马铃薯栽培品种‘合作88’细菌人工染色体文库的构建与评价
细菌人工染色体基因组文库构建方法的改进
细菌人工染色体基因组文库构建方法的改进
耿士忠;潘志明;张玉红
【期刊名称】《生物技术通讯》
【年(卷),期】2006(017)005
【摘要】目的:建立一种改进的更简便、易操作的细菌人工染色体(BAC)文库构建方法.方法:在构建猪霍乱沙门氏菌基因组大片段DNA的BAC文库时,对改进的基因组BAC文库构建方法和常规的BAC文库构建方法进行比较.结果:利用改进的方法可简便快速地构建猪霍乱沙门氏菌基因组BAC文库.结论:使用2种方法构建BAC文库,其转化效率,以及在BAC克隆中插入的DNA片段的大小和BAC克隆的稳定性等都相同,从而表明改进的方法更简单、更方便,它能使BAC文库的构建更为高效.
【总页数】3页(P728-730)
【作者】耿士忠;潘志明;张玉红
【作者单位】扬州大学,生物科学与技术学院,江苏,扬州,225009;扬州大学,生物科学与技术学院,江苏,扬州,225009;扬州大学,生物科学与技术学院,江苏,扬州,225009【正文语种】中文
【中图分类】Q813.4
【相关文献】
1.毛竹大片段双元细菌人工染色体基因组文库的构建 [J], 管雨;杨洋;张智俊;罗淑萍;汤定钦
2.毛竹大片段双元细菌人工染色体基因组文库的构建 [J], 管雨;杨洋;张智俊;罗淑萍;汤定钦
3.Cupriavidus necator JMP134细菌人工染色体基因组文库的构建与鉴定 [J], 张俊亚;宋任涛;许政暟;朱晨光
4.黑龙江野鲤细菌人工染色体基因组文库构建 [J], 耿波;关云涛;孙效文
5.细菌人工染色体基因组文库的构建及应用 [J], 任斐
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近5_年马铃薯基因组及重要性状基因研究进展
宁夏农林科技,Ningxia Journal of Agri.and Fores.Sci.&Tech.2023,64(11):6-11基金项目:马铃薯育种专项(2019NYYZ01-2)、国家自然科学基金(32260504)、宁夏自然科学基金(2021AAC05015)、宁夏回族自治区农业科技自主创新专项科技创新引导项目(NKYG-22-02)。
作者简介:巩檑(1981—),男,宁夏石嘴山人,理学博士,副研究员,主要从事马铃薯分子育种相关研究。
收稿日期:2023-09-06习近平总书记指出,“中国人的饭碗必须牢牢地端在自己手里”。
马铃薯具有适应性广、高产潜力大、营养全面等多种优势,不仅是三大主粮作物之外的重要补充,而且因主食和加工产品产业开发前景十分广阔,将给我国粮食安全提供更多保障。
我国70%左右的马铃薯集中种植于资源条件有限的西北、西南等地区,作为当地重要的粮食作物、经济作物和饲料作物,为地区经济发展贡献重要力量,已成为重要的支柱产业。
国家统计数据显示,自2015年我国农业部启动马铃薯主粮化战略以来,全国种植面积稳定在475.8万hm 2左右,单产逐年上升,2019年平均单产为3804.7kg/hm 2(折合原粮)。
2022年,我国马铃薯制品进出口总额5.41亿美元,其中出口4.24亿美元。
马铃薯产业对巩固脱贫攻坚成果、促进乡村产业振兴、粮食安全战略保障国家经济安全等方面均具有重要意义。
近5年马铃薯基因组及重要性状基因研究进展巩檑宁夏农林科学院农业生物技术研究中心,宁夏银川750002摘要:马铃薯是保障我国粮食安全的重要补充。
高质量的参考基因组和重要性状形成基因是分子育种工作的两个核心要素。
相对于水稻、小麦、玉米等作物分子育种的迅猛发展,马铃薯还处于常规育种向分子育种的转型阶段,尤其需要构建高质量参考基因组,挖掘并充分利用重要性状调控基因在辅助育种中的作用。
简要总结了近5年上述两方面的国内外研究现状和重要成果,简要分析了我国马铃薯分子育种面临的瓶颈问题,以期为马铃薯遗传育种等研究提供参考。
马铃薯种子培育技术
马铃薯种子培育技术作者:王卫东来源:《农民致富之友(上半月)》 2019年第23期王卫东一、马铃薯人工种子培育技术在现代化的发展中,我国的农业发展是非常的可观的,许多的农产品种子培育,是通过人工来进行的,这么做最终的结果是为了使农产品在产量和质量上得到很大的提升,我国对于农产品种子的培育技术不断地加强研究,目前,马铃薯人工种子培育技术应用在培育种子上已经逐渐成熟。
在人工马铃薯种子培育过程中,把没有病毒的马铃薯种子接种在液体的培养基上。
然后通过微型薯来进行诱导,关于培养基在整个诱导过程中是有一定要求的,当筛选出培养基上的微型薯以后,马铃薯人工种子就开始制作。
在整个人工培育种子的过程,会分别培育种皮和胚乳,然后通过人工对种皮和胚乳进行种子包埋,最终获得品质较高的马铃薯种子。
通过实验表明,人工培育的马铃薯种子在整体的种子出芽率和成活率明显高于普通的马铃薯种子。
人工马铃薯种子与普通马铃薯种子对比,是占有很大的优势的,在栽培的过程中,种植的方法一定要与种子相配合,使用科学的种植方式来种植优良的马铃薯种子,可以使马铃薯的产量和质量得到很大的提高。
实践证明,人工马铃薯种子的培育技术是农业发展的一个重要体现,也要根据实际的情况,在种植马铃薯时候,不但要对种子进行严格的筛选,也要注意种植的环境等等。
二、马铃薯无土培育技术1、马铃薯种子处理在种植马铃薯前,一定要把马铃薯的种子进行处理,一般情况下马铃薯的种子处理程序是三步。
第一步,消灭种子上的细菌,这样可以确保在培育马铃薯的过程中减少霉变的发生率。
第二步打破马铃薯休眠。
这一步的处理是为了促进马铃薯种子提早发芽,而且有利于发芽率的增长。
打破种子休眠的方法是对于温度是有要求的,在培养箱中保证温度在1度左右,不超过两度,也不可以低于零度。
第三步浸种催芽。
这一步操作所用的工具需要先使用乙醇消毒,然后加入定量的清水,而且要每天更换,一直到种子发芽为止。
2、马铃薯种子培育与管理把马铃薯种子处理好后,然后把马铃薯的苗进行三个阶段的培育。
马铃薯高产栽培技术文
1高寒山区马铃薯高产栽培技术吕文清巧家县炉房乡农业综合服务中心1高寒山区马铃薯高产栽培技术摘要: 合作88号是一个蒸食品质优,又适宜加工淀粉的全粉马铃薯新品种,由会泽县农业技术推广中心和云南师范大学与国际马铃薯中心(CIP)合作选育而成,随着淀粉加工厂的不断增多,对该品种的需求不断增加,合作88号的种植面积不断扩大,论述合作88号的特征特性及栽培技术。
一、概述.......................................................................................................................................- 4 -二、马铃薯的特征.......................................................................................................................- 4 -三、马铃薯脱毒技术...................................................................................................................- 4 -四、马铃薯露地栽培技术...........................................................................................................- 6 -(一)播种期与品种选择...................................................................................................