乙型肝炎病毒核酸定量检测标准作业指导书
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乙型肝炎病毒核酸定量检测标准作业指导书-模板
1.目的
采用PCR技术、实时荧光探针技术,用于临床血清或血浆标本中的乙型肝炎病毒核酸的定量检测,或用于乙型肝炎的辅助诊断和抗病毒药物治疗中的疗效观察。
2.范围
适用于乙型肝炎病毒核酸(HBV DNA)定量检测(PCR-荧光探针法)。
3. 职责
3.1 操作人员:负责标本制备检测、仪器操作、报告发送。
3.2 专业组组长:负责本组耗材的请购,监督本组标本检测、仪器操作、报告发送、质控管理等各方面工作。
3.3 实验室主任:负责监督和指导实验室各方面工作。
4. 原理
采用荧光PCR技术,以HBV基因组中相对保守区为靶区域,设计特异性引物及荧光探针,在样品核酸纯化之后,通过荧光定量PCR对HBV DNA进行扩增,并检测荧光信号,仪器软件系统自动绘制出实时扩增曲线,根据阈循环值(CT)实现对未知样品的检测。另外,本试剂盒带有内标物质,用于对核酸提取的整个过程进行监控,减少假阴性结果的出现。
5. 样品要求
5.1 适用样品类型:血清或血浆。
5.2 样品采集:
5.2.1 血清
用一次性无菌注射器抽取受检者静脉血2ml,注入无菌的真空采血管中(未加抗凝剂),室温(22-25℃)放置30-60min血标本可自发完全凝集析出血清,或直接使用水平离心机,1500rpm离心5min,吸取上层血清,转移至1.5ml灭菌离心管。
5.2.2血浆
用一次性无菌注射器抽取受检者静脉血2ml,注入含EDTA(乙二胺四乙酸二钠)抗凝剂的真空采血管,立即轻轻颠倒混匀5-10次,使抗凝剂与静脉血充分混匀,5-10min后分离血浆于无菌的1.5ml
灭菌离心管。
5.3 样品保存和运送
使用专用样品0℃冰壶送检,温度约维持在4℃左右。分离后的血清或血浆可立即用于测试,也可以保存于-20℃待测,保存期为6个月。
5.4 拒收样品:拒绝重度溶血样品、肝素抗凝的血浆。
6. 仪器和试剂
6.1 仪器
AB7500核酸扩增仪、恒温金属浴、生物安全柜、低温离心机等。
6.2 试剂
生产厂家:中山大学达安基因股份有限公司
产品标准批号:YZB/国7265-2013
线性范围:100 IU/ml-5×108 IU/ml
最低检出限及定量限:最低检出限浓度为30 IU/ml,最低定量浓度为100 IU/ml。
试剂各组分见表1:
表1 试剂盒组分表
7. 操作步骤
7.1 试剂准备(试剂储存和准备区)
7.1.1 进入试剂准备区,打开通风设备,按照消毒清洁程序擦拭实验台面。
7.1.2 取出N个(N=待测样品数+8 =待测样品数+ 4个HCV阳性定量标准品+HCV强阳性质控品+HCV临界阳性质控品+阴性质控品+空白孔)PCR反应管,HBV单人份扩增体系配制如下表2:
表2 反应液配制表
将各组分充分混匀,混合好后进行瞬时离心将管壁上的液体全部离心至管底,之后将30 ul扩增体系分装到PCR反应管,反应液分装时尽量避免产生气泡,盖紧管盖,经传递窗传递到标本制备区。
7.2 DNA提取(标本制备区)
7.2.1 进入标本制备区,从传递窗中取出PCR反应管,将其放入标本制备区冰箱冷藏。
7.2.2 从冰箱取出待测样品、阴性质控品、强阳性质控品、临界阳性质控品、DNA提取液Ⅰ和内标液,放入生物安全柜内室温溶解,备用。
7.2.3 打开金属浴,调节温度为100℃,使仪器自动升温。
7.2.4 用镊子夹取按需要量准备的1.5 ml灭菌离心管放于安全柜内离心管架上,所需离心管数为样品数+8。
7.2.5向离心管中各加入450 ul DNA 提取液Ⅰ和4 ul内标溶液,再按编号加入200 ul样品,离心管与样品对应编号,每个离心管的编号方向都要朝向管口开启的方向。用振荡器剧烈震荡混匀15s,瞬时离心数秒。
7.2.6将离心管放入金属浴,100℃恒温处理10±1 min。(摆放离心管时,离心管开口要背向人放置。)7.2.7 温育10min后,用镊子从金属浴中取出所有离心管,室温静置冷却。12000g,离心5min,备用。(摆放离心管时要将离心管开口朝向内侧。)
7.2.8 从标本制备区冰箱冷藏室取出分装好的HBV DNA PCR反应管,向对应编号的PCR管中加入处理好的的样品(包括样品、阴性质控品、阳性质控品、临界阳性质控品)上清液各20 ul,空白对照不加模板,盖紧反应管。8000rpm离心数秒,经传递窗移至扩增检测区。(用移液枪小心吸取上清液,尽量不要碰到底层沉淀。)
7.3 PCR扩增(扩增区)
7.3.1 从传递窗中取出PCR反应管,放入仪器样品槽内。
7.3.2 按对应顺序设置空白管、阴性质控品、阳性室内质控品、临界阳性质控品、阳性定量参考品及待测样品,并在“sample name”一栏中设置样品名称,探针检测模式设置:Reporter Dye1:FAM,Quencher Dye1:none;Reporter Dye2:VIC,Quencher Dye2:none;Passive Reference:Rox。具体设置方法参考《AB 7500核酸扩增仪标准作业指导书》。
7.3.3 打开Run窗口设置循环条件:
93℃ 2 min;
93℃ 45 s → 55℃ 60 s,10个循环;
93℃ 30 s → 55℃ 45 s,30 个循环。
7.3.4 保存文件,运行仪器。
8. 结果分析
8.1 反应结束后,操作人员可根据实际情况自行调节Baseline的Start值、End值以及Threshold值。Start值可以在3-15,End值可设在5-20。在Log图谱窗口设置的Threshold的Value值,使基线位于扩增曲线指数期,调整阴性质控品的扩增曲线平直或低于阈值线,点击Analysis自动获得分析结果在Report界面查看结果,记录样品数值(C)。
8.2 如果在FAM检测通道扩增曲线无明显对数增长期或CT值等于30,在VIC检测通道扩增曲线有对数增长期,则判定样品的HBV DNA浓度小于检测灵敏度。
8.3 如果在FAM检测通道扩增曲线有对数增长期且CT值小于30,则按以下方法判断:
(1)若样品的C﹤100,则样品的HBV DNA浓度﹤100IU/ml;
(2)若样品的100﹤C﹤5.0E+008,则样品的HBV DNA浓度=C IU/ml;
(3)若样品的>5.0E+008,则样品的HBV DNA浓度>5×108 IU/ml;如需要精确定量结果,可将样品用阴性质控品稀释到线性范围后在检测。则该样品的HBV DNA浓度=(C×稀释倍数)IU/ml。
9. 质量控制
每次实验均需检测阴性质控品、HBV 强阳性质控品、HBV临界阳性质控品。质控品结果满足质量控制要求时方可进行检测结果的判断。
9.1 试剂盒自带质控
(1)阴性质控品:FAM检测通道扩增曲线无明显对数增长期或CT值=30,VIC检测通道扩增曲线为明显对数增长期;
(2)HBV 阳性质控品:FAM检测通道扩增曲线有明显对数增长期且CT值<30,强阳性质控