洋桔梗ACC合酶基因RNA干扰之载体pCAMBIA1301-gfp-(GUS+ACS)i-NPTII的构建第三篇周记

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进行实验的下步操作:含质粒菌种的保存和鉴定

用甘油作为保护剂,采用低温冻结法保存含质粒的大肠杆菌,同时采用酶切法对质粒进行鉴定。

(1)挑取阳性单克隆入5ml含50ug/mlKm的LB液体培养基,37℃恒温振荡培养12-16h;

(2)吸取1ml菌液于1.5ml无菌EP管,加入440ul 50﹪甘油,混匀,制成甘油菌,-80℃速冻保存;

(3)从剩余的4ml菌液中提取质粒,具体方法参见普通质粒小提试剂盒说明:

①柱平衡步骤;向吸附柱CP3中(吸附柱放入收集管中)加入500ul的平衡BL,

12,000rpm(~13,400×g)离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。(请使用当天处理过的柱子)

②去1-5ml过夜培养的菌液,加入离心管中,使用常规台式离心机,12,000rpm(~

13,400×g)离心1min,尽量吸出上清(菌液较多时,可以通过多次离心将菌体沉淀收集难题到一个离心管中)

③向留有菌体沉淀的离心管中加入250ul溶液P1(请检查是否已加入RNaseA),

使用移液器或涡旋振荡器彻底悬浮细菌沉淀。注意:如果有未彻底均匀的菌块,会影响裂解,导致提取量和纯度降低;

④向离心管中加入250ul溶液P2,温和的上下翻转6-8次使菌体充分裂解。注

意:温和的混合,不要剧烈晃动,以免打破基因组DNA,造成提取的制粒中混有基因组DNA片段。如果未变的程亮,可能由于菌体过多,裂解不彻底,营减少菌体量;

⑤向离心管中加入250ul溶液P3,立即温和的上下翻转6-8次,充分混匀,此

时应出现白色絮状沉淀。12,000rpm(~13,400×g)离心10min,此时在离心管底部形成沉淀。注意:P3加入后应立即混合,避免产生局部沉淀。如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清;

⑥将上一步收取的上清液用移液管转移到吸附柱CP3中(吸附柱放入收集管中),

注意尽量不要吸出沉淀。12,000rpm(~13,400×g)离心30-60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP3放入收集管中;

⑦可选步骤:向吸附柱CP3中加入500ul去蛋白液PD, 12,000rpm(~13,400×g)

离心30-60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP3重新放回收集管中。如果宿主菌是end+宿主菌,这些宿主菌含有大量的核酸酶,易降解质粒DNA,推荐采用此步。如果宿主菌是endA-宿主菌,这步可省略;

⑧向吸附柱CP3中600ul漂洗液PW(请检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm(~

13,400×g)离心30-60秒,倒掉收集管管中的废液,将吸附柱CP3放入收集管中;

⑨向吸附柱CP3放入收集管中,12,000rpm(~13,400×g)离心2min,目的是将

吸附柱中残余的漂洗液去除注意:漂洗液中乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR)实验。为确保下游实验不受残留乙醇的影响,建议将吸附柱CP3开盖,置于室温数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液;

⑩将吸附柱CP3置于一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位滴加50-100ul 洗脱缓冲液EB,室温放置2min, 12,000rpm(~13,400×g)离心1min将质粒

溶液收集到离心管中。注意:洗脱缓冲液体积不应少于50ul,体积过小影响回

收率。洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大的影响。

(4)去1ul的质粒小提产物点入含0.5ug/ml溴化乙钉的1.0﹪琼脂糖凝胶加样孔,于1×TAE电泳缓冲液中,设定100V/cm稳定电泳30min。置电泳

结果于紫外分析仪上观察,并通过UVP紫外凝胶成像系统采集图像;

(5)酶切鉴定体系设定如下:

EcoRI 0.5ul

10×H Buffer 1ul

pCAMBIA1301 2ul

灭菌ddH2O 6.5ul

37℃酶切2h,取3ul的质粒小提产物点入含0.5ug/ml溴化乙钉的1.0﹪琼脂糖凝胶加样孔,于1×TAE电泳缓冲液中,设定100V/cm稳定电泳30min。置电泳结果于紫外分析仪上观察,并通过UVP紫外凝胶成像系统采集图像

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