- 6 - (二)切芽块.......................................................................................................................- 6 - (三)整地、施肥、播种...................................................................................................- 7 - (四)田间管理...................................................................................................................- 7 - (五)收获...........................................................................................................................- 8 - 五、马铃薯地膜栽培技术...........................................................................................................- 8 -(一)地膜覆盖增产原理...................................................................................................- 8 - (二)马铃薯地膜覆盖栽培技术.......................................................................................- 9 -一、概述马铃薯又名洋芋,原产于秘鲁和智利的高山地区,17世纪中叶由荷兰人传入中国,在我国已有300多年的栽培历史。
21_个马铃薯品种(系)在温州地区的引种表现和生长评价
㊀㊀2024年第65卷第4期913收稿日期:2023-12-08基金项目:温州市瓯海区科技特派员专项项目(2022OHKJ1471);浙江省农业科学院瓯海科创中心课题(2022OHKC0005)作者简介:叶友菊(1994 ),女,安徽当涂人,助理研究员,博士,研究方向为观赏植物育种,E-mail:yeyj@㊂通信作者:钱仁卷(1981 ),E-mail:qrj@㊂文献著录格式:叶友菊,陈义增,张涛,等.21个马铃薯品种(系)在温州地区的引种表现和生长评价[J].浙江农业科学,2024,65(4):913-915.DOI:10.16178/j.issn.0528-9017.2023117421个马铃薯品种(系)在温州地区的引种表现和生长评价叶友菊1,陈义增1,张涛2,张旭乐1,钱仁卷1∗(1.浙江省亚热带作物研究所,浙江温州㊀325005;2.温州市农业农村局,浙江温州㊀325005)㊀㊀摘㊀要:观测引种的21个马铃薯品种(系)在温州地区的生长情况,进行初步生长评价,明确马铃薯引种表现㊂采用固定样方,确定标准株,标准株上随机确定有代表性的观测枝,测定土豆硬度和产量㊂试验结果表明,21个引种马铃薯品种在温州地区均能够正常生长㊂其中豫商薯2号植株性状良好,产量最高,品质较佳,适合在温州地区进行推广㊂彩色马铃薯浙薯927生育时期适合温州耕作制度,性状良好,可作为彩色马铃薯代表品种(系)在温州地区进行推广种植㊂关键词:马铃薯;温州;引种;推广中图分类号:S532㊀㊀㊀文献标志码:A㊀㊀㊀文章编号:0528-9017(2024)04-0913-03Introduction performance and growth evaluation of 21potatovarieties (lines )in WenzhouYE Youju 1,CHEN Yizeng 1,ZHANG Tao 2,ZHANG Xule 1,QIAN Renjuan 1∗(1.Zhejiang Institute of Subtropical Crops,Wezhou 325005,Zhejiang;2.Wenzhou Agriculture and Rural Bureau,Wezhou 325005,Zhejiang)㊀㊀Abstract :The growth of 21introduced potato varieties (lines)in Wenzhou was observed,and the preliminary growthevaluation was conducted to clarify the performance of potato introduction.Fixed samples were used to determine standardseedlings,and representative observation branches were randomly determined on standard seedlings to determine potato hardness and yield.The results showed that the 21introduced potato varieties could grow normally in Wenzhou Area.Among them,Yushangshu 2has good plant characteristics,the highest yield and good quality,which is suitable for promotion in Wenzhou Area.The growth period of colored potato Zhejiangshu 927is suitable for Wenzhou farming system,with good characteristics,and can be promoted as the representative variety of colored potato in Wenzhou Area.Keywords :potato;Wenzhou;introduction;promotion㊀㊀马铃薯(Solanum tuberosum L.),是一年生茄科(Solanaceae)茄属(Solanum )植物,呈现块茎类,有土豆㊁洋芋等别名[1]㊂马铃薯是保障我国粮食安全的重要粮食作物之一,是除稻米㊁小麦㊁玉米之外的第四大主粮,在几十年前为我国解决温饱问题作出重要贡献[2-3]㊂马铃薯因富含淀粉㊁蛋白质㊁胡萝卜素和维生素等营养物质,也是常见的蔬菜鲜食,经常出现在老百姓的餐桌上[4]㊂此外,常见的马铃薯淀粉㊁马铃薯全粉等产品也是马铃薯加工后的主要产物,均受到消费者的喜爱[5]㊂马铃薯在全世界近200个国家和地区广泛种植,在我国多个省市也广泛分布[6]㊂其中浙江省近几年马铃薯播种面积在6万hm 