PCR注意事项

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PCR操作规程

1. PCR试剂要做好预混和分装:所有的PCR试剂都应进行小量分装,PCR反应液应尽可能预先配制好,然后再小量分装,在-20℃下保存,以减少重复加样次数,从而避免污染机会。另外,PCR试剂、PCR反应液应当与样品及PCR产物分开保存,不可放于同一冰盒或冰箱。

2. 吸样枪污染防护:吸样枪是一个非常容易发生污染的设备。如操作时不慎将样品或模板核酸吸入枪内或粘在枪头上,将会成为一个严重的污染源,因而使用吸样枪时要格外小心,吸样要慢,并尽量一次性完成,忌多次抽吸,避免发生交叉污染或气溶胶污染。

3. 减少PCR循环次数:以PCR产物达到检测水平为宜。

4. 防止操作人员污染:使用一次性手套、吸头、小离心管。

5. PCR产物的电泳检测时间:一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚至消失。

PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及,④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。

实验操作注意事项尽管扩增序列的残留污染大部分是假阳性反应的原因,样品间的交叉污染也是原因之一。因此,不仅要在进行扩增反应是谨慎认真,在样品的收集、抽提和扩增的所有环节都应该注意:

1. 戴一次性手套,若不小心溅上反应液,立即更换手套;

2. 使用一次性吸头,严禁与PCR产物分析室的吸头混用,吸头不要长时间暴露于空气中,避免气溶胶的污染;

3. 避免反应液飞溅,打开反应管时为避免此种情况,开盖前稍离心收集液体于管底。若不小心溅到手套或桌面上,应立刻更换手套并用稀酸擦拭桌面;

4. 操作多份样品时,制备反应混合液,先将dNTP、缓冲液、引物和酶混合好,然后分装,这样即可以减少操作,避免污染,又可以增加反应的精确度;

5. 最后加入反应模板,加入后盖紧反应管;

6. 操作时设立阴阳性对照和空白对照,即可验证PCR反应的可靠性,又可以协助判断扩增系统的可信性;

7. 尽可能用可替换或可高压处理的加样器,由于加样器最容易受产物气溶胶或标本DNA的污染,最好使用可替换或高压处理的加样器。如没有这种特殊的加样器,至少PCR操作过程中加样器应该专用,不能交叉使用,尤其是PCR产物分析所用加样器不能拿到其它两个区;

8. 重复实验,验证结果,慎下结论。

a.煮胶时,胶液的量不应超过三角瓶容量的1/3,否则易溢出。

b.煮好的胶应冷却至50℃左右时再倒,以免制胶板变形,并减少漏胶的机会。

c.倒胶注意厚度(4-6 mm),充分凝固后再拔出梳子,以保持齿孔形状完好。也可待胶稍凝固后,放入4℃冰箱10多分钟,以加速胶的凝固。

d.加样前赶走点样孔中的气泡,点样时吸管头垂直,切勿碰坏凝胶孔壁,以免使带型不整齐。

e.一般情况下不必每点一个样品都换枪头,吸电泳缓冲液洗几次即可再点下一个样品。凝胶中含有EB,切勿直接用手接触胶,废弃胶应集中处理,勿乱丢。

DNA条带拖尾严重分析:

1.应该是里边残余的RNA条带吧。另外点样孔里有条带,建议抽提的时候少抽点

2.胶的质量、缓冲液ph、电泳电压(电泳电压太大了,跑得太快会拖尾),一般就考虑这几个方面

3.DNA上样量

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