并行算法的设计与分析》培训课件
并行计算_多媒体课件_并行算法设计与分析_ch06_Parallel_Search
若x找到,进行了1次比较;
若未找到,确定出在某一子段内继续查找,子段长不超过(N+1)g-1-1
由归纳假设,在每一子段中查找至多需g-1次比较,所以g次一定能在S中找到。
2020/1/23
Y.Xu Copyright
USTC
Parallel algorithms 8 / Ch6
6.2 SIMD共享存储模型上有序表的搜索
6.5 网孔连接的SIMD模型上随机序列的搜索
6.5.2 示例: S={1,2,3,4,8,7,6,5,9,10,11,12,16,15,14,13}, x=15
6.2.2 SIMD-CREW上的搜索
并行N+1分查找算法时间复杂性分析
其次再证至少需要g次比较。
比较1次之后,各子段的长度为
nN N 1
nN N 1
n 1 1 N 1
n
所以,经过g次比较之后,剩下的序列长度至少为(N
1 1)g
1
要完成搜索,则至少应有 n
(N
1 1)g
1
0
==> g≥log(n+1)/log(N+1)
综上, g log(n 1) / log(N 1)
证毕。
由定理知:并行N+1分查找算法 时间: t(n)=O(logN+1(n+1)) 成本: c(n )=O(NlogN+1(n+1))
2020/1/23
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2020/1/23
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Parallel algorithms 2 / Ch6
并行计算概述PPT课件
• 第一篇 并行计算的基础 • 第一章 并行计算机系统及其结构模型 • 第二章 当代并行机系统:SMP、MPP和Cluster • 第三章 并行计算性能评测
• 第二篇 并行算法的设计 • 第四章 并行算法的设计基础 • 第五章 并行算法的一般设计方法 • 第六章 并行算法的基本设计技术 • 第七章 并行算法的一盘
桥
系统 I
节点 2
节点 N
SAN(e.g.Myrinet)
I/O总 线 ,系 统 总 线
接口
LAN(e.g.以 太 网 ,FDDI)
系统 II
2021/8/11
15
第15页/共84页
网络性能指标
• 节点度(Node Degree):射入或射出一个节点的边数。在单向网络中, 入射和出射边之和称为节点度。
2
N / 2向)
4
2( N 1)
N
4
N 1
2N
4
2 N/2
2N
3 2loN g 1
1
非
N 1
是
N
非
2(N N)
非
2N
是
2N
非
N 1
星形
2
N N 1
超立方
N 2n
n
n
非 N / 2
是
N/2
N 1 nN/ 2
立方环
Nk2k
3
2k1k/2 N/(2k)
是
3N/ 2
2021/8/11
24
第24页/共84页
动态互连网络 (1)
1100
1110 1101
1111
0010
0011
1010
14并行算法设计(PCAM)讲解
从问题描述开始设计并行算法
方法描述
从问题本身描述出发,不考虑相应的串行算 法,设计一个全新的并行算法。
评注
挖掘问题的固有特性与并行的关系; 设计全新的并行算法是一个挑战性和创造性
的工作;
借用已有算法求解新问题
通信:原来是一个整体,不需要通信,分解后 各个部分之间存在交流了,即通信。
通信属于额外成本,越少越好。
组合:任务组合形成更大的任务,目的是减少 通信。
映射:并行程序的实现过程。
图中:三个处理器,有六个任务,怎样安排来 执行的问题。
PCAM设计方法学
设计并行算法的四个阶段
划分(Partitioning) 通讯(Communication) 组合(Agglomeration) 映射(Mapping)
映射(实现的考虑,系统来做)
方法描述 负载平衡算法 任务调度算法 映射判据
方法描述
每个任务要映射到具体的处理器,定位 到运行机器上;
任务数大于处理器数时,存在负载平衡 和任务调度问题;
映射的目标:减少算法的执行时间
并发的任务 不同的处理器 任务之间存在高通讯的 同一处理器
权重轮询调度算法(Weighted Round-Robin Scheduling)
