植物DNA分子标记
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是指DNA探针与染色体上的DNA杂交，并在染 色体上直接进行检测的分子技术，其原理是两 条核苷酸单链片断在适宜的条件下，通过氢键 结合，形成DNA-DNA，DNA-RNA，RNARNA双键分子，用带有标记的DNA或者RNA片 断作为核酸探针，与细胞内染色体杂交，用放 射自显影等方法予以显示，在荧光显微镜下观 察目的mRNA或者DNA的存在与定位。
In situ hybridization
For in situ hybridization, a tissue sample is incubated with a labeled nucleic acid probe, excess probe is washed away and the location of hybridized probe is examined.
(a) Bx350-184, a 28-chromosome
genome with at least 14 intergeneric translocations, some of which have two breakpoints in an arm (arrows). Bar: 10 μm.
(b) Bx351-160, a 28-chromosome
The technique enables the spatial localization of gene expression to be determined as well as the location of individual genes on chromosomes.
Guo et Βιβλιοθήκη l. 2005ab
c
d
Fig. 5 GISH images of chromosomes of tetraploid and diploid Festulolium progenies. The DNA of L. perenne was used as probe, and shown as blue color. The chromosomes of F. pratensis were shown as pale blue color. Translocation breakpoints are indicated in a and c by arrows.
DNA扩增指纹印记
（DNA amplification fingerprinting, DAF）
简单序列重复标记（simple sequence repeat, SSR）
随机引物聚合酶链式反应
（arbitrarily primed PCR, AP-PCR）
扩增片段长度多态性标记
（amplified fragment length polymorphism, AFLP）
随着分子生物学技术的发展，现在DNA分子标记 技术已有数十种，广泛应用于遗传育种、基因组作 图、基因定位、物种亲缘关系鉴别、基因库构建、 基因克隆等方面。
DNA分子标记大多以电泳谱带的形式表现，分为 非PCR依赖的分子标记(基于Southern 杂交技术的 分子标记)和PCR依赖的分子标记。
非PCR依赖的分子标记
genome with intergeneric translocations. Bar: 20 μm.
(c) Bx350-177 with fertile pollen, a
28-chromosome genome comprising approximately equal amount of Lolium and Festuca DNA with 9 intergeneric translocations, some of which have two breakpoints in an arm (arrows). Bar: 20 μm.
(基于Southern 杂交技术的分子标记)包括：
限制性片段长度多态性标记 （restriction fragment length polymorphism,
RFLP）
原位杂交（in situ hybridization）
PCR依赖的分子标记：
随机扩增多态性DNA标记
（random amplification polymorphism DNA, RAPD）
* 杂合子的一对等位基因各自都具有自己的表型效应，称为共显性 （codominance）
** 基因多效性（gene pleiotropism）：一个基因产生多种表型效应 的现象。
DNA分子标记（DNA molecular marker）直接 在DNA分子水平上检测生物间的差异，是DNA水平 上遗传变异的直接反应。
分子标记的概念
广义的分子标记（molecular marker）： 可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白。包 括蛋白质标记和DNA标记（狭义的分子标 记）。
蛋白质标记包括动植物蛋白、同工酶及 等位酶
理想的分子标记：
1.高多态性 3.能明确辨别等位基因 5.无基因多效性 ** 7.成本低廉
2.共显性遗传 * 4.遍布整个基因组 6.检测手段简单快速 8.重复性好
(d) Prior-57, a 14-chromosome
genome with intergeneric translocations. Bar: 10 μm.
RFLP标记：限制性片段长度多态性
RFLP指应用特定的核酸内切酶切割有关的DNA分 子所产生的DNA片段在长度上的变化。
包括基因组DNA限制性酶切，Southern印记， DNA探针制备，同位素/非同位素标记，DNA分 子杂交等步骤。
基于分子杂交技术的分子标记技术
此类标记技术是利用限制性内切酶解及凝胶电 泳分离不同的生物 DNA 分子，然后用经标记 的特异 DNA 探针与之进行杂交，通过放射自 显影或非同位素显色技术来揭示 DNA 的多态 性。
分子杂交：由具有互补碱基顺序的任何两 条单链核酸分子片断形成双链的过程。
染色体原位杂交
生物能快速、精确地复制自身的DNA，但这种精确 性是相对的。实际上，在植物的自然群体中存在大量 的DNA序列变异。如：碱基对的代换、缺失等。几乎 不可能有两个生物体DNA的碱基序列是相同的。
In situ hybridization
For in situ hybridization, a tissue sample is incubated with a labeled nucleic acid probe, excess probe is washed away and the location of hybridized probe is examined.