2左右[7],是浙江省第二大薯类作物㊂温州市地处浙江省南部,属亚热带湿润季风气候,有着悠久的马铃薯种植历914㊀㊀2024年第65卷第4期史[8]㊂但是目前温州地区的马铃薯产业发展缓慢,主要是因为品种单一和更新慢等问题[9]㊂因此,本试验自2022年年底开始从浙江省农业科学院和金华市农业科学研究院引进浙薯56㊁浙薯927和豫商薯2号等21个马铃薯品种(系)在温州市进行品种适应性鉴定和产量比较试验,旨在筛选出适合温州市种植推广的优良品种(系),为后期温州地区推广种植马铃薯提供基础㊂1㊀材料与方法1.1㊀试验地概况㊀㊀马铃薯引种试验位于温州市泽雅镇天长村试验地(28.029ʎN,120.48ʎE)㊂试验地2022年的平均高温为23ħ,平均低温为14ħ,年日照时数1461.5h,年均降雨量1579.2mm㊂1.2㊀参试品种(系)㊀㊀参试马铃薯品种(系)有浙江省农业科学院提供的中薯3号㊁实验1号㊁浙薯56㊁浙薯59㊁闽薯㊁浙薯926和浙薯1086,以及金华市农业科学研究院提供的裕丰6号㊁中薯早47㊁中薯早35㊁浙薯934㊁中薯5号㊁陇芋1号㊁甘引9号㊁浙薯927㊁中薯早30㊁商马铃薯1号㊁豫商薯2号㊁豫商薯11号㊁兴薯36和浙薯956等马铃薯品种㊂1.3㊀试种方式㊀㊀供试的马铃薯材料为25~30g的整薯或块茎㊂2022年11月15日对试验田进行深耕翻犁,并施用有机肥15t㊃hm-2和45%硫酸钾型复合肥750kg㊃hm-2作基肥㊂播种前对大薯进行切块,采用纵切法,每个切块留1~2个芽眼且带有顶芽,每个薯块以25~30g为宜,25~50g的种薯直接进行整薯播种㊂播种前对各参试品种进行适当催芽㊂于11月30日进行人工点播㊂在出苗后及时破膜迎苗㊂其间用45%硫酸钾复合肥(N15%㊁P2O515%㊁K2O15%)150kg㊃hm-2兑水浇施㊂2023年4月20日进行马铃薯采收㊂1.4㊀调查项目及方法㊀㊀马铃薯生长期观察记载物候期㊂每一种植小区选取马铃薯5株,用于测定产量构成因子的各个指标㊂每个品种筛选出大小一致㊁薯形规则的块茎用于品质性状测定,其中硬度检测使用的是数显水果硬度计(SN-FH-D006)㊂试验数据应用Microsoft excel2007计算马铃薯产量因子㊁各品质指标含量的平均值,以及最大值㊁最小值与变异系数㊂2㊀结果与分析2.1㊀主要农艺性状㊀㊀薯形方面,豫商薯11号㊁豫商薯2号㊁闽薯为长椭圆,其余品种多为圆㊁扁圆㊁长圆和椭圆;皮色方面,浙薯927为红色,浙薯934为紫色,其余品种为黄色或者淡黄色㊂肉色方面,浙薯927为红色,浙薯934为紫色,其余品种为黄色或者淡黄色㊂不同类型芽眼(深㊁中㊁浅)的占比在21个引进土豆品种中较为均匀㊂此外,在21个马铃薯品种中,除了浙薯56㊁浙薯926㊁中薯早47㊁中薯早30和豫商薯11号,其余薯皮均光滑(表1)㊂值得注意的是,可能因为温州地区温度偏高,在采收时(2023年4月20日,温度高于20ħ),中薯系列品种均已发生了腐烂的情况㊂表1㊀21个引进马铃薯品种(系)的农艺性状Table1㊀Agronomic traits of21introducedpotato varieties品种(系)薯形皮色肉色芽眼薯皮类型闽薯长椭圆黄色黄色深光滑浙薯934椭圆紫色紫色深光滑浙薯1086圆粉色黄色浅光滑裕丰6号椭圆黄色深黄色中等光滑兴薯36椭圆黄色黄色深光滑浙薯927椭圆红色红色中等光滑浙薯56椭圆黄色黄色浅粗糙豫商薯2号长椭圆黄色黄色深光滑浙薯926椭圆黄色黄色深粗糙中薯5号椭圆浅黄色黄色浅光滑商马铃薯1号椭圆黄色黄色浅光滑浙薯59椭圆黄色黄色中等光滑中薯3号椭圆黄色黄色浅光滑甘引9号椭圆黄色黄色中等光滑浙薯956椭圆黄色黄色浅光滑中薯早47椭圆浅黄色黄色中等粗糙中薯早35椭圆黄色黄色浅光滑中薯早30椭圆黄色黄色中等粗糙实验1号椭圆黄色黄色浅光滑豫商薯11号长椭圆黄色黄色中等粗糙陇芋1号椭圆黄色黄色浅光滑2.2㊀单穴产量㊀㊀由表2可知,豫商薯2号薯重最大,达到单穴1.482kg㊂其次是中薯早30和中薯5号,单穴产量分别是1.451和1.392kg㊂此外,本研究发现浙薯926薯重最小,仅0.332kg(表2)㊂其中,中薯早30是21个引种马铃薯品种中薯数最多的(10.3),但是整体偏小,>100g的个数仅为3.6㊂豫商薯2号薯数(9.8)仅次于中薯早30,>100g 的个数可达7.11,是21个引种马铃薯品种中最多的,整体质量较高㊂表2㊀21个引进马铃薯品种(系)单穴结薯情况Table2㊀The situation of single hole potato formation in21introduced potato varieties(lines)品种(系)薯重/kg薯数>100g个数闽薯0.720 6.30 4.20ʃ1.12浙薯9340.568 5.10 3.60ʃ0.91浙薯1086 1.1878.20 6.50ʃ2.32裕丰6号 1.3398.40 5.90ʃ1.75兴薯360.9597.50 5.50ʃ2.25浙薯927 1.1827.80 4.30ʃ1.86浙薯560.696 5.30 3.60ʃ1.02豫商薯2号 1.4829.807.11ʃ3.56浙薯9260.3320.420.22ʃ0.11中薯5号 1.3928.20 6.60ʃ1.15商马铃薯1号0.9297.50 5.80ʃ1.23浙薯59 1.3268.80 5.90ʃ2.12中薯3号0.9227.00 4.50ʃ1.79甘引9号0.9627.30 4.20ʃ1.63浙薯956 1.033 6.40 4.10ʃ1.89中薯早470.738 5.70 2.20ʃ1.32中薯早350.634 5.20 1.90ʃ1.11中薯早30 1.45110.30 3.60ʃ2.26实验1号0.722 4.70 2.30ʃ1.25豫商薯11号 1.3657.80 4.30ʃ2.11陇芋1号0.701 4.50 2.20ʃ0.75 2.3㊀硬度检测㊀㊀通过硬度检测(表3),发现浙薯956硬度最㊀㊀表3㊀21个引进马铃薯品种(系)硬度检测Table3㊀Hardness testing of21introducedpotato varieties(lines)品种(系)硬度/N闽薯 1.12ʃ0.23浙薯934 1.53ʃ0.37浙薯1086 1.01ʃ0.27裕丰6号 1.48ʃ0.16兴薯360.91ʃ0.12浙薯927 1.35ʃ0.08浙薯560.69ʃ0.08豫商薯2号 1.80ʃ0.22浙薯926 1.52ʃ0.04中薯5号 1.69ʃ0.28商马铃薯1号 1.51ʃ0.34浙薯59 1.61ʃ0.05中薯3号 1.41ʃ0.09甘引9号 1.58ʃ0.23浙薯956 1.94ʃ0.06中薯早47 1.56ʃ0.09中薯早35 1.51ʃ0.14中薯早30 1.60ʃ0.09实验1号 1.90ʃ0.26豫商薯11号 1.90ʃ0.26陇芋1号 1.33ʃ0.30高,达到了1.94,其次是豫商薯11号和实验1号,均是1.90,表明在采收期这些马铃薯品种更为紧实㊂此外,浙薯56的硬度最低,表明在采收期浙薯56最为膨胀松散㊂3 结论豫商薯2号植株性状良好,黄皮黄肉,产量是21个引种马铃薯中最高的,品质较佳,单穴大于100g的马铃薯数量较多,表明该品种适合在温州地区进行推广,可以进一步扩大种植面积㊂中薯早30和中薯5号产量仅次于豫商薯2号,但是中薯早30腐烂情况较为严重,中薯早35和中薯早47同样发生了不同程度的腐烂情况,可能是中薯早系列在统一采收期时温州地区湿度和温度较高导致,应提前进行采收㊂浙薯927和浙薯934为彩色马铃薯,其中浙薯927的产量在21个引种马铃薯中处于中上水平,薯形光滑;浙薯934产量处于中下水平,薯形较小㊂说明在这2个彩色马铃薯中,浙薯927在温州地区的引种表现比浙薯934好,可在一定范围内作为彩色马铃薯代表品种进一步扩大种植面积㊂参考文献:[1]㊀李明福,张磊,王颖,等.云南省冬作马铃薯新品种筛选初探[J].山地农业生物学报,2021,40(6):81-86. [2]㊀陈娟,贺锦红,刘吉利,等.半干旱区不同种植模式对马铃薯淀粉形成及产量的影响[J].作物杂志,2020(3):169-176.[3]㊀龚静,郑顺林,熊湖,等.马铃薯种薯播前温度处理对苗期抗旱能力的影响[J].四川农业大学学报,2020,38(3):251-256,271.[4]㊀陈吉昆,钱彩霞,余丽燕,等.马铃薯绿色高质高效栽培技术研究[J].中国农业文摘-农业工程,2023,35(1):83-86.[5]㊀黄耀锋.优质马铃薯高产高效栽培技术要点[J].南方农机,2022,53(4):69-71,89.[6]㊀张帆,李源,陈梦茹,等.20个马铃薯品种品质比较与综合评价[J].河南农业科学,2022,51(8):28-36. [7]㊀崔永伟,杜聪慧,李树君.中国马铃薯种薯产业发展分析与展望[J].农业展望,2020,16(1):71-76. [8]㊀蔡仁祥.浙江省马铃薯产业现状与主粮化对策[J].中国马铃薯,2016,30(2):118-121.[9]㊀吴早贵,张育青.浙江省薯类生产现状与发展对策[J].中国农技推广,2016,32(8):8-10.(责任编辑:董宇飞)。