上面所讲的轮询调度算法并没有考虑每台 服务器的处理能力,在实际情况中,可能并不 是这种情况。由于每台服务器的配置、安装的 业务应用等不同,其处理能力会不一样。所以, 我们根据服务器的不同处理能力,给每个服务 器分配不同的权值,使其能够接受相应权值数 的服务请求。
该算法形式化描述如下:
(2024年)并行计算第并行算法的设计ppt课件
运用并行计算技术加速基因序列的比对和分析,促进生物医学研究 的发展。
28
工程仿真领域
01
流体动力学仿真
通过并行算法模拟流体的运动状 态,以优化飞行器、汽车等交通 工具的设计。
02
03
结构力学仿真
电磁场仿真
利用并行计算技术对建筑物、桥 梁等结构进行力学分析和优化, 提高工程安全性。
运用并行算法模拟电磁场的分布 和传播,以改进电子设备和通信 系统的性能。
高速互联网络
用于连接处理器和存储器,提供高带宽和低延迟 的数据传输,保证并行计算的效率。
2024/3/26
5
并行计算的软件支持
并行编程模型
包括消息传递模型、数据并行模型和 共享内存模型等,为并行计算提供抽 象的编程接口。
并行编程语言
如MPI、OpenMP、CUDA等,这些 语言提供对并行硬件的直接支持,使 程序员能够方便地编写并行程序。
2024/3/26
并行最长公共子序列算法
通过并行处理多个子序列的比较和合并操作,加速 最长公共子序列的求解过程。
并行最短编辑距离算法
将编辑距离的计算过程拆分成多个步骤,每 个步骤可以在多个处理单元上并行执行,从 而加快计算速度。
18
04
现代并行算法设计
2024/3/26
19
分布式并行算法
2024/3/26
11
并行算法的性能评价
加速比
衡量并行算法相对于串行算法的速度提升程度。
效率
衡量并行算法在给定资源下的性能表现。
2024/3/26
12
并行算法的性能评价
• 可扩展性:衡量并行算法在增加处理单元 数量时的性能提升能力。
并行算法的设计与分析课件
2.3 分治策略
n设计思想
• 将原问题划分成若干个相同的子问题分而治之,若子问题仍然
较大,则可以反复递归应用分治策略处理这些子问题,直至子 问题易求解。
n求解步骤
• 将输入划分成若干个规模相等的子问题; • 同时(并行地)递归求解这些子问题; • 并行地归并子问题的解成为原问题的解。
n示例
• SIMD-SM模型上的FFT递归算法
Parallel Algorithms 3 / Ch2
2.1 平衡树方法
n算法2.1 SIMD-SM上求最大值算法
Begin for k=m-1 to 0 do for j=2k to 2k+1-1 par-do A[j]=max{A[2j], A[2j+1]} end for end for
end
时间分析 t(n)=m×O(1)=O(logn) p(n)=n/2 c(n)=O(nlogn) 非成本最优
2023/10/19
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Parallel Algorithms 4 / Ch2
2.1 平衡树方法
前缀和
n 问题定义
n个元素{x1,x2,…,xn},前缀和是n个部分和: Si=x1*x2*…*xi, 1≤i≤n 这里*可以是+或×
for j=1 to n/2h par-do B[h,j]=B[h-1,2j-1]*B[h-1,2j]
end for end for
时间分析:
(3)for h=logn to 0 do //反向遍历
for j=1 to n/2h par-do (i) if j=even then //该结点为其父结点的右儿子 C[h,j]=C[h+1,j/2]
《并行程序设计导论》第四章
并行程序设计导论第四章:并行算法的设计与分析并行算法是并行程序设计的核心,它直接影响着程序的性能和效率。
本章将介绍并行算法的设计方法,分析并行算法的性能,并探讨如何评估并行算法的效率。
一、并行算法的设计方法1.分治法分治法是一种常见的并行算法设计方法,它将问题分解成若干个子问题,分别解决后再合并结果。
分治法的关键在于子问题的划分和结果的合并。
在并行计算中,分治法可以充分利用多核处理器的并行性,提高程序的执行效率。
2.流水线法流水线法是一种将计算过程分解成多个阶段,每个阶段由不同的处理器并行执行的算法设计方法。
