电穿孔转染质粒DNA
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质粒的构建:
1. 酶切反应
按照1ugDNA需1-10u内切酶的用量,在反应体系中加入相应的10×缓冲液,内切酶的体积不得大于总体积的十分之一,ddH2O补足体系,如需长时间消化,还需加入适量的BSA 已稳定内切酶活性。
2. DNA片断的回收
欲回收的DNA片断经琼脂糖凝胶电泳分离后,切下所需片断所在的凝胶(胶的体积尽可能小),加入3倍体积的BufferQX1,及适量的QIAXⅡ(Glassmilk),55℃10分钟,每隔2分钟涡旋1次,待凝胶完全溶解,12000转离心1分钟,BufferQX1洗涤沉淀1次以消除剩余凝胶.。再用BufferB洗涤沉淀2次,将沉淀晾干,加入适当体积的ddH2O,离心后收集上清,琼脂糖凝胶电泳确定回收效率。
3. DNA片断3凹端的补平
于Eppendorf管中依次加入DNA0.2-5ug,2mMdNTP2ul,人以一种酶切缓冲液(10×)2ul,加水至19ul。然后加入1-5单位Klenow酶,混匀后室温下反应15分钟。待补平反应结束后,于65℃水浴20分钟使Klenow酶失活,电泳定量后即可用于连接反应或-20℃保存备用。
4. DNA片断3凸端的补平
于Eppendorf管中依次加入DNA0.2-5ug,2mMdNTP2ul,人以一种酶切缓冲液(10×)2ul。,加水至19ul。然后加入1-2单位T4噬菌体DNA聚合酶,12℃温育15分钟,于75℃加热10分钟,使T4噬菌体DNA聚合酶灭活。
5. 载体的脱磷酸化:
载体质粒经内切酶酶切后可直接进行脱磷酸化处理。40ul的酶切反应体系,景点永建车酶切完全后可加入10×CIAP(牛小肠碱性磷酸酶)缓冲液5ul,水4ul和适量CIAP进行脱磷酸化反应。
CIAP的用量依载体5端磷酸的摩尔数及末端性质而定,对于5突出的末端,每100pmol 5末端磷酸需1单位CIAP,对于5凹端或平末端,每2pmol 5端末端磷酸需1单位CIAP,一般2ug 5kb的线性化质粒DNA约翰1.4pmol 5端磷酸。
反应条件:1)5突出末端:加入CIAP后于37℃反应30分钟,再加另一小份CIAP(加入量依DNA量而定),继续反应30分钟。2)5凹或平末端:加入CIAP后于37℃反应15分钟,56℃反应15分钟,再加另一小份CIAP(加入量依DNA量而定),又于37℃反应15分钟,56℃反应15分钟。
反应结束后,加300ulCIAP反应终止液(10mM Tris-Cl pH 7.5,1mM EDTA pH7.5,200mM NaCl,0.5%SDS),依次用酚、酚/氯仿和氯仿抽提,加0.5倍体积7M醋酸铵,2倍体积酒精沉淀,室温晾干,溶于适量TE缓冲液中。
6. 连接反应
用适当的内切酶酶解载体和插入片断,DNA片断回收后电泳检查比较二者的浓度,按载体:插入片断1:4-6的比例将二者加入到连接反应体系中,加入10×连接缓冲液1ul,补水至10ul,取出1ul 作连接前对照,然后加入1单位的T4DNA连接酶(平末端连接加入5单位的T4DNA 连接酶),12-14℃水浴中过夜,平末端连接在20-22℃进行。次日,转化大肠杆菌感受态细胞。
7. 感受态大肠杆菌制备
将宿主菌的单菌落接种到5ml LB培养基中,37℃振摇过夜,次日,取1/50体积的过夜菌液接种到50-100mlLB培养基中,37℃振摇,待菌液OD600 接近0.3-0.4时,于4℃4000转离心10分钟,收集菌体,取原菌液体积的1/5体积预冷的0.1M CaCl2溶液,轻轻加至菌体中,冰浴上轻轻摇动离心管,使菌体缓慢散开,冰浴静置20分钟,4℃离心,弃上清。重复上一次操作,同样条件离心收集菌体后,向菌体中加入1/50体积预冷的CaCl2,混匀,冰浴静置12小时后用于转化。感受态细胞于4℃保存一周仍可维持较高效率,或加入1/10体积的DMSO冻存于-70℃保存。
8. 转化