马铃薯育种的方式
马铃薯育种的方式马铃薯是一种全球重要的粮食作物,而马铃薯育种则是为了改进其产量、耐逆性和抗病能力等各个方面。
下面将介绍几种马铃薯育种的方式。
1.人工杂交人工杂交是通过植物育种学知识,选取优良品种进行人工授粉配对,来获得更优质高产的优良品种。
这项技术被广泛应用于马铃薯育种中。
在人工杂交过程中,首先选择出若干个基础品种后,在控制传粉的情况下进行杂交,然后收集结果进行筛选。
与其他方法相比,人工杂交的成本相对较低,可操作性也很简单。
2.质量选择质量选择是以选择优质种子的方式进行“有机育种”,即以小育大,只保留生长中充满活力的种子,以培养长势更健康的苗。
它也被看作是马铃薯育种领域的一项主要成果之一。
另外,利用多目标反向选择,同样可以快速且有效地选出表现优异的种子。
3.基因编辑技术基因编辑技术是一项新兴的育种领域。
利用现代生物学手段(CRISPR-Cas9)直接对马铃薯底层遗传信息进行编辑和精细调整,实现性状特异性定向选育,同时也利用可编篡纸基因警醒马铃薯抵御入侵的病菌、病毒等生物的能力的提升,如此在保证中高产镰刀菌素食味道的前提下,大幅降低防治成本及食品处理过程产生的有害物质数量.4.分子标记分子标记法是要选择某些与目标性状相关的基因区段,来筛选更优品种。
这个技术模式相对于人工杂交来说,筛选出重要性状的时间更加简短。
然而,在将该方法集成到更为复杂的育种工作链之中会变得困难,因此还需要不断地针对研究结果作出不断更新的反思,从而不断完善建立于分子标记基础上的马铃薯育种方法。
总之,以上这些方式是目前马铃薯育种中比较常见的技术。
马铃薯所在行业正以显着的速度发展,因此也需要持续不断地研究更好的育种方法,以应对日益加剧的气候变化等因素。
通过这些技术的运用,相信未来可以将马铃薯品种推向一个全新的高峰。
马铃薯合作88号肥胖与密度丰产栽培试验
F ,所 以 ( ) 回 归 关 系 显 著 , 回 归 方 程 是 有 效 0 1
的 ,与 实 际情 况 拟 合 较 好 ,具 有 实 际 意 义 。
对 回归系数检验如下 :
t I= 2. 97 t 2. 7 t2: 1. tI: 3. ,= 6 I 36 I 77
管 理 措 施 同 大 田生 产 。
Y = 4 1 5. 2 0+ 21 9. 2 5 . 1 4 6 4 X ̄ 3 1 9 5 6 6 5 X + 9 8. 2 5
玉 米 ,土 壤 有 机 质 5 7 % ,有 效 氮 2 7mgk ,速 .9 4 /g
效磷 4 2mek ,速 效 钾 1 1m J g H 值 6 8 。 . d g 8 gk ,p _0
t2 0. 4 2= 5
因 t. ( f 4 =2.7 , t. ( f 4 : os d : ) o 76 ol d = ) 0
收 稿 日期 :2 0 0 2—0 — 1 3 5
4.0 ,所 以 ( )x, 64 1 ,
与 Y的回归关系显著,
维普资讯
中 国 马 铃 薯 ,第 l 6卷 ,第 4期 ,2 0 02
而 X 、X。 与 Y 之 间 的 回 归 关 系 均 不 显 著 。 把 码 2 X2 值 方 程 ( ) 变成 用 量 纲 表示 的生 产 因素 效 应 方 程 , 1
通 过 边 际分 析 确 定 最 优 化 生 产 因素 组 合 ,才 能 用 于
种 植 密 度 不 合 理 、 肥 料 投 入 不 足 及 不 平 衡 。 如 何 采 用 适 宜 的 肥 料 与 密 度 措 施 ,改 善 植 株 营 养 状 况 ,促 使 养 分 平 衡 ,是 当前 我 市 马 铃 薯 生 产 进 一 步 获 得 高
马铃薯基因育种实验报告(3篇)
第1篇一、实验背景马铃薯(Solanum tuberosum L.)是全球重要的粮食作物,也是我国第四大主粮作物。
然而,传统马铃薯的育种进程较为缓慢,主要原因是马铃薯基因组复杂,育种改良困难。
为了加快马铃薯育种进程,提高马铃薯产量和品质,本研究通过基因育种技术对马铃薯进行改良。
二、实验目的1. 探究马铃薯基因育种的可行性;2. 筛选出具有高产、抗病、抗逆等优良性状的马铃薯新品种;3. 为马铃薯育种提供理论依据和技术支持。
三、实验材料1. 马铃薯品种:马铃薯品种A、B、C;2. 基因组测序设备;3. 转基因技术相关试剂;4. 实验室常规试剂。
四、实验方法1. 马铃薯基因组测序:采用高通量测序技术对马铃薯品种A、B、C的基因组进行测序,获得基因组序列信息。
2. 基因挖掘与功能验证:根据基因组序列信息,挖掘与产量、抗病、抗逆等性状相关的基因,并进行功能验证。
3. 转基因操作:采用农杆菌介导的遗传转化技术,将目标基因导入马铃薯品种A、B、C中,获得转基因植株。
4. 转基因植株筛选与鉴定:对转基因植株进行表型观察、分子标记鉴定和抗病性、抗逆性等性状测试,筛选出优良转基因植株。
5. 马铃薯新品种选育:将筛选出的优良转基因植株进行自交、回交等育种操作,选育出具有高产、抗病、抗逆等优良性状的马铃薯新品种。
五、实验结果与分析1. 马铃薯基因组测序:通过高通量测序技术,成功获得马铃薯品种A、B、C的基因组序列信息,为后续基因挖掘与功能验证提供数据基础。
2. 基因挖掘与功能验证:根据基因组序列信息,挖掘到与产量、抗病、抗逆等性状相关的基因,并通过功能验证,确定这些基因在马铃薯生长发育过程中的重要作用。
3. 转基因操作:采用农杆菌介导的遗传转化技术,成功将目标基因导入马铃薯品种A、B、C中,获得转基因植株。
4. 转基因植株筛选与鉴定:通过表型观察、分子标记鉴定和抗病性、抗逆性等性状测试,筛选出具有高产、抗病、抗逆等优良性状的转基因植株。
马铃薯品种抗旱性评价及遗传多样性分析
Drought Resistance Evaluation and Genetic DiversityAnalysis of Potato VarietiesYU Jiale 1,ZHENG Zifan 1,NIE Hushuai 1,LIU Jie 2,WEI Wei 2,WANG Peijie 1,WU Xiaojuan 1,WU Juan 1,MA Yanhong 1*(1.Inner Mongolia Agricultural University,Hohhot,Inner Mongolia 010019,China;2.Huasong Seed Industry (Beijing)Co.,Ltd.,Beijing 102601,China )A bstract:Potato is an important food crop,and sensitive to water.With global warming,drought damage to agriculture is increasing.In order to enrich new varieties of potato resistant to drought in Inner Mongolia Autonomous Region,the main agronomic characters,yield and quality characters related to drought resistance of 18potato varieties were measured under the drought stress treatments.Principal component