在流水线法中,数据在各个阶段之间流动,每个阶段只处理部分数据。
这种方法可以充分利用处理器的计算能力,提高程序的执行效率。
3.数据并行法数据并行法是一种将数据分解成多个部分,每个部分由不同的处理器并行处理的算法设计方法。
在数据并行法中,每个处理器处理相同的数据结构,执行相同的操作。
这种方法可以充分利用处理器的计算能力,提高程序的执行效率。
二、并行算法的性能分析1.时间复杂度时间复杂度是衡量算法性能的一个重要指标,它表示算法执行时间与输入规模之间的关系。
在并行算法中,时间复杂度通常表示为多个处理器执行时间的总和。
对于一个并行算法,我们希望其时间复杂度尽可能低,以提高程序的执行效率。
2.加速比加速比是衡量并行算法性能的另一个重要指标,它表示并行算法执行时间与最优串行算法执行时间的比值。
加速比越高,说明并行算法的性能越好。
在实际应用中,我们希望并行算法的加速比尽可能接近处理器的核心数量。
3.可扩展性可扩展性是衡量并行算法性能的另一个重要指标,它表示算法在增加处理器数量时的性能变化。
对于一个好的并行算法,我们希望其在增加处理器数量时,性能能够得到有效提升。
三、并行算法的效率评估1.性能模型性能模型是一种用于评估并行算法效率的工具,它将算法的性能与处理器数量、数据规模等因素联系起来。
通过性能模型,我们可以预测并行算法在不同条件下的性能表现,为算法设计和优化提供依据。
(2024年)并行程序设计课件Chapter2
实例4
并行图像处理程序,利用MPI进行图像处理 的并行化,加速了图像处理过程。
24
06 OpenMP并行编程实践
2024/3/26
25
OpenMP基本概念及功能
OpenMP是一种支持多平台共享内存并行编程的API,在C/C和Fortran中 广泛使用。
它提供了一种简单、灵活的线程并行编程模型,程序员可以使用OpenMP 的编译器指令来明确地指示程序的并行部分。
同步和互斥
使用`#pragma omp critical`、 `#pragma omp barrier`等指令 来实现线程间的同步和互斥操作 ,确保并行执行的正确性。
2024/3/26
27
OpenMP并行程序设计实例分析
1 2
矩阵乘法
通过将一个矩阵乘法操作拆分为多个小的矩阵块 ,并使用OpenMP的并行for循环来实现并行计 算,提高计算效率。
2024/3/26
16
线程概念及作用
线程定义
线程是操作系统能够进行运算调度的 最小单位,是进程中的实际运作单位 。
线程作用
线程可以实现并发执行,提高CPU的 利用率,同时降低程序的开发难度和 复杂性。
2024/3/26
17
多线程实现方式
2024/3/26
用户级线程
01
由用户程序实现,不依赖于操作系统核心,应用提供创建、同
并行排序
使用OpenMP的并行区域和同步操作来实现并行 排序算法,如并行快速排序、并行归并排序等。
3
并行图像处理
将图像处理算法中的循环操作使用OpenMP进行 并行化,提高图像处理的速度和效率。
2024/3/26
28
并行算法课件第二章
S' WS pW p WS pW p WS p W p/ p WS WP
• 并行开销W o :
S' f p (1-f) p f (1-p) p-f (p-1)
S' WS pWP f p1 f
WS WP WO 1 WO /W
工作负载W 执行时间T
2.2.4 Sun 和 Ni定律
• 基本思想:
– 只要存储空间许可,应尽量增大问题规模以产生更好和更精确的解 (此时可能使执行时间略有增加)。
– 假定在单节点上使用了全部存储容量M并在相应于W的时间内求解之, 此时工作负载W= fW + (1-f)W。
– 在p 个节点的并行系统上,能够求解较大规模的问题是因为存储容量 可增加到pM。令因子G(p)反应存储容量增加到p倍时并行工作负 载的增加量,所以扩大后的工作负载W = fW + (1-f)G(p)W。
并行度:算法的并行度是指该算法中能用一个计算步(并行)完成的运算或 操作的个数。在并行机上即为可同时运算的处理机的数目,而在向量 机上则为向量操作的长度。
平均并行度:算法的平均并行度为该算法总的操作数除以计算步数。在向 量机上则是平均向量长度。
算法的相容性:如果当问题的规模 n 时,并行(向量)算法和
• 存储受限的加速公式 :
S''
fW 1 f GpW fW 1 f GpW / p
