分子生物学实验指导
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分子生物学实验指导动植物检疫专业
2012,2
分子生物学实验注意事项
1.课前要提早预习实验内容,了解实验设计的原理,理清实验顺序,制定实验方案(没有方案或方案不合理者不能进入实验操作)。
2.由于实验内容多,时刻短,多数实验需要同时或穿插进行,一定要做好统筹安排。
3.实验课中的所有单项实验都属于一个整体流程。实验时刻安排上没有上下午晚上等严格的作息安排,一切服从实验进度,必须在理论课上课期间完成。
4.实验的每一步都要详细地记录操作内容、时刻、步骤、结果等,以备查询!
5.对任何自己不熟悉的实验仪器都不要随意操作(专门是微量移液器!)。在操作的过程中发觉任何意外的现象都要及时向任课教师汇报。
6.写作实验报告或实验论文一定要文理通顺、逻辑清晰、图表讲明详细,讨论分析透彻。
7.在实验室内不能大声喧哗。
8.在实验的过程中制造的任何垃圾都要丢到垃圾筐里(或先放在自己的桌面一角),严禁随地丢弃!专门注意对废弃细菌的杀灭和有毒垃圾的定点投放。
9.实验终止后要把用过的器皿清洗后归放整齐并清点数目,向教师汇报征得同意后方可离开实验实。
10.值日组的同学最后离开,等待清扫实验室的卫生,关闭门窗水电。
11.实验时损坏的任何物品都要及时申报。
实验一质粒DNA的提取
1.目的
学会最常用的小量制备质粒DNA的碱裂解方法。
2.原理
按照共价闭合环状质粒DNA与线性DNA在拓扑学上的差异来分离。在pH12.012.5那个狭窄的范畴内,线性DNA双螺旋结构解开而被变性。尽管在这项的条件下共价闭合环状质粒DNA也会变性,但两条互补链彼此互相盘绕,仍会紧密结合在一起。当加入pH4.8的乙酸钾高盐缓冲液使pH 复原中性时,共价闭合环状质粒DNA复性快,而线性的染色体DNA复性缓慢,通过离心与蛋白质和大分子RNA一起沉淀下去。
3.器材
超净工作台,接种环,酒精灯,台式离心机,旋涡混合器,微量移液取样器,1.5ml微量离心管,恒温摇床,摇菌试管,双面微量离心管架,试管架,标签纸,磁力搅拌机。
4.试剂
pMD18-T-F载体菌,LB培养基1000ml(含100ug/ml氨苄青霉素),葡萄糖/Tris/EDTA(GTE)溶液(溶液I),NaOH/SDS溶液(溶液II),KAc溶液(pH4.8)(溶液III),RNase A,95%乙醇,70%乙醇,TE buffer(pH8. 0)。
5.实验预备
氨苄青霉素储存液(无菌水配制5mg/ml,分装后-20C储存),配制LB培养基(胰化蛋白胨10g,酵母提取物5g,NaCl 10g加200mL d d water 搅拌完全溶解,用约200L 5N NaOH调pH至7.0,加dd water 至1L,121 C 20min灭菌);溶液I(50mmol/L葡萄糖,25mmol/L Tris HCl pH8.0,10mmol/L EDTA pH8.0);溶液II(0.2mol/L NaOH,1% SDS);溶液III(60mL 5mol/L Kac,加冰乙酸调pH4.8,补dd water至100ml),7
0%乙醇(-20C储存),TE buffer(10mmol/L Tris HCl pH8.0,1mmol/L EDTA pH8.0);10mg /mL RNase A(RNA酶A溶于10mmol/L Tris HCl pH7.5,15mmol/L NaCl中);摇菌试管洗净并盖上棉花塞、1.5ml离心管装入铝制饭盒、移液器吸头装入相应的吸头盒,一起高压灭菌(121 C 30m in)。
6.操作步骤
(1)在超净工作台中取5ml LB(Amp+),加入灭菌的摇菌管中。
(2)从超低温冰箱中取出储存pMD-18T-F的菌种(操作完后迅速把菌种放回超低温冰柜中,切不可将菌融解!),在超净工作台上用烧红的接种环刮一下,再把接种环于无菌LB培养液(含100ug/ml氨苄青霉素)中搅拌一下,37C摇床中摇20h。
(3)取1.5ml的菌液于1.5ml离心管中,15000rpm离心1min,弃上清液(尽量弃洁净),留沉淀备用。
(4)在沉淀中加入100l 溶液I,盖上盖后赶忙在涡旋混合器上混匀,室温下静置5min。(等待的同时,取一个塑料盒,装上适量的冰块备用。)
(5)加入200l 溶液II,盖上盖后上下颠倒几次混匀,插入冰中,放置5min。
(6)加入150l 溶液III,盖上盖后上下颠倒几次混匀,插入冰中,放置5min。
(7)15000rpm离心5min,小心吸取400l 上清液于另一个洁净的1.5ml离心管中,(不要将白色沉淀物带入!),加入800l 95% 乙醇,盖上盖后赶忙在涡旋混合器上混匀,室温下静置5min。
(8)15000rpm离心10 min,小心弃掉上清液,加入500l 70%乙醇,盖上盖后赶忙在涡旋混合器上混匀。15000rpm离心10 min,小心弃掉上清液,尽量倒置弃洁净
(9)再加入500l 70% 乙醇,盖上盖后赶忙在涡旋混合器上混匀。1 5000rpm离心10 min,小心弃掉上清液,尽量倒置弃洁净
(10)离心管倒置于37C培养箱中(或室温)空气干燥。(管底的沉淀质粒DNA用肉眼几乎看不见!)。
(11)pMD18-T-F 加入30l 无菌蒸馏水或TE缓冲液,用记号笔标记后放入冰箱中备用。
(12)在剩余的菌液中倒入少许84消毒液,待溶液变清亮后随废液和剩余的冰块一起倒入下水池。清理桌面,清洗仪器,撰写实验报告7.摸索
(1)阻碍本实验结果的因素有哪些?
实验二、质粒DNA的酶切
1.目的
学会用限制性内切酶切割质粒DNA。
2.原理
II型限制性内切酶能识别双链DNA内部的专门序列并在识别位点处将双链切断,形成粘性末端或齐平末端,通过电用酶切后的DNA混合物能够确认和分离酶切片段。
3.器材
旋涡混合器,微量移液取样器,移液器吸头,1.5ml微量离心管,双面微量离心管架,水漂,恒温水浴。