基因表达与蛋白质合成
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不依赖 ρ因子的转录终止
1、终止位点上游一般存在一个富含GC碱基的二重 对称区,由这段DNA转录产生的RNA容易形成 发卡结构。 2、在终止位点前面有一段由4—8个A组成的序列, 所以转录产物的3’端为寡聚U,这种结构特征 的存在决定了转录的终止。
与原核生物的-35区相对应的序列 ,称为CAAT区。
第一步:模板识别
原核生物只含有一种RNA聚合酶, 可以催化合成mRNA、tRNA、rRNA RNA聚合酶与启动子DNA 双链相互作用并与之结合的过程。 。其核心酶是由两个 α 亚基、一 个β 亚基,一个β ’亚基、一个 ω亚基组成,加上一个σ亚基后则 成为RNA聚合酶全酶。 σ亚基 真核生物由三种 RNA聚合酶,其中 RNA聚合酶:以双链 RNA聚合酶I合成 rRNA 前体 45S; DNA为模板,以 NTP 为 RNA聚合酶Ⅱ合成 mRNA的前体及大 原料,并以镁离子或 部分snRNA 以及microRNA;RNA聚 者锰离子为辅助因子 合酶Ⅲ合成 tRNAs 、rRNA 5S等。 ,催化 RNA链的起始、 它们的结构与原核生物 RNA聚合酶 延伸和终止,不需要 类似。 任何引物。
第三步:转录终止
终止 位点
当链延伸到转录终 止位点时,RNA聚 合酶不再形成新的 磷酸二酯键,RNADNA杂合体分离, DNA恢复到双链状 态而RNA聚合酶和 新生成的RNA链从 模板上释放出来, 这就是转录的终止。
RNA前体
真核生物转录的终止
5’ AAUAAA
在3’端加上polyA的尾巴, 与转录终止密切相关(多聚 腺苷酸化)
依赖 ρ因子的转录终止
“穷追模型”:
RNA合成起始以后, ρ因子即附着在新生的RNA链 5’端的某个有序列或二级结构特异性的位点上,利 用ATP水解产生的能量,沿着5’到3’方向朝着转录泡 移动,其运动速度比RNA聚合酶快些,当RNA聚合 遇到终止子而暂停时, ρ因子追上并取代了暂停在终 止位点上的RNA聚合酶,它所具有的RNA-DNA解螺 旋活性使转录产物RNA从模板上释放。随后转录复合 解体,完成转录过程。
GA GU 3’ polyA结合蛋白
polyA合成酶的复合物
polyA合成酶复合物 GA GU 包括polyA合成酶、 AAUAAA 多聚腺苷酸化特异因 多聚腺苷酸化 CPSF 及 CstF 会在约AAUAAA序列后35个核苷GA处启动切割 子( CPSF )、切割活 。化因子( polyA合成酶( PAP)会立即展开编写polyA尾巴,细胞 CstF)以及 polyA结合蛋白。 核内的 polyA结合蛋白会立即与新的 polyA序列结合。其 CAAAAAAAAAAAAAAA AAUAAA
CPSF
polyA合成酶
CstF
中,polyA结合蛋白作为一种分子标尺,界定多聚核苷酸 化何时停止。
原核生物 转录的终止
ρ 因子是由相同的6个亚基组成六聚 体,具有NTP酶活性和解螺旋酶活性 依赖 ρ因子的转录终止 ,是促使转录三元复合物解离的根 本原因。依赖ρ 因子终止的终止子 含有一个反向重复序列,使 RNA末 不依赖 ρ因子的转录终止 端形成一个发夹结构,导致转录延 宕,ρ 因子得以发挥作用,终止转 录。
RNA聚合酶 结构示意图
σ亚基:负责模板链 的选择和转录的起始 ,是核心酶的别构效 应物,使酶专一性的 识别模板上的启动子 ,可以极大的提高 RNA聚合酶对启动子 ω 亚基:还未清楚它 区 DNA序列的亲和力 的功能。但是它在 。 耻垢分枝杆菌中似 乎是有保护β‘亚基的 功能。
两个α 亚基:与核心酶的 组装及启动子的识别有关
启动子
有高度的亲和力。
多种调 上游 控原件
原件
启动子:是一段位于 CAAT 区 TATA 区 -35区 -10区
结构基因5’端上游的 一段DNA序列,能活 化RNA聚合酶,使之 真核生物在转录起始位点上游 -30 与模板 DNA准确结合 ~ -25bp有一个共同序列,功能和 原核生物的 -10区类似,称为TATA 并具有转录起始的特 区;另外在 异性。 -78 ~-70bp也有一段
β亚基:有着聚合酶的活性 ,负责催化RNA的合成。
β’亚基:与DNA模板结合, 与β亚基一起组成了RNA聚 合酶的催化中心。
真核生物在转录起始 第二步:转录起始
位点上游200bp附近 还有增强子序列,能 1、聚合酶与启动子可逆性结合形成转录起始复合物, 够强化转录起始。 此时DNA链仍处在双链状态,称为二元封闭复合物。
基因转录 DNA RNA
整体流程
转录起点 终止子
模板链 编码链 转录 RNA
启动子
转录区域
其中原核生物启动子区在转 原核生物有操纵子结构:操纵子是原核生物进行基因转录调控的 录起始位点上游10bp处有 主要方式,包括:操纵基因、启动子和结构基因,其中结构基因 也就是要表达的基因,通过启动子上游阻遏物基因是否表达产生 一个-10区,是RNA聚合酶 阻遏物与启动子区的阻遏基因结合来调控基因转录,阻遏物基因 的紧密结合位点,在上游 表达,产生阻遏蛋白,与启动子区的操纵基因结合,结构基因被 35bp处有-35区,是RNA 聚 抑制,不表达,阻遏物基因不表达,没有阻遏蛋白,启动子区与 RNA聚合酶结合,转录起始。 合酶的σ亚基识别位点并具
顺式作用元件:影响自身基因表 达活性的DNA序列,启动子、增强 σ亚基 子、沉默子; 反式作用因子:和调控区序列相 结合或间接影响其作用的蛋白质 原核生物形成的起始复合物比较简 因子,统称为反式因子。一般为 单,是由聚合酶和启动子直接结合 DNA结合蛋白,核内蛋白,可使邻 形成的,而真核生物则较为复杂, 近基因开放(正调控)或关闭( 需要众多因子的参与,其中包括顺 负调控) 。 式作用元件和反式作用因子。
2源自文库DNA构象发生重大变化,封闭复合物打开,变成二元 开链复合物。
σ亚基
3、 σ 亚基释放,RNA聚合酶结合到模板链,形成 RNA聚合酶、DNA、新生RNA的三元复合物。
σ亚基 新生 RNA链
第二步:转录延伸
RNA聚合酶释放σ亚 基之后与启动子脱离, 核心酶沿模板DNA链 移动并使新生RNA链 不断延长的过程。