(a) Bx350-184, a 28-chromosome
genome with at least 14 intergeneric translocations, some of which have two breakpoints in an arm (arrows). Bar: 10 μm.
(b) Bx351-160, a 28-chromosome
The technique enables the spatial localization of gene expression to be determined as well as the location of individual genes on chromosomes.
Guo et Βιβλιοθήκη l. 2005ab
c
d
Fig. 5 GISH images of chromosomes of tetraploid and diploid Festulolium progenies. The DNA of L. perenne was used as probe, and shown as blue color. The chromosomes of F. pratensis were shown as pale blue color. Translocation breakpoints are indicated in a and c by arrows.
DNA扩增指纹印记
（DNA amplification fingerprinting, DAF）
简单序列重复标记（simple sequence repeat, SSR）
随机引物聚合酶链式反应
（arbitrarily primed PCR, AP-PCR）
扩增片段长度多态性标记
（amplified fragment length polymorphism, AFLP）
随着分子生物学技术的发展，现在DNA分子标记 技术已有数十种，广泛应用于遗传育种、基因组作 图、基因定位、物种亲缘关系鉴别、基因库构建、 基因克隆等方面。
DNA分子标记大多以电泳谱带的形式表现，分为 非PCR依赖的分子标记(基于Southern 杂交技术的 分子标记)和PCR依赖的分子标记。
非PCR依赖的分子标记
genome with intergeneric translocations. Bar: 20 μm.
(c) Bx350-177 with fertile pollen, a
28-chromosome genome comprising approximately equal amount of Lolium and Festuca DNA with 9 intergeneric translocations, some of which have two breakpoints in an arm (arrows). Bar: 20 μm.
(基于Southern 杂交技术的分子标记)包括：
限制性片段长度多态性标记 （restriction fragment length polymorphism,
RFLP）
原位杂交（in situ hybridization）
PCR依赖的分子标记：
随机扩增多态性DNA标记
（random amplification polymorphism DNA, RAPD）
* 杂合子的一对等位基因各自都具有自己的表型效应，称为共显性 （codominance）
** 基因多效性（gene pleiotropism）：一个基因产生多种表型效应 的现象。
DNA分子标记（DNA molecular marker）直接 在DNA分子水平上检测生物间的差异，是DNA水平 上遗传变异的直接反应。
分子标记的概念
广义的分子标记（molecular marker）： 可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白。包 括蛋白质标记和DNA标记（狭义的分子标 记）。
蛋白质标记包括动植物蛋白、同工酶及 等位酶
理想的分子标记：
1.高多态性 3.能明确辨别等位基因 5.无基因多效性 ** 7.成本低廉
2.共显性遗传 * 4.遍布整个基因组 6.检测手段简单快速 8.重复性好
(d) Prior-57, a 14-chromosome
genome with intergeneric translocations. Bar: 10 μm.
RFLP标记：限制性片段长度多态性
RFLP指应用特定的核酸内切酶切割有关的DNA分 子所产生的DNA片段在长度上的变化。
包括基因组DNA限制性酶切，Southern印记， DNA探针制备，同位素/非同位素标记，DNA分 子杂交等步骤。
基于分子杂交技术的分子标记技术
此类标记技术是利用限制性内切酶解及凝胶电 泳分离不同的生物 DNA 分子，然后用经标记 的特异 DNA 探针与之进行杂交，通过放射自 显影或非同位素显色技术来揭示 DNA 的多态 性。
分子杂交：由具有互补碱基顺序的任何两 条单链核酸分子片断形成双链的过程。
染色体原位杂交
生物能快速、精确地复制自身的DNA，但这种精确 性是相对的。实际上，在植物的自然群体中存在大量 的DNA序列变异。如：碱基对的代换、缺失等。几乎 不可能有两个生物体DNA的碱基序列是相同的。