analysis was performed on 10main traits,including the number of tubers per plant,mean tuber weight and number of large-and medium-sized tubers.The cumulative contribution rate of three principal components was 71.293%.According to the comprehensive score,'Zhongshu 31','Huasong 7'and 'Huasong 56'were considered relatively drought-resistant.The genetic diversity of 18potato varieties was analyzed using SSR molecular marker technology.Based on the genetic distance (GD)value of 0.66,18potato varieties were divided into four categories:'Zhongshu 9','Zhongshu 28','Zhongshu 31','Neinongshu 2',于佳乐1,郑子凡1,聂虎帅1,刘杰2,魏巍2,王沛捷1,武小娟1,吴娟1,马艳红1*(1.内蒙古农业大学,内蒙古呼和浩特010019;2.华颂种业(北京)股份有限公司,北京102601)收稿日期:2023-04-20基金项目:内蒙古自治区科技计划项目(2020GG0221);内蒙古自治区马铃薯种业技术创新中心项目。
马铃薯优良新品系培育及其细胞学和SSR分析
马铃薯优良新品系培育及其细胞学和SSR分析在我国马铃薯主粮化战略的驱动下,对加工专用型及彩色马铃薯等特色品种的需求增大。
为培育优质、高产、抗病、适应性强的马铃薯新品种,近几年我们依据生态型差异较大、优点和缺点互补的亲本选配原则,以美国引进的马铃薯种质材料’YSP-4’,’2027’,’MIN-021’及国内育成的品种’陇薯7号’和’黑美’作亲本,组配了’YSP-4×MIN-021’、’2027×黑美’、’YSP-4×陇薯7号’ 3个杂交组合,通过人工套袋授粉杂交,获得其杂种F1代分离群体,并以F1代及其亲本为材料,在田间纱网大棚栽培条件下选择符合育种目标的优良杂种无性系单株,成功培育出7个马铃薯优良新品系A4、A8、A21、B5、B7、B10和C2。
本试验重点对新品系的生育特性、产量和营养品质表现、PMCMI染色体配对构型及SSR指纹特征等进行了分析,主要结果如下。
1.试验从3个组合’YSP-4×MIN-021’、’2027×黑美’和’YSP-4×陇薯7号’的杂种F1代分离群体中选育出7个马铃薯优良新品系A4、A8、A21、B5、B7、B10和C2。
A4为全粉加工型新品系,B7和B10为彩色马铃薯新品系,其余均为鲜食型新品系。
2.各新品系生育期变幅为85~113 d,品系B10中早熟,C2晚熟,其余5个品系均为中熟类型;7个新品系的块茎芽眼浅,结薯集中整齐,平均单株产量在1 kg以上,商品薯率81%以上。
3.7个新品系A4、A8、A21、B5、B7、B10和C2的花粉可育率变幅为48.82%~87.69%,其染色体配对构型分别为 6.57Ⅰ+9.66Ⅱ+5.06Ⅲ+1.74Ⅳ、5.38Ⅰ+8.98Ⅱ+4.63Ⅲ+2.69Ⅳ、4.05Ⅰ+ 15.54Ⅱ+2.12Ⅲ+1.63Ⅳ、4.55Ⅰ+12.12Ⅱ+2.39Ⅲ+3.01Ⅳ、1.93Ⅰ+11.52Ⅱ+2.0Ⅲ+4.26Ⅳ、4.37Ⅰ+9.97Ⅱ+3.19Ⅲ+3.53Ⅳ和 6.08Ⅰ+7.6Ⅱ+3.4Ⅲ+4.13Ⅳ。
引进马铃薯种质资源材料的综合分析评价
引进马铃薯种质资源材料的综合分析评价引进马铃薯种质资源材料的综合分析评价引进马铃薯种质资源材料是提高我国马铃薯产量和质量的重要手段。
在评价引进的马铃薯种质资源材料时,需要进行综合分析评价。
本文将从品质评价、抗病性评价、适应性评价三个方面对引进的马铃薯种质资源材料进行综合分析评价。
首先,品质评价是对马铃薯种质资源材料进行的首要评价。
马铃薯品质的好坏直接影响人们对其口感和食用价值的认可度。
我们一般通过观察马铃薯的外观、感受它的质地、品尝它的口感来评价品质。
外观上,优质的马铃薯外皮光滑,形状规整,无明显的疤痕和病斑。
质地上,好的马铃薯纹理细腻,口感鲜美。
此外,香味和营养价值也是品质评价的考量因素。
通过品质评价可以筛选出品质优良的马铃薯种质资源材料,提供给种植户种植,以提高产品的市场竞争力。
其次,抗病性评价是对马铃薯种质资源材料进行的重要评价。
由于马铃薯容易感染各种病害,选择抗病性强的种质资源材料对于提高产量和减少病虫害防治成本至关重要。
抗病性评价一般通过田间鉴定和室内繁殖评价两种方法进行。
田间鉴定是指将马铃薯种质资源材料种植在病害较重的地区,观察其是否受到病虫害的侵害程度。
室内繁殖评价是指通过室内繁殖材料的方式,观察其是否对病虫害有抵抗力。
通过抗病性评价,可以选择出具有较强病虫害抵抗能力的马铃薯种质资源材料,从而有效降低病害带来的损失。
最后,适应性评价是对马铃薯种质资源材料进行的必要评价。
马铃薯作为一种重要的粮食作物,其种植地域广泛,生态条件差异大。
因此,引进的马铃薯种质资源材料必须具有良好的适应性才能在不同地区获得良好的产量和质量。
适应性评价一般采用多点试种的方法进行。
将引进的马铃薯种质资源材料分别种植在不同的地域和环境条件下,观察其生长情况和产量变化。
通过适应性评价,可以了解马铃薯种质资源材料对不同环境的适应性,从而为种植户选择合适的品种和种植地区提供参考。
综上所述,对引进的马铃薯种质资源材料进行综合分析评价是提高马铃薯产量和质量的重要手段。
马铃薯高代品系的引进与评价
马铃薯高代品系的引进与评价作者:罗文彬李华伟许泳清林志坚纪荣昌邱思鑫汤浩来源:《福建农业学报》2018年第07期摘要:为了选育或引进优质、高产马铃薯新品种在福建省推广应用, 2016年11月从中国农业科学院蔬菜花卉研究所引进12个马铃薯高代品系进行品比试验,结果表明:N182、D597、D862、N157、N209和N215等6个品系产量比对照紫花851高7%以上,建议这6个品系继续进行多点试验,以确定其稳产性和推广价值。
在筛选出的6个高代品系中,N182、D597和D862等3个品系在产量方面表现突出,均比对照紫花851增产50%以上; N182、N157和D597等3个品系在品质方面表现突出,其中N182的维生素C含量(27.1 mg·hg-1),N157的钾含量(2.94 g·hg-1),D597的甲硫氨酸(0.12 g·hg-1)、缬草氨酸(0.51 g·hg-1)、异亮氨酸(0.35 g·hg-1)、苯丙氨酸(0.46 g·hg-1)、组氨酸(0.16 g·hg-1)、丝氨酸(0.42 g·hg-1)、甘氨酸(0.37 g·hg-1)和胱氨酸(0.09 g·hg-1)等8种氨基酸含量均在参试品系(种)中居第一位。
