叶酸代谢能力基因检测操作流程

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MTHFR C677T , MTHFR A1298C, MTRR A66G基因检测操作流程实验流程

一、操作步骤

适用仪器:普通PCR仪

样本要求:EDTA抗凝剂的静脉全血(100µl),室温保存不超过7天,2~8℃保存不超过1个月,-20℃保存不超过3个月,反复冻融次数不超过5次;DNA的浓度应不低于5ng/μl,A260/ A 280应在1.6~2.0之间。有血块的样本需经匀浆处理或用组织研磨仪研磨处理后再进行全血DNA的提取。

检验方法:(试剂盒中的检本测卡、阳性/阴性对照卡上标识解释如下:M表示突变型,WT表示

野生型,C表示质控线,T表示检测线。)

A:样本DNA的制备

试剂盒准备工作:

1、清洗液BW-I:用50 ml量筒分别移取35 ml无水乙醇(分析纯)和35 ml异丙醇加入至清洗液BW-I试剂瓶中,颠倒混合均匀,在试剂瓶上标明“已加入醇”和日期,备用。

2、清洗液BW-II:用50 ml量筒移取49 ml无水乙醇加入至清洗液BW-II试剂瓶中,颠倒混合均匀,在试剂瓶上标明“已加入醇”和日期,备用。

3、蛋白酶K准备:取出蛋白酶K,室温解冻,涡旋混匀后备用。

4、磁性微粒准备:将磁性微粒涡旋混匀,保证均一。

实验操作步骤:

1.将20 μl蛋白酶K溶液加入2 ml 离心管的管底。依次加入100 μl全血、200 μl裂解液

BL,用涡旋振荡器混合15 sec(以下简称涡旋混匀),56 ℃水浴20 min。

2.向步骤1裂解处理的样品中依次加入300 μl结合液BI、25 μl的磁性微粒(移取前必须充

分涡旋混匀),涡旋混匀,室温静置5 min。磁性分离5 min,弃上清。

3.从磁性分离器上取出离心管,加入400 μl清洗液BW-I,涡旋混匀,磁性分离至上清澄清(期

间上下颠倒数次,以清洗离心管管壁),弃上清;重复本步操作,以400μl清洗液BW-I重复清洗一次。

4.从磁性分离器上取出离心管,加入400 μl清洗液BW-II,涡旋混匀,磁性分离至上清澄清(期

间上下颠倒数次,以清洗离心管管壁),弃上清(尽可能弃去所有的清洗液BW-II)。

5.打开离心管盖,将其室温晾干5 min。

6.从磁性分离器上取下离心管,向管中加入100 μl 洗脱液ES,涡旋混匀,56℃水浴5 min。

7.将离心管置于磁性分离器上,磁性分离至上清澄清。将上清液(分离纯化得到的DNA溶液)

转移到2 ml离心管中,直接用于下游实验或于-20 ℃保存备用。

B:PCR扩增液准备

(1)每人份需做两个反应,取两个无菌0.2ml PCR薄壁管,在PCR薄壁管管盖上依次标有M、WT。

(2)将试剂从-20℃取出平衡至室温,瞬时离心。在标有M的管中加入29µl 扩增液(M),在标

有WT的管中加入29 µl扩增液(WT)。

(3)分别向以上M和WT各管中加入1µl反应液。将管盖盖紧后,涡旋混匀,瞬时离心待用。C:待检测DNA样本的配制

在上述标有M、WT管中分别加入3µl待测基因组DNA,分别再加入17µl ddH2O使终体积为50 µl。将管盖盖紧后,涡旋混匀,瞬时离心。

D:PCR扩增

将PCR管放入PCR仪中,按如下程序扩增:50℃ 2min;95℃ 5min;94℃ 30sec、60℃ 30sec、65℃ 1min(26Cycles);65℃ 10min;4℃ Hold。取出PCR产物,2~8℃保存。

E:检测卡检测实验

从密封袋中取出检测卡,将待测样本M与WT管中的PCR产物分别滴加在检测卡对应的样品垫处,待2~5 min对结果进行判读,20min后结果不可靠。

F:质量控制

(1)检测结果中阳性对照应在阳性对照卡检测线(T线)出条带,阴性对照应在阴性对照卡检测线(T线)不出条带。正常检测时,应定期进行阳性对照品及阴性对照品实验。

(2)阳性对照品实验:取两个无菌0.2ml PCR薄壁管,在PCR薄壁管管盖上依次标有M、WT,将20µl M阳性对照液、20µl WT阳性对照液分别加入标有M、WT的PCR薄壁管中,再依次分别加入M扩增液29µl及1µl反应液、WT扩增液29µl及1µl反应液,按照步骤中D~F完成,检测线(T线)及质控线(C线)均应出现条带。

(3)阴性对照品实验:取两个无菌0.2ml PCR薄壁管,在PCR薄壁管管盖上依次标有M、WT,将M扩增液29µl、1µl反应液及WT扩增液29µl、1µl反应液分别加入标有M、WT的PCR薄壁管中,再分别加入20µl阴性对照液,按照步骤中D~F完成,质控线(C线)应出现条带,检测线(T线)应无条带出现。

G:结果判读(如下图、下表)

如上图一所示,以阳性对照液为模板进行PCR反应,对PCR产物进行检测,检测线(T线)有

条带出现,作为阳性对照;以阴性对照液为模板进行PCR 反应,对PCR 产物进行检测,检测线(T 线)无条带出现,为阴性对照。若阴性样本有条带出现,有可能加样时未及时更换吸头,有DNA 污染,建议在操作过程中,先配制阴性对照管并及时闭合PCR 管盖。图二显示MTHFR 677CC 表示正常野生型;图三显示MTHFR 677TT 表示一对等位基因的第677位胞嘧啶(C )均变为胸腺嘧啶(T ),即纯合突变;图四显示MTHFR 677CT 表示其中一个等位基因的第677位胞嘧啶(C )变为胸腺嘧啶(T ),即杂合突变;图五质控线(C 线)无条带或质控线(C 线)与检测线(T 线)均无条带,即为无效检测。无效原因可能为操作不正确或试纸条已变质损坏。应再次仔细阅读说明书,并用新的检测卡重新检测。如果问题仍然存在,应立即停止使用该批号产品,并与厂家或供应商联系。

H :注意事项

(1)实验室应该遵循PCR 实验规范的要求分区操作,各区物品均为专用,不得交叉使用,加模板和引物的移液器不能混用,每次加样后均需更换吸头,推荐使用无核酶、带滤芯的吸头。各区的仪器、设备和工作服应独立使用。

(2)本试剂盒用于体外操作。用户切勿吸入试剂或直接接触皮肤。

(3)使用本试剂盒前,请仔细阅读说明书,严格按照说明书的要求操作。打开包装后请尽快使用。

(4)使用本试剂盒时,因PCR 体系为50µl 体系,应使用200µl 的PCR 扩增管进行操作。

(5)本试剂盒备有“PCR 组分加入确认单”,在【检测方法】中的步骤B(PCR 扩增系统的准备)和C(待图二 野生型 图三 纯合突变 图一 阳性及阴性对照 图五 无效图

图四 杂合突变

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