB法,9-12孔为苯酚法 • 1,2为西洋参;3.鲜品布渣叶;4.干品布渣叶
一、概述
• 核酸分离提取的原则 • 常用方法及基本原理 • DNA的分离纯化 • RNA的分离纯化
第一节 核酸分离提取的原则
• 一、基本原则
• 1.保证核酸一级结构的完整性。 • 2.排除其它分子的污染。
• 二、注意事项
• 1.简化操作步骤,减少对核酸的破坏。 • 2.避免过酸(碱)等化学因素的影响(pH4~10)。 • 3.减少物理因素对核酸的降解。 • 4.防止核酸的生物降解。
• ③分离浮力密度不同的DNA分子或其他分子颗粒, 如图1。
图1 氯化铯梯度纯化λ噬菌体
噬菌体在1.45g/ml与1.50g/ml氯化铯界面之间形成一肉眼可 见的带。在1.45g/ml与1.50g/ml氯化铯界面之间可看到一个 由噬菌体颗粒形成的浅蓝色带。
• ④纯化DNA分子。在中性CsCl溶液中,DNA的 浮力密度为1.7g/ml,RNA为2.0g/ml,蛋白 质的浮力密度为1.3~1.4g/ml。在起始密度 为1.7g/ml的CsCl溶液中进行超速离心,可 以很好地将三者区分开。蛋白质浮在上层液 面,DNA分子在离心管中间形成区带,RNA沉 于管底,从而达到从DNA样品中去除微量RNA 和蛋白质的目的。
核酸分离纯化方法
核酸分离纯化方法
核酸分离纯化方法包括以下几种常用方法:
1. 酚酸法(Phenol-Chloroform Extraction):通过酚酸混合液溶解蛋白质,然后进行醚抽提,可分离出核酸。
该方法通常用于大量样品的纯化。
2. 高盐法(Salt Precipitation):通过加入高浓度盐溶液,如氯化钠,使核酸在低温下形成沉淀,然后离心分离。
3. 硅胶柱法(Silica Column):将核酸样品通过硅胶柱,利用硅胶对核酸的亲合性,使核酸固定在柱中,通过洗脱剂洗脱纯化的核酸。
4. 钠离子交换柱法(Sodium Ion Exchange Column):利用柱内载体对核酸的亲合性,在一定的钠离子浓度下,核酸与载体结合,通过洗脱缓冲液洗脱纯化的核酸。
5. 凝胶电泳法(Gel Electrophoresis):利用电场作用,将核酸样品在凝胶上进行分离和纯化。
根据核酸的大小,可选择琼脂糖凝胶电泳或聚丙烯酰胺凝胶电泳。
核酸的分离和纯化
琼脂糖凝胶电泳操作注意细节
1) 根据片段大小配制不同浓度的胶(改变分辨率),片段越小, 需要胶浓度越大。 2) 胶要现制先用 3) 选择合适的Marker 4) 配胶的缓冲液与电泳缓冲液要是同一种,且浓度一致(1倍) 5) 点样时要加入loading buffer,并注意,不要将样点到点样 孔之外(飘样),也不要将胶戳漏(漏样) 6) 根据片段大小及电泳检测目的,选择合适的电压及电泳时间 7)EB染色。
检测原理:
溴化乙锭(EB)可插入双链DNA分子中, 在紫外光照射下,发射荧光。
EB: 先染与后染
核酸凝胶电泳技术
溴化乙锭染料的化学结构及 其 对 DNA 分 子 的 插 入 作 用 。 由于插入了溴化乙锭分子, 在紫外光照射下,琼脂糖凝 胶 电 泳 中 DNA 的 条 带 便 呈 现 出荧光,易于鉴定。
琼脂糖及聚丙烯酰胺凝胶分辨DNA片段的 能力
凝胶类型及浓度 (bp)
分离DNA的大小范围
0.3%琼脂糖
50 000~1 000
0.7%琼脂糖
20 000~1 000
1.4%琼脂糖
6 000~300
4.0%聚丙烯酰胺
1 000~100
10.0%聚~1
琼脂糖凝胶电泳的原理