关键词:马铃薯;高代品系;品比试验;产量;品质中图分类号:S 532文献标识码:A文章编号:1008-0384(2018)07-691-05Abstract: For breeding or introducing new highquality, highyield potato varieties for cultivation in Fujian, 12 highgeneration progenies of potato strains from the germplasm collection of Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences were evaluated in November,2016. Among them, N182, D597, D862, N157, N209 and N215 had a yield 7% higher than the control variety, Zihua851, and were selected for further evaluation. In the multipoint experiments in the following year, N182, D597 and D862 showed a tuber yield 50% higher than the control. The potatoes of N182, N157 and D597 excelled in their nutritional qualities: N182 was high on vitamin C at 27.1 mg·hg-1,N157 on potassium at 2.94 g·hg-1, and D597 on methionine at 0.12 g·hg-1, on valerian at 0.51 g·hg-1, on isoleucine 0.35 g·hg-1, on phenylalanine at 0.46 g·hg-1, on histidine at 0.16 g·hg-1, on serine at 0.42 g·hg-1, on glycine at 0.37 g·hg-1, and on cysteine at 0.09 g·hg-1.Key words: potato; highgeneration hybrid strains; evaluation; yield; quality福建省已有300多年的馬铃薯引种栽培历史,但在很长的一段时间里主要是民间自发种植。
《马铃薯NF-YB基因家族鉴定及StNF-YB3.1在马铃著中的功能分析》范文
《马铃薯NF-YB基因家族鉴定及StNF-YB3.1在马铃著中的功能分析》篇一马铃薯NF-YB基因家族鉴定及StNF-YB3.1在马铃薯中的功能分析摘要本文主要通过生物信息学方法对马铃薯NF-YB基因家族进行鉴定,并重点对StNF-YB3.1基因在马铃薯中的功能进行了深入分析。
通过基因克隆、表达模式分析以及转基因技术等手段,揭示了StNF-YB3.1基因在马铃薯生长发育及抗逆性等方面的作用,为马铃薯的遗传育种和分子改良提供了理论依据。
一、引言马铃薯作为世界范围内重要的粮食作物和经济作物,其产量和品质的改良一直是科研人员关注的焦点。
近年来,随着分子生物学和基因组学技术的发展,马铃薯的基因功能研究取得了重要进展。
NF-YB基因家族作为植物基因组中的重要转录因子,在植物生长发育和逆境响应中发挥着重要作用。
因此,对马铃薯NF-YB基因家族的鉴定及其功能分析具有重要的理论和实践意义。
二、材料与方法1. 材料本实验以马铃薯为研究对象,采用生物信息学方法对NF-YB 基因家族进行鉴定,并重点分析了StNF-YB3.1基因的序列特征。
2. 方法(1)生物信息学分析:利用公共数据库资源,对马铃薯NF-YB基因家族进行序列比对、系统进化分析和表达模式预测。
(2)基因克隆:通过PCR技术扩增StNF-YB3.1基因的编码区序列,构建表达载体。
(3)表达模式分析:利用实时荧光定量PCR技术,分析StNF-YB3.1基因在不同组织及不同处理下的表达水平。
(4)转基因技术:构建过表达和沉默StNF-YB3.1基因的转基因马铃薯,观察其表型变化及生理指标的变化。
三、结果与分析1. NF-YB基因家族鉴定通过生物信息学分析,我们鉴定了马铃薯中NF-YB基因家族的成员,并对其进行了系统进化分析。
结果显示,马铃薯NF-YB 基因家族具有较高的保守性,与其他植物NF-YB基因家族具有相似的结构特征。
2. StNF-YB3.1基因序列特征StNF-YB3.1基因编码一个含有典型B盒结构的转录因子,其序列具有高度的保守性。
马铃薯种质资源描述数据标准
马铃薯种质资源描述数据标准马铃薯属茄科(Solanceae)茄属(Solanum)的一年生草本块茎植物,学名Solanum tuberosum L.,别名土豆、洋芋、山药蛋等,染色体基数n=12,包括二倍体(2n=24)、三倍体(2n=36)、四倍体(2n=48)、五倍体(2n=60)、六倍体(2n=72)等系列倍性的种,生产上应用最广泛、经济价值最高的是四倍体马铃薯亚种(S.tuberosum ssp.tuberosum)。
马铃薯种质资源包括野生资源、地方品种、选育品种、品系、遗传材料等。
1基本信息马铃薯种质资源基本情况描述信息,包括全国统一编号、种质名称、学名、原产地、种质类型等。
1.1全国统一编号种质的唯一标识号,马铃薯种质资源的全国统一编号。
1.2种质圃编号马铃薯种质在种质资源圃中的编号。
1.3引种号马铃薯种质从国外、省外引入时赋予的编号。
1.4采集号马铃薯种质在野外采集时赋予的编号。
1.5种质名称马铃薯种质的中文名称。
国外引进种质的外文名和国内种质的汉语拼音名。
1.6原产省内马铃薯种质的原产县、乡、村名称。
国内马铃薯种质原产省份名称;国外引进种质原产国家一级行政区的名称。
马铃薯种质原产国家名称、地区名称或国际组织名称。
1.7来源地国外引进马铃薯种质的来源国家名称、地区名称或国际组织名称;国内种质的来源省、县名称。
1.8海拔马铃薯种质原产地的海拔高度。
单位为m。
1.9经度马铃薯种质原产地的经度,单位为(。
)和(’)。
格式为DDDFF,其中。
DDD为度,FF为分。
1.10纬度马铃薯种质原产地的纬度,单位为(。
)和(’)。
格式为DI)FF,其中DD为度,FF、为分。
1.11保存单位马铃薯种质保存单位名称或种质资源圃依托单位的名称。
1.12保存单位编号马铃薯种质保存单位赋予的种质编号。
1.13系谱马铃薯选育品种(系)的亲缘关系。
1.14选育单位选育马铃薯品种(系)的单位名称或个人。
1.15育成年份马铃薯品种(系)培育成功的年份。
《马铃薯NF-YB基因家族鉴定及StNF-YB3.1在马铃著中的功能分析》范文
《马铃薯NF-YB基因家族鉴定及StNF-YB3.1在马铃著中的功能分析》篇一马铃薯NF-YB基因家族鉴定及StNF-YB3.1在马铃薯中的功能分析一、引言马铃薯是全球重要的农作物之一,其产量和品质直接关系到粮食安全和农业经济发展。
近年来,随着分子生物学技术的飞速发展,基因家族的鉴定和功能分析成为了作物遗传育种领域的研究热点。
NF-YB基因家族是植物中一个重要的转录因子家族,其在植物的生长发育、环境适应性及对逆境胁迫的响应中发挥关键作用。
本研究旨在通过生物信息学方法鉴定马铃薯NF-YB基因家族,并进一步分析StNF-YB3.1在马铃薯中的功能。
二、材料与方法1. 材料本研究所用材料为马铃薯栽培品种的基因组数据。
2. 方法(1)生物信息学分析:利用生物信息学软件和数据库,对马铃薯基因组进行扫描,鉴定NF-YB基因家族成员。
(2)基因克隆与表达分析:通过PCR技术克隆StNF-YB3.1基因,并利用实时荧光定量PCR技术分析其在不同组织及不同处理下的表达模式。
(3)功能验证:利用转基因技术,构建过表达和沉默StNF-YB3.1的马铃薯植株,观察其表型变化及生理指标的差异。
三、结果与分析1. NF-YB基因家族的鉴定通过生物信息学分析,我们在马铃薯基因组中鉴定出了多个NF-YB基因家族成员。
这些基因在染色体上分布均匀,具有较高的保守性。
通过序列比对和结构域分析,我们确定了各个基因的编码序列、启动子序列及调控元件等信息。
2. StNF-YB3.1的克隆与表达分析我们成功克隆了StNF-YB3.1基因,并对其进行了序列分析。
通过实时荧光定量PCR技术,我们发现StNF-YB3.1在马铃薯的不同组织中均有表达,且在不同环境条件下表达模式存在差异。