f
f 1 1 f
f Gp Gp/ p
• 并行开销W o:
S'
fW 1 f W Gp fW 1 f GpW / p WO
f
f
1
1 f Gp f Gp/ p WO /W
并行数据算法简介PPT幻灯片
被称作数据并行算法是因为它要对 大量数据同时进行操作。它甚至可 以解决那些第一眼看去属于串行的 操作。
机器模型
可以完成一般通信的并行机器模型以 Connection Machine System(简称CMS) 为基础。
前端计算机(冯诺依曼结构) 系统有两部分组成
一组Connection Machine 处理器
*
2 3
5
6 53
S
5 12346 12346
6 5
Q
31 5 5
5
3
3
<
=
5
E
1
24
34
6 5
24
分析正则语言的并行处理
每个处理器存放一个字符。例如:分析int a;
step1:用一个数组去代替这个字符,这个数组指的是在这9种状态下 读入当前字符之后的状态。数组的下标可以理解为读入这个字符之前的 状态。
K代表每个处理器,也可理解为每个处理器的下 标。
假如数组有a0, a1, a2, a3四个数。总共循环两次。
k: 0 1 2 3
j为1,执行后,a0不变,a1里存放的是a0和a1的和,a2不变,a3里 存放的是a2和a3的和。
j为2,执行后,a0 a1 a2不变,a3里存放的是a3和a1的和。其实a3里 存放的是最初的a0, a1, a2, a3的和。
每个处理器都有一个本地内存。对前端来说, 处理器组就好像一个存储器。处理器组与前端计算 机的内存总线相连,所以前端可以直接访问处理器 组的本地内存。处理器组扩大了前端的指令集,使 其可以对大量数据进行同时操作。
机器模型
对于运行在CMS上的程序,是由前端计算机 按照通常的方式执行。处理器组按照SIMD的方式 执行命令。一个从前端传来的简单的指令作用于多 个数据项,每个处理器负责一个数据或几个。
并行算法PPT课件
2021/3/12
《并行算法》 4 / Ch0
0.2 课程介绍: 内容、特点和学习方式
课程内容: ▪ 并行机结构模型、并行计算模型、并行算法基本知识; ▪ 非数值并行算法:排序、选择、组合搜索、串匹配、图论算法等; ▪ 数值并行算法:矩阵运算、线性方程组求解、FFT算法等; ▪ 并行计算理论。 ▪ 新增内容:多核计算和GPU上的并行算法
nature. But their existing applications are designed for uniprocessor systems. Their parallelization is required.
2021/3/12
《并行算法》 13 / Ch0
0.4 并行计算介绍: 几种实现方案
2021/3/12
《并行算法》 11 / Ch0
0.4 并行计算介绍: 为什么需要并行计算?(1)
Interest in parallelism since the very ancient era of computers(e.g. ILLIAC IV of 1967 had 64 processors)
0.2 课程简介: 课程在并行计算技术中的地位
算法理论
可计算性与
算法研究的
计算复杂性
数学基础
专业面博向士计生算机
算法设计与分析并行排序和 选择算法
C06-并行计算培训-并行算法设计与案例分析
矩阵的带状划分
• 16×16阶矩阵,p=4
P0 P1 P2 P3
0 4 8 12 1 5 9 13 2 6 10 14 3 7 11 15
P0 P1 P2 P3
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15
列块带状划分
行循环带状划分
矩阵的带状划分
并行算法设计与案例分析
谭光明 博士
tgm@
中国科学院计算技术研究所 国家智能计算机研究开发中心 计算机体系结构国家重点实验室
• 并行算法的一般设计过程 • 并行数值算法
– 矩阵乘法 – PDE
并行行算法的一一般设计过程
• 设计并行算法的四个阶段
– – – – 划分 通讯 组合 映射 Partitioning Communication Agglomeration Mapping
P 5
(5,5) (5,2) (2,5) (2,2)
P 6