rRNA分子具有确定的大小和核苷酸序列, 特别是28S和18S特征性条带是电泳鉴定总 RNA纯度和完整性的重要参数。
3、 琼脂糖凝胶电泳
• 3. 1 原理: • 3. 2 用途:
琼脂糖凝胶电泳的原理
DNA电泳迁移:电荷效应+分子筛效益
(1)DNA带负电,电场中,向正极移动; (2)决定移动速度三因素:DNA大小,电荷数,构 型(超螺旋 > 线性 > 开环); (3) 线性DNA分子移动速度与其分子质量的对数成 反比(分子量越大,跑得越慢);
核酸分离纯化的技术原理
核酸分离纯化的技术原理核酸提取是核酸检测实验的第一步,也是最关键的一步。
核酸提取的纯度、产量和质量是影响下游实验的关键。
核酸提取主要有两个步骤,分别是裂解和纯化,其中,裂解的目的是通过各种方法裂解细胞,将核酸释放到溶液中,纯化的目的则是将核酸分子从裂解液中特异性地分离出,从而避免裂解液中原有的蛋白分子、脂类、糖类、多肽、其他有机或无机分子对后续核酸检测实验的干扰。
在核酸提取过程中还应遵循以下原则:保证核酸分子一级结构的完整性;去除其他污染分子。
一、液相核酸分离纯化技术(一)胍硫氰酸酚-氯仿提取法盐类通常是核酸样本中最常见的杂质成分,因此,在将核酸样本进行下游处理和分析前,通常需要去除盐类成分。
因此,通常需一或多个分离和(或)纯化步骤来使样本脱盐。
核酸纯化的常规步骤包括细胞裂解,该步骤通过破坏细胞结构而形成细胞裂解液,同时灭活包括DNA酶和RNA酶在内的细胞内源性核酶,并最终从细胞碎片中获得纯净的核酸样本。
有机溶剂-苯酚-氯仿提取法正是基于上述原理最常见的核酸经典提取方法之一。
苯酚-氯仿-异丙醇按照一定比例混合后(即:25∶24∶1)可抵制RNA酶活性,从而克服单用苯酚无法抑制RNA酶活性的不足。
蛋白、脂质、碳水化合物和细胞碎片可通过提取苯酚和氯仿有机试剂混合物的水相而去除。
含有DNA样本的水相可通过加入2∶1或1∶1比例的乙醇或异丙醇沉淀,最后,沉淀下来的DNA用70%乙醇洗涤并最后溶解于TE缓冲液或无菌去离子水中。
异硫氰酸胍(guanidinium isothiocyanate)用于RNA提取的方法最早见于1977年,但是,由于该方法比较繁琐,后来逐步被称之为胍硫氰酸酚-氯仿提取法(guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction)代替,该方法可一步完成RNA提取。
其基本原理是:硫氰酸胍是蛋白质强变性剂,能裂解组织细胞,释放RNA,抑制RNA酶的活性,同时与RNA形成可溶性复合物,经过酚-氯仿抽提,使RNA 与组织中的DNA和蛋白质分离开,达到分离提取总RNA的目的。
核酸分离纯化方法
核酸分离纯化方法引言:核酸分离纯化是分子生物学研究中常用的基础技术之一。
通过分离纯化核酸可以获取高纯度的目标核酸样品,为后续的核酸分析和实验提供可靠的基础。
本文将介绍几种常见的核酸分离纯化方法及其原理、步骤和应用。
一、酚/氯仿法酚/氯仿法是最早用于核酸提取的方法之一,其基本原理是利用酚和氯仿的不同溶解度和密度,将核酸从其他细胞组分中分离出来。
主要步骤包括细胞破碎、酚处理、氯仿处理和酒精沉淀等。
该方法操作简单、成本低廉,适用于从体内或体外样品中提取DNA或RNA。
然而,酚/氯仿法存在操作危险性大、提取效果依赖于操作者经验等问题。
二、硅胶柱层析法硅胶柱层析法是一种常用的核酸纯化方法,利用硅胶吸附核酸的特性实现核酸的分离纯化。
该方法主要包括样品处理、硅胶柱处理和洗脱等步骤。
硅胶柱层析法具有操作简便、纯化效果好、适用于各种核酸样品等优点,广泛应用于基因克隆、PCR扩增和测序等实验中。