这表明StNF-YB3.1可能参与马铃薯的多种生理过程和对环境的响应。
3. StNF-YB3.1的功能分析(1)过表达分析:构建了StNF-YB3.1的过表达载体,并转化至马铃薯中。
《二倍体马铃薯DM及几个野生近缘种染色体识别和比较FISH的分析》范文
《二倍体马铃薯DM及几个野生近缘种染色体识别和比较FISH的分析》篇一二倍体马铃薯DM及多个野生近缘种染色体识别和比较FISH 的分析一、引言在植物育种与基因资源研究领域,马铃薯是一种具有极高经济价值和生态意义的重要农作物。
而二倍体马铃薯DM及多个野生近缘种,由于其基因的多样性及复杂性,成为了科研领域研究的热点。
本篇报告旨在分析二倍体马铃薯DM及其多个野生近缘种的染色体,并运用荧光原位杂交(FISH)技术进行染色体识别和比较,以期为马铃薯的遗传育种和基因资源研究提供科学依据。
二、材料与方法1. 材料本实验所使用的材料为二倍体马铃薯DM及其多个野生近缘种的种子。
通过种植、收获后提取其根尖细胞,用于后续的染色体识别和比较。
2. 方法(1)染色体制备:采用常规的根尖染色体制备方法,获取各物种的染色体样本。
(2)荧光原位杂交(FISH):通过将特定探针与染色体进行杂交,利用荧光显微镜观察并识别染色体。
(3)数据分析:利用计算机软件对杂交结果进行图像处理和数据分析。
三、结果与分析1. 染色体识别结果通过FISH技术,我们成功识别了二倍体马铃薯DM及其多个野生近缘种的染色体。
各物种的染色体形态、数量等特征均有所差异,为后续的遗传育种和基因资源研究提供了重要的参考信息。
2. 染色体比较分析我们将各物种的染色体进行了比较分析,发现在染色体长度、数量及基因排列等方面,各物种间存在显著的差异。
这些差异可能与各物种的生态适应性、抗病性等生物学特性有关。
此外,我们还发现二倍体马铃薯DM与某些野生近缘种在染色体结构上存在相似之处,这为马铃薯的遗传育种提供了重要的参考依据。
四、讨论本次实验运用FISH技术成功识别了二倍体马铃薯DM及其多个野生近缘种的染色体,为进一步研究其遗传特性和基因资源提供了重要依据。
通过对各物种染色体结构和特征的对比分析,我们发现各物种在生物学特性上的差异可能与其独特的染色体结构有关。
这些发现不仅有助于我们更深入地了解马铃薯及其野生近缘种的遗传机制,还为马铃薯的遗传育种和基因资源保护提供了重要的理论依据。
马铃薯新型栽培种后代材料的改良鉴定
马铃薯新型栽培种后代材料的改良鉴定
李佩华
【期刊名称】《西南农业学报》
【年(卷),期】2013(026)002
【摘要】采用马铃薯新型栽培种,经初次轮回选择改良后,在四川省凉山州开展了选留其后代材料群体遗传多样性无性世代评价、鉴定、筛选,并继续进行轮回选择、半同胞轮回选择或直接采集F1分离世代植株的实生籽,继续培育评价筛选.结果表明,初步获得了9个具有不同抗病性、长势强劲或品质优的不同类型种质资源,克服了其原生境的短日性,且开花繁茂,性状稳定,其性状表现出与普通栽培种Mira、凉薯97有较多的相似性,为综合利用创造了良好的条件.
【总页数】4页(P460-463)
【作者】李佩华
【作者单位】西昌学院,四川西昌615013
【正文语种】中文
【中图分类】S334.1
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马铃薯实生种子优良杂交组合评价
马铃薯实生种子优良杂交组合评价
田兴亚;陈伊里
【期刊名称】《马铃薯杂志》
【年(卷),期】1995(009)002
【摘要】本文研究了国内最新配制的马铃薯实生种子9个杂交组合,通过试验,分析和比较了F1实生苗世代主要经济性状的表现,综述评价了各个杂交组合在杂种优势利用中的价值,筛选了可用于商品生产的优良组合。
【总页数】4页(P70-73)
【作者】田兴亚;陈伊里
【作者单位】不详;不详
【正文语种】中文
【中图分类】S532.035.1
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马铃薯高效再生及遗传转化体系的优化
马铃薯高效再生及遗传转化体系的优化
张薇
【期刊名称】《安徽农业科学》
【年(卷),期】2024(52)3
【摘要】为优化马铃薯高效再生及遗传转化体系,研究鄂马铃薯3号茎段外植体在不同激素浓度配比下愈伤组织及分化情况,获得最佳愈伤组织及分化激素配比,再采用根癌农杆菌的遗传转化进行筛选,获得最佳转化体系,为马铃薯优质品种的基因工程育种提供依据。
结果表明,不同激素浓度配比下愈伤组织及分化率差异较大,其中2.0 mg/L ZR+0.1 mg/L IAA激素配比下可高效再生出芽,出芽率高达100%,芽长势粗壮。
通过构建植物表达载体pCambia1301,以GV3101为介导菌株,预培养
2~3 d,共培养2~3 d,350 mg/L羧苄青霉素,50 mg/L卡那霉素筛选浓度转化效果较好,转化效率可达65%,其中转化苗在0.8 mg/L IBA+0.2 mg/L NAA激素配比的培养基中可形成再生植株,再生率达80%,苗茎粗壮,根系发达。
【总页数】5页(P35-39)
【作者】张薇
【作者单位】湖北生物科技职业学院园艺园林学院
【正文语种】中文
【中图分类】S532
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园艺学报,2015,42 (2):361–366.Acta Horticulturae Sinicadoi:10.16420/j.issn.0513-353x.2014-0885;http://www. ahs. ac. cn 361马铃薯栽培品种‘合作88’细菌人工染色体文库的构建与评价杨煜1,杨晓慧1,*,李灿辉2,郭晓1,单伟伟1,马伟清1,**,黄三文3,李广存1,3,**(1山东省农业科学院蔬菜花卉研究所,山东省设施蔬菜分子生物学重点实验室,济南 250100;2云南师范大学生命科学学院,昆明 650500;3中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京 100081)摘 要:以四倍体马铃薯栽培品种‘合作88’培养12 ~ 15 d苗龄的幼嫩叶片为试材,提取高分子量基因组DNA,利用限制性内切酶Hin dⅢ部分酶切后回收100 ~ 300 kb片段,连接到载体CopyControl TMpCC1BAC TM的Hin dⅢ位点上,构建了细菌人工染色体(BAC)文库。
该文库约由850 000个克隆组成,空载率约2.08%,保存在1 700个混合池中,克隆插入片段平均大小约为90 kb,覆盖单倍型马铃薯基因组约85倍。
随机挑取6个BAC克隆连续培养5 d,提取DNA进行Hin dⅢ完全酶切检测,确认不同培养时间的BAC克隆的指纹图谱完全一致,表明文库较好的稳定性。
BAC文库的构建为马铃薯重要农艺性状基因克隆、基因组测序以及比较基因组研究等奠定了基础。
