液体活检精品PPT课件
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of circulating tumor DNA. Nature Biotechnology(2016) doi:10.1038/nbt.3520 7
cfDNA－片段谱系分析
ห้องสมุดไป่ตู้
Deep sequencing of circulating cell-free DNA yields a dense, genome-wide map of nucleosome occupancy that enables identification of its cell-types of origin, potentially enabling the noninvasive monitoring of a broader set of clinical conditions
Ellen Heitzer,Peter Ulz,and Jochen B.Geig.Circulating Tumor DNA as a Liquid Biopsy for Cancer.
Clinical Chemistry . 2015,112–123
10
液体活检应用价值（分析耐药株的遗传变异）
Ellen Heitzer,Peter Ulz,and Jochen B.Geig.Circulating Tumor DNA as a Liquid Biopsy for Cancer.
Clinical Chemistry . 2015,112–123
6
ctDNA-高通量测序
1 ： CAPP-Seq （ cancer personalized profiling by deep sequencing ） 癌 症 个 体化深度测序分析方法:利用定制化的 NimbleGen SeqCap EZ Choice Library 作 为”筛选器“对样本靶向捕获后再深度测 序，灵敏度高，特异性强且经济可行。
Matthew W. Snyder, Martin Kircher,Andrew J. Hillet al. Footprint that Informs Its Tissues-Of-Origin.Cell. 2016
JCaenll-1f4re;1e6D4N(1A-2C):o5m7-p68ri.s8es
• 适应症广泛，如乳腺癌、结直肠癌、肺癌、胃癌、食管癌等常见肿瘤 均可用液态活检技术进行诊断与监测。
• 2015年美国发布的肿瘤治疗计划的四大举措之一：“液态活检”血浆 开发新方法来评估治疗反应以及抵抗可能的耐药性。
• 根据中国国家癌症中心发布的数据，我国5年内诊断为癌症且仍存活的 病例数约为749万。也是液态活检巨大的市场。
2 ： 利 用数 字错 误抑 制 （ IDES ）的 方法和 CAPP-seq（ctDNA测序方法），能够检测到 频率低至0.004％的突变等位基因
Newman AM , Lovejoy A F , Klass DM, et al. Integrated digital error suppression for improved detection
• 提示肿瘤发展进程及抗 药性等信息，指导个体 化精准治疗
Diaz LA Jr, Bardelli A.Liquid Biopsies: Genotyping Circulating Tumor DNA. J3Clin Oncol. 2014; 32(6):
579–586
cfDNA cell-free DNA
cfDNA
• What :循环游离DNA，机体细胞释放入外周血 循环后发生部分降解的内源性DNA。高度片段 化，约170bp。
（
• Source:正常细胞、异常细胞（如肿瘤细胞） ，病毒DNA 等
• State: 半衰期短，动态表达量，核小体以单 个、双联或三联的形式进入血液，并逐步分解 。
）
4
ctDNA circulating tumor DNA
液体活检在肿瘤精准治疗中的研究进展
1
内容摘要
一. 液体活检
1）cfDNA&ctDNA & CTC概念和最新研究进展
2）液体活检应用和意义
二. CTC/CTSC研究方法和进展 三. 我们的研究
2
液态活检
• 来源于肿瘤组织，存在 于血液中：
• 循环肿瘤细胞 （CTC） • 循环肿瘤DNA（ctDNA） • 肿瘤外泌体 exosome
12
CTC 研究概况
1）CTC与转移的关系 2）CTC异质性与肿瘤治疗
3）CTC应用和意义 4）CTC 研究方法
13
CTCs (circulating tumor cells, CTCs)
Ashworth早在1896年就提出了循环肿瘤细胞的概念。侵入循环系 统的肿瘤细胞，大部分由于机体的免疫识别、机械杀伤及自身凋亡在 短期内死亡，只有极少数存活下来，在适于自身存活和增殖的器官或 组织形成转移灶。
ctDNA
• What: 循环肿瘤DNA，是指肿瘤细胞DNA经脱落或 细胞凋亡后释放进入循环系统。一种特征性的肿
（ 瘤生物标记物，可以被定性、定量和追踪。
• Source:来源于肿瘤细胞的cfDNA，属于cfDNA的 一种类型。不同患者的水平差异显著，受肿瘤负 荷，分期等因素的影响
5
cfDNA & ctDNA
an
In
Vivo
Nucleosome
CTC circulating tumor cells
CTC
What： 循环肿瘤细胞，是指从实体瘤中脱离出来并 进入外周血液循环的肿瘤细胞。
（
Source: 原发肿瘤和转移灶都会释放CTC。可检测到 的CTC是肿瘤细胞在循环系统微环境下生存竞争的结
果。
）
9
液体活检应用价值（监测肿瘤特异性突变发现肿瘤复发）
Ellen Heitzer,Peter Ulz,and Jochen B.Geig.Circulating Tumor DNA as a Liquid Biopsy for Cancer.
