实验十四18SrDNA在人类染色体上的免疫荧光原位杂交(选做,

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(1)剪取适当大小的带有正电荷的尼龙膜 (Roche)。 (2)将标记探针分别稀释至原浓度的10-1、10-2、 10-3、10-4和10-5,分别点各浓度稀释物和若干 已知DIG标记DNA浓度的样品各1 L于膜上。 (3)在80 ℃下烤膜2 h,使DNA固定于膜上。 ( 4)将膜置于封堵缓冲液中,浸泡2 min。封堵缓 冲液成分为含有1×封堵剂(Blocking Reagent, Roche)的马来酸缓冲液( 0.1 mol/L 马来酸, 0.15 mol/L NaCl,pH 7.5)。 (5) 以 1 ∶ 2 0 0 0 稀 释 抗 体 Anti-digoxigenin-APconjugate(alkaline phosphatase,AP)于上述
(6)将尼龙膜转移至封堵溶液中,浸泡1 min。 (7)使尼龙膜在冲洗缓冲液( Washing Buffer) (含 0.3 % Tween-20 的马来酸缓冲液)中晃动 1 min。 (8) 在 检 测 缓 冲 液 ( Detection Buffer)(0.1 mol/L Tris-Cl,0.1mol/L NaCl,pH 9.5) 中 平 衡1 min。 (9)将 40 L NBT/BCIP 储存液( Roche)稀释于 2 mL检测缓冲液中。 (10)将尼龙膜转移至显色缓冲液中,黑暗中显色5 min~30 min。 (11)对照各杂交点的颜色深浅,判断标记混合物 中探针浓度。
实验十四
18S rDNA在人类染色体上的 免疫荧光原位杂交
(选做,综合性实验,自我设计, 开放性实验 18学时)
什么是免疫荧光原位杂交

原位杂交(in situ hybridization)是一种在显微或 亚显微结构水平上对某些特异的DNA或RNA片段 进行定位研究的技术,是研究基因定位,基因扩 增和基因表达的最重要,最直接和最有效的手段。 免疫荧光原位杂交技术就是其中的一种。这种方 法比较简便,能够检测出中期或间期染色体上各种 长度的DNA片段和单一中期染色体上的DNA片段, 被认为是进行基因定位研究的最快速和最有效的 方法之一。
实验原理

由于抗体和抗原间的特异性反应,抗Bio 或 抗Dig抗体便与探针分子中的Bio 或Dig结合。 在荧光显微镜下,抗Bio 或抗Dig抗体因携 带有一定数量的荧光素分子而发出一定颜 色的荧光,籍此,细胞学制片中待测的 DNA或RNA片段被定位。
常用的荧光素染料



异硫氰酸荧光素(fluorescein isothiocyanate,FITC) 四乙基罗达明B-200(lissamine rhodamine B-200,RB-200) 四甲基异硫氰酸罗达明(tetramethyl rhodamine isothiocyanate,TMRITC)
染色体标本预处理
( 1 )每张载玻片上滴加 100 L RNA 酶( Rnase) (100 g/mL),盖parafilm膜,37 ℃温育1 h。 (2)2×SSC洗载玻片3×5 min。 (3)-20 ℃下70% 85% 100%乙醇系列脱水各5 min后,室温下干燥。 ( 4 )每张载玻片上滴加 200 L 胃蛋白酶( Pepsin) (Sangon)( 含 0 . 0 1 % 胃 蛋 白 酶 的 1 0 mmol/L HCl),盖parafilm膜,37 ℃温育10 min。 (5)1×PBS 洗 涤 2 × 5 min,10×PBS 中 包 含 : 8 % NaCl、0.2% KCl、1.44% Na2HPO4 和 0 . 2 4 % KH2PO4。
杂交



(1)配制杂交液,其组分为:50%去离子甲酰胺, 2 × SSC,50 mmol/L 磷 酸 钠 , 1 0 % 硫 酸 葡 聚 糖 (dextran sulfate,DS),0.1% SDS和2 ng/L 探针DNA。 (2) 杂交液在沸水中变性 10 min,然后迅速冰 浴至少5 min。 (3)将杂交液滴加到染色体标本上(10 L/片), 盖上盖玻片,置于37 ℃湿盒中杂交过夜。
接上步
( 6 ) 加 2 L 0.2 mol/L EDTA pH8.0,2.5 L 4 mol/L LiCl,75 L 冰冷无水乙醇混 匀。 (7)-20 ℃沉淀2 h后,12000 rpm离心15 min。 (8)70%冷乙醇洗涤沉淀两遍。 (9)加入20 L TE溶解沉淀。
探针检测
实验目的
了解免疫荧光原位杂交的基本原理和 意义,掌握细胞免疫荧光原位杂交的 基本条件,方法和步骤。 熟悉染色体上核仁形成区的所在部位Fra Baidu bibliotek及特征,验证杂交位点与NORs的关系

实验原理

免疫荧光原位杂交的基本原理是基于免疫学研究 中抗原和抗体间的特异性反应与常规的荧光显微 镜镜检技术。在这种技术中,用于进行原位杂交 的DNA或RNA探针首先用结合有Bio(botin,生 物素)或Dig(digoxigenin,异羟基洋地黄毒甙) 的核甘酸类似物(Bio-11-dUTP,Bio-11UTP, Dig-11-dUTP,Dig-11-UTP)标记,然后使用结 合有荧光素分子的抗Bio 或抗Dig抗体或抗抗体处 理实施原位杂交后的细胞学制片。
接上步


( 6 )用含 50 mmol/L MgCl2 的 1 × PBS 洗涤玻片 5 min。 (7)用含50 mmol/L MgCl2和1%甲醛的1×PBS固 定标本5 min。 (8)2×SSC洗玻片2 min。 (9)在含70%去离子甲酰胺的2× SSC中 65 ℃处 理2 min。 (10)-20 ℃下70% 85% 100%乙醇系列脱水 各5 min后,室温下干燥。
探针标记及纯化 探针标记采用随机引物法标记
(1)纯化后的45SrDNA在沸水中变性10 min。 (2)将变性rDNA立即放至冰水中至少5min。 (3) 加 入 2 L 六 碱 基 随 机 引 物 , 2 L dNTP (dATP,1mmol/L;dCTP,1mmol/L;dGTP, 1mmol/L;dTTP,0.65 mmol/L;DIG-11-dUTP, 0.35 mmol/L,pH 7.5)(Takara)。 (4) 加 入 Klenow 酶 2 U(Takara), 加 水 补 足 2 0 L。 (5)37 ℃过夜标记20 h。
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