(5,6) (5,3) (2,6) (2,3)
P 7
(5,7) (2,7)
P8
(5,0) (6,0) (5,1) (5,2) (6,1) (6,2)
P9
(5,3) (5,4) (6,3) (6,4)
P10
(5,5) (5,6) (6,5) (6,6)
方方法描述
增加粒度
• 在设计过程的划分阶段,致力于定义尽 可能多的任务以增大并行执行的机会。 • 大量的细粒度任务不一定能产生一个有 效的并行算法。 • 大量细粒度任务有可能增加通信代价和 任务创建代价
• 表面-容积效应:通讯量与任务子集的表面 成正比,计算量与任务子集的体积成正比
– 增大划分粒度有可能减少通讯量 – 增加重复计算有可能减少通讯量
并行计算多媒体课件并行算法设计与分析ch15GraphA.ppt
=G
Parallel Algorithms 17 / Ch15
15.3 图的连通分量
012345678
0100100101
1010010010
2001001000
3100100101 4010010010
=C
5001001000
6100100101
7010000010
8100100101
15.1 图的并行搜索
3.三种并行搜索示例 (1)p-深度优先搜索
6
5
4
1
7
2
3
9
8
(a) 图G
(5)
1
(1)
(1)
2
3
(2)
7
(2)
8
(3)
6
(6)
(3) 9
5 (4)
(7)
4
(b) 两个处理器的p-深度优先搜索
2019/10/20
优秀课件,精彩无限!
Parallel Algorithms 4 / Ch15
2019/10/20
优秀课件,精彩无限!
Parallel Algorithms 2 / Ch15
15.1 图的并行搜索
15.1.1 算法原理 1.并行搜索的一般方法
(1)建立一个主表和p个子表; (2)开始时主表空, 任取一个顶点作为待搜索顶点, 并置入主表; (3)p个处理器分别搜索与该顶点相邻的边, 将搜索到的顶点加入子表; (4)以一定的策略, 将子表链到主表, 并从主表中任取一个作为待搜索顶点; (5)重复(3)、(4)直至所有的顶点加入到主表.
ij有长为0或1的有向路径
对于B2=(A+I)2=(b(2)ij)n×n, b(2)ij=∨k=1~nb(1)ikb(1)kj, 这里∨为逻辑或
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• Knuth ==>
CO M(En,n)O(nlon)g
• 当m=n=2t时,不难推得
CO ME(n,n)2CO ME(n/2,n/2)n122CO ME(n/2,n/2)(n1)12
2CO ME(n/2,n/2)(n1)2(2CO ME(n/4,n/4)n/21)(n1)
22CO ME(n/22,n/22)(n2)(n1)...
2020/10/2
Parallel Algorithms 9 / Ch3
3.1.3 双调归并网络
1. 定义及定理
定义3.5: 一个序列a1,a2,…,an是双调序列(Bitonic Sequence),如果: (1)存在一个ak(1≤k≤n), 使得a1≥…≥ak≤…≤an成立;或者 (2)序列能够循环移位满足条件(1)
6
3
1
4
4
5
5
6
8
8
1级交叉比较
(2,2)偶归并
Parallel Algorithms 7 / Ch3
3.1.2 奇偶归并网络
3. 复杂性分析 比较器个数
C O M (m E ,n ) C O M (E m 2 ,n 2 ) C O m M (E m 2 ,n n 2 ) m 2 n 1 m m 1 1 n n
3.2 (m, n)-选择网络
3.2.1 分组选择网络 3.2.2 平衡分组选择网络
2020/10/2
Parallel Algorithms 2 / Ch3
3.1 Batcher归并和排序
3.1.1 比较操作和[0, 1]原理 3.1.2 奇偶归并网络 3.1.3 双调归并网络 3.1.4 Batcher排序网络
2020/10/2
Parallel Algorithms 3 / Ch3
3.1.1 比较操作和[0,1]原理
1. Batcher比较器
• 比较和条件交换操作: CCI • 比较器网络:用Batcher比较器连成的,完成某一功能的网络 • 假定:每次每个元素只能与另一个元素比较 • 比较器网络的参数:比较器数目、延迟级数