Clinical Chemistry . 2015,112–123
11
液体活检优势及前景
• 液态活检无侵入性、可频繁多次检测及快速反应能力均体现出发展潜 力巨大应用价值。将削减无效肿瘤医疗开支、降低医疗成本。
cfDNA－片段谱系分析
ห้องสมุดไป่ตู้
Deep sequencing of circulating cell-free DNA yields a dense, genome-wide map of nucleosome occupancy that enables identification of its cell-types of origin, potentially enabling the noninvasive monitoring of a broader set of clinical conditions
Ellen Heitzer,Peter Ulz,and Jochen B.Geig.Circulating Tumor DNA as a Liquid Biopsy for Cancer.
Clinical Chemistry . 2015,112–123
10
液体活检应用价值（分析耐药株的遗传变异）
Ellen Heitzer,Peter Ulz,and Jochen B.Geig.Circulating Tumor DNA as a Liquid Biopsy for Cancer.
Clinical Chemistry . 2015,112–123
6
ctDNA-高通量测序
1 ： CAPP-Seq （ cancer personalized profiling by deep sequencing ） 癌 症 个 体化深度测序分析方法:利用定制化的 NimbleGen SeqCap EZ Choice Library 作 为”筛选器“对样本靶向捕获后再深度测 序，灵敏度高，特异性强且经济可行。
Matthew W. Snyder, Martin Kircher,Andrew J. Hillet al. Footprint that Informs Its Tissues-Of-Origin.Cell. 2016
JCaenll-1f4re;1e6D4N(1A-2C):o5m7-p68ri.s8es
• 适应症广泛，如乳腺癌、结直肠癌、肺癌、胃癌、食管癌等常见肿瘤 均可用液态活检技术进行诊断与监测。
• 2015年美国发布的肿瘤治疗计划的四大举措之一：“液态活检”血浆 开发新方法来评估治疗反应以及抵抗可能的耐药性。
• 根据中国国家癌症中心发布的数据，我国5年内诊断为癌症且仍存活的 病例数约为749万。也是液态活检巨大的市场。
2 ： 利 用数 字错 误抑 制 （ IDES ）的 方法和 CAPP-seq（ctDNA测序方法），能够检测到 频率低至0.004％的突变等位基因
Newman AM , Lovejoy A F , Klass DM, et al. Integrated digital error suppression for improved detection
• 提示肿瘤发展进程及抗 药性等信息，指导个体 化精准治疗
Diaz LA Jr, Bardelli A.Liquid Biopsies: Genotyping Circulating Tumor DNA. J3Clin Oncol. 2014; 32(6):
579–586
cfDNA cell-free DNA
cfDNA
• What :循环游离DNA，机体细胞释放入外周血 循环后发生部分降解的内源性DNA。高度片段 化，约170bp。
（
• Source:正常细胞、异常细胞（如肿瘤细胞） ，病毒DNA 等
• State: 半衰期短，动态表达量，核小体以单 个、双联或三联的形式进入血液，并逐步分解 。
）
4
ctDNA circulating tumor DNA
液体活检在肿瘤精准治疗中的研究进展
1
内容摘要
一. 液体活检
1）cfDNA&ctDNA & CTC概念和最新研究进展
2）液体活检应用和意义
二. CTC/CTSC研究方法和进展 三. 我们的研究
2
液态活检
• 来源于肿瘤组织，存在 于血液中：
• 循环肿瘤细胞 （CTC） • 循环肿瘤DNA（ctDNA） • 肿瘤外泌体 exosome
12
CTC 研究概况
1）CTC与转移的关系 2）CTC异质性与肿瘤治疗
3）CTC应用和意义 4）CTC 研究方法
13
CTCs (circulating tumor cells, CTCs)
Ashworth早在1896年就提出了循环肿瘤细胞的概念。侵入循环系 统的肿瘤细胞，大部分由于机体的免疫识别、机械杀伤及自身凋亡在 短期内死亡，只有极少数存活下来，在适于自身存活和增殖的器官或 组织形成转移灶。
ctDNA
• What: 循环肿瘤DNA，是指肿瘤细胞DNA经脱落或 细胞凋亡后释放进入循环系统。一种特征性的肿
（ 瘤生物标记物，可以被定性、定量和追踪。
• Source:来源于肿瘤细胞的cfDNA，属于cfDNA的 一种类型。不同患者的水平差异显著，受肿瘤负 荷，分期等因素的影响
5
cfDNA & ctDNA
an
In
Vivo
Nucleosome
CTC circulating tumor cells
CTC
What： 循环肿瘤细胞，是指从实体瘤中脱离出来并 进入外周血液循环的肿瘤细胞。
（
Source: 原发肿瘤和转移灶都会释放CTC。可检测到 的CTC是肿瘤细胞在循环系统微环境下生存竞争的结
果。
）
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液体活检应用价值（监测肿瘤特异性突变发现肿瘤复发）
Ellen Heitzer,Peter Ulz,and Jochen B.Geig.Circulating Tumor DNA as a Liquid Biopsy for Cancer.
Clinical Chemistry . 2015,112–123
11
液体活检优势及前景
• 液态活检无侵入性、可频繁多次检测及快速反应能力均体现出发展潜 力巨大应用价值。将削减无效肿瘤医疗开支、降低医疗成本。