第七章数量性状遗传参数估测_PPT幻灯片

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是个体内方差。 2W = VEs
重复力估测
• •
re =
VG+VEg VP
= VG+VEg
=
2B
VG+VEg+Ves
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
2B+ 2W
• = MSB-MSW
（ MSB估计的是 2W+n2B）
•
MSB+（n-1）MSW
（ MSW估计的是 2W）
• MSB=SSB/dfB MSW =SSB/dfW SSP=SSB+SSW dfP=dfB+dfW
•
bOP = VA / VP = h2
h2 = 2bOP
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②上下代方差相同，子代两性间方差不相同。
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需分别求女儿和儿子对亲本的回归，并
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经矫正后计算遗传力。
遗传力的估测
• 2 由同胞关系估测遗传力
• ①半同胞相关（Half-sib correlation）法（组内相关系数）
• • r（HS）=
•
2S
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Q..>1时,用 第I次度量值估测准确。
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Q<1 时，用第j次度量值估测准确
第四节 遗传力
• 遗传力的概念：
• 1 广义遗传力（heritability in the broad sense）数量性 状基因型方差占表型方差的比率。H2=VG/VP。
• 2 狭义遗传力（ heritability in the narrow sense）数量性
COVOP=COVG（OP）=∑1/2A（A+R）/ N
• 由于∑AR=0
∴ COVG（OP）= 1/2∑A2 / N = 1/2VA
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bOP=1/2（VA /2P ）=1/2（ VA /VP ）= 1/2 h2
h2 = 2bOP
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子代对双亲均值的回归
•
COVOP = COVG（OP）=∑A（A+R）/ N = VA
• 根据不同次记录与所有记录平均数的相关系数，确定用那一次记
录来估测后期产量最可靠。
• • •
rPi P =
COVPiP Pi P
= 2Pi = Pi = Pi P P
Vpi = VP（n）
1-（n-1）ri n
• • •
rPjP =
1-（n-1）rj n
Q = rPi P rPjP
= 1-（n-1）ri 1-（n-1）rj
• 根据n 次度量记录,评定个体育种值:
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AX= ( Pi - P ) h2(n) + P
n h2
• •
AX
=
(
Pi
-
P
) 1+（n-1）re
+
P
重复力的用途
• 5 根据早期的记录估测后期的产量 重复力的大小反映不同度量值间的重复程度，对于重复力高的性 状，早期产量高的个体，其后期的产量也高，早期产量低，后期 产量也低。
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状育种值方差占表型方差的比率。h2=VA/VP。
• 3 已实现的遗传力（realized heritability）子代选择
•
反应占亲代选择差的比例。
遗传力的表达方式
• 1遗传力是育种值对表型值的决定系数。 h2 = dPA = A2 / P 2 • 2 表型各组分间无相关时，遗传力是育种值对表型值的回归系数。
SPAP SSP
P ·
A
=
bAP
·
P =
A
h2
·
1 h
=
h
•
•
h2 = r2AP
遗传力的估计原理
• 只有通过亲属关系才能估计遗传力. rA
• 亲属间没有环境相关,
R1 A1 A2 R2
• 基因型值与剩余值无相关,则
hh
• P1和 P2个体间的相关系数
• rP=hrAh=h2rA h2=rP/rA
•
•
亲缘个体为全同胞关系
•
h2=rP(HS)/rA(HS) =rP(HS)/0.25= 4rP(HS)
遗传力的估测
• 1 由亲子关系估测遗传力
•
----亲子回归法（Offspring-Parent regression）
• ①上下代方差相同，两性间方差也相同。
• 子代对一个亲本的回归
• bOP = COVOP/2P
根据不同的亲缘关系,
P1 P2
•
可计算出遗传力.
rP
遗传力的估计原理
• 亲缘个体为同卵双胞胎或自交后代
•
h2=rP(MT)/rA(MT) =rP(MT)/1= rP(MT)
• 亲缘个体为亲子关系
•
h2=rP(OP)/rA(OP) =rP(OP)/0.5= 2rP(OP)
• 亲缘个体为全同胞关系
•
h2=rP(FS)/rA(FS) =rP(FS)/0.5= 2rP(FS)
• 一般环境方差（General environmental variance）:
• 在时间上持久 或空间上非局部的条件所造成的环境方 差，是个体间方差的 一部分。
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VE = VEg+ VEs
2B = VG+ Veg
• 特殊环境方差（Special environmental variance）
•
是暂时的或局部的条件造成的环境方差，
重复力的用途
• 3. 判断遗传力估计是否正确
• re = （VG+VEg）/ VP
H2 = VG/ VP
h2 = VA/ VP
• re > H2 > h2 重复力是遗传力的上限。
• 4. 综合评定畜禽育种值
• •
h2(n) =
VA VP(n)
=
n 1+（n-1）re·
VA VP
n h2 = 1+（n-1）re
MSS – MSW
=
MSS—公畜间均方
2S+ 2W MSS+（n0-1）MSW MSW —公畜内女儿间均方
• n0 是公畜的女儿头数。
•
当公畜的女儿数不等时
：
• A = h2 P
即 h2 = bAP
∵ ∑SPAR = 0
• h2 = 2A/ 2P=SSA/ SSP =（SSA+SPAR）/ SSP = SPAP / SSP = bAP
• 3 遗传力是育种值与表型值的相关系数的平方，是用表型值估计
育种值准确性的度量。
• • •
rAP = COVAP/ AP =
重复力概念
• 某一性状在多个家畜中进行多次度量，同一个 体多次 度量值间 的差异称为个体内（组内） 方差 （inter-individual variance），
• 不同个体间多次度量值的差 异称为个体间（组
间）方差（intra- individual variance）。
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VP= 2B+ 2W
•
环境方差的剖分
• SSB =n∑k（Xj-X）2
SSW
k
=∑
∑n（Xji-Xj）2
i = n j= k
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dfB = K-1 dfW = K（n-1） K是个体数 n 是度量次数
•
SSP =∑kn（Xji-X）2
dfP = nK-1
•
当个体间度量次数不等时，用加权平均数
• •
度量n0
n0 =
1（ k-1
∑nj-
∑n2j ） ∑nj