链霉菌基因实验操作
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LA
LB中加入终浓度为1.5-2%的琼脂粉(不同的琼脂加的量不同,如青岛琼脂大概需1.5%,而华美的需要2%)。
*做蓝白斑筛选时不加葡萄糖
基本培养基(MM)
溶液:L-天冬酰胺0.5g,
K2HPO4 0.5g,
MgSO4·7H2O 0.2g,
FeSO4·7H2O 0.01g,
蒸馏水至1000ml
将每250ml溶液分装到装有2.5g琼脂的500ml三角瓶中,灭菌,使用时每瓶加入50%葡萄糖(8磅灭菌)5ml,调pH7.0。
配置MM的琼脂有lab agar、Ice agar(IA)
R5(1L)链霉菌原生质体转化时用
蔗糖103g
K2SO4 0.25g
MgCl2·6H2O 10.12g
葡萄糖10g
Difco酪蛋白氨基酸0.1g
微量元素溶液2ml
Oxoid酵母提取物5g
TES 5.73g
加蒸馏水至1000ml
称取5.5g Difco琼脂放入500ml三角瓶中,倒入250ml上述溶液,然后塞上塞子后8磅灭菌(114度15分种)。使用时,将培养基融化,每瓶中加入:
KH2PO4(0.5%) 2.5ml
CaCl2·2H2O(5M) 1ml
L-脯氨酸(20%) 3.75ml
NaOH(1M)调pH至7.3
对营养缺陷型菌株加入适当的营养因子(请参考《手册》)
YEME(酵母膏-麦芽膏培养基) 1L(液体培养链霉菌)
Oxoid酵母提取物3g
Oxoid蛋白胨Tryptone 5g
麦芽提取物(BD公司原Difco公司218630)3g
葡萄糖10g
蔗糖*340g
蒸馏水至1000ml
高压灭菌后加入:(8磅灭菌,113-114゜C,15min,自动灭菌锅一次不能灭过多东西,否则会灭不彻底。)
MgCl2·6H2O(2.5M) 2ml/L
制备原生质体时,还要加入:
甘氨酸(20%)*25ml/L
*蔗糖的主要作用是维持链霉菌生长时的渗透压。
*甘氨酸被认为能干扰链霉菌细胞壁的形成,使菌丝体片段更短,利于溶菌,有利于外源DNA的导入。
TSBY(1L)(液体培养链霉菌)
Oxoid胰胨豆汤粉(TSB)30g
蔗糖*340g
Oxoid酵母抽提物5g
蒸馏水至1000ml
*不同菌株培养需要不同浓度的蔗糖,蔗糖的主要作用是维持链霉菌生长时的渗透压。
MS培养基
将黄豆饼粉加蒸馏水煮2到3小时,用纱布过滤得到滤液,将每250ml滤液分装到装有5g琼脂,5g 甘露醇的500ml三角瓶中,10磅灭菌,使用时调pH7.2-7.3。
2CMY培养基(用于井岗的接合转移)
可溶性淀粉10g
胰蛋白胨2g
NaCl 1g
(NH4 )2SO4 2g
K2 HPO4 1g
CaCO3 2g
无机盐溶液* 1 ml
琼脂20g
蒸镏水1000 ml
PH7.2
无机盐溶液(每升)
FeSO4 .7H2 O 1g
MgCl.6 H2 O 1g
大肠杆菌质粒的抽提
苯酚/氯仿溶液抽提法
1. 接种5ml LB,37℃摇床过夜培养(12小时)
2. 离心,3000rpm,5min去上清
3. 振荡混匀沉淀,分装在2个离心管中,spin一下,吸去上清,加入150μl的溶液I (50mmol/L葡萄糖, 25mmol/L Tris·Cl(PH8.0), 10mmol/L EDTA(PH8.0) 在10lbf/in2
(6.895×104Pa)高压蒸气下灭菌15min(8磅),贮存于4℃),剧烈振荡5分钟打散菌体(菌体不打散容易在产物中出现较多蛋白)。
4. 加入300μl溶液II(0.2mol/LnaOH, 1%SDS, 用2倍的溶液现配现用)后立即振荡混
合均匀,处理2分钟后加入225μl溶液III(5mol/L乙酸钾60ml,冰乙酸11.5ml,水28.5ml)混合均匀,12000rpm离心5min,取上清液中于新的离心管。
5. 加120μl酸性苯酚/氯仿溶液,振荡混匀,12000rpm离心5min,再取上清液中于新的离心管中。
6. 用120ul氯仿重复操作5。
7. 加等体积的异丙醇或2倍体积的乙醇,混匀,12000rpm离心7min。
8. 沉淀用70%乙醇洗涤两次,每次10min。50℃烘干后加适量无菌去离子水(ddH2O)
溶解,-20℃保存。
氯化锂抽提法
1. 前四部同苯酚/氯仿溶液抽提法(用Solution I II III处理)
2. 加等体积的异丙醇,混匀,沉淀DNA,12000rpm离心7min。去上清,尽量去干净。
3. 用少量70%乙醇洗一下(洗去异丙醇),离心去尽酒精,50℃烘干沉淀,用适量ddH2O (100ul)充分溶解(可在50度水浴中助溶)后加入4/5体积的氯化锂溶液(浓度约10mol/L)处理1min沉淀RNA和蛋白。
4. 12000rpm离心5min,取上清液于新的离心管中,用等体积的异丙醇混匀,12000rpm 离心8min,去上清。
5. 将沉淀用70%乙醇洗涤两次,每次10min。50℃烘干后加一定量的无菌去离子水(ddH2O)溶解,-20℃保存。
酶连反应
一般采用10μl反应体系:
T4连接酶1μl,连接酶缓冲液1μl,外源片段与载体按DNA 摩尔含量3:1加入即可。
如果是粘端连接,则需把外源片段和载体的混合物在50度处理10分钟使粘端变性,然后立即放入冰中5分钟。
平端连接采用14度,粘端连接采用16度,连接4小时以上(一般可过夜)。
*外源片段与载体按DNA 摩尔含量为3:1或外源更多。
DNA片段凝胶回收
1试剂盒回收(离心法)(详见说明书)
(1) 在长波紫外灯下切下含有目标DNA的琼脂糖凝胶,用纸巾吸干凝胶表面的液体并切小.计算凝胶的重量,该重量作为一个凝胶体积(如1oomg=1ooul)