Parallel Algorithms 6 / Ch3
3.1.2 奇偶归并网络
2. 例:m=n=4 A=(2,4,6,8) B=(0,1,3,5)
(4, 4)奇偶归并2×(2, 2)奇偶归并+1级交叉比较
2 20
0
0
4 02
2
1
6 63
3
2
(2,2)奇归并
2020/10/2
8 36 0 41 1 14 3 85 5 58
3.1.2 奇偶归并网络
1. 网络构造
有序序列A:a1,a2,…,an B: b1,b2,…,bm
归并思想:
• A, B中奇数号元素进入奇
归并器;
• A, B中偶数号元素进入偶
归并器;
• 再将奇归并器与偶归并器
的输出进行交叉比较 注: (m,n)规模划分为:
m/2,n/2奇 m/2,n/2偶
2020/10/2
Parallel Algorithms
Chapter 3 Sorting and Selection on Comparison
Network
2020/10/2
Parallel Algorithms 1 / Ch3
主要内容
3.1 Batcher归并和排序
3.1.1 比较操作和[0, 1]原理 3.1.2 奇偶归并网络 3.1.3 双调归并网络 3.1.4 Batcher排序网络
(1) bi≤cj (1≤i, j≤n) (2) MIN和MAX序列仍是双调的
2020/10/2
Parallel Algorithms 10 / Ch3
3.1.3 双调归并网络
2. 网络构造(依据Batcher定理)
2n个输入的双调序列两两比较形成2个大小为n的MIN和MAX序列
MIN和MAX序列是双调的,可以递归重复进行下去
t1
t1
t1
2tCO ME(n/2t,n/2t) (n2i)nCO ME(1,1) n 2i
i0ห้องสมุดไป่ตู้
i0
i0
ntn(n1)nlogn1
2020/10/2
Parallel Algorithms 8 / Ch3
3.1.2 奇偶归并网络
3. 复杂性分析 延迟级数:穿过网络任一路线上的最多比较器数目
0
m 0或 n= 0
D O M (m E,n)
1
m n1
1mD aO M (x E m /2,n/2)D ,O M (E m /2,n/2) 其他
• 一般地有
D O M ( m E ,n ) 1 D O M ( m E /2 , n /2 )
• 当m=n=2t时,不难推得 D O M(En,n)long1
2020/10/2
Parallel Algorithms 13 / Ch3
3.1.3 双调归并网络
2020/10/2
Parallel Algorithms 4 / Ch3
3.1.1 比较操作和[0,1]原理
2. [0, 1]原理(定理3.1):
如果一个n输入的网络能排序所有2n种0,1序列, 那么它也能排序n个数的任意序列。
2020/10/2
Parallel Algorithms 5 / Ch3
MIN MAX
MIN
MIN
双 调
MAX
序
列
MAX
双 调 序 列
2020/10/2
MIN MAX
MIN MAX
Parallel Algorithms 11 / Ch3
3.1.3 双调归并网络
3. 例:双调序列(8,6,4,2,0,1,3,5)的(4,4)双调归并网络
8
80
6
08
MIN归并
0
1
4
61
2
16
0
43
1
34
2 3
MAX归并
4
5
2020/10/2
3 5
22 55
6 8
两两比较 2个(2,2)双调归并网络
Parallel Algorithms 12 / Ch3
3.1.3 双调归并网络
4. 复杂性分析
比较器数目
MIN比较器数 MAX比较器数 本级两两比较器数 当n=2t时 延迟级数
注:如何推导?
示例:
序列(1,3,5,7,8,6,4,2,0), (7,8,6,4,2,0,1,3,5)和(1,2,3,4,5,6,7,8)
都是双调序列。
ak
定理3.3(Batcher定理):
设序列a1,…,an,an+1,…, a2n是一个双调序列, 记 bi=min{ai, ai+n} ==> MIN={b1,…,bn}, ci=max{ai, ai+n} ==> MAX={c1,…,cn}, 则