取新鲜制备的感受态细胞溶液100ul置于1.5ml管中,加入5-10ul连接反应液,轻轻混匀后,冰上静置30分钟,然后置于42℃水浴中热休克90秒,加入0.5ml LB培养基,37℃振摇40分钟,然后接种于含氨卞青霉素的LB平板上,37℃孵箱培养10-12小时后观察菌落生长情况。或用快速转化法:取新鲜制备的感受态细胞溶液100ul置于1.5ml管中,加入5-10ul连接反应液,轻轻混匀后,冰上静置5分钟,然后涂布于经37℃预热2小时的含氨卞青霉素的LB平板上,37℃孵箱培养10-12小时后观察菌落生长情况。该方法适用于质粒和粘端连接产物的转化。
9. 质粒DNA的小量制备
在1.5mlEppendorf管中,加入过夜培养的转化细菌液,12000转离心30秒,弃上清,加入100ul溶液Ⅰ(25mM Tris-Cl pH8.0,10mM EDTA pH 8.0,50mMSucrose)震荡混匀,在加入200ul溶液Ⅱ(0.2M NaOH,1%SDS)混匀后室温变性5分钟,加入150ul溶液Ⅲ(3M KAC,pH4.6)混匀中和5分钟,12000转离心5分钟,转移上清至另一Eppendorf管中,加入1ml 无水乙醇,-20℃静置5分钟,12000转离心5分钟,70%乙醇洗沉淀一次,室温晾干,沉淀溶于50ulTE缓冲液中。
10.质粒DNA的大量制备
将宿主菌的单菌落接种到含适当抗菌素的5ml LB培养基中,37℃振摇培养过夜,次日,取
0.1ml过夜菌液接种到含抗菌素的25mlLB培养基中,37℃振摇培养到OD600 接近0.6,将25ml培养物转移至含抗菌素的500mlLB培养基中,37℃振摇2.5小时(OD600约为0.4),加入2.5ml氯霉素溶液(34mg/ml), 37℃振摇培养过夜,于4℃4000转离心10分钟,收集菌体,用20ml含溶菌酶(5mg/ml)的溶液Ⅰ(25mM Tris-Cl pH8.0,10mM EDTA pH 8.0,50mMSucrose)悬浮细菌,室温静置5分钟,加入新鲜配置的溶液Ⅱ(0.2M NaOH,1%SDS)40ml,冰上混匀变性10分钟,加入30ml溶液Ⅲ(3M KAC,pH4.6)中和10分钟。4℃12000转离心20分钟,转移上清至另一管中,加入0.6倍体积的异丙醇,混匀,室温放置30分钟,室温12000转离心15分钟,用70%乙醇洗沉淀一次,室温晾干,沉淀溶于8mlTE缓冲液中
,称取8gCSCl加至DNA溶液中,加入0.6mlEB(10mg/ml)溶液中,于20℃,45000转离心24小时,用毛细管吸出质粒DNA区带。水饱和正丁醇抽提数次去除EB,用4倍体积ddH2O稀释含CSCl的DNA溶液,再用2.5倍体积的无水乙醇沉淀DNA,-20℃静置1-2小时,于4℃15000转离心20分钟,用70%乙醇沉淀一次,室温晾干后,荣誉适量的(0.5-1ml)TE缓冲液中,电泳检查DNA质量,读取OD260与OD280,计算DNA浓度与纯度。
电穿孔转染质粒DNA
1) 电穿孔前一天,以合适密度传代细胞,使细胞在转染前处于对数生长期。
2) 胰酶消化收集贴壁细胞,离心收集细胞。用电转缓冲液洗细胞两次。电转缓冲液为磷酸缓冲液。
3) 弃上清,用0.5ml电转缓冲液重悬细胞,细胞浓度最好在2×106-2×107之间。细胞悬液移入0.4cm电转杯中,加入5-40ug质粒,轻弹混匀。置于冰上10分钟。
4) 电击。对大部分哺乳动物细胞,电压为250-400伏,即625-1000v/cm,电容为960uF。在此条件下,电击时间大约在30-50毫伏。不同的细胞电转的最适条件不同,细胞电击后死亡率在40%-60%左右时转染效率最高。
5) 电击结束后,将细胞置于冰上10分钟。有文献报道,电击前后置于冰上10分钟可提高转染效率。
6) 电击后,细胞移入非选择性培养基培养。培养24小时后,计数,稀释15倍以上,用选择培养基培养。2-4天换液,直至抗性克隆形成。如用于筛选单克隆,HeLa细胞电击24小时后计数,细胞用选择培养基(G418,0.5mg/ml)稀释,以1000细胞/孔的密度传于96孔板。培养10天左右,既有克隆形成。