然而,硅胶柱层析法的纯化效果受到核酸长度和样品质量的影响。
三、离心管柱法离心管柱法是一种基于离心技术的核酸分离纯化方法,其原理是利用离心管柱中填充的分离介质将核酸与其他杂质分离。
该方法主要包括样品处理、离心管柱处理和洗脱等步骤。
离心管柱法操作简单、纯化效果好、适用于多种核酸样品,被广泛应用于基因克隆、PCR 扩增和测序等领域。
然而,离心管柱法的分离效果受到核酸长度和样品质量的影响。
四、凝胶电泳法凝胶电泳法是一种常用的核酸分离纯化方法,可根据核酸的大小和电荷差异进行分离。
该方法主要包括制备凝胶、样品处理、电泳和染色等步骤。
凝胶电泳法操作简单、成本低廉,适用于从体内或体外样品中分离DNA或RNA。
然而,凝胶电泳法不能提供高纯度的核酸样品,常用于初步分析和检测。
五、商业化试剂盒法随着分子生物学技术的发展,商业化试剂盒法逐渐成为核酸分离纯化的主要选择。
商业化试剂盒包含了多种核酸纯化方法的关键试剂和耗材,操作简便、方便快捷。
根据不同的试剂盒,可以选择合适的纯化方法。
核酸分离与纯化技术的实验操作步骤
核酸分离与纯化技术的实验操作步骤引言:核酸分离与纯化技术是现代生命科学研究中不可或缺的重要手段。
在分子生物学研究中,分离和纯化核酸的高效率和高质量是保证实验结果准确性的关键。
本文将介绍一种常用的核酸分离与纯化技术,并详细叙述其实验操作步骤。
材料与设备准备:首先,我们需要准备以下实验材料与设备:1. 厌氧蒸馏水:用于制备实验过程中所需的缓冲液和试剂;2. 离心管:用于收集和离心样品;3. 磁力搅拌器:用于在适当温度下进行试剂反应;4. 超低温冰箱:用于保存实验动物组织和细胞样品;5. 离心机:用于离心样品以分离细胞碎片和细胞核;6. 高速离心机:用于离心样品以分离核酸;7. 离心管架:用于固定离心管,防止其在离心过程中翻倒。
实验操作步骤:一、细胞收获与裂解1. 从培养皿中收集待处理的细胞,并用无菌生理盐水洗涤一次,去除培养基残留。
2. 加入适量的细胞裂解缓冲液(含有蛋白酶抑制剂)裂解细胞,在低温条件下搅拌1-2小时。
二、细胞碎片与细胞核的分离1. 将裂解后的细胞样品离心10分钟,离心速度2000g,室温,将上清液(上清液中包含细胞碎片和核糖核蛋白等)转移到新的离心管中。
2. 将上清液进行二次离心,离心速度10000g, 10分钟,4℃。
3. 丢弃上清液中的细胞碎片,在室温下用冷蒸馏水悬浮沉淀。
三、核酸的纯化1. 向沉淀中加入适量的核酸提取试剂,充分悬浮沉淀,并在室温下搅拌5-10分钟。
2. 通过离心的方式将沉淀分离,离心速度10000g,10分钟,室温。
3. 取出上清液(富含核酸)放入离心管中,加入等体积的异丙醇,混匀后放置于室温下搅拌10分钟。
4. 通过离心分离异丙醇上清液和沉淀,离心速度10000g,10分钟,室温。
5. 倒掉上清液,用70%无菌酒精洗涤沉淀。
将酒精去除后,用离心机低速离心,离心速度2000g,5分钟,即可获得纯化的核酸。
结论:通过上述实验操作步骤,我们可以成功地进行核酸的分离与纯化。
核酸分离纯化的总原则
核酸分离纯化的总原则
核酸分离纯化的总原则主要包括以下几点:
1. 选择适当的提取方法:根据样品类型和目标核酸的特点选择合适的提取方法,如CTAB法、硅胶柱法、磁珠法等。
2. 去除污染物:通过选择合适的缓冲液和添加试剂来去除可能存在的污染物,如蛋白质、RNA、PCR抑制物等。
3. 确保纯化的选择性:选择合适的纯化方法来分离目标核酸,如凝胶电泳、柱层析、磁珠萃取等,使目标核酸与其他杂质分离。
