沙门氏菌六种检测方法的研究
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PCR产物用1.5%的琼脂糖凝胶进行电泳检测。
普 通 PCR 法
特异性检测
普 通 PCR 法
11ng 1.1ng 0.1ng 11pg 1.1pg 0.1pg 0.01pg
灵敏性检测
实时荧光PCR法
SYBR Green Ⅰ 上游引物(P1) 下游引物(P2) DNA模板 dH2O 95℃ 95℃ 60℃ 65℃ 95℃ 30s 5s 20s 15s 0.1℃/ s 10µL 0.4μL 0.4μL 2μL 7.2μL
普 通 PCR 法
10×Buffer(Mg2+) dNTP(2.5mM) 上游引物( invA-F ) 下游引物( invA-R ) 模板DNA 双蒸水 5μL 6μL 1μL 1μL 5μL 31.7μL
50μL
95℃ 95℃ 60℃ 72℃ 72℃
5min 10s 20s 60s 7min
38个循环
VITEK法:利用沙门氏菌常见的
29种生化反应,对1麦氏浊度的沙门
氏菌进行自动化检测,结果为99% Salmonella species, <1% Escherichia coli
VIDAS法
沙门氏菌经过1)前增菌;2) 增菌;3)后 增菌三步,进行上机检测,检测值为1.09≥检
测阈值0.23,判定为沙门氏菌为阳性。
6
比常规PCR更加 灵敏,更加的快 速。但此方法对 酶的活性、引物 特异性要求高, 检测费用昂贵
讨 论
六种方法都有各自的优缺点,单一的检测方法总是
有其难以解决的困难,针对传统方法的缺点,实验中
摒弃了传统的生化鉴定程序,结合API 20法和Vitek 法 别对沙门氏菌进行生化鉴定,这不仅减少了生化鉴定前 的实验准备,而且缩短了传统鉴定的时间。 针对PCR法出现气溶胶、样品间的交叉污染,死 活菌不能区别,产生假阳性结果的不足,我们可以引进
六种沙门氏菌检测方法 的研究
指导教师: 教授 老师 老师
班级: 学生: 学号:
级动医一班
报告内容
研究背景
研究内容 方法 结果
讨论
研究背景
沙门氏菌属是一群寄生在人和动物肠
道内的无芽孢直杆菌,能引起人和动
物的多种沙门氏菌病,是人类食物中 毒的主要病原之一,是食品安全与质 量检测的一项重要指标。
沙门氏菌在干制生化鉴定试剂盒的反应结果
氨基酸 赖氨酸 靛基质
尿素
氰化钾 氰化钾 甘露醇 山梨醇 对照
ONPG
+
+
―
―
―
―
+
+
―
血清学鉴定
O抗原鉴定
多价 O4 O
+ ―
O3
―
O10
―
O7
―
O8
―
O9
―
O2
―
O11
―
O1
+
O5
+
O27
+
H抗原鉴定
g ― f ― s ― i + b ― d ― a ― c ― h ― m ― w ―
20μL
两步法
RT-PCR
40个循环
实时荧光PCR法
标准曲线:y = -3.3971x + 27.313 相关系数:R²= 0.9996
标准曲线扩增图 标准曲线
实时荧光PCR法
灵敏性检测 融解曲线
讨 论
1
鉴定结果准确, 但步骤繁琐,耗 时4~7d
2
不需要特殊仪器, 操作方法简便, 但只能用于鉴定 单个细菌的纯培 养物,结果判定 依赖于操作者的 肉眼判断
美国的一种新检测方法,在检测样品中添加一种染料, 这种染料可以被死亡的沙门氏菌吸收。这种新的 PCR 法保留了 PCR检测快速、敏感、特异的优点,同时避 免了可能产生假阳性的缺点。
讨 论
在试图减少检测时间方面,美国科学家 R Ferretti用沙门氏菌在缓冲蛋白胨水BPW 中非选择性增菌6h,再进行细菌DNA提取 和普通PCR实验,此方法仅用时12h。在实 时荧光PCR中引入此方法,缓冲蛋白胨水 增菌6h,45min水煮法提取DNA,实时荧光 PCR30min,在8h内就能检测出沙门氏菌。
讨 论 传统的方法结合API 20E和Vitek法对一 般细菌的检测都能做到直接、快速和准确。 当有大量的待检样品时,VIDAS法可以快 速、准确的判断出细菌的阴阳性,再结合 传统方法进行检测,即节省了时间又避免 了假阳性、假阴性对检测的影响。当某地 区发生突发性的细菌病时,采用实时荧光 PCR法可在8h内检测出细菌的阴阳性,再 结合血清学鉴定,为细菌病的治疗、防控 奠定了基础。
研究背景
沙门氏菌的风暴已经席卷全球
六种沙门氏菌的检测方法
一 传 统 检 测 法
二
三
四
TEXT
五
六
API 20 VITEK 法 法
VIDAS 法
普 通 PCR 法
实 时 荧 光 法
5
传统检测法
4.血清学鉴定 3.生化鉴定 2.染色特性 1.培养特性
One Two Three
Four
Company Logo
3
快速、准确,操 作步骤简便,人 为因素的影响小, 但是鉴定时需要 纯培养,对菌悬 液的制备和浓度 也有要求
讨 论
4
检测范围广,耗 时短,不需要样 品前处理和纯化, 且稳定性高,但 需要特殊的仪器 和设备,使用成 本高
5
简便、快速、对 标本的纯度要求 低,但容易出现气 溶胶、样品间的 交叉污染,死活 菌不能区别,产 生假阳性结果
致 谢
感谢
教授悉心指导。
感谢甘肃省出入境检疫检验综合技术中心给予我这次实习
的机会,感谢
老师和
师姐在实验过程中和的教导,
让我真正感觉到我们专业的作用,同时也增长了不少的专 业知识和兴趣。 感谢动物医学院所有老师的细心教导,以及大学4年来对 我的帮助和关心 。
沙门氏菌在各培养基上的典型特征
A. BS琼脂平板
B. SS琼脂平板
C. 显色培养基
D. XLD琼脂平板
染 色 特 性
A.标准菌株:ATCC 14028
生 化 鉴 定
沙门氏菌生化试验反应结果
三糖铁琼脂 底层 产气
斜面
硫化氢
赖氨酸 OPNG 脱羧酶 + ―
V-P ―
吲哚 ―
K
A
+
+
注: K:产碱; A:产酸; +:阳性;―:阴性
最后得出结果为(1,4,5,12:i) 判定为鼠伤寒沙门氏菌
API 20法
API 20E法根据沙门氏菌的21个生化反应,每3个试验
为一组,每个阳性试验分别赋予数值1、2或4,阳性反应
以相应的数值相加,根据鉴定手册鉴定为Salmonella spp
沙门氏菌API-20E 试条中的生化反应结果
ห้องสมุดไป่ตู้
VITEK法