王镜岩生化4-酶[2]PPT课件
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酶是非常有效的和特异性高的生物催化剂。酶催化反应条件
温和、常温、常压。酶催化的反应比相应的没有催化剂的反应
快103~1017倍。例如在0℃时,1mol过氧化氢酶能使5×106 mol
H2O2 分 解 为 H2O 和 O2 ; 而 在 同 样 条 件 下 , 每 克 离 子 铁 只 能 使 6×10-4mol H2O2分解,酶比铁离子快了1010倍。
光学异构性是指一种酶只能催化一对镜像异构体中的一 种,而对另一种不起作用。例如精氨酸酶只水解L-精氨酸生 成L-鸟氨酸和尿素,而对D-精氨酸没有作用。
几何异构性是指立体异构中的顺式和反式,-、-构型。 有的酶具有这种立体异构的专一性,如延胡索酸酶只能催化 延胡索酸(反丁烯二酸)加水生成苹果酸,对顺丁烯二酸不 起作用。
过渡态
无催化
自 由 能
自由能变化
活化能
a.无酶催化的反应
自 由 能
反应剂
催化
产物
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b.酶催化的反应
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纵坐标表示自由能(G),横坐标为反应过程。从图中 可以看到,S和P都含有一定的自由能,即处于称为基态的一 种稳定的状态。S和P之间的平衡反映了它们的基态自由能的 差别,它们之间存在着象座“ 山 ” 的能障,反应的底物必 须提高能量水平才能跨越能障。
酶作用的特异性分为绝对特异性、相对特异性和立体异构
特异性。
绝对特异性是指酶只能催化一种或两种结构极相似的化合
物的反应,如脲酶只水解尿素。而相对特异性是指酶可作用于
一类化合物或一种化学键,如脂肪酶或酯酶催化酯键水解,对
酯键两侧的基团要求不严格,对很多有机酸和醇(或酚)形成
的酯键都能水解。
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2
立体异构特异性是指酶作用的底物应具有特定的立体结 构才能被催化。这种异构性包括光学异构性和几何异构性。
低。
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4.4 酶催化作用发生在活性部位
酶分子一般都很大,但酶中真正起催化作用的部位只是酶
分子中某一部位,该部位称为酶的活性部位,活性部位是酶结
合和催化底物的场所。
活性部位是一个三维空间结构;通常位于酶蛋白的两个结
构域或亚基之间的裂隙,或位于蛋白质表面的凹槽。
活性部位是多肽链折叠形成的一个特殊的空间结构,一些
6. 连接酶:催化两个底物的连接反应或称之交联反应。这类 反应通常需要输入能量,例如腺苷三磷酸ATP。连接酶也常 称之合成酶。
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5
4.2 比活是酶纯化程度的指标
酶活性也称为酶活力,是指酶催化指定化学反应的能力。 酶活力的大小用酶活性单位的多少来表示。 比活是指每毫克蛋白含有的酶单位数。
猪肾氨基酰化酶各个步骤纯化数据
3. 水解酶:催化水解反应。这是特殊的一类转移酶,水作为转 移的基团的受体。
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4
4. 裂合酶:催化非水解和非氧化的底物的消除反应,或裂解, 生成一个双键。在裂解酶催化的可逆反应中,裂解酶催化一 个底物加到第二个底物的一个双键处。催化细胞内的加成反 应的裂解酶常命名为合成酶。
5. 异构酶:催化异构化反应。这类反应是最简单的酶促反应, 因为这些反应只有一个底物或一个产物。
4酶
4.1 酶可以按催化的反应类型分类 4.2 比活是酶纯化程度的指标 4.3 酶降低反应的活化能,但不会改变反应平衡 4.4 酶催化作用发生在活性部位 4.5 存在着几种解释酶催化作用的机制 4.6 米氏方程是表示酶促反应的速度方程 4.7 可逆抑制剂通过非共价键与酶结合 4.8 不可逆抑制剂共价修饰酶 4.9 酶促反应的速度受pH的影响 4.10 丝氨酸蛋白酶可以说明酶活性的许多特征 4.11 调节酶一般都是寡聚体 4.12 某些酶具有组织或器官特异性
是6到7,所以它是一个在中性pH下用于质子转移的理想的基
团。天冬氨酸和谷氨酸的羧基在某些酶中也可以充当酸碱催
化剂,因为这些羧基解离的pKα.值近似为4。
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用B:表示一个碱,或一个质子受体,而用BH+表示相应 的共轭酸,一个质子的供体。一个质子受体可以通过除去一个 质子切断C-H键形成一个负碳离子。
“ 山 ”顶处称为过渡态,因为具有过渡态能量的分子可
以转化为 S 或 P。从反应物化能用ΔG0 S→P,P→S的活化能 用ΔG0 P→S表示。而ΔG0 代表由S到P的整个标准自由能变化。 一个底物要转化为产物必须克服活化能障,升高反应温度可
以增加具有克服活化能障的底物分子数,但活化能并没有降
纯化步骤
粗提取液 丙酮分级 凝胶层析
级分体积 (ml)
1860
80
80
总蛋白 (mg)
6720
960
300
活力 (U) 13440
9600
8700
比活 (U/mg)
2
15
29
离子交换
22
90
4230
47
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4.3 酶降低反应的活化能,但不会改变反应平衡
一个简单的单底物的酶促反应可用下式表示。 E+S=ES=E+P 可以用相应反应历程图表示。
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4.1 酶的命名和分类是根据酶催化的反应
将酶按照酶催化的有机化学反应类型分为六大类型:
1. 氧化还原酶:催化氧化-还原反应。其中的大多数酶称之脱 氢酶,但有些也称之氧化酶、过氧化酶、加氧酶或还原酶。
2. 转移酶:催化基团转移反应。其中许多转移酶需要辅酶。通 常底物分子的一部分与酶或辅酶共价结合,这类酶包括激酶。
在氨基酸序列相距很远的氨基酸残基经折叠会靠近,有的就是
活性部位的组成成分,直接参与酶的催化作用。
对活性部位没有直接贡献的其它部位是形成和稳定酶天然
结构所需要的。当然酶的其它功能还包括调节功能和指导酶正
确定向于细胞中的信号部分。
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4.5 存在着几种解释酶催化作用的机制
4.5.1 几乎所有酶的作用机制都包括酸碱催化机制
在活性部位,离子化的氨基酸残基侧链参与两类化学催
化,即酸碱催化和共价催化,是两种主要的化学催化模式。
在酸碱催化中,一个反应的加速是通过催化一个质子转
移完成的。酶利用在细胞接近中性pH条件下可以给出或接受
质子的氨基酸侧链,酶的活性部位可以提供一个相当于强酸
或强碱溶液的生物环境。
由于在大多数蛋白质中,组氨酸侧链咪唑基解离的pK值
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也可参与涉及碳的其它键的断裂,例如一个C-N键的 断裂,通过B:在中性溶液中除去水分子的一个质子后产 生的一个等价的OH-来完成。
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4.5.2 许多酶催化的基团转移反应都是通过共价催化进 行的