4. 去除RNA和DNA降解酶:为了保护目标核酸的完整性和稳定性,在分离纯化过程中要避免使用RNase和DNase酶。
5. 确保纯化的高效性和高纯度:通过优化纯化条件和使用高质量纯化试剂来确保核酸的高效纯化和高纯度。
6. 储存和保存:纯化的核酸要储存和保存在合适的条件下,如使用低温冰箱或液氮保存,并注意避免冻融循环。
核酸分离纯化的主要步骤
核酸分离纯化的主要步骤1. 什么是核酸分离纯化?嘿,大家好!今天我们来聊聊核酸分离纯化这回事。
说白了,它就是从细胞里提取出DNA或RNA的过程。
就像是把美味的汤从锅里倒到碗里,确保里面没有杂质。
咱们的细胞里有很多东西,像是蛋白质、脂类和水分,真是五花八门。
但我们只想要那个最重要的核酸,嘿,这可是一项技术活哦!2. 核酸分离纯化的主要步骤2.1 细胞裂解第一步,就是把细胞搞破。
这听起来有点狠,但其实这是必须的,像个忍者一样,咱们得悄悄潜入细胞的世界。
我们用一种叫做裂解缓冲液的东西,里面有各种化学物质,可以把细胞膜弄得稀巴烂。
想象一下,把一个坚硬的蛋壳敲开,里面的蛋黄蛋白就可以流出来啦!这时候,细胞里的东西就会全部跑出来,嘿嘿,包括咱们要找的核酸。
2.2 细胞碎片去除接下来,咱们要把那些不需要的“杂物”清理掉。
细胞里面可不是清汤挂面,咱们得把破碎的细胞膜和其它大块的东西滤掉。
这个过程可以用离心来搞定,像旋转木马一样,把重的东西甩到边上,让核酸跟着跑到上面。
然后小心翼翼地把上面的液体吸出来,这可得细心,别把宝贝也给弄丢了!2.3 核酸沉淀好啦,经过一番折腾,咱们终于把核酸从那些杂七杂八的东西里解救出来了。
可是,这时候核酸还没完美地展现出来,咱们还需要进一步把它沉淀下来。
这里就要用到乙醇或异丙醇,咱们把它们加入到提取液中,就像给核酸穿上一件漂亮的外衣。
等一会儿,核酸就会像小颗粒一样沉到瓶底,真是美得不要不要的!3. 清洗和重悬核酸3.1 清洗核酸在沉淀出核酸后,我们还得给它洗个澡,别让它沾上那些脏东西。
再加点冷的乙醇,把沉淀的核酸轻轻洗一遍,像给小狗洗澡一样,既要温柔又要彻底。
洗完后,再把它离心一遍,剩下的就会是干净的核酸,闪闪发光,简直美丽动人!3.2 重悬核酸最后一步,就是把干净的核酸放到一个适合它的环境中,让它重新“生活”起来。
咱们用合适的缓冲液把它溶解开,确保它能够活跃地工作。
就像小鸟飞回温暖的家,核酸终于回到了它该待的地方。
核酸提取与纯化
核酸提取与纯化引言核酸提取与纯化是生物学研究中常用的操作步骤之一。
核酸提取是指从生物样本中分离出DNA或RNA分子,纯化则是指将提取得到的核酸分子除去杂质,获得纯净的核酸样品。
本文将介绍核酸提取与纯化的基本原理、常用方法以及注意事项。
核酸提取原理核酸提取的基本原理是利用生物样本中DNA和RNA分子与其他组分(如蛋白质、细胞壁等)之间的化学或物理性质的差异,将核酸分子从样本中分离出来。
常见的提取方法有有机溶剂法、盐析法和离心法等。
有机溶剂法有机溶剂法是一种常用的核酸提取方法。
其原理是利用有机溶剂(如酚-氯仿混合液)与生物样本中的其他组分之间的亲和性差异,将核酸分子从样本中提取出来。
这种方法操作简单,适用于提取DNA和RNA。
具体操作步骤如下:1.准备生物样本,如细胞培养物或组织样本。
2.加入细胞裂解缓冲液,破坏细胞膜、核膜等结构,释放核酸分子。
3.加入酚-氯仿混合液,与细胞裂解液混合,形成两相体系。
4.离心分离两相,核酸分子会在有机相中分配到有机相中,而其他杂质会在水相中。
