【免费下载】实验三 酵母核糖核酸的提取及测定实验报告
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生物化学实验报告
实验三酵母核糖核酸的提取及测定
一、研究背景及目的
RNA(核糖核酸)属酸性高分子化合物,是遗传信息的载体,由数量不等的核糖核苷
酸通过磷酸二酯键连接而成。由于RNA在细胞内能够行使各种各样的生物功能,参与蛋白质生物合成、调控基因表达、作为核酶催化生化反应活性等,对维持生物体的正常发育有
着重要作用。RNA制剂是以RNA及其衍生物为材料,经加工制成的产品,主要包括从富
含RNA的生物体中的提取物、自溶物或者降解产物加工制成的各种商品。核糖核苷酸与其衍生物作为一大类RNA制剂,在生物体内有着诸多的功能,例如:ATP是细胞内的能量通用货币,cAMP作为第二信使传递胞外信号,CoⅠ、CoⅡ、CoA、FAD作为酶的辅因子在
催化反应中起重要作用,UDP等作为单糖载体在糖代谢中起着重要作用等。此外,鸟苷酸(GMP)和肌苷酸(IMP)是强力助鲜剂,胞苷酸(CMP)和尿苷酸(UMP)可作为生产
治疗癌症、肝炎及冠心病等药物的原料;在化妆品中加入核酸或其水解物,可促进皮肤蛋
白合成,达到养护皮肤的作用;在农业上,RNA降解物具有促进作物生长增产的作用,因
此RNA制剂被广泛应用于医药、食品、农业、日化、环境保护等各产业,具有广阔的商业前景,形成了一大新兴产业。[1]可见,无论是科研工作还是商业产品的生产过程,都需要
大量的纯品RNA作为原料。但是RNA的活化能较高,不易直接合成,而天然材料中的RNA往往与细胞内的其他化合物混在一起,故采用廉价、合适的手段分离纯化得到RNA
就显得至关重要。目前,人们已经摸索出来了多种多样的方法,这些方法各有特点,但其
基本的思路和程序大致相似,基本战略也是有规律可循的。
本实验中,我们需要了解RNA制剂开发应用的前景和基本思路,掌握RNA分离纯化
的设计思想及主要的操作细节,并以酵母为材料学习RNA提取和测定的基本操作方法。
二、原理
1.选材
即选取富含RNA的生物材料,微生物由于其原料的易获得性被广泛应用于工业上大量生产RNA的原料,本实验中我们以食品用干酵母粉直接作为RNA提取的原料。
2.提取
此处需要明确科研与工业生产的差异。科研工作中,通常需要得到有活性的RNA分子,以研究其生物学功能,故在提取过程中需要保证一级结构不被破坏,而后通过一定的手段
使其恢复到正确的空间结构。所以在提取过程中动作要轻柔,避免机械力(如气泡破裂等)打断RNA链,另外,提取时较多的使用了有机溶剂。一般有苯酚法、去污剂法和盐酸胍法,其中苯酚法又是实验是最常用的。组织匀浆用苯酚处理并离心后,RNA即溶于上层被酚饱
和的水相中,DNA和蛋白质则留在酚层中,向水层加入乙醇后,RNA即以白色絮状沉淀析出,此法能较好的除去DNA和蛋白质。此外实验室所广泛使用的RNA试剂盒使方便、快
速提取纯度高、完整性好的RNA分子实现了可能。
然而在大工业生产中,要求降低成本,只需获得纯品核苷酸,没有必要保证RNA链的完整性,且方法需要适合机械化生产的流水线,因此工业制备RNA常采用浓盐法和稀碱法,用这两种方法所提取的均为变性的RNA,主要用作制备核苷酸的原料,其工艺比较简单。两种方法的原理不同,浓盐法是原理是即利用高浓度的盐(10% NaCl)在90~100°C条件