关键词:马铃薯;细菌人工染色体文库;抗病性中图分类号:S 532 文献标志码:A 文章编号:0513-353X(2015)02-0361-06Construction and Characterization of a Bacterial Artificial Chromosome Library of Potato Cultivar C88YANG Yu1,YANG Xiao-hui1,*,LI Can-hui2,GUO Xiao1,SHAN Wei-wei1,MA Wei-qing1,**,HUANG San-wen3,and LI Guang-cun1,3,**(1Institute of Vegetables and Flowers,Shandong Academy of Agricultural Sciences,Molecular Biology Key Laboratory of Shandong Facility Vegetable,Ji’nan 250100,China;2College of Life-Sciences,Yunnan Normal University,Kunming 650500,China;3Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,China)Abstract:A bacterial artificial chromosome library of potato(Solanum tuberosum L.)was constructed for‘C88’,a tetraploid potato cultivar conferring resistance to late blight,PVX and PVY,using BAC vector CopyControl TM pCC1. Fresh leaf tissues from 12–15 day-old seedlings were used to isolate high molecular weight genomic DNA,and 100–300 kb partially Hin dⅢ digested DNA fragments were selected and ligated into the Hin dⅢsite of pCC1. The library consists of 850 000 clones and stored in 1 700 pools. The average insert size of BAC clones is about 90 kb and the empty clones consist of about收稿日期:2014–10–24;修回日期:2015–01–07基金项目:国家‘863’计划项目(2013AA102603-4);国家科技支撑计划项目(2012BAD02B05-10);山东省良种工程农业生物资源创新利用项目(PTBR2013);公益性行业(农业)科研专项(201303018-03);山东省农业科学院青年科研基金项目(2014QNZ03)* 共同第一作者** 通信作者Author for correspondence(E-mail:liguangcun001@;maweiqing008@)Yang Yu,Yang Xiao-hui,Li Can-hui,Guo Xiao,Shan Wei-wei,Ma Wei-qing,Huang San-wen,Li Guang-cun.Construction and characterization of a bacterial artificial chromosome library of potato cultivar C88. 362Acta Horticulturae Sinica,2015,42 (2):361–366.2.08%. The library is equivalent to 85 haploid potato genomes. Six randomly picked clones showed stable Hin dⅢfingerprints after 5 days’ successive culture,indicating that the clones in the library are stable. The library will facilitate gene cloning,sequencing and comparative genomics research of potato.Key words:potato;bacterial artificial chromosome library;pathogen resistance马铃薯单倍型DM基因组测序计划的完成(The Potato Genome Sequencing Consortium,2011)为马铃薯重要农艺性状的研究奠定了坚实基础,但由于已测序马铃薯材料为双单倍体,而马铃薯栽培种为四倍体,利用已测序单倍型基因组序列信息进行马铃薯重要农艺性状的研究仍有很大的局限性。
因此,以四倍体马铃薯为材料,深入研究马铃薯重要农艺性状及抗病性具有重要意义。
构建基因组文库是从DNA水平上对各种生物进行研究的技术平台,基因组文库是永久保存基因资源的最好方法之一,也是进行基因组结构和功能研究的基础。
细菌人工染色体文库(Bacterial artificial chromosome library,BAC文库)具有插入片段大、稳定性好、操作简单、易于保存等优点,在基因的染色体定位、物理图谱构建、图位克隆、基因组测序及比较基因组研究等方面发挥着重要作用。
目前已在多种植物中成功构建了BAC文库,如拟南芥(Choi et al.,1995)、玉米(穆春华等,2013)、大白菜(冯大领等,2011)、小麦(李孟军等,2014)、水稻(Qiu et al.,1999)、棉花(Hu et al.,2011)、甘蓝(Gao et al.,2004)、大豆(许靖曼等,2010)、烟草(高晓明等,2012)等。
马铃薯栽培品种‘合作88’是由云南师范大学通过杂交选育而成的一个蒸食品质优良,又适宜淀粉加工的马铃薯高产新品种,其母本来自印度一个抗晚疫病的马铃薯克隆I-1085,父本来自具有Solanum andigena遗传背景的高抗晚疫病群体。
‘合作88’同时抗晚疫病菌IPO428.2(A2交配型)和X-4(A1交配型),且高抗马铃薯X病毒(PVX)和马铃薯Y病毒(PVY o)、中抗马铃薯卷叶病PLRV(Li et al.,2011a)。
因此,本研究中以‘合作88’为材料构建其BAC文库,为马铃薯抗病基因筛选、重要农艺性状功能基因的定位克隆、基因组测序及比较基因组研究等奠定基础。
1 材料与方法1.1材料供试材料马铃薯(Solanum tuberosum L.)四倍体品种‘合作88’由云南师范大学李灿辉研究员提供。
克隆载体采用Epicentre公司的CopyControl TM pCC1BAC TM Vector。
1.2 BAC文库构建1.2.1 高分子量基因组DNA的提取马铃薯高分子量基因组DNA的提取参照 Zhang等(1995)和 Ma 等(2000)的方法并做改进。
取培养12 ~ 15 d的马铃薯幼嫩叶片30 g,液氮研磨,转入300 mL预冷的核离析液(内含0.1% β–巯基乙醇,10% Triton X-100)中,轻摇洗脱15 min。
过滤除杂并收集滤液至50 mL离心管中,进一步离心弃上清液,沉淀用不含β–巯基乙醇和 Triton X-100的核离析液洗涤2次。
洗涤后的沉淀重悬于适量体积的不含β–巯基乙醇和 Triton X-100的核离析液中,42 ℃水浴3 min,再加入等体积1.5%低熔点琼脂糖凝胶混匀,制备大小为(0.5 × 0.25 × 0.1)cm3的凝胶块。
将制备好的凝胶块放入15倍体积含有1 mg · mL-1蛋白酶K的裂解液中,50 ℃水浴中缓和振荡 22 h,换一次蛋白酶K 裂解液,重复水浴22 h。
之后将胶块置于30 mL含40 μg · mL-1苯甲基磺酰氟(PMSF)的TE中冰浴2 h,重复1次,再于不含PMSF的TE中清洗胶块1 h,重复1次。
最后将处理好的胶块置于0.5杨 煜,杨晓慧,李灿辉,郭 晓,单伟伟,马伟清,黄三文,李广存.马铃薯栽培品种‘合作88’细菌人工染色体文库的构建与评价.园艺学报,2015,42 (2):361–366. 363 图1 高分子量DNA 的质量检测与最佳酶切条件选择 Fig. 1 Quality determination of high molecular weight DNA andits optimal partial digestion analysis mol · L -1 EDTA 中4 ℃保存备用。