5.取出有机相,加入异丙醇或乙醇等沉淀剂,沉淀核酸分子。
6.离心沉淀,弃去上清液。
7.用乙醇洗涤沉淀,去除残留的盐和有机溶剂。
8.干燥沉淀,加入适量的去离子水溶解核酸。
盐析法盐析法是利用核酸分子与盐溶液中的离子交互作用的原理进行分离。
该方法适用于高含量的核酸样本(如DNA或RNA)。
其操作步骤如下:1.准备生物样本,如细胞裂解液。
2.加入适量的盐溶液,使盐浓度达到一定程度。
3.离心分离沉淀,核酸分子会与高浓度盐溶液结合形成沉淀,而其他杂质会在上清液中。
4.取出沉淀,用盐溶液洗涤核酸,去除杂质。
5.干燥沉淀,加入适量的去离子水溶解核酸。
离心法离心法是一种快速分离核酸的方法。
其原理是利用离心力将核酸分子从样本中沉淀下来。
离心法适用于小样本量和快速提取的情况。
具体步骤如下:1.准备生物样本,如细胞裂解液。
2.加入高盐缓冲液,增加核酸与其他组分之间的亲和性差异。
核酸的分离和纯化
RNA制备前的准备
玻璃器皿 在使用前应180℃烤至少4小时 塑料器皿 用0.1% 焦碳酸二乙酯(DEPC)或用氯仿洗涤 电泳槽 用去污剂洗涤,水冲洗,乙醇干燥,再浸泡于
3%H2O2 液中10分钟,然后0.1%DEPC处理水彻 底冲洗。 配制的溶液应用0.1% DEPC在37℃处理12小时以上,再高 压灭菌去除 DEPC。 不能高压灭菌的溶液用
EDTA/0.1 SDS的试管收集洗脱的RNA溶液。
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6)按步骤2重新平衡柱子,重复步骤2-4的poly(A)选 择吸附和洗脱过程。
7)调整收集的RNA溶液的乙酸钠浓度至 0.3mol/L, 加2.5倍体积乙醇,移至2个硅化的SW-55离心管 中,-20℃放置过夜 。
8)4℃离心, 30, 000g 30分钟沉淀RNA(极稀浓 度 )。弃去乙醇,晾干沉淀,重溶于150微升无 RNA酶的TE缓冲液,合并样品。取5微升在70℃ 加热5分钟后,在1%琼脂糖凝胶电泳中检查RNA 的质量。
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方法 一、异硫氰酸胍法制备总RNA
二、TRIzol试剂提取细胞总RNA
步骤:
1) 组织标本需在预冷的碾钵中捣碎,收获1x106-5x106细
胞, 移入1.5 ml管中。
2) 加TRIzol试剂1 ml,混匀,冰浴5 mins。
3) 加氯仿0.2毫升,混匀,冰浴10 mins。
4) 4℃,10, 000g离心5 mins。
288 kb
痘病毒
196 kb
质体 几~100以上kb
线粒体
藻类 线状
15kb
酵母 环状
19~78 kb
植物 环状 100~150 kb
动物(扁虫到人)环状 15~18 kb
锥虫 网状
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(异)硫氰酸胍-酚氯仿一步法
硫氰酸胍+β-巯基乙醇 裂解细胞 pH4.0
酚/氯仿抽提裂解溶液
异丙醇沉淀
75%乙醇洗涤
RNA
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三、mRNA的分离与纯化
细胞内mRNA特点:含量少 种类多 分子大小不一
mRNA结构特点:多聚腺苷酸尾(polyA) 方法:oligo(dT)-纤维素柱层析法
❖ 核酸是分子生物学实验的主要研究对象, 许多分子生物学实验的第一步都要进行 核酸的提取,如PCR、基因测序及分子 克隆等.