下改变了细胞膜通透性,并将核蛋白体解离成RNA和蛋白质而使RNA释放到盐溶液中;
稀碱法是利用碱使微生物的细胞壁溶解,释放RNA。本实验中,我们使用浓盐法提取RNA。[3]
3.分离与纯化
在提取时我们使用了沸水浴,这不仅使细胞破碎,RNA释放,同时让相当多的一部分
蛋白质变性,疏水氨基酸暴露,溶解性下降,生成沉淀。经过冰浴冷却,温度骤降,热变
性蛋白发生错误折叠形成足够稳定的构象而并非原来的空间结构。这样,离心之后,母体
残渣和热变性蛋白与溶解在上清液中RNA得以分离。随后,根据核酸的两性特点,采用等电沉淀法,调节体系pH 2.0,使RNA以沉淀形式析出。在分离RNA的同时,也除去了一
部分DNA和蛋白质等杂质。最后,利用95%的乙醇洗涤RNA沉淀,由于RNA不溶于乙醇,而其他脂溶性物质溶于乙醇,这样就除去了少量的其他脂溶性杂质。
4.含量测定
测定RNA的含量可通过测定核糖核苷酸的糖、碱基或者磷酸来实现。目前有三种方法,定磷法、戊糖测定法和紫外吸收法。三种方法各有特点,但考虑到学生实验的操作时间、
安全性及实验器材等可行性因素,我们在本次实验中用比消光系数法(以紫外法为基础)
测定RNA的OD260值,计算溶液中的RNA含量,最终得出制品纯度和RNA提取率。
三、仪器与试剂
仪器:UV9600紫外分光光度计(北京瑞利分析仪器公司)、JP-100架盘药物天平(常熟市双杰测试仪器厂)、TDL-40B低速离心机(上海安亭科学仪器厂)、FA1004电子分析
天平(上海精密仪器科技厂)、DL-101-3BS电热鼓风干燥箱(天津市中环科技开发公司)、电磁炉;
器具:微量可调手动移液器(大龙)、具塞刻度试管、25ml容量瓶、50ml容量瓶、研钵;
试剂:10%的NaCl溶液、6M HCl、95%乙醇、2%的氨水、RNA沉淀剂、蒸馏水;
材料:食品用干酵母粉(湖北安琪酵母股份有限公司)。
四、实验步骤
1.粗提取:量取50ml 10%的NaCl溶液,称取7g酵母粉,研磨至面粉状,在研钵中加入10ml 左右的NaCl溶液并研磨成糊状(没有肉眼可见的块状颗粒),将糊状物及剩余NaCl溶液转移至三角瓶,沸水浴浸提至少40min。
2.分离:取出提取液,冰浴冷却10min,转入离心管,3500r/min离心30min,取上
清液。
3.沉淀:将上清液转移至小烧杯中,冰浴冷却至10℃以下。搅拌下(不要过分剧烈)
加入6M HCl调节至pH 2.0,冰浴4h。
4.洗涤:轻柔而彻底地搅拌使沉淀充分悬浮,将悬浊液转入离心管,3500r/min离心
15min,取RNA沉淀。用约15ml 95%的乙醇彻底悬浮搅拌洗涤沉淀,3000r/min离心
10min。洗涤离心3次,弃去上清液。
5.干燥并称重:取预先在80℃烘箱内干燥的硫酸纸精确称重,再将边缘折起成框,备用。将洗涤后的RNA沉淀转移涂布于硫酸纸上,80℃烘箱干燥至沉淀成粉末状。准确称量干燥后的RNA制品及硫酸纸总重并记录。将大部分RNA制品转移至玻璃匀浆器中,称量
剩余沉淀连同硫酸纸的重量并记录。
6.含量测定:向玻璃匀浆器中加入约5ml蒸馏水,充分匀浆至均一的胶体溶液(匀浆
器底部无块状颗粒),转移RNA至洁净的小烧杯中,用10~15ml蒸馏水分次洗涤匀浆器,