❖ 提取核酸的种类:真核细胞基因组DNA、 质粒DNA、总RNA及mRNA
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❖ 提取的核酸样品的完整性和纯度直接 关系到最后实验的结果
❖ 鉴定技术 : 分光光度技术:样品定量、纯度鉴定 凝胶电泳技术:样品定量、纯度鉴定 分子量测定 、分离核酸片段
聚丙烯酰胺凝胶电泳
琼脂糖凝胶电泳
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二、DNA片段的回收
(一) 原则与要求
1.提高DNA片段的回收率
2.除去回收DNA样品中的污染
(二) 回收方法:
1.DEAE纤维素膜插片电泳法 琼脂糖凝胶
2.电泳洗脱法
3.压碎与浸泡法
聚丙烯酰胺凝胶
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第三节 质粒DNA的提取与纯化
沉淀(质
粒DNA溶于上清液中) 取上清液
无水乙醇沉淀质粒DNA 70%乙醇洗涤
质粒DNA
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二、质粒DNA的回收 提取纯化的质粒DNA
凝胶电泳 回收
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第四节 RNA的分离与纯化
rRNA 80~85% tRNA 15~20% 总RNA mRNA 1~5%
oligo (dT)-纤维素液相结合离心法
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第五节 DNA测序
❖ 主要方法: 双脱氧末端终止法 Maxam-Gilbert化学降解法 DNA自动化测序
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一、双脱氧末端终止法
原理: 模板:单链DNA(待测序的DNA) 酶:大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ 引物:5`端标记的寡核苷酸链 底物:dNTP(AGCT)
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②纯度鉴定 a 紫外分光光度法: 测A260/A280的比值判断是否有蛋白质污染 (为什么) A260/A280比值为1.8,纯DNA A260/A280比值为2.0, 纯RNA b 荧光光度法:用溴化乙锭为染料示踪核 酸电泳结果判断纯度
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③完整性鉴定:用溴化乙锭为染料示踪核酸 电泳结果判断完整性。 2)核酸的保存
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第一节核酸分离与纯化的基本过程
一、材料与方法 1.材料:血液、尿液、唾液、组织、培养细胞
2.方法: 保证核酸一级结构的完整性
原则 排除其他分子的污染,保证样品的纯度
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二、技术路线 1.核酸的释放 破碎细胞,释放核酸 方法:机械法 破坏线性DNA 非机械法 2.核酸的分离与纯化 大分子污染物 污染物 非需要的核酸分子 对后续实验有影响的溶液和试剂
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3.核酸的浓缩、沉淀与洗涤 浓缩: 沉淀:有机溶剂沉淀法 原理: 洗涤:用70%~75%乙醇去除沉淀中的盐
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4、鉴定与保存 1.)核酸的鉴定 浓度、纯度、完整性 ①浓度鉴定 a 紫外分光光度法 260nm 在标准条件下,1个吸光度单位相当于 50g/ml的双链DNA 38g/ml的单链DNA或RNA 33g/ml的单链寡聚核苷酸 b 荧光光度法 荧光染料:溴化乙锭 发出橙红色荧光
一、提取与纯化
基本过程:
细菌培养
细菌裂解
提取质粒
1.提取方法: 碱裂解法 煮沸裂解法
SDS裂解法 2.纯化方法:
氯化铯-溴化乙锭等密度梯度超速离心法(CsCI-EB法) 聚乙二醇沉淀法
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裂解细胞 pH12.0~12.6 细胞蛋白质、染色体变性
释放质粒DNA
调pH中性
质粒DNA恢复天然结构 高浓度盐
ddNTP(AGCT)
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反应体系:四组独立的反应体系 每组均含有dNTP(AGCT) ddNTP(一种)
操作: 1.获得标记片段组 2.电泳 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 3.显影 4.读序
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二、Maxam-Gilbert化学降解法
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① DNA的保存 pH 影响DNA稳定性 pH7.0~8.0 EDTA 减少二价金属离子 氯仿 防止细菌污染 温度 低温 -70℃ 保存数年 4 ℃保存
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② RNA的保存 a 0.3mol/L的醋酸钠或双蒸水,-70℃~-80 ℃。若加入RNA酶抑制剂可延长保存时间。 b 将RNA沉淀溶于70%乙醇溶液或去离子的 甲酰胺溶液中,-20 ℃可长期保存。
mRNA 一、RNA制备的条件与环境
RNase 注意:1.细胞外RNase的污染
2. 抑制细胞内RNase
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措施:1.洁净的实验室 2.戴手套与口罩 3.一次性的实验材料和新包装的试剂 4.玻璃器皿用DEPC处理 5.冰浴条件下进行操作
19第Biblioteka 9页/共32页二、总RNA的分离与纯化
待测DNA标记 四组独立反应体系 针对某一种碱基进行切割
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三、 DNA测序自动化 DNA自动测序仪,凝胶电泳、数据收集、
序列分析均自动化。 原理:四组反应体系均含有dNTP和
ddNTP及一种荧光标记的引物,并且四组反应 体系的引物用不同颜色的荧光染料标记。
小量分装保存
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第二节 基因组DNA的分离与纯化
一、分离与纯化的方法
1.酚抽提法:
EDTA 裂解缓冲液 SDS 裂解细胞
蛋白酶K
RNA酶
pH8.0的Tris饱和酚抽提 醋酸铵、无
水乙醇沉淀
70%乙醇洗涤 DNA
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2.DNA样品的进一步纯化 方法: 透析、层析、